广东3个地方鸡种mtDNA D-loop全序列的遗传多样性分析

基于mtDNA D-loop全序列分析广东3个地方鸡种的遗传多样性.利用PCR和测序技术获得清远麻鸡、阳山鸡和惠阳胡须鸡共98个个体mtDNA D-loop全序列,结合NCBI已收录的地方鸡种、红色原鸡和绿头鸭共33条序列综合分析.结果表明:广东3个地方鸡种mtDNA D-loop区全长1231～1232 bp,其A、...     

鸡胚来源的外泌体不同提取方法比较

【目的】鸡胚蛋可用于改善机体免疫功能,研究不同提取方法对鸡胚组织中外泌体的分离效果,有利于深入解析鸡胚蛋生理功能。【方法】收集13胚龄惠阳胡须鸡胚蛋12枚(3组,4枚/组),通过酶消化、差速离心及过滤等前处理后将所获样品分为4份,通过超速离心法(UC)、蔗糖垫超速离心法(SDUC)、膜亲和法(exoEasy)以及聚乙二醇沉淀法(ExoQuick)4种方法分离提取外泌体,分别标记A～D。比较BCA蛋白浓度测定、透射电镜、纳米流式和标志蛋白流式检测等4种方法获得的外泌体蛋白浓度、形态、大小及其标志性蛋白表达情况。【结果】4种方法均能获得符合外泌体直径分布(40～200 nm)、具有外泌体典型微囊结构特征的囊泡物质,外泌体蛋白浓度和颗粒浓度由高到低依次为DCAB,但D样品中含有其他聚团杂质蛋白;表面标志蛋白CD63、CD81阳性率变化趋势为BDCA。【结论】综合考量外泌体的纯度、形态、大小及其标志性蛋白表达情况,根据供试组织样品来源、试验条件和目的可优选蔗糖垫超速离心法或膜亲和法,如需高纯度外泌体可首选蔗糖垫超速离心法,样品稀有或不具备超速离心设备则选用膜亲和法。     

不同光色 LED 灯对育雏期文昌鸡生长性能的影响

【目的】基于鸡不同时期对光环境的不同需求,研究最佳的光照体系。采用定制的5 W LED灯作为人工光源,研究白、暖白、红、黄、蓝、绿、紫7种光色对育雏期文昌鸡生长性能的影响,确定育雏期适合文昌鸡养殖的最适光色。【方法】将630只体重相近的1日龄文昌鸡母鸡,随机分配到7个不同光色处理中,每个处理3个重复,每个重复30只鸡,笼养、自由采食和饮水。24 h光照,试验周期8周。【结果】8周龄时蓝光处理文昌鸡平均体重最高达793.16 g,比红光、白光和绿光处理文昌鸡分别重58.68、45.17、45.77 g,差异显著。蓝光处理文昌鸡平均体增重与红光、绿光和白光处理文昌鸡差异显著,蓝光处理文昌鸡体增重比白光对照处理增重45.12 g,红光处理文昌鸡体增重最少。试验全期,蓝光处理文昌鸡群体体重均匀度最好,在90%以上。蓝光处理与绿光处理文昌鸡体增重均匀度差异显著;蓝光处理文昌鸡体增重均匀度最好,其次是白光和暖白光处理。白光处理文昌鸡料肉比最低,且与黄光处理差异显著。各处理间鸡只死亡率差异不显著。【结论】综合生长体重、群体均匀度和料肉比各项指标,与白光对照处理对比,LED蓝光可显著促进育雏期文昌鸡的生长,且提高群体体重均匀度,其次是紫光和黄光,而红光抑制鸡只生长,绿光处理群体体重均匀度最差。     

基于0-1线性规划的家禽选配方案优化研究

将0-1线性规划引入家禽选配方案中,通过建立最优化模型,利用Lingo软件求解得出最优交配方案。通过计算机模拟实验研究,发现本优化方案优于传统的避免同胞和半同胞选配方案,利用该方案使后代群体近交系数更低,并且选留群体育种值更高。     

商业化模式下的优质肉鸡产蛋曲线数学模型研究

以优质肉鸡商业化育种模式下周产蛋数据为研究对象,选取常用的Ali&Schaeffer模型、Wood模型、Mc-Millan模型和Yang模型等4种数学模型进行优质肉鸡产蛋模型研究。采用决定系数(R2)、平均绝对离差(MAD)、均方误差(MSE)等作为模型拟合效果评价指标。研究结果表明,4种模型拟合效果存在差异,模型R2值范围为0.858 4～0.968 3,其中Ali&Schaeffer模型R2值最高。MAD和MSE评价与R2评价所得结论一致。结果表明Ali&Schaeffer模型(R2=0.968 3,MAD=0.017 8,MSE=0.000 5)用于优质肉鸡产蛋曲线拟合效果最为合适。     

不同实验类型的基因表达数据聚类分析方法研究

就基因芯片数据聚类分析中广泛应用的K-means算法对常见的2种类型的基因芯片数据上的应用进行研究.结果表明,不同类型的基因芯片数据适用于不同的预处理方式和不同的相似度.对于时间序列数据集,对数化转换后,相似度选择协方差所得结果最好.对于非时间序列数据集,对数转化最好,相似度选取欧氏距离、平方欧氏距离、马氏距离都比较好.     

家禽基因组选择研究进展

基因组选择(Genomic selection,GS)是新一代畜禽遗传评估方法,具有早期选择准确率高、可缩短世代间隔、对于低遗传力性状以及难以测量或测量费用较高的性状选择效率高等优点,目前已经广泛应用于奶牛育种中。本文综述了基因组选择方法在家禽中的研究进展,并对我国家禽实施基因组选择方法进行展望。     

基于简化基因组测序技术和基因芯片技术比较研究黄羽肉鸡基因组选择

旨在比较简化基因组测序技术和基因芯片技术实施基因组选择的基因组估计育种值（GEBV）准确性。本研究在AH肉鸡资源群体F₂代中随机选取395个个体（其中公鸡212只,母鸡183只,来自8个半同胞家系）,同时采用10×SLAF测序技术和Illumina Chicken 60K SNP芯片进行基因标记分型。采用基因组最佳无偏估计法（GBLUP）和BayesCπ对6周体重、12周体重、日均增重、日均采食量、饲料转化率和剩余采食量等6个性状进行GEBV准确性比较研究,并采用5折交叉验证法验证。结果表明,采用同一基因标记分型平台,两种育种值估计方法所得GEBV准确性差异不显著（P>0.05）;不同的性状对基因标记分型平台的选择存在差异,对于6周体重,使用基因芯片可获得更高的GEBV准确性（P<0.05）,对于剩余采食量,则使用简化基因组测序可获得更高的GEBV准确性（P<0.05）。综合6个性状GEBV均值比较,两个基因标记分型平台之间差异不到0.01,高通量测序技术和基因芯片技术都可以用于黄羽肉鸡基因组选择。