藜麦DAPB基因丰度及生物信息学分析

二氢砒啶二羧酸还原酶(DAPB)是赖氨酸合成途径中的一个重要酶,在蛋白质和细胞壁的合成中起着重要作用。本研究基于KEGG总数据库分析表明,藜麦中DAPB的基因拷贝数远高于水稻、玉米及大豆等作物。对藜麦基因组数据筛选得到4个DAPB基因成员,均属于碱性蛋白质,氨基酸序列长度约330 bp,分子量为36.623~36.880 k D,等电点(p I)为5.79~6.01,最大疏水系数为0.028~0.123,为疏水性蛋白,亚细胞定位于细胞质中,不存在跨膜区。4个DAPB基因之间的Ka/Ks值均小于0.5,表明该基因在进化过程中比较保守。系统进化分析发现,藜麦DAPB家族成员位于同一个亚家族,且与菠菜的亲缘关系较近。启动子顺式作用元件分析结果显示,DAPB家族除含有TATA-box和CAAT-box以外,还含有多个参与激素响应、光照、低温及其它应激反应相关的顺式作用元件和转录因子结合位点,暗示藜麦DAPB家族成员可能参与以上多种响应。本研究分析了藜麦DAPB基因的拷贝数并对DAPB进行了生物信息学分析,可为进一步了解DAPB基因家族的生物学功能提供参考。     

情动设计在老年人活动空间中的应用——以北京东城区八所社区公园为例

指出了北京市老龄化程度和社区养老趋势持续上升。在此背景下,以景观设计中的情感需求为研究对象,选择北京市东城区的八所社区公园中的老年人活动进行了深入调研,分析了其性格特征及情感需求,研究了满足不同情感需求老年人的景观空间特征,并建立了一套可推广的社区公园初建设评价体系。在此基础上,提出了“复建设”这一概念,以老年人、政府管理机构、基层管理者、景观设计师多方合作的方式,进行社区公园“多元复建设体系”的实践。     

木本植物低温应答机制研究进展

低温是限制木本植物生长和分布的重要非生物胁迫因子之一。木本植物作为一个生物体系统,在受到低温胁迫时,为抵御逆境带来的伤害,其自身会发生一系列的分子及生理反应,以响应和应对逆境信号。这些反应互相联系,形成一套完整的分子生理应答机制。综述近年来低温胁迫下木本植物信号转导、转录组、蛋白质组、代谢组的分子响应,及膜系统、保护酶系统、有机调节物质的生理响应,从信号转导、转录调控、基因表达、代谢调节到生理变化这一连贯的系统进行初步阐述,以揭示木本植物低温应答机制,并就当前的问题进行分析,对未来进行展望。为进一步探究木本植物应对低温胁迫的抗寒机制和适应机制提供理论参考。同时,为选育抗寒性强的木本植物种质资源提供理论基础。     

河南省生猪规模养殖生产效率分析

本文采用2001年至2013年《全国农产品成本收益汇编》的数据,运用DEA方法分析比较了河南省大中小生猪养殖模式下的综合效率、纯技术效率、规模效率以及投入冗余等。指出河南省生猪规模养殖的综合技术效率处于比较高的水平,大中小规模生猪养殖的生产效率不等。中规模养殖在仔畜投入方面存在冗余,大中小规模生猪养猪在饲料投入方面都存在冗余。从政府财政支持、生猪养殖场管理水平和生猪市场机制方面,提出了相应的政策建议。     

基于RNA-seq数据分析玉米抗虫响应基因的可变剪接事件

采用Illumina Hiseq~(TM)分别对黏虫取食的玉米叶片及对照组材料进行转录组测序,鉴定和分析响应黏虫取食基因的可变剪接事件。结果表明,对照组中鉴定出15 701个基因对应79 363个可变剪接事件,黏虫取食组中鉴定到11 791个基因的39 385个可变剪接事件。2组玉米基因组在不同的可变剪接类型中,均是以第1个外显子可变剪切、最后1个外显子可变剪切、单内含子滞留和可变5′或3′端剪切4种类型为主。对2组发生可变剪接事件的基因进行比对发现,黏虫处理组新增加了1 121个可变剪接基因,差异表达分析鉴定出177个表达显著差异的可变剪接基因。GO功能富集分析表明,发生可变剪接的差异基因主要富集于氧化还原酶活性、转移酶活性、DNA结合、ATP结合、代谢过程、以DNA为模板的转录及调控相关的功能,表明这些可变剪接差异表达基因参与了玉米的抗虫响应过程。