利用加权基因共表达网络分析筛选天农麻鸡胴体性状候选基因

旨在通过转录组测序(RNA-Seq)与加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)筛选慢速型黄羽肉鸡天农麻鸡胴体性状相关候选基因。本研究以104只天农麻鸡为素材,在126日龄时进行屠宰,测定胸肌重等7个胴体性状,采集胸肌组织进行RNA-Seq。基于RNA-Seq数据获得基因表达矩阵后,结合表型进行WGCNA分析,确定目标模块,筛选目标模块的枢纽基因,并分别进行KEGG通路富集、蛋白质互作网络(protein-protein interaction network,PPI)构建和相关性分析。104份胸肌组织RNA-Seq质控后获得15 092个基因的表达量。与胴体表型进行WGCNA,共得到19个模块,其中4个模块与胴体性状极显著相关。功能富集结果表明,目标模块内基因主要富集在ECM-受体相互作用、黏着力等通路。以|Module membership|> 0.8、|Gene significance|> 0.2为标准筛选到58个枢纽基因,并通过PPI网络构建鉴定到5个网络节点基因,整合相关性分析确定COL1A2和SPARC为最重要候选基因。本研究通过大样本量转录组分析,发现ECM-受体相互作用等通路在天农麻鸡胴体性状调控中发挥主要作用,筛选到COL1A2和SPARC是影响全净膛率性状的重要候选基因,研究结果为鉴定选育分子标记,解析胴体性状分子机制奠定理论基础,为慢速型黄羽肉鸡育种提供重要参考。     

商品有机肥中重金属含量状况调查

通过对商品有机肥的调查和监测发现,有些商品有机肥在使用中不但由于腐熟度不够引起土壤板结,而且其中含有的重金属物质已对农产品品质产生了不良影响,应予以关注。     

矮脚黄鸡轻度脂肪肝对其屠宰性能和肉品质的影响

本研究以矮脚京星黄鸡为试验动物，研究上市日龄鸡发生轻度脂肪肝对其屠宰性能、肉品质的影响。矮脚京星黄鸡饲养至98日龄时，选同批饲养的273只公鸡分两次进行屠宰性能与肉品质性能测定和血清生化指标的检测，同时利用HE染色与油红O染色切片，判断脂肪肝的程度。结果显示，53只公鸡的肝脏细胞排列紊乱，发生一定程度空泡变性并有较多脂肪沉积，分入轻度脂肪肝组；而另外219只公鸡肝脏细胞排列致密，无明显变性特征，分入为对照组。与对照组相比，轻度脂肪肝组公鸡：①血清甘油三酯（TG）、总胆固醇（TC）、低密度脂蛋白（LDL）含量极显著升高（P<0.01）；肝脏重和肝脏指数均极显著或显著增加（P<0.01；P<0.05），且血清胆固醇含量与肝脏重呈极显著正相关（P<0.01）；②屠宰性能有所提升，活体重、屠体重、全净膛重及腿肌重均显著或极显著增加（P<0.05；P<0.01）；③肌肉品质显著提升，胸肌和腿肌肌内脂肪含量极显著增加（P<0.01）；胸肌和腿肌剪切力均显著或极显著降低（P<0.05；P<0.01）；胸肌肉色亮度（L^*_{45 min}、L^*_{24 h}）显著降低（P<0.05），红度（a^*_{45 min}）极显著增加（P<0.01）；pH_{24 h}仅相差0.04，但差异显著（P<0.05）；④腹脂过多沉积，腹脂重、腹脂率极显著增加（P<0.01）。上述结果表明，上市日龄矮脚黄鸡发生轻度脂肪肝可使鸡部分屠宰性能提升，且对肉品质有改善作用，但会造成腹脂的过多沉积。     

磁珠法提取鸡血液基因组DNA效果研究

为确定一种稳定高效的鸡血液DNA提取方法,满足基因组检测对DNA的要求,研究应用磁珠法、酚-氯仿法和试剂盒法。分别对抗凝血和凝血状态的鸡血液样品进行基因组DNA提取,通过超分光光度计和1%琼脂糖凝胶电泳评价所获得的DNA质量,并对三种提取方法所需成本进行估算和比较。结果显示：三种方法均能从两种不同状态血液样本中提取出基因组DNA,酚-氯仿法最为经济,但耗时长且需要使用危险化学品,磁珠法与试剂盒法具有耗时短和环保的优点,且磁珠法较试剂盒法更经济。研究表明磁珠法使用的试剂量少、操作简单、耗时短、日提取样本数目远大于其他两种方法,是三种方法中最为快捷的方法,可以满足实际生产中大批量鸡血液基因组DNA提取的要求。     

快大型黄羽肉鸡肉品质性状的遗传参数估计和关键基因挖掘

旨在挖掘快大型黄羽肉鸡胸肌肉品质性状的重要候选区间和基因。本研究以1 923只快大型黄羽肉鸡为素材，于56日龄屠宰并测定屠宰和胸肌肉品质性状；利用“京芯一号”55K SNP芯片进行基因分型，利用传统最佳线性无偏预测（BLUP）、基因组最佳线性无偏预测（GBLUP）和全基因组关联分析（GWAS）等方法进行遗传参数估计和QTL区间/关键基因的检测。结果显示，胸肌pH、肉色L_{24 h}^*。同时发现，位于5号染色体上的2个单倍型对胸肌pH、肉色性状均有极显著影响。以上结果为黄羽肉鸡肉品质遗传选择方案优化和分子育种技术研发奠定了重要基础。     

长链非编码RNA在畜禽脂代谢中的作用研究进展

脂代谢对机体的生长发育、繁殖、免疫等均有重要作用,背膘厚、肌内脂肪含量和腹脂率等多种畜禽重要经济性状与脂肪代谢密切相关.长链非编码RNA(Long non-coding RNAs,lncRNA)是一类长度大于200个核苷酸的RNA分子,其在调节影响发育、分化和代谢的多种主要生物过程中有重要作用,近些年lncRNA在脂代...     

矮脚黄鸡轻度脂肪肝对其屠宰性能和肉品质的影响

本研究以矮脚京星黄鸡为试验动物,研究上市日龄鸡发生轻度脂肪肝对其屠宰性能、肉品质的影响。矮脚京星黄鸡饲养至98日龄时,选同批饲养的273只公鸡分两次进行屠宰性能与肉品质性能测定和血清生化指标的检测,同时利用HE染色与油红O染色切片,判断脂肪肝的程度。结果显示,53只公鸡的肝脏细胞排列紊乱,发生一定程度空泡变性并有较多脂肪沉积,分入轻度脂肪肝组;而另外219只公鸡肝脏细胞排列致密,无明显变性特征,分入为对照组。与对照组相比,轻度脂肪肝组公鸡:①血清甘油三酯(TG)、总胆固醇(TC)、低密度脂蛋白(LDL)含量极显著升高(P0.01);肝脏重和肝脏指数均极显著或显著增加(P0.01;P0.05),且血清胆固醇含量与肝脏重呈极显著正相关(P0.01);②屠宰性能有所提升,活体重、屠体重、全净膛重及腿肌重均显著或极显著增加(P0.05;P0.01);③肌肉品质显著提升,胸肌和腿肌肌内脂肪含量极显著增加(P0.01);胸肌和腿肌剪切力均显著或极显著降低(P0.05;P0.01);胸肌肉色亮度(L~*_(45 min)、L~*_(24 h))显著降低(P0.05),红度(a~*_(45 min))极显著增加(P0.01);pH_(24 h)仅相差0.04,但差异显著(P0.05);④腹脂过多沉积,腹脂重、腹脂率极显著增加(P0.01)。上述结果表明,上市日龄矮脚黄鸡发生轻度脂肪肝可使鸡部分屠宰性能提升,且对肉品质有改善作用,但会造成腹脂的过多沉积。