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禽流感病毒、新城疫病毒、猪瘟病毒和口蹄疫病毒多联RT-PCR诊断技术的建立 总被引:4,自引:0,他引:4
选择禽流感病毒(AIV)、新城疫病毒(NDV)、猪瘟病毒(CSFV)和口蹄疫病毒(FMDV)基因组序列高保守区,按照多联PCR引物的设计要求,利用DNAsis计算机软件设计并合成了4对特异性扩增引物,扩增片段大小分别为470、320、200和140bp。以AIV、NDV、CSFV和FMDV的培养物提取RNA并反转录,进行RT-PCR特异性扩增。结果表明,各单项RT-PCR扩增产物与设计的4对引物之间的序列大小一致。在分别建立了各病毒单项RT-PCR及AIV与NDV、CSFV与FMDV二联RT-PCR的基础上,进一步优化各种多联PCR扩增条件,成功建立了上述4种病毒的四联RT-PCR技术。经特异性和灵敏度实验证明,本方法具有高度的特异性和灵敏性,其灵敏度为10pg总RNA。在3h内即可完成样品的检测。 相似文献
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从水貂脑垂体中分离提取总RNA,经过RT—PCR分别扩增出水貂生长激素前体肽和成熟肽cDNA。PCR产物经凝胶回收纯化,克隆到栽体pGEM—T,然后转化感受态细胞DH5α。在含X—gal、IPTG的LB(Amp^ )平板上筛选阳性克隆,提取质粒作限制性酶切鉴定后,对目的片段进行测序。结果表明,RT—PCR扩增出的2个cDNA片段碱基数分别为713bp和780bp,用DNAsis2.5软件进行分析表明,此扩增序列与GenBank中发表的水貂生长激素cDNA100%相同。前体肽编码区由651bp组成,编码216个氨基酸,包括长度为29个氨基酸的信号肽;成熟肽的开放阅读框全长564bp,编码187个氨基酸,分子量约为21kDa。通过Blast比对,分析了与人、马、牛、猪、山羊、绵羊、猫、狗、大鼠和小鼠生长激素核苷酸序列的同源性。 相似文献
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非典型肺炎冠状病毒与其他动物冠状病毒的亲缘关系 总被引:1,自引:0,他引:1
非典型肺炎即重症急性呼吸综合征(severe acute respiratory syndromes,SARS),其病原目前被普遍认为是一种冠状病毒。本试验利用分子生物学计算机软件,首先对已在GenBank中发表的17株SARS病毒的主要结构蛋白基因S、M、N进行了定位,然后分别与已发表的其他冠状病毒的S、M、N基因进行同源性分析。结果发现,我国内地的5个SARS毒株的主要结构蛋白基因与其他冠状病毒的相对应基因的同源性普遍较低,而且变化范围较大。香港及国外的SARS毒株的情况恰好相反。从总体上看,SARS病毒与已发表的其他冠状病毒的亲源关系均较远,相对而言,与牛冠状病毒(BCV)、小鼠肝炎冠状病毒(MHV)的亲缘关系最近。这一结果对于SARS病毒的起源及流行病学研究乃至该病的预防和控制研究具有一定的参考价值。 相似文献
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