基于CRISPR/Cas系统的现场核酸检测技术

核酸检测技术在病原鉴定中发挥了至关重要的作用.传统核酸检测主要依赖聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)技术,但该技术难以满足便携式现场核酸检测需求.近年来发明的CRISPR/Cas生物传感技术可实现高灵敏度、高特异性、快速准确的现场核酸检测.本文重点探讨了CRISPR/Cas生物...     

应用两种策略克隆猪miRNAs let-7b及 let-7c

MicroRNAs（miRNAs）为一类大小约22个核苷酸的非编码小分子RNA，它们能通过与靶mRNA 的3′UTR（非编码区）完全互补导致mRNA降解，或不完全互补结合阻断mRNA翻译。研究表明，miRNAs在动植物的生长发育，免疫调节，病毒感染等过程中发挥了重要作用。本文分别利用构建小RNA的cDNA文库和RNA加尾、引物延伸RT-PCR克隆法从猪骨骼肌中鉴定了miRNAs let-7b和let-7c，并综合比较了这两种方法的优缺点，为推动猪miRNA的克隆鉴定提供了新的策略。     

一种简易快速鉴定动物组织总RNA质量的方法

通过一系列的对比实验发现,RNA电泳检测效果不仅与凝胶孔径大小和稀释与否相关,而且也与电泳时间长短和RNA上样量的多少有关。建立了一套可方便快捷地鉴定动物组织总RNA质量的方法,即在孔径宽度为7 mm的1.2% 琼脂糖凝胶上,仅需取3~5 μg 总RNA,加6×RNA上样缓冲液混合并用无RNase的灭菌双蒸水稀释到一定体积后上样,电泳15~30 min即可准确地鉴定RNA的质量。经实践证明,该方法实用性强,重复性好,具有良好的推广应用价值。     

恩施黑猪基因组群体遗传学参数的估计与选择信号研究

旨在调查恩施黑猪基因组群体遗传学参数与选择信号。本研究利用Porcine 80K SNP芯片,通过计算亲缘系数、近交系数、连锁不平衡程度与有效群体大小等群体遗传学层面的参数评估恩施黑猪种群结构关系,运用CLR和iHS方法检测恩施黑猪基因组选择信号,并通过生物信息学分析揭示其潜在受选择基因。亲缘系数计算发现,咸丰县恩施黑猪个体间平均亲缘系数为0.12;近交系数计算表明, 16%的样本近交系数大于0.125,存在明显近交累积。此外,本研究构建了恩施黑猪全基因组连锁不平衡图谱;利用连锁不平衡信息,恩施黑猪估计历史有效群体大小呈现逐代下降趋势,其中5世代前有效群体大小约为25头。基于CLR方法共检测到126个显著选择信号候选区域,总长约为51.6 Mb,占基因组总长的2.1%。利用iHS方法,共发现248个显著选择信号候选区域,长度约为78.78 Mb,约占基因组总长的3.2%。富集分析表明,与选择信号区域重叠的LPAR2、NDUFA13、MEF2B、AHR基因分别与胴体长度(滴水损失)、精子形成、骨骼肌分化和总产仔数相关。研究表明,现存恩施黑猪群体血统较窄,近交累积严重,有效群体大小较小,并呈现继续缩小的趋势。选择信号分析揭示的一系列潜在受选择基因能够为未来恩施黑猪的遗传改良提供一定的参考依据。     

应用两种方法克隆猪miRNA let-7b及let-7c

microRNA(miRNA)为一类大小约22个核苷酸的非编码小分子RNA,它们能通过与靶mRNA的3'UTR(非编码区)完全互补导致mRNA降解,或不完全互补结合阻断mRNA翻译.研究分别利用构建小RNA的cDNA文库和RNA加尾及引物延伸RT-PCR克隆法从猪骨骼肌中鉴定了miRNA let-7b和let-7c,结果显示这两种直接克隆法特异性高,对包含这2个miRNA的前体序列折叠后显示具有茎-环结构特征.其中猪的let-7b还未见报道,而let-7c克隆结果与预测的完全一致,通过克隆的方法证实了猪中的let-7b和let-7c,比较后认为这两种方法各有优缺点,为推动猪miRNA的克隆鉴定提供了新的策略.     

漫话猪转基因与基因组编辑

正0前言景阳冈上有棵树,树上挂了个牌儿:近因景阳冈猛虎伤人,但有过往客商,应结伙成队过冈,请勿自误。可见大多数人怕虎,以至于谈虎色变。如今,这个警示牌可能要挂到菜市场门口了,菜市场有什么可怕的?转基因。与其说是"怕",不如说是"不了解"。"转基因"这个词在今天看来更像是一个社会上通俗的称呼。我们搞不清"基因"是什么,但凡涉及到基因层面的动植物,就剑指"转基因",这很容易导致食品安全恐慌,也使得科学研究受     

猪肢蹄结实度评估方法的研究进展

在我国,由于栏舍、地板、营养、育种、疾病等因素的影响,猪的肢蹄问题愈加突出。肢蹄问题轻则影响母猪的生产,重则导致母猪淘汰,从而降低养殖生产效率和加大经济损失。因此,肢蹄问题的预防和度量在猪的育种和生产中具有十分重要的作用。猪的肢蹄结实度是度量猪的肢蹄问题的重要指标之一。猪的肢蹄结实度是指猪四肢的结实程度,被认为是肢蹄健康程度、结实程度、四肢运动协调程度的综合反映。衡量肢蹄结实度的方法较多,在屠宰测量中,可以使用观察关节软骨状况、测定肱二头肌的长度和质量来评估,在活体状态下,可以通过腿型评分、肢蹄结构评分、步态评分、骨密度测定、观察蹄甲损伤情况等方法来评估。该文对猪肢蹄结实度评估方法的研究进行综述。