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代谢组学是系统生物学研究的重要组成部分,是一种对特定条件下生物体内所有内源性小分子代
谢物进行全面定性和定量分析的技术。质谱和核磁共振系统的不断更新迭代推进了代谢组学技术的迅猛发展,
其中质谱技术因其能同时检测出数千个生物流体、细胞和组织中的代谢物,且所需前处理步骤简单,已发展为
当前代谢组学研究中应用最广泛的技术,开发基于质谱的代谢组学数据分析方法也因此成为过去 10 年代谢组学
研究的热点领域。对基于 GC-MS 和 LC-MS 的代谢组学数据预处理、代谢组学数据统计分析、代谢途径富集分析,
以及未知代谢物鉴定 4 个方向取得的研究进展进行系统总结,详细介绍常用的数据分析策略和分析软件;并重
点综述了包括基于数据库、分子网络算法、人工智能算法等未知代谢物鉴定的前沿方法,最后展望了基于质谱
的代谢组学数据分析的未来发展方向,在已知生化反应和分子网络分析的基础上再整合代谢物合成的遗传位点
等信息,有望进一步提高代谢物的鉴定数量和准确度。全面综述基于质谱的代谢组学数据分析技术,将为开发
新的代谢组学分析方法和挖掘代谢组学数据的生物学意义提供重要的参考和思路。 相似文献
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以重组植酸酶(phyA-ABCD5F7)的毕赤酵母工程菌为植酸酶生产菌,经高密度发酵制备得到粗酶液。通过在粗酶液中添加Mg~(2+)和Zn~(2+)等金属离子以及海藻糖,可明显提高植酸酶的热耐受能力。以植酸酶的酶活回收率为评价指标,考察了进风温度、出风温度和保护剂对植酸酶酶活回收率的影响,确定最佳喷雾条件:保护剂5 g/L MgSO_4·7H_2O、2 g/L ZnSO_4·7H_2O和10 g/L海藻糖,进风温度为160℃,出风温度为70~75℃,在此条件下,植酸酶的酶活回收率达80%。 相似文献
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腺苷酸是能量代谢的载体,为了更好地研究长白猪肌肉组织和肠道内容物中能量代谢的差异,建立了一种快速检测猪肌肉组织和肠道内容物中腺苷酸含量的高效液相色谱(HPLC)分析方法。色谱条件为:Waters Symmetry C18反相色谱柱(250 mm×4.6 mm,5μm);流动相为甲醇-50 mmol/L磷酸二氢钾缓冲液(pH6.5),其体积比为9∶91;流速0.5 m L/min;柱温30(±1)℃;紫外检测波长259 nm,进样体积10μL时,在0.1~100 mg/L浓度范围内,ATP、ADP和AMP质量浓度与峰面积呈良好的线性关系,线性相关系数分别为0.999、0.998和0.996,检出限(LOD,S/N≥3)分别为0.0001、0.004、0.004 mg/L,定量限(LOQ,S/N≥10)分别为0.002、0.02、0.02 mg/L,且平均回收率分别为92.00%~99.05%、100.77%~104.48%和110.84%~113.72%,相对标准偏差(RSD)为0.29%~1.02%、0.33%~1.65%和0.69%~1.92%,整个过程可在10min内完成。该方法具有快速、准确、灵敏性高、重复性好等特点,可用于猪肌肉组织和肠道内容物中ATP、ADP和AMP含量的检测以及能量代谢研究。 相似文献
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