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为分离纯化奶牛腐蹄病坏死杆菌,分析其与其他菌株的亲缘关系,本研究利用坏死杆菌白细胞毒素特异性引物,对奶牛腐蹄病病牛蹄部拭子样品进行了PCR检测,利用厌氧培养基对PCR检测阳性样品进行了坏死杆菌的分离培养,以分离的坏死杆菌基因组DNA为模板,对白细胞毒素基因进行了克隆和序列分析。结果显示,9份奶牛腐蹄病病牛蹄部拭子样品PCR检测结果均为阳性,对其中一份样品中的坏死杆菌进行分离培养,获得了纯培养物,命名为bFR13-1。坏死杆菌bFR13-1菌株白细胞毒素基因测序结果显示,与GenBank已发表的H05、A25和B35菌株的白细胞毒素基因在核苷酸水平的同源性分别为98.40%、98.35%和90.79%,推导氨基酸的同源性分别为97.7%、97.6%和89.0%。进化树分析结果显示,坏死杆菌bFR13-1菌株白细胞毒素与H05菌株的同源性最高,bFR13-1菌株与H05菌株和A25菌株呈较近亲缘关系。结果表明,不同坏死杆菌分离株的白细胞毒素呈现一定的变异性,这种变化是否与坏死杆菌致病性相关,值得深入研究。 相似文献
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为了调查黑龙江牡丹江地区犬博卡病毒流行情况,在2014年5月至2015年4月,在黑龙江牡丹江地区采集40份腹泻犬的粪便拭子样品,利用PCR扩增方法进行鉴定和混合感染检测,进一步做进化树进行分析。检测结果显示,在40份样品中,8份样品为CBoV阳性(20%,8/40);在8份CBoV阳性样品中,与CPV-2、CCoV、CaKV混合感染率分别为37.3%(3/8)、25%(2/8)、25%(2/8)。序列分析表明,8个CBoV毒株的NS1片段在核苷酸水平的同源性为94.2%~100%,在氨基酸水平的同源性为91.7%~100%。进化树分析显示,与韩国、美国、德国和中国香港的CBoV毒株相比,8个中国CBoV毒株表现出遗传多样性。研究揭示了黑龙江牡丹江地区流行的CBoV毒株显示出遗传多样性以及与其他肠道病毒的混合感染情况。 相似文献
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