西瓜花叶病毒辽宁臭椿分离物的鉴定与全序列分析

2015年10月,在辽宁省盖州市采集到表现花叶的臭椿样品。应用电子显微镜负染色技术检测到线状病毒粒子(800 nm×18 nm)。利用Potyvirus通用引物PVY-Legpoty-F/PVY-Legpoty-R对三株代表样品进行RTPCR扩增,得到750 bp阳性片段。经Blast搜索,与西瓜花叶病毒(Watermelon mosaic virus,WMV)高度同源。利用WMV-5NF/WMV-5NR、WMV-MNF/WMV-MNR和WMV-3NF/WMV-3NR三对引物扩增WMV全基因组,确定为10070核苷酸(MF418043)。基于cp基因进行同源性分析和系统进化关系分析,发现盖州臭椿分离物与北京臭椿分离物的关系最近。这是辽宁臭椿上WMV分子特征的首次报道。     

菜豆普通花叶病毒辽宁分离物的鉴定与序列分析

2016年8月,于辽宁省盖州市采集到表现为黄化的菜豆样品。利用Potyvirus通用引物Legpoty-F/Legpoty-R对3个代表样品进行RT-PCR扩增,得到预期725 bp的片段。Blast显示它们与菜豆普通花叶病毒(Bean common mosaic virus,BCMV)同源性最高。利用报道的特异引物BCMV-CP-F/BCMV-CP-R扩增到约1.2 kb的片段,包含完整的外壳蛋白(coat protein,cp)。基于cp基因进行同源性分析,发现它们与美国菜豆分离物BCMV-[USA:Iowa:Phaseolus vulgaris:11](KM023744)同源性最高,为97.9%。根据Potyvirus的分类标准,认为它们是BCMV的辽宁分离物。这是辽宁首次报道菜豆感染BCMY。     

小西葫芦黄花叶病毒辽宁分离物的鉴定与序列分析

从辽宁省沈阳市和盖州市分别采集表现花叶的南瓜样品,经透射电镜负染色实验,观察到典型的马铃薯Y病毒属(Potyvirus)线状病毒粒子.利用Potyvirus通用引物Legpoty F/LegpotyR分别对3个沈阳样品和3个盖州样品进行RT-PCR扩增,得到预期片段,克隆并测序.Blast显示6个病毒样本与小西葫芦黄花叶病毒(ZYMV)同源性最高,均大于99%.利用已经报道的特异引物ZYMV-F/ZYMV-R,从6个样本中扩增到约1.2 kb的ZYMV片段,片段包含完整的外壳蛋白(CP)基因.基于CP的核苷酸序列同源性分析,发现2个ZYMV辽宁分离物与山西分离物ZYMV-[CN:SX:Chrysanthemum:14](KP742962)同源性最高,达99.1%和99.4%.系统进化树分析表明,2个ZYMV辽宁分离物与山西分离物ZYMV-[CN:SX:Chrysanthemum:14]聚集在一个分支,推测ZYMV辽宁分离物与山西分离物亲缘关系最近.     

辽宁沈阳甜椒曲叶病的病原鉴定

从辽宁省沈阳市采集到具有严重曲叶症状的甜椒叶片,负染色试验显示病叶中存在300 nm×18 nm的杆状病毒粒子.RT-PCR检测、克隆和测序显示9个样本中存在辣椒轻斑驳病毒(PMMoV).基于外壳蛋白(cp)基因进行同源性分析,显示PMMoV沈阳分离物与已报道PMMoV核苷酸同源性为93.7%~99.8%,氨基酸同源性为96.8%~100.0%.系统进化树分析表明,PMMoV沈阳分离物与PMMoV P_(1,2)致病型的各个分离物聚在一个分支上.摩擦接种试验显示,PMMoV局部侵染心叶烟并诱导其产生坏死枯斑,但可系统侵染辣椒并诱导曲叶症状的发生.