基于转录组测序的苦瓜热激蛋白相关基因分析

为获得苦瓜叶片高温胁迫状态下表达的相关基因,本研究以高温胁迫下苦瓜叶片为实验材料,采用Illumina HiSeq 2500高通量测序技术对正常温度(26℃)和高温胁迫(38℃)下苦瓜叶片转录测序后进行组装,再利用KEGG、Pfam、Swiss-Prot和NR数据库平台对热激蛋白的相关功能基因筛选,共获得24个热激蛋白相关基因,包括得20个热激蛋白基因、2个位于叶绿体中的小热激蛋白以及2个热激转录因子。聚类分析研究表明,涉及到热激蛋白相关的20个Unigene广泛分布于3大类中,其中c42567和c43094这两个亲缘关系最近;两个小热激蛋白c42963和c12133的亲缘关系次之;c35683和c3040两个热激转录因子亲缘关系最远。通过本次研究中获取的24个热激蛋白相关Unigene信息,有助于深入研究苦瓜耐高温胁迫机理等提供数据信息。     

贺州市烟草病毒病种类鉴定与防治对策

从贺州市主要产烟区采集疑似病毒病症状的烟叶样品71份,并对症状进行了拍照和描述记载,采用ELISA法对样品进行了检测。检测出TMV、CMV、To MV、Ts WV 4种病毒病,检出率分别为51.87%、46.92%、19.35%、74.79%,复合侵染率为71.83%,以TMV和To MV复合侵染为主,病毒阳性检出率和采集烟叶样品发病特征基本吻合。同时对贺州市烟草病毒病发生原因进行分析,提出了有针对性的防治措施。     

基于瓠瓜转录组测序的EST-SSR标记的开发及其应用

为丰富瓠瓜分子标记库、开发瓠瓜SSR标记、寻找有效的瓠瓜种质资源鉴定方法,利用MISA软件对瓠瓜转录组测序获得的87 518条unigene序列进行筛选,共检测出11 029个SSR位点,发生频率为9.85%,分布距离为平均每8.3 kb有1个SSR 位点。其中只包含1个SSR位点的unigene 序列有6759条,其发生频率为7.72%;有1858条unigene序列含有2个及2个以上的SSR位点,发生频率为2.123%;有920条unigene序列属于混合形式的SSR标记,频率为1.051%。瓠瓜转录组中优势重复基序为单核苷酸、三核苷酸和二核苷酸,分别占总SSR位点的55.51%、25.41%和17.07%。A/T、AG/CT和AAG/CTT分别是单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸的优势重复基元,分别占总SSR重复类型的98.22%、55.39%和39.86%。用Primer 3.0共设计出8617对SSR引物,利用6对条带清晰、多态性稳定的SSR引物构建了36个品种的指纹图谱,部分位点具有高度的一致性,说明基因来源范围较小。聚类分析显示,在相似系数为0.68时将36个瓠瓜品种分为6类。其表明我国瓠瓜品种资源遗传多样性非常狭窄,利用现有瓠瓜资源开展品种选育潜力有限,应加强对野生特异种质的引进与发掘利用。利用瓠瓜转录组数据进行SSR标记开发,获得的SSR位点能为其遗传多样性分析和遗传图谱构建提供更丰富可靠的标记选择。     

茄子小孢子再生体系的优化

【目的】开展影响茄子（Solanum melongena）小孢子愈伤组织诱导、生长和分化的研究，为茄子小孢子再生体系的建立及应用提供技术支持。【方法】以二倍体茄子游离小孢子为材料，探讨培养方式、诱导条件、培养基配方等若干因素对茄子小孢子愈伤组织诱导、生长和分化的影响，初步建立茄子小孢子培养体系。【结果】黑暗静止培养条件下采用 2~3 次更换部分新鲜培养基利于愈伤组织诱导和生长；愈伤组织分化培养时，愈伤组织直接转接到固体培养基时其成活率与大小有关，＞ 2 mm 时其成活率可达 82.67% 以上，固液共培对愈伤组织大小要求不严格，添加 1~2 mL N3 液体培养基时有利于愈伤组织生长和成活，液体培养基＞ 2 mL会降低愈伤组织分化培养成活率；在添加 36 g/L 甘露醇的 MS 固体培养基培养的愈伤组织转绿（成熟）率最高，达 94.64%；ZT 1.5 mg/L+NAA 0.05 mg/L 激素组合有利于芽分化，分化率达 57.78%。【结论】黑暗静止培养时，定时更换部分培养基利于愈伤组织诱导和生长，添加 1~2 mL N3 液体培养基固液共培养时愈伤组织成活率最高，生长快，固体培养基附加 36 g/L 甘露醇和 ZT 1.5 mg/L+NAA 0.05 mg/L 激素组合有利于愈伤组织分化。     

保康烟区烟草品种现状与发展策略分析

结合保康地区烤烟品种布局、更替等种植历史及品种现状,分析了烟叶生产品种布局及推广现存问题,探索烟叶品种发展策略。针对保康地区烤烟品种老化现象严重、单一化现象突出、储备品种不足、新品种引进与推广探索不够的问题,提出依据烟叶生产形势做好烟叶品种选育工作,工商协作、工农结合,推进品种选育推广,加强新品种推广配套技术的研究,并且合理做好品种布局的措施,以期通过改良烟叶品种提高烟叶品质满足卷烟工业企业发展要求。     

一株烟草黑胫病高效拮抗菌的筛选、鉴定及生防潜力评价

采用稀释涂布平板法、对峙培养法和牛津杯法从烟草黑胫病土壤中分离和筛选出21株对烟草黑胫病有拮抗作用的细菌,其中,XCS007菌株拮抗作用最明显,运用微观形态学、生理生化特征及16Sr DNA基因序列鉴定其为一株铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)。菌株XCS007菌液及其粗提物对烟草黑胫病病菌菌丝的抑制率分别是91.80%和97.11%;盆栽试验结果显示,其防治效果分别是83.18%和83.55%;大田试验结果显示,其防治效果分别达到78.64%和79.54%。     

低温胁迫下苦瓜叶片转录组差异基因分析及生理响应特征

苦瓜在生长季节遇到低温会影响其生长发育和产量,限制了种植分布区域。为了研究苦瓜耐寒性的分子机制,本研究以苦瓜自交系43为试验材料,在8℃低温胁迫处理后观察其表型并测定相关生理生化指标,再利用转录组测序技术从生理角度结合分子水平对苦瓜低温胁迫机制进行生物信息学分析。结果表明,在8℃低温胁迫下,苦瓜表现出耐低温适应性,在低温胁迫下丙二醛(MDA)含量、脯氨酸含量及电解质渗透率均呈现显著变化。分析了低温胁迫0和12 h后的转录组变化,结果发现低温胁迫处理后有916个基因上调,369个基因下调。对差异表达基因进行通路注释分析,发现大量与低温胁迫相关的代谢途径。进一步筛选到10个在其他物种报道过可能与冷胁迫相关的基因,包括MYB、WRKY以及NAC转录因子等。对植物耐低温相关的候选基因进行了实时荧光定量PCR(qRT-PCR)表达谱分析,结果与生理表型变化相吻合,同时进一步证实了RNA-seq数据的准确性。本研究基于全基因组水平分析苦瓜在低温胁迫下的转录组变化,以及耐低温相关基因动态变化和生理反应的分子机制,为揭示苦瓜中的耐寒性机理和筛选遗传改良候选基因提供了一定基础。     

瓠瓜幼叶转录组功能基因测序及分析

为探讨瓠瓜转录组功能基因信息,对福州芋瓠瓠瓜叶片进行了Illumina Hiseqxten高通量无参转录组测序分析,共获得664 252 268个reads片段,经序列组装共计获得87 518个Unigene,总长度高达91 405 320 bp,76.03%的Unigene长度主要集中在1~1 000 bp。功能注释结果显示,有55 725个Unigene在Nr数据库获得注释,注释到葫芦科的Unigene数量最多,有26 354个,占总Unigene的47.29%。GO数据库注释到18 278个Unigene,可以分为分子功能、细胞组分和生物学过程共三大类的55个亚类。COG数据库中有41 635个Unigene获得注释,分布在信息存储与处理、细胞过程和信号传递、新陈代谢、无特征基因四大类的25个功能区域,其中参与氨基酸运输和代谢的Unigene数量最多。KEGG数据库中有24 770个Unigene获得注释,涉及到220个KEGG代谢途径。SSR位点检索结果显示,包含SSR序列的8 617条Unigene中存在11 029个SSR位点,发生频率为9.846%。本研究结果为进一步深入开展瓠瓜功能基因研究和SSR分子标记开发奠定了重要基础。