胡枝子高质量RNA的提取及ALMT基因片段的克隆和表达分析

针对木本植物胡枝子组织中多糖、多酚等次生物质含量高的特点,采用改良的CTAB法,成功地从胡枝子组织中提取了总RNA。所提取的胡枝子总RNA OD260/OD280值介于1.9~2.1之间,产率介于100~250μg/g之间。采用该方法提取的胡枝子总RNA,经过RT-PCR成功地克隆到了胡枝子ALMT基因片段,克隆得到的胡枝子ALMT基因片段序列与已知ALMT基因序列之间具有较高同源性,经半定量RT-PCR和实时荧光定量PCR表达分析,证明该基因在根中表达且受铝诱导。试验结果表明利用改良的CTAB法提取的胡枝子总RNA样品质量较高,能够用于基因的半定量和定量表达分析。     

改良Trizol试剂法提取番茄成熟叶总RNA探究

Trizol法是一种简单有效的总RNA提取方法,但在抽提总RNA的过程中,RNA又会受RNase的影响而降解。基于此,以番茄成熟叶为材料,对传统的Trizol试剂法进行了改良,利用nanodrop微量分光光度计及普通琼脂糖凝胶电泳技术对总RNA的浓度和完整性进行了检测。结果表明改良Trizol试剂法提取的总RNA经微量分光光度计测定A260/A280值为1.9;电泳显示28S、18S和5S RNA三条带清晰可见。这些结果说明经改良Trizol试剂法提取的番茄成熟叶总RNA,纯度及质量均达到理想状态,能用于后续分子生物学实验。     

聚丙烯酰胺凝胶电泳的一种辅助辨型方法

聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE）是实验室常用的基本鉴定方法之一。但由于做胶方式以及各实验室仪器设备良莠不齐，经过一系列纷繁复杂的操作，电泳结果未必尽如人意。其中凝胶带型的判断就是一个较为困惑的问题，一般的聚丙烯酰胺胶跑出的条带总体上都有弧度，越是靠近凝胶两侧越是严重。在本实验中，我们设计了一种较为简单易行的方案，即将难以区分的条带样品做成混合样marker来辅助辨型，通过调整电压和凝胶浓度来达到区分条带的目的。我们用该方案可以将相差0～3bp大小的条带区分开来。     

棉花miRNA表达量检测方法Stem-loop RT-PCR的建立

为建立一套鉴定棉花miRNA表达丰度的分子技术,优化了Stem-loop RT-PCR方法,并通过分析棉花3个miRNA的表达谱来评价分析该技术体系的特性。首先设计3条引物(茎环特异性反转录引物、正向引物和通用反向引物),通过cDNA和RNA梯度稀释,分析引物的扩增效率和检测灵敏度。结果表明,Stem-loop RT-PCR方法中设计的引物具有较高的扩增效率和检测灵敏度,miR156和miR159扩增效率分别为102.0%和103.6%;并对不同miRNA分析其总RNA检测灵敏度,miR156和miR159的总RNA检测灵敏度差异较大,分别为20 ng和2 pg。同时,应用建立的棉花Stem-loop RT-PCR方法,成功地分析了Gh-miR156、Gh-miR159和Gh-miR5658在根茎叶中的表达量。由此可见,棉花Stem-loop RT-PCR方法具有灵敏度高、特异性强、成本较低和适用于一般实验室等优点,为棉花等植物miRNA相关研究提供了技术保证,加快了miRNA及其调控基因功能的研究步伐。     

十字花科黑腐病菌RNA提取与质量鉴定

十字花科黑腐病菌,学名野油菜黄单胞菌野油菜致病变种（Xanthomonas campestris pv.campestris,简称Xcc）,是一类γ-变形菌纲的革兰氏阴性细菌,能在世界范围内侵染十字花科植物,给农业生产造成重大损失。RNA是分子生物学的主要研究对象之一,提取高质量的RNA是研究十字花科黑腐病菌基因表达调控机理的基础。由于Xcc能产生大量胞外多糖及黄单胞色素,且细菌RNA半衰期较短,目前尚缺少一种大量提取Xcc高质量RNA的有效方法。该研究在参考多种RNA提取方法的基础上,建立了一种简单、有效的适合十字花科黑腐病菌RNA的提取方法。得到的RNA样品经过紫外分光光度法和甲醛变性凝胶电泳检测,证实为完整、均一的总RNA,达到了表达谱分析及cDNA文库构建的要求。     

自制的可升降两用电泳器及辅助装置

本文介绍一种自行设计和制造的垂直式可升降的柱型与板型两用电泳器及辅助装置。电泳器由可活动的上槽和下槽组成。上槽板底有孔,可装置柱型凝胶,两侧可装置平板凝胶。辅助装置有供灌胶时保持玻柱和板框垂直的支架,为加速成层胶聚合所需强光的萤光灯架及谱带观察装置等。     

山羊IL-2基因cDNA的克隆、鉴定及序列分析

根据GenBank发表的山羊（Capra hircus)IL-2基因序列，设计了一对引物。以ConA刺激的外周血淋巴细胞为材料用RT－PCR的方法。从总RNA中扩增出山羊IL－2基因。琼脂糖电泳显示扩增片段约为500bp。分离纯化片段，克隆入表达质粒pBV220，经酶切鉴定，测序结果显示，克隆的山羊IL－2基因与GenBank上发表的序列一致。该序列与绵羊（Ovis aries)和牛(Bas taurus)的IL－2基因序列同源性最大，在96％以上，氨基酸和抗原性比较分析认为，山羊IL－2与绵羊及牛的IL－2在这两方面有较大的同源性。     

山药组织总RNA提取方法的比较与分析

采用异硫氰酸胍一巯基乙醇联合变性法、Trizol法和CTAB—LiCl法等3种方法,分别对山药叶片和块茎进行总RNA提取效果进行了比较。结果表明,Trizol法难以提取RNA,异硫氰酸胍-巯基乙醇联合变性法提取RNA效果不理想,存在DNA污染,这2种方法不适合于富含多糖类物质的山药组织总RNA的提取;CTAB-LiCl法提取叶片和块茎组织总RNA质量高、完整性好、成功率高,可作为山药类植物总RNA提取的首选方法。     

四种类型竹种竹叶总RNA提取方法的比较研究

为探索适合不同类型竹种竹叶总RNA的提取方法,本研究选取合轴丛生型竹种勃氏甜龙竹、合轴散生型竹种云南箭竹、单轴散生型竹种毛竹、复轴混生型竹种巴山木竹为代表,提取其心叶的总RNA,通过琼脂糖凝胶电泳检测RNA的完整性,利用超微量紫外分光系统检测RNA的纯度和浓度,比较自配TRIzol试剂法、商品化TRIzon试剂法、RNA提取试剂盒法、改良十六烷基三甲基溴化铵（CTAB）法四种方法提取的竹叶总RNA的质量、纯度和提取成本的差异。结果表明,自配TRIzol试剂法可以提取出质量好、浓度高的竹叶总RNA,且提取成本较低;商品化TRIzon试剂法提取的总RNA质量及浓度仅次于自配TRIzol试剂法,提取成本稍高;而RNA提取试剂盒法和改良CTAB法无法提取出高浓度的竹叶总RNA。本研究结果为竹类植物更深入的分子生物学研究提供了一定的基础,并为其他竹类植物总RNA的提取提供了参考依据。     

转HBsAg基因樱桃番茄组培苗叶片总蛋白双向电泳体系的建立

建立转乙肝表面抗原(HbsAg)基因樱桃番茄组培苗叶片的蛋白质组双向电泳体系,为转基因番茄的蛋白质组学研究提供技术参数。比较转HBsAg基因的樱桃番茄与野生型在不同蛋白裂解液、不同蛋白上样量及不同等电聚焦程序下,叶片总蛋白的双向电泳结果差异。以裂解液Ⅲ制备叶片总蛋白,采用一向13cm、pH3-10L IPG胶条,二向12.5%的SDS-PAGE凝胶,单次上样120μg叶片总蛋白,聚焦程序Ⅲ,银染时,可以得到最理想的双向电泳分析结果。在此操作程序下,野生型樱桃番茄叶片蛋白双向电泳最多可识别699个蛋白点,而转基因型樱桃番茄叶片蛋白双向电泳最多可识别545个蛋白点,其中有368个点匹配,选取丰度百分比差异2倍以上蛋白点25个进行质谱鉴定,16个蛋白点成功鉴定。本研究建立的转HBsAg基因番茄植株叶片总蛋白的双向电泳体系可为以番茄试管苗为材料进行的蛋白质组学研究提供技术支持。     

一种适用于提取香蕉果肉RNA的方法

介绍一种适用于提取富含多糖和酚类物质的香蕉果肉总RNA的方法。此方法可用于从不同成熟度的果肉中提取总RNA。经紫外分光光度法检测和1％琼脂糖变性凝胶电泳分析，结果表明，所得样品RNA具有较好的完整性，较高的纯度和产率，可满足RT—PCR研究要求。     

猪肌肉组织双向电泳分离条件的建立及常见问题分析

为建立和优化猪肌肉组织蛋白质双向电泳技术,从提取方法、加样量、IPG胶条的选择、SDS-PAGE胶浓度、染色方法等多个方面对双向电泳分离效果进行比较研究.结果显示,液氮研磨+超声破碎法提取猪肌肉组织蛋白效果优于液氮研磨法,前者细胞破碎彻底蛋白质溶解性好且核酸污染少,图谱质量较好;18cm pH 4～7的IPG胶条分离效果比pH 3～10非线性IPG胶条好;对于银染,18 cm pH 4～7的IPG胶条150μg上样量比较适宜;同一肌肉样品的三块胶的重复性可达70％以上;同时,对双向电泳过程中的典型问题作了详尽分析.研究结果表明,通过优化的双向电泳条件获得了较高分辨率和较好重复性的猪肌肉组织双向电泳图谱,可用于后续蛋白质组学分析.     

Capillary electrophoresis is essential for microsatellite marker based detection and quantification of adulteration of Basmati rice (Oryza sativa)

Microsatellite markers are employed for genotyping of Basmati varieties and assaying purity of market samples. However, employment of diverse electrophoresis techniques across laboratories has resulted in inconsistent allele sizes, creating doubts about the suitability of the assay. This study evaluated agarose gel electrophoresis, slab gel electrophoresis, and capillary electrophoresis techniques for their efficiency in the detection and quantification of adulteration in Basmati samples. Comparative analysis across 8 microsatellite loci in 12 rice varieties demonstrated that the capillary electrophoresis method showed less error (+/-0.73 bp) in the estimation of allele sizes compared to slab gel (+/-1.59 bp) and agarose gel (+/-8.03 bp) electrophoretic methods. Capillary electrophoresis showed greater reproducibility (<0.5 bp deviation) compared to slab gel (1 bp) and agarose (>3 bp) based methods. Capillary electrophoresis was significantly superior in quantification of the adulterant, with a mean error of +/-3.91% in comparison to slab gel (+/-6.09%). Lack of accuracy and consistency of the slab gel and agarose electrophoretic methods warrants the employment of capillary electrophoresis for Basmati rice purity assays.     

鱿鱼与白鲢鱼混合比例对鱼糜制品凝胶特性的影响研究

为了改善鱿鱼与白鲢鱼混合鱼糜制品的凝胶特性,本研究通过鱼糜制品的感官评价、凝胶强度、持水性、白度、水分分布、肌原纤维蛋白凝胶电泳和光学显微镜观察等指标,分析鱿鱼与白鲢鱼混合比例对鱼糜制品凝胶特性的影响。结果表明,当鱿鱼与白鲢鱼混合比例为3∶4时,凝胶特性最好,其中鱼糜凝胶的凝胶强度及持水性较混合比例为5∶2时分别提高了42.74%和2.93个百分点;感官评价总分、白度值显著高于其他混合比例（P<0.05）,分别为76.3和72.3,不易流动水相对含量显著高于其他混合比例（P<0.05）,且该比例下鱼糜凝胶网络结构致密均一,对水分的束缚能力强。肌原纤维蛋白电泳结果显示,混合比例为3∶4时,肌球蛋白重链交联程度高,形成了大分子聚集体。综上,当鱿鱼与白鲢鱼混合比例为3∶4时,可明显改善混合鱼糜制品的凝胶品质。本研究结果为提高鱿鱼鱼糜制品的凝胶品质及生产研发提供了一定的理论依据。     

小麦幼穗蛋白质双向电泳条件的优化

本研究以温光敏小麦为试材,用TCA/丙酮和酚提取法提取小麦幼穗蛋白样品,进行了双向电泳优化分析,并对双向电泳过程中出现的问题进行了讨论。结果表明,用TCA/丙酮法提取小麦幼穗蛋白质其产率（浓度）高于酚提取法。SDS-PAGE电泳显示,用TCA/丙酮提取法提取的蛋白质能获得较清晰条带,分辨率较高,而酚提取法提取的蛋白质其条带模糊,分辨率低。对蛋白质纯化除盐可以提高分辨率,减少横竖纹,获得背景清晰的圆形蛋白点。通过ImageMasterTM 2D Platinum5.0软件分析凝胶图谱,结果显示纯化后可降低噪点,纯化后蛋白点数可从未纯化蛋白点数的216增加到583。显然,采用TCA/丙酮法可获得高浓度高质量的蛋白质,而进一步纯化、除盐离子可进一步获得背景清晰可高重复性的电泳图谱。在双向电泳实验过程中,观察到一些异常缺陷胶的出现,如双向电泳图谱中蛋白点扩散,蛋白聚集形成斑点串,没有点或点很少,出现纵纹横纹及图谱扭曲等影响图谱质量的严重问题,本研究对这些问题做了分析并提出了解决方案。     

Simple rapid procedure for preparation of large quantities of ovalbumin

A simple rapid procedure for preparation of large quantities of highly purified homogeneous ovalbumin from egg white by using an anion exchanger is described. It is based on the principle of frontal chromatography. The volume of "mucin-free" egg white loaded onto the column was determined in order to exceed resin capacity. Thus, competition between proteins for resin sites was created. Owing to its high negative charge density, ovalbumin drives other egg white proteins from the column progressively. Two hundred and fifty milliliters of Q-Sepharose FF gel eluted isocratically with 0. 5 M NaCl extracted 9.55 g of ovalbumin with a purity rate of 83%. A 6.75 g amount of ovalbumin, with a purity rate of 94%, was recovered with an isocratic elution program using 0.14 M NaCl. Purified ovalbumins were compared by electrophoresis and analytical chromatography with other ovalbumin preparations.     

Rapid PCR-based method for the direct analysis of fungal communities in complex environmental samples

Fungal community analysis using 18S rDNA primer pairs and denaturing gradient gel electrophoresis of PCR products (Vainio, E.J., Hantula, J., 2000. Mycological Research 104, 927–936) was applied to field studies of the forest ecosystem. We report a DNA extraction method producing high quality DNA allowing successful PCR amplification from problematic samples without use of nested polymerase chain reaction (PCR) procedures. The analysis was found to be applicable for samples from environments of varying fungal diversities and high organic matter content: wood samples from fallen branches of trees, laboratory mini-ecosystems and forest humus samples. When the method was tested using replicate forest soil samples, it was shown to be highly reproducible.