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光敏色素B(phytochrome B,PHYB)是植物光周期依赖开花途径的关键调控因子之一。本研究对极端晚花和早花大白菜(Brassica rapa L.ssp.pekinensis)自交系06-247与He102的PHYB全基因组序列进行了生物信息学分析。结果表明,二者全长分别是5 986和5 528 bp,均与数据库中Chiifu-401的同源序列有不同程度的差异,表明二者均是大白菜PHYB基因的突变体,并命名为BraphyB1(GenBank登录号:KJ866947)和BraphyB2(GenBank登录号:KJ866948)。二者之间有476个插入/缺失(Inserts/Deletions,InDels)和57个SNPs。启动子区有473个InDels和31个SNPs、编码区有3个InDels和26个SNPs。InDels主要体现为phyB2在启动子区、5'非翻译区和编码区分别缺失445、18和3 bp。phyB2启动子缺失的445bp中包含两个TATABOX4和两处成髓细胞血症(myeloblastosis,MYB)类转录因子结合基序,一处GA响应元件。开发了鉴定phyB1/phyB2中445 bp InDel突变的共显性标记phyB1-762/phyB2-317,用该标记检测了以06-247与He102为亲本杂交构建的F2群体,利用F2代群体植株对抽薹开花时间与标记进行了关联分析,结果表明,phyB1-762/phyB2-317分别与晚花/早花表型显著关联(P0.05)。荧光定量RT-PCR显示,PHYB基因在He102各个发育阶段的表达水平均显著低于06-247(P0.01)。上述结果表明,大白菜PHYB基因启动子InDel是造成PHYB基因表达差异和开花期改变的主要原因之一。本研究为系统研究PHYB基因在转录、翻译、蛋白结构等水平突变对大白菜开花时间影响的分子机制提供了线索。 相似文献
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大白菜(Brassica rapa ssp.pekinensis)参考基因组序列的公布及测序成本的降低为大规模开发插入/缺失(Insertion/Deletion,InDel)标记提供了可能.本研究以性状差异明显的大白菜自交系He102与06-247为亲本,开展了全基因组重测序、标记开发和验证工作.二者测序深度分别为10×和8×,经筛选共获得330 218个InDels差异位点,出现频率为1.2个/kb,其中有11 238个差异位点位于编码区,包括5 184个差异基因,每个基因平均包含2.2个差异位点.分别以He102与06-247测序数据中筛选出的多态性InDels位点为参照,从10条染色体上随机选择933个位点进行了PCR扩增及电泳检测验证.结果表明,测序深度对假阳性率有直接影响,以测序较深的材料中筛选到的差异位点为参照,其验证结果的假阳性率亦较高,反之则较低.本研究中以He102与06-247为参照选择InDels位点验证的平均假阳性率分别是51.9%和22.5%.从933个位点中共筛选出593个在亲本之间实际表现为多态性的位点,这些差异位点中有375个位于编码区,是潜在的功能性标记.利用上述差异位点,检测了He102与06-247衍生的F7代重组自交系群体,明确了F7代各株系在593个位点的纯/杂合状态,为利用剩余杂合株系精细解析和精准定位大白菜耐抽薹、抗病毒、抗干烧心等重要农艺性状奠定了基础. 相似文献
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大白菜是深受广大消费者欢迎的大宗蔬菜,本文简要介绍山东省农业科学院蔬菜研究所育成的大白菜系列新品种。1天正春白一号该品种是在“九五”国家科技攻关和省蔬菜良种产业化开发项目资助下育成的一代杂交种。2002年通过山东省农作物品种审定委员会审定(鲁种审字[2001]037)。该品种冬性强,叶球叠抱,矮桩倒锥形,叶色淡绿,白帮,口感微甜,生、熟食皆宜。植株高34cm左右,开展度为40cm×40cm,净菜率为70%,软叶率为55.4%,单球重2~2.5kg,生长期60d。净菜产量4607.9kg/667m2,比对照增产21.20%;经中国农科院蔬菜花卉所室内苗期人工接种鉴定,病毒病达到高抗水平,病指为2.9。适宜在山东、江苏、湖南、湖北、河南、陕西等及生态条件相似地区春季均可种植。栽培要点:天正春白一号是生长速度快、前期耐低温、后期耐干热,薹位低、耐先期抽薹性强的春季专用品种。在山东的大部分地区适宜2月中下旬日光温室或温床育苗,3月下旬定植、中小拱棚或地膜覆盖栽培,5月下旬收获上市。或3月底4月初露地直播、覆盖地膜,5月下旬6月初上市。栽培过程中前期加强保温措施,避免苗期过多的感应低温,并增施有机肥作底肥。中期采用拱棚... 相似文献
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天正萝卜12号是由雄性不育系01-11A和自交系9230-11杂交而成的水果萝卜一代杂种,生长期(播种~收获)约80 d(天)。叶丛半直立,羽状裂叶,叶色深绿,单株叶片13~15片。肉质根圆柱形,入土部分较小,皮深绿色,肉翠绿色,肉质致密,微辣,脆甜多汁,风味好,生熟食兼用。干物质含量7.5%,VC 296.0 mg·kg-1(FW),可溶性总糖3.7%。单根质量0.5~0.7 kg,耐贮藏,每667m2产量4 000 kg左右,高抗霜霉病和病毒病,适宜我国北方与中南部地区秋季种植。 相似文献
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不同萃取头萃取萝卜风味物质的GC-MS分析 总被引:1,自引:1,他引:0
采用PDMS/DVB和DVB/CAR/PDMS两种萃取头,以固相微萃取(SPME)法提取萝卜风味物质成分,经气相色谱-质谱联用(GC-MS)对风味物质成分进行鉴定,分析比较两种萃取头提取的风味物质成分差别,以确定适宜的萃取头。结果表明:两种萃取头的固相微萃取共检测到29种风味成分,PDMS/DVB提取数量为17种,DVB/CAR/PDMS为27种;PDMS/DVB萃取头所萃取的醇类、异硫氰酸酯类的数量比DVB/CAR/PDMS萃取头少2种,烷烃类少3种,杂环类少1种,酯类、酮类均未检测到;DVB/CAR/PDMS萃取异硫氰酸酯类、烷烃类、醛类、杂环类、酮类、醚类及醇类的灵敏度高,PDMS/DVB萃取芳香族类的灵敏度高。因此,根据获得风味物质数量、种类以及灵敏度,供试萃取头中,DVB/CAR/PDMS比PDMS/DVB更适于提取分析萝卜风味物质成分。 相似文献