使用Cytoscape对生物网络数据的建模和分析

生物网络是系统生物学研究的重要内容。本文介绍了多种常用复杂生物网络可视化系统,针对Cytoscape系统在可视化的建模过程以及在建模过程中使用到的布局算法进行对比研究,并利用Cytoscape系统中丰富的插件对复杂网络数据进行分析,包括对数据进行网络分析和更改、使用BINGO插件进行基因注释、使用AGILENT LITERATURE SEARCH(ALS)插件搜索基因相互作用文献等。     

建德市石蛙资源衰退原因及对策

阐述了建德市石蛙资源的现状,分析了其野生资源量日趋匮乏的原因,包括气候改变、环境破坏、人为捕捉等,就确保生态平衡、合理开发利用提出对策,以期为石蛙资源的壮大发展提供参考。     

紫外辐射UV-B增加对小麦株高和节间细胞长度影响的初步研究

研究了UV-B强度增加对小麦株高、各节间长度及各节间纵向细胞个数、细胞长度的影响,结果表明：UV- B强度增加,小麦株高呈显著下降趋势,小麦株高下降是由于节间长度缩短,而节间个数不变,且各节间缩短的百分率也有显著的差异,穗下第4,5节间的长度缩短对于株高下降影响的效应较大。显微切片测定节间细胞的纵向长度结果表明：穗下第五节间和穗下第四节间的缩短主要是由于节间纵向细胞个数下降,而穗下第三节间和穗下第二节间的缩短主要是由于节间细胞纵向长度缩短。小麦节间缩短和叶片长度的缩短呈显著的正相关。     

一种植物病害图像识别卷积网络架构

针对人工提取植物病害图像特征存在效率低、识别率低、成本高等问题,提出一种基于DenseNet网络的现代卷积神经网络架构FI-DenseNet,旨在对多种类的植物病害图像达到高精准的识别准确率.引入Focal损失函数对DenseNet网络进行改进,使得训练模型的注意力集中于难分类的样本.FI-DenseNet网络可以增强特征传递、进行深层训练或有效改善过拟合问题.采用的数据集有87 867张植物病害图像,图像包含同种植物的多种病害,并涉及38种植物病害.对图像进行预处理、数据增强后,将DenseNet169网络、ResNet50网络和MobileNet网络作为参照实验.实验结果表明,FI-DenseNet网络的收敛速度更快且识别准确率最高,测试集识别准确率为98.97％,FI-DenseNet网络的鲁棒性和泛化能力均优于对照网络,可为植物病害智能诊断提供参考.     

基于LM-BP神经网络的耕地土壤养分等级划分模型──以皖南山区为例

研究旨在通过BP神经网络方法,构建起LM-BP网络结构(5-M-1)模型,达到对土壤养分等级划分的目的,为合理的土壤养分管理提供可靠依据。采用Levenberg-Marquardt (LM)训练算法,构建3层网络模型：一个输入层、一个隐含层、一个输出层,利用3层网络作为耕地土壤养分等级划分模型。利用土壤养分各级评价标准作为模型的训练样本和测试样本,以此来对BP神经网络进行训练和测试,并对歙县土壤养分进行综合评价。结果表明：LM-BP网络结构对测试样本输出的预测值和实际参考值是一致的。最终通过灰色关联模型和主成分分析方法对歙县土壤养分的综合评价结果与BP神经网络的模拟结果相对比,发现也是基本一致的。LM-BP网络结构应用于土壤养分等级划分中,得到了很好的预测效果,为智能算法应用于农业领域奠定了良好的基础。     

基于Web的溯源系统

茶叶溯源平台是以二维码为基本信息载体,对茶叶质量安全和种植生产等全过程进行追溯。通过茶厂、制茶厂等的农事信息采集系统,实现茶叶履历信息的快速采集与实时数据更新。通过在生产企业应用茶叶安全生产管理系统,实现有机生产的产前提示、产中预警和产后检测;通过将各生产企业数据汇集到管理部门,构建追溯平台数据库,实现上网、二维条码扫描、触摸屏等方式的追溯,从而保障茶叶质量,使企业能够实时、精确地掌握整个生产及供应链上的产品流向和变化,控制整个生产流通环节安全可靠。     

玉米SSR技术引物数据库搜索系统

本研究项目是利用SSR技术,为目前的品种鉴定真伪创造了有利条件,可以使用引物对目的 DNA进行PCR、毛细管电泳技术等获得扩增DNA的玉米多样性,维护大多专利者的权利。创建玉米SSR技术引物数据库,可以检索其引物序列,查找对应其扩增的DNA序列,也可以对玉米多样性进行查找。其中查找到的种质信息,利用玉米引物数据库db_database2以及NCBI中BLAST进行比较,与所要做鉴别的品种进行序列对比,通过各碱基的校对,辨别检验品种的真伪性,最后用本项目设计的数据库中的专利权信息以及相关法律知识可以对玉米品种侵权问题进行处理。同时本论文研发的系统具有较好的数据查询功能,对数据的添加、删除和更新操作简便,也具有较高潜在的应用价值。     

土壤侵蚀研究新动态

土壤侵蚀模型常被作为了解土壤侵蚀过程与强度、预报水土流失、指导人们合理配置土地资源的重要技术手段。本研究对国内外各种土壤侵蚀模型进行了评价,总结了今后土壤侵蚀模型应该注重的发展方向:注重土壤侵蚀模型的理论研究,从以侵蚀因子为基础的侵蚀预报向侵蚀过程的量化研究和理论完善;充分利用先进的RS、GIS技术和BP神经网络理论结合的发展趋势,为侵蚀模型的研究提供大量的数据源,以利于对土壤侵蚀模型的检验;加快土壤侵蚀所造成的生态经济损失进行估算研究;着眼于土壤侵蚀导致土壤养分流失这一实际情况,根据土壤各养分流失的差异,给出指导性建议,以便改良和保护土壤,并合理的耕种。     

酒精罐的变位识别与罐容表标定

酒精罐在使用一段时间后,由于地基变形等原因,使罐体位置发生纵向倾斜和横向偏转等变化,从而导致罐容表发生改变,为准确测量酒精罐内酒精的容量,需要定期对罐容表进行重新标定。首先我们将实际酒精罐抽象成小椭圆型的数学模型并给定纵向倾斜α,研究罐体变位后对罐容表的影响;再将上一问题中的数学模型扩展到实际生活中,并给出的大量实际采集数据。根据这些特点我们在物理模型的基础上,通过合理的假设,利用Matlab软件对给出的大量数据进行分析拟合,从而得出实现对酒精罐的变位识别与罐容表标定。