局部根区灌溉水肥耦合效应的研究进展

综述了局部根区灌溉水肥耦合效应的研究背景、研究进展。局部根区灌溉水肥耦合在节水条件下可以提高作物对水分、养分的利用率,稳定作物产量,提高品质;有利于降低硝态氮的淋洗,增加耕层残留,增加被作物吸收利用的机会;有利于减少土壤气态氮挥发,防止对大气环境的污染。同时,该方式可以增加土壤微生物数量,提高土壤酶活性等。     

局部根区灌溉的植物生理效应

概述了局部根区灌溉的研究背景和理论基础,综述了局部根区灌溉对植物的水分利用、光合能力、植物生长发育等的影响,并对今后相关领域的工作进行了展望。     

内蒙古绒山羊皮肤KRTAPs表达谱与日照时长的相关性

【目的】研究绒山羊皮肤部分角蛋白关联蛋白(keratin-associated protein,KRTAPs)基因的表达谱及其与全年日照变化规律间的相关性。【方法】以3只周岁阿尔巴斯型内蒙古绒山羊体侧皮肤为样本,进行高通量转录组测序(RNA-Seq),对获得的部分KRTAPs基因一年内不同月份间的转录本进行表达丰度分析,并结合当地全年日照变化规律与RT-PCR试验方法,验证KRTAP24-1、KRTAP3-1、KRTAP8-1在关键节点月份的表达谱,确定全年皮肤KRTAPs表达丰度变化与日照变化规律间的相关性。【结果】Illumina solexa高通量转录组测序表明,内蒙古绒山羊全年皮肤部分KRTAPs基因的表达具有规律性差异。RT-PCR试验验证表明,部分基因表达谱与测序表达丰度具有一致性,并且基因差异变化规律与全年日照时长的变化具有相关性。【结论】全年日照时长由长变短(夏-冬)时皮肤KRTAPs表达丰度上调,日照时长由短变长(冬-夏)时皮肤KRTAPs表达丰度下调。     

转录组测序技术在生物学研究中的现状及展望

高通量测序技术在当前生物学研究中占据了越来越重要的地位,而转录组学的研究更是占据了很大区域。本文针对Illumnina测序对转录组测序的应用前景、发展概况以及存在的问题进行综述,并对Pacbio测序原理进行剖析,对Nanopore公司开发的MinlON四代测序进行展望,阐述整个转录组测序技术的发展。     

燕山绒山羊绒细与毛、绒性状间的相关、回归及通径分析

为探究燕山绒山羊毛、绒性状(产毛量、产绒量、毛细、毛长、绒长和绒厚)对绒细的影响,选取健康、年龄相近(2～3岁)的成年燕山绒山羊母羊共119只,利用Excel 2010和SPSS 26对该山羊各毛、绒性状进行了相关、回归和通径分析,并建立最优回归方程。结果表明,燕山绒山羊产毛量、产绒量、绒厚与绒细呈极显著正相关;毛、绒性状与绒细的最优回归方程为：Y=0.114X₁(毛细)+0.641X₂(绒厚)+0.346X₃(绒长)+7.712X₄(产毛量),其中毛细对绒细的直接作用最大,产毛量对绒细的间接影响最大。生产上,以羊绒细度为主要指标选育优质燕山绒山羊时,需同时兼顾毛细、产毛量等性状,以获得最优选育结果。     

基于高通量转录组测序阿尔巴斯型绒山羊绒毛生长周期差异表达基因分析

为研究绒山羊绒毛生长周期内皮肤基因表达规律以及皮肤差异表达基因的挖掘,采用Illumina HiSeqTM2000高通量转录组测序平台RNA-Seq技术,对3只成年雌性阿尔巴斯型内蒙古绒山羊全年12个月的皮肤样本进行转录组测序,将无参考基因组de novo拼接组装的unigene运用Nr,GO,COG以及KEGG数据库进行比对注释,并进行差异基因在全年各月份间的变化规律分析。结果显示,测序获得的unigene数为105 854条,比对注释基因55 541个,其中共有51 078条转录本进行了GO注释,21 189条转录本在COG数据库分析得到注释,26 201条预测基因KEGG数据库比对成功。其中皮肤基因GO注释在生物学功能分类中,细胞过程、代谢过程、生物学调控、生物功能调控以及刺激应答方面注释到的转录本比例最大;在分子功能分类中,结合以及催化活性作用方面注释到的转录本比例最大;通过COG数据库的比对注释,看到皮肤表达基因的同源蛋白功能主要集中在基因转录、翻译后修饰、和信号传导机制方面,反而在同工酶转运和代谢、细胞动力、二级代谢生物合成、转运和催化以及核结构方面注释到的基因极少;皮肤转录组数据与KEGG数据库比对,得到皮肤相关转录本较为富集的几条通路分别为MAPK signaling pathway,Wnt signaling pathway,Notch signaling pathway,Hedgehog signaling pathway,TGF-βsignaling pathway,JAK-STAT signaling pathway以及Focal signaling pathway;通过绒山羊不同月份皮肤转录组测序数据进行差异基因分析,得出绒山羊全年皮肤生长周期中基因差异变化规律为绒山羊全年皮肤共有4次较为剧烈的基因差异变化,第1次发生在2月与3月之间,第2次发生在3月与4月之间,第3次发生在6月与7月之间,第4次发生在10月与11月之间,前2次出现的基因差异变化较后2次剧烈得多,说明绒山羊绒毛生长启动时基因变化剧烈,而绒毛生长到休止时的皮肤基因变化较为缓和,是一个基因缓慢变化的过程。     

基于SWATH技术筛选影响乌珠穆沁羊肉品质的蛋白

为了研究影响乌珠穆沁羊肌肉品质的蛋白,通过IDA的方法对乌珠穆沁羊背最长肌与臀部肌肉进行蛋白全谱鉴定,1%假阳性条件下,共检测到蛋白质1003种。通过SWATH技术,差异倍数大于2或小于0.05作为阈值选取差异蛋白,获得背最长肌中高表达差异蛋白11个,其中7个与肌肉品质密切相关,这7个蛋白中Long-chain-fatty-acid-CoA ligase 1、Acyl-protein thioesterase 1、30Sribosomal protein S6、Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3通过影响脂肪沉积影响肌肉品质;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 1、Parvalbumin alpha通过影响几种氨基酸的变化,影响蛋白质组成,进而影响肌肉品质;Myosin-2heavy chain在背最长肌高表达,是决定肌纤维类型的重要蛋白,其通过影响肌纤维类型,决定肌肉品质。     

杜泊羊背最长肌中脂肪酸种类与含量分析

杜泊羊作为一种进口品种,因其胴体嫩、多汁、鲜、瘦而被国际誉为"钻石级肉"。为探讨杜泊羊肉中脂肪酸的含量随月龄的变化规律,本研究利用气相色谱质谱(GC-MS)技术对6月龄与12月龄杜泊羊背最长肌中36种脂肪酸的种类和含量及在脂肪酸中所含比重进行研究。结果显示,杜泊羊背最长肌共有36种脂肪酸,其中6月龄与12月龄的饱和脂肪酸含量单不饱和脂肪酸含量多不饱和脂肪酸,饱和脂肪酸以及长链脂肪酸含量在12月龄显著高于6月龄(P0.05),多不饱和脂肪酸的含量在12月龄极显著高于6月龄(P0.01)。C15:1,C17:0在不同月龄表达差异显著(P0.05),C18:2c6,C18:3n3,C20:3n3在不同月龄表达差异极显著(P0.01)。脂肪酸分析结果表明,12月龄杜泊羊的肌肉比6月龄营养价值高。     

内蒙古绒山羊TNFRSF1A基因shRNA表达载体的构建及鉴定

通过设计和合成TNFRSF1A基因的3条靶向shRNA,并分别插入到pSGU6/GFP/Neo载体中,成功构建出了3个干扰载体,通过脂质体介导法将干扰载体成功转入到内蒙古绒山羊胎儿成纤维细胞中,并利用Real Time PCR检测TNFRSF1A基因的表达量。由结果可知,TNFRSF1A基因的干扰载体经测序鉴定证明构建成功,干扰载体转染内蒙古绒山羊胎儿成纤维细胞24 h后可见绿色荧光表达,当到达48 h时,转染效率达到最大, shRNA-1、 shRNA-2、 shRNA-3三组中TNFRSF1A的mRNA表达水平均低于转染空载体的NC组,且shRNA2对TNFRSF1A的mRNA表达具有最佳的干扰效果。综上所述,该研究成功构建了TNFRSF1A干扰载体,为进一步研究绒山羊TNFRSF1A基因在毛囊生长与周期调控的作用奠定基础。