新疆核桃'新露'与'新萃丰'全基因组重测序分析

新疆是我国核桃重要的产区之一,核桃果皮发育不全(露仁)不利于核桃的运输与储存,为清晰新疆核桃露仁机理,对新疆核桃薄壳露仁品种'新露'与薄壳不露仁品种'新萃丰'进行全基因组重测序分析,获得2种核桃SNP和InDel的变异位置及注释,筛选两者的差异基因并富集分析.结果表明:'新露'的总SNP数量为4700220个,编码区内...     

过氧化物酶(POD)调控木质素合成研究进展

在植物的生长发育过程中,木质素合成是极其重要的,其代谢过程中涉及到多种酶类参与,而过氧化物酶(POD)就是这一过程的一个关键酶。本文从木质素合成途径、POD酶学性质以及POD基因调控方面综述过氧化物酶对木质素合成的调控,阐述了过氧化物酶与木质素合成的关系,介绍了过氧化物酶的类型、功能及对POD基因层面的研究,最后对POD研究做出展望。     

核桃内果皮硬化期生长素动态变化及差异表达基因分析

为研究核桃内果皮硬化主要涉及的生物过程及生长素在硬化过程中的作用,以‘新露’核桃为研究试材,形态学观察及木质素沉积分析表明,内果皮硬化与其表面维管束分布具有密切关系,靠近维管组织附近的内果皮硬化先于远离维管的区域。IAA含量在内果皮硬化过程中呈V字形变化;IAA在5个时期平均含量最高(16.467 ng·g^-1),约为IBA、ICA和ME-IAA总和的6.8倍。木质素合成中间代谢物分析显示,木质素单体对香豆醇在内果皮硬化区的含量是未硬化区的16倍,芥子醇在内果皮硬化区的含量极高,但在未硬化区未检测到存在,且随着硬化进程这两种物质在内果皮硬化区的含量总体呈上升趋势。转录组与蛋白组关联分析获得了内果皮硬化相关的差异表达基因369条,在转录水平和蛋白质水平同时存在差异的基因关联结果较好,相关系数最低为0.48124;但差异表达基因整体关联结果较差,相关系数最高为0.22112。利用Metascape构建了差异表达基因显著富集的前20个生物学功能之间的关系网络,发现内果皮硬化主要涉及苯丙烷类代谢、氧胁迫响应、细胞壁组织与生物合成和氨基糖与核酸糖代谢4个生物过程。荧光定量结果表明,AUX/IAA基因JrIAA9、JrIAA16和JrIAA27的表达量变化趋势与IAA含量的基本一致。由此推测生长素IAA在内果皮硬化过程中发挥着重要调控作用,这对后续开展露仁发生机理研究具有重要参考意义。     

中国核桃种质资源研究方法进展

我国是核桃的主要起源和分布地区之一,其种质资源丰富,包括大量野生、农家实生种质材料及栽培种类型,栽培产量及面积位于世界前列。本文主要通过对核桃的地理分布,结果习性,生物学,遗传多样性及基因定位的角度来分析我国核桃种质资源的研究现状。     

核桃基因组学研究进展

核桃具有极佳的经济价值与保健效果,富含人体必需的营养物质和微量元素,在国内国际市场均具有极大的消费潜力。对核桃基因组进行研究,获得遗传序列信息,有助于核桃重要农艺性状的定位与克隆,剖析复杂性状的遗传机制,对开发利用核桃优质种质资源和培育、改良核桃品种具有重要意义。综述了基因组学在核桃上的进展,包括核桃的全基因组测序技术和叶绿体测序技术的更新与应用,利用基因组学在核桃中进行的SNP等分子标记的开发、QTL定位结合遗传连锁图谱与全基因组联合分析方法进行的数量性状基因定位、核桃的起源演化等问题研究,并对未来核桃等果树基因组学的应用前景进行展望。