IBA诱导楸树嫩枝扦插不定根发育的转录组分析

【目的】利用RNA-seq技术对楸树易生根品种‘豫楸1号’的嫩枝扦插生根的4个发育阶段进行转录组测序和分析,为阐明楸树不定根发育的分子机制奠定理论基础。【方法】首先利用浓度为2 g·L-1IBA处理‘豫楸1号’嫩枝,然后分别提取处理后0天(对照)、1天(激活期)、15天(愈伤形成期)的插穗基部的RNA及25天(不定根形成期)和35天(不定根伸长期)的根部的RNA进行转录组测序;接着测序得到raw reads,通过去除接头、重复序列、低质量的序列,得到高质量的clean reads,使用Trinity软件进行拼接获得contigs;随后,利用BLASTx、RSEM、Cytoscape及Me V4.9.0分子生物学软件对测序结果进行注释和差异基因鉴定;最后随机选取15个差异表达的RNA-Seq数据利用q PCR验证基因的表达。【结果】在62 955个unigenes中,31 646(50.26%)个unigenenes获得了注释;差异基因分析发现了11 100个差异基因,其中包括10 200个特异的和900个共同的差异基因;GO富集分析发现‘细胞骨架’仅在激活期显著富集,而‘DNA代谢过程’仅在愈伤组织形成期显著富集;KEGG富集分析显示参与丙烷合成、糖酵解和植物激素代谢等途径的基因对楸树不定根的形成具有重要的作用,并且随着楸树不定根发育进程的发展,参与糖酵解途径的基因数目逐渐减少而参与苯丙素合成的基因数量却在持续增加,表明在IBA刺激后,代谢通路的动态变化响应了不定根的发育进程。【结论】通过对楸树‘豫楸1号’不定根发育的4个阶段的转录组分析,发现细胞分裂素和乙烯间的互作促进楸树愈伤形成而生长素和油菜素内酯间的互作则促进了楸树不定根的伸长。虽然本研究不能完全解释‘豫楸1号’不定根形成的分子机制,但它可以作为进一步探索与这一复杂过程相关的候选途径和基因的有力工具,可为解析楸树不定根发育的分子机制和其他近缘物种的研究提供帮助。     

霍山石斛新品种‘九仙尊2号’

‘九仙尊2号’是通过系统选育的方法从霍山石斛实生苗中选育出的新品种。茎肉质，亮绿黄色（3B），叶呈鲜黄绿色（140A）和亮黄绿色（4D）。总状花序，长2 ~ 4 cm，常1 ~ 3朵，花白色（nn155D），唇瓣处有黄色（3A）斑块。花期4月下旬至5月下旬。     

霍山石斛新品种“九仙尊1号”的选育

"九仙尊1号"是通过系统选育的方法从霍山石斛实生苗中人工选育的新品种。茎肉质,黄绿色(154b),叶片正面鲜黄绿色(140A),背面为亮黄绿色(140B)。总状花序,花亮黄绿色(2C),长2～4 cm,常1～3朵,唇瓣处有黄绿色(151C)斑块。花期4月下旬至5月下旬。喜阴凉、湿润、通风。     

紫薇金叶品种金幌叶色变化响应高光照的生理特性

以紫薇品种金幌和粉晶为材料,对其由低光照[50～120μmol/(m~2·s)]转向高光照[1 200～2 000μmol/(m~2·s)]后168 h内叶片叶绿素含量、光合特性、叶绿素荧光参数、叶绿素合成前体物质含量及过氧化物酶活性等进行了测定和分析。结果表明:(1)与低光照相比,高光照处理168 h后,金幌叶片中叶绿素a、叶绿素b含量、超氧化物歧化酶活性、净光合速率和蒸腾速率显著低于粉晶。(2)在低光照时,金幌叶片中的5-氨基乙酰丙酸、胆色素、尿卟啉和粪卟啉等4种前体物质含量均显著高于粉晶,其中粪卟啉含量是粉晶中的2倍。(3)高光照处理168 h后,金幌叶片中非光化学猝灭(NPQ)参数值显著高于粉晶,而PSⅡ原初光化学效率(F_v/F_m)和非循环光合电子传递速率(ETR)则与粉晶差异不显著。说明金幌叶色变化的直接原因是叶绿素含量,特别是叶绿素b含量变化。叶绿素b含量的改变则是由于叶绿素合成前体物质,特别是粪卟啉的累积造成的。叶绿素含量的改变同时导致了金幌光合能力的降低及光合系统PS II的稳定性的改变。     

紫薇EST-SSR标记的开发与利用

以紫薇为试材,利用MISA软件对转录组测序获得45 308条unigenes中的SSR特征进行分析。结果表明:9 074条unigenes存在10 905个SSR位点,1 486条unigenes含有2个以上的SSR位点,550个位点是复合重复位点;从7 620个SSRs位点中设计出4 501对SSR引物;随机选择68对SSR引物进行检测,其中61对引物可以成功的扩增出清晰可用的条带,28对引物有多态性。