砂生槐单粒种子DNA的快速提取及RAPD检测

为探讨快速提取种子DNA的有效方法,以砂生槐单粒种子为试验材料,在传统CTAB法基础上建立一种快速提取DNA的方法,并通过紫外分光光度法、凝胶电泳和RAPD-PCR检测所提基因组DNA。结果表明:快速法提取得到了质量较好、浓度及纯度较高的DNA,可以满足分子生物学实验的要求。此方法操作方便、快捷,是一种有效的砂生槐种子的DNA提取方法。     

伊朗蒿精油的微波提取及抑菌活性初步研究

[目的]探讨微波提取伊朗蒿精油的最佳工艺条件,并对精油的抑菌效果进行研究。[方法]采用微波处理方法,试用不同的条件对伊朗蒿精油进行提取,并采用滤纸片扩散法来检测精油的抑菌效果。[结果]伊朗蒿精油的最佳微波提取工艺是:料液比为1∶15(W/V,g/ml,下同),微波湿处理30 min后保持4 h的回流时间;在此条件下,伊朗蒿精油的精油量为11.0 ml/kg。抑菌试验结果表明,伊朗蒿精油对于细菌生长具有明显的抑制作用。[结论]该研究为伊朗蒿的综合利用与开发提供了理论依据。     

基于ITS2 DNA条形码的苞叶雪莲分子鉴定

【目的】基于ITS2条形码技术鉴定藏药材苞叶雪莲,以保证药材质量,确保用药安全。【方法】对采自西藏林芝的苞叶雪莲进行DNA提取,PCR扩增得到ITS序列并测序;所有样品的ITS2序列采用基于隐马尔可夫模型(HMM)的注释方法获得,使用MAGE6.0进行多重序列比对,并构建进化树,同时预测苞叶雪莲ITS2序列的二级结构。【结果】苞叶雪莲及其近缘物种的ITS2序列间存在明显差异,基于ITS2序列的NJ树及ITS2二级结构能将苞叶雪莲及其近缘物种区分开。【结论】ITS2序列可以有效的鉴别苞叶雪莲及其近缘物种,可以为苞叶雪莲的安全用药及合理开发利用提供依据。     

菊叶香藜转录组单核苷酸多态性(SNP)信息挖掘及功能注释分析

【目的】挖掘菊叶香藜转录组数据中的SNP信息,对具有SNP位点的unigene(SNP-unigene)进行功能注释分析,为菊叶香藜SNP分子标记的开发提供理论依据。【方法】利用Samtools和VarScan v.2.2.7软件寻找候选的SNP位点,并对SNP-unigene进行GO注释、COG注释和KEGG注释。【结果】在菊叶香藜花和叶转录组中,分别鉴定出了889个和673个SNP位点,转换分别占63.0%和62.7%,颠换分别占37.0%和37.3%,转换和颠换的比值分别为1.70和1.68,非编码区分别占21.15%和21.10%,编码区分别占67.27%和67.46%。菊叶香藜所有SNP位点分布于643条SNP-unigene上,功能注释结果显示,总共有343条SNP-unigene具有GO注释,370条SNP-unigene具有COG注释,232条SNP-unigene具有KEGG注释,这些SNP-unigene涉及较多的功能主要与代谢、核糖体、次生代谢产物的生物合成相关。【结论】本研究通过大规模地筛选菊叶香藜中的候选SNP位点,可以为研究菊叶香藜基因分型、构建遗传图谱等方面奠定基础,对于开发利用菊叶香藜植物资源具有重要的价值。     

菊叶香藜精油合成关键HMGR基因的生物信息学分析

采用生物信息学的方法分析菊叶香藜3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(Ds HMGR)基因所编码蛋白质的理化性质、信号肽、跨膜结构域、亚细胞定位、保守结构域、二级结构、三级结构,并进行多条氨基酸序列比对和系统进化树构建。结果表明,Ds HMGR基因包含一段1 725 bp的开放阅读框,编码574个氨基酸,非极性氨基酸为主要氨基酸,等电点为7.46,为不稳定蛋白质,编码蛋白质中不含有信号肽,在N端具有2个疏水区域,含有2个跨膜结构域,Ds HMGR蛋白定位到内质网上,在C端和连接区具有较高保守性,在N端保守性较低,含有HMGR蛋白特有的4个保守活性位点,二级结构主要为α-螺旋,三级结构预测显示Ds HMGR蛋白具有N、L和S 3个催化活性中心结构域。HMGR蛋白进化分析中,菊叶香藜与藜科植物聚为一支,遗传距离较近。     

菊叶香藜精油的提取及对昆虫活力抑制的研究

[目的]探讨菊叶香藜精油的最佳提取方式,初步研究精油对昆虫的活力抑制.[方法]利用水蒸气蒸馏的方法,对不同形式、不同部位及不同条件下菊叶香藜的精油进行提取,并用提取的精油设计不同的精油剂量梯度进行玉米象的活力抑制试验.[结果]不同形式、不同部位及不同条件下菊叶香藜的精油提取量均有较明显的差异.微波处理10 min、料液比1∶15时,回流4h,菊叶香藜的精油量达最大值;菊叶香藜的花部位的精油含量最大,在4h的回流时间下可以获得8.4 md/kg的精油量;菊叶香藜精油对玉米象活力有一定抑制作用,且随精油浓度增加抑制程度增加.[结论]该研究为菊叶香藜精油向杀虫剂方面发展提供理论依据.