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根据GenBank已知的H6N1亚型流感病毒的NA基因序列,设计扩增NA基因的特异性引物,通过RTPCR技术扩增5株H6N1亚型禽流感病毒NA基因序列,并将其克隆到pMD18-T载体后进行了测序分析.同时通过生物学软件对5株禽流感病毒NA基因进行了分析研究.结果表明:5株禽流感病毒NA基因全长1 410 bp,编码47... 相似文献
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1株野鸭源禽流感病毒全基因的分子克隆和测序 总被引:1,自引:0,他引:1
从2004年8月采自黑龙江扎龙自然保护区的野鸭咽喉和泄殖腔拭子中监测到并成功分离出1株禽流感病毒。经亚型鉴定确定为H4N6型禽流感病毒。命名为A/maliard/ZhaLong/88(H4N6)。携带该病毒的野鸭外观健康,为隐性带毒。对此株禽流感病毒基因组的8个节段进行全序列扩增并测序,并与GenBank上发表的不同来源的H4亚型禽流感病毒进行核苷酸及氨基酸序列的同源性比较,分析了遗传变异关系及此株病毒的潜在致病力特点。 相似文献
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根据GeneBank上已发表的H3N8亚型禽流感的非结构蛋白基因(NS)序列,设计了一对特异性引物,成功地从A/mallard/SanJiang/167/2006(H3N8)中克隆到NS基因序列,该克隆基因全长860 bp,编码NS1和NS2两种非结构蛋白.与其他H3N8亚型的NS基因进行了同源性比较,核苷酸同源性为65.5%~98.3%,推导的氨基酸序列同源性为65.4%~97.8%.NS基因遗传进化树形成两个分支,该分离株处于等位基因B组.另外,此毒株NS基因在263~277位没有发生15个碱基的缺失.A/mallard/SanJiang/167/2006(H3N8)株149位为丙氨酸,其不能感染哺乳动物. 相似文献
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准确、方便快捷的禽流感病毒亚型鉴定方法对于野鸟流感病毒感染与流行状况的调查监测是十分必要的。本研究参照Phipps L P等人建立的通用引物RT-PCR HA亚型鉴定方法,分别对已知为H1、H2、H3、H4、H6和H11亚型的22株野鸟流感病毒毒株以及6株未知亚型的野鸟流感病毒毒株进行了HA亚型分型的验证性试验。即利用1对通用引物对所有病毒样品进行RT-PCR扩增,将各PCR产物进行核苷酸序列测定并与GenBank上参考毒株序列进行同源性比较,以确定其HA亚型。BLAST分析显示,22株已知亚型毒株的PCR扩增产物的序列测定结果与GenBank公布的相应亚型毒株序列比较其核苷酸序列同源性均在99%~87%之间,而6株未知亚型的野鸟流感病毒毒株测得的核苷酸序列经BLAST比对分别确立为1株H4、1株H5、2株H7、2株H11亚型。利用该通用引物HA亚型鉴定方法对于已知亚型所获得的鉴定结果均与实验室原亚型鉴定结果一致,对于未知亚型能准确的确定其HA的亚型。因此相较于其他HA亚型鉴定方法,该方法简便易行,更适合于野鸟流感病毒的亚型鉴定。 相似文献
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本研究选取2周龄SPF鸭(绍兴麻鸭)自天然孔感染1株野鸭源H6N2亚型LPAIV,评价其对幼龄鸭的致病性。结果显示,试验感染鸭临床症状较轻微,病毒在鸭消化道复制能力较呼吸道内更强,且具有水平传播的能力。仅能在盲肠扁桃体和法氏囊2个组织器官中检测到病毒,但可对法氏囊等多个组织器官造成不同程度的损伤。此外感染鸭可产生HI抗体,并在第21天达到高峰。结果表明,该株H6N2亚型LPAIV对幼龄鸭的致病力较低,在AIV病毒传播中幼龄鸭起到了一定作用,为研究H6N2亚型LPAIV的致病机制及AIV发病机理提供了理论数据。 相似文献
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[目的]研究禽6型副粘病毒生物学特性.[方法]从来自吉林省自然保护区的野鸭拭子中分离出1株禽6型副粘病毒(Avian paramyxovirus type 6,APMV6),进行了形态学、血清学、生物学和病毒分子生物学鉴定,测定该病毒全基因组序列,并对F和HN毒力基因进行进化分析.[结果]成功分离鉴定出1株APMV6,命名为JL-127,基因组全长为16 236 nt,毒力基因进化结果表明,JL-127株与TW及FE株遗传关系较近,与HK株遗传关系较远.[结论]首次对我国野鸭源APMV6分离株进行全基因组测序,并对其进行遗传进化分析. 相似文献
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本研究选取2周龄SPF鸭(绍兴麻鸭)自天然孔感染1株野鸭源H6N2亚型LPAIV,评价其对幼龄鸭的致病性。结果显示,试验感染鸭临床症状较轻微,病毒在鸭消化道复制能力较呼吸道内更强,且具有水平传播的能力。仅能在盲肠扁桃体和法氏囊2个组织器官中检测到病毒,但可对法氏囊等多个组织器官造成不同程度的损伤。此外感染鸭可产生HI抗体,并在第21天达到高峰。结果表明,该株H6N2亚型LPAIV对幼龄鸭的致病力较低,在AIV病毒传播中幼龄鸭起到了一定作用,为研究H6N2亚型LPAIV的致病机制及AIV发病机理提供了理论数据。 相似文献
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为了解黑龙江大兴安岭地区鸟类携带禽流感病毒(AIV)的情况,于2015~2017年春、秋季候鸟迁徙重点时期,在该地区双河国家级自然保护区、南瓮河国家湿地公园等重点区域,采集雀形目等林栖鸟咽、肛拭子2547份,采用SPF鸡胚分离病毒,通过血凝试验筛选疑似阳性样品后再对其进行RT-PCR鉴定。在2 547份被检样品中,有4份样品呈血凝阳性,其余样品的血凝效价结果均为阴性。RT-PCR检测结果显示所有样品均为禽流感病毒核酸阴性。该研究结果为了解黑龙江大兴安岭地区鸟类AIV带毒情况以及候鸟迁徙路线上禽流感的监测提供了基础数据。 相似文献
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