基于两类全基因组距离的EV71型病毒亲缘关系分析

[目的]了解世界各地EV71病毒的亲缘关系。[方法]下载了NCBI数据库所有EV71全基因组序列,以常用的Kimura 2-parameter距离和E距离进行距离矩阵邻接法建树。[结果]基于E距离和Kimura 2-parameter距离构建的进化树结果一致,2种方法均支持EV71进化树反映出的基于全基因组的病毒亲缘关系。[结论]E距离是病毒系统发育应用中另一种颇具潜力的新距离,能为鉴定EV71病毒亲缘关系提供支持。     

基于全基因组序列和E距离信息的CoxA16病毒亲缘关系分析

柯萨奇病毒A组16型(CoxsackievirusA16,CoxA16)病毒是引起手足口病(Hand,footandmouthdisease,HFMD)的主要病原体。为了解不同地区CoxA16病毒株的系统进化关系,收集了NCBI数据库中注释有具体地区分布的23条CoxA16全基因组序列,分别采用Kimura2-parameter法和E距离法对病毒株进行亲缘关系分析。结果表明,基于E距离的系统进化树最大程度地吻合了Kimura 2-parameter遗传距离法构建的系统进化树,且E距离法普适性较强,颇具应用潜力,为更精确地判断病毒株之间的进化关系提供了一条新途径。     

运用不同建模方法评估醇类lgK_(ow)及lgS_w

[目的]构建可靠的QSAR模型用于评价醇类化合物的毒性。[方法]利用MLR、SLR和SVR 3种方法研究60种醇类化合物辛醇/水分配系数lgKow和水溶解度lgSw这两个指标与mX的相关性。[结果]模型评估结果显示出MLR和SLR的建模能力与文献方法一样优异,SVR在具有合适核函数时其建模能力也能表现出优异的泛化推广能力。[结论]该研究可为QSAR模型的构建提供参考。     

哈尔滨市新型农业经营主体生产绩效研究

运用DEA数据包络分析模型测算哈尔滨市专业大户、农业合作社和龙头企业3种新型农业经营主体的生产绩效,包括生产玉米、大豆、水稻3种生产作物。通过建模分析得出3种新型农业经营主体的生产绩效存在明显不同,龙头企业的生产效率高于另外两种经营主体。对于玉米生产,主要原因包括技术效率和规模效率;对于大豆和水稻生产,技术效率差异是主要原因。生产技术的提高对于专业大户和农业合作社尤为关键。