荷斯坦奶牛妊娠早期血浆差异蛋白质组学研究

采用二维凝胶电泳(2-DE)结合MADIL-TOF-TOF串联质谱法对荷斯坦奶牛妊娠早期血浆进行蛋白质组学分析鉴定,发现了6种差异蛋白在妊娠后表达量上调,分别是凝集素1前体、转甲状腺素蛋白前体、3,5-二碘水杨酸络合的牛血清白蛋白的晶体结构的A链、白蛋白、未命名蛋白产物及结合珠蛋白-25同源物1前体。对这6种蛋白在不同时期含量的变化趋势及可能引起每种蛋白含量变化的原因和在妊娠过程中的功能进行了分析。     

植物磷酸化蛋白质组研究进展

在介绍磷酸化蛋白富集技术和质谱技术的基础上,综述了近年来磷酸化蛋白质组的研究进展,并对其研究前景进行了展望。     

野牛草种子蛋白质双向电泳体系的优化

通过对野牛草种子蛋白双向电泳蛋白样品制备方法、等电聚焦程序以及固化胶条pH范围优化筛选,构建了适合其植物种子蛋白组研究的电泳体系。实验结果表明,使用Trizol法制备样品,可得到高纯度种子蛋白,结合使用pH4～7IPG胶条,以及优化的聚焦程序Ⅲ,能获得高分辨率、重复性好的蛋白质2-DE图谱。图像分析表明,银染后可以检测到600个以上蛋白点,其等电点主要分布于pH4～7区域,分子量主要分布于10～120kDa之间。     

基于组学的作物杂种优势研究进展

杂种优势,又称杂种活力,是指来源于物种内不同品种或者不同物种间杂交后代在生物产量、生长势以及育性等方面均优于亲本的现象。目前对于杂种优势形成的遗传机制一直停留在假说层面。分子标记技术的飞速发展为杂种优势的遗传机制研究提供了新的途径,在不同作物中,已证实显性、超显性和上位性效应对杂种优势的形成均有贡献。随着基因组、转录组、蛋白组等多组学技术及表观遗传学技术的兴起,为在全基因组水平研究杂种优势提供了机会,更有利于从不同角度对杂种优势形成的遗传基础进行全面解析。本研究从杂种优势位点定位,杂交种相对于亲本的转录组水平,蛋白质水平及表观调控改变等方面进行了概述,为全面深入理解杂种优势及更好地研究、利用杂种优势提供帮助。     

不同环境温度条件下双峰驼血浆蛋白质组学差异

根据不同环境温度条件下双峰驼血浆中蛋白表达的差异,探讨环境高温对双峰驼的差异蛋白在环境适应性中的作用机制。采用二维凝胶电泳（2-DE）结合MADIL-TOF-TOF串联质谱的方法对环境高温双峰驼的血浆进行蛋白质组分析鉴定。结果显示,4种蛋白的表达上调,分别是免疫球蛋白重链的恒定区,结合珠蛋白,载脂蛋白AIV,纤维蛋白原β链前体。1种蛋白的表达下调即血清白蛋白。结果表明,环境高温引起内分泌系统变化,从而使一些蛋白的表达发生变化。这些蛋白主要与机体急性期应答、免疫反应、物质运输及物质代谢等相关。     

健康奶牛与临床型乳腺炎奶牛乳腺线粒体蛋白组差异表达分析

运用亚细胞蛋白质组学的研究策略,分离纯化亚细胞结构再进行蛋白质组学研究,可提高低丰度蛋白在双向凝胶电泳中的检出率。通过对比分析乳腺炎奶牛乳腺与正常奶牛乳腺线粒体蛋白质组的表达变化,为奶牛乳腺炎的生物学治疗及抗病育种工作筛选出目基因和蛋白。超速离心法分离线粒体,双向凝胶电泳分离蛋白,PDQuest7．4软件分析差异蛋白斑点,高效液相色谱串联离子阱质谱鉴定差异蛋白。从奶牛乳腺线粒体蛋白2-DE图谱中筛选出17个差异表达的蛋白质斑点,质谱鉴定出17个差异表达蛋白（6个蛋白在奶牛乳腺炎发生过程中下调,8个上调,1个只在正常情况下表达,2个只在乳腺炎乳腺组织中表达）。筛选出的差异蛋白质涉及到细胞的能量代谢、蛋白质合成、mRNA的加工成熟及调亡调控等许多方面,表明奶牛乳腺炎发生时乳腺线粒体组织结构和代谢状态都发生了明显的变化。     

不同限饲方法对AA肉仔鸡生产性能及其经济效益的影响

1材料与方法1.1试验动物本试验选用960只1日龄AA肉仔鸡,随机分为对照组(自由采食组)、限25%蛋白组(限蛋白组)、限25%能量组(限能量组)和限25%饲料采食量组(限采食量组),每组各须重复,每个组重复80只,公母混养。1.2试验饲料本试验饲料采用玉米-豆粕型日粮,限饲期(7～14日龄)饲料     

烟草根系在青枯病菌侵染早期的蛋白组分析

烟草青枯病是一种由茄科雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum)引起的毁灭性土传病害。为研究烟草根系在青枯菌侵染早期的抗性机理,本研究以抗青枯病品种D101为材料,对接种青枯菌3 h后的烟苗根系进行了蛋白组学分析。结果显示,与未接种的对照比较,青枯菌侵染早期的烟草根系中存在相当比例的差异表达蛋白,但蛋白表达水平的变化幅度总体上不高。在P值小于0.05和变化倍数大于1.2的标准下,筛选到63个差异表达蛋白。对这些蛋白进行基因本体(gene ontology,GO)和KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)路径分析发现,烟草根系对青枯菌侵染的早期抗性主要涉及具有杀菌作用的次生代谢物(如木脂素)的合成,能够杀菌和诱导系统抗性的亚磷酸盐的合成,以及活性氧毒性物质(如过氧化氢)的消除方面的生物学过程和路径。本研究结果为深入研究烟草及其它茄科植物抗青枯病的分子机制提供了有价值的线索,也可为烟草青枯病抗性分子育种提供参考。     

水稻灌浆过程中旗叶和倒二叶的蛋白质差异表达分析

 水稻叶片的光合作用在确定最终的水稻产量中发挥着重要作用,其决定了水稻约70%的产量。但是,从蛋白质水平对水稻叶片如何影响产量方面的研究十分有限。为了从分子水平揭示水稻叶片的功能,文章以水稻品种kasalath为材料,利用蛋白质组的差异表达手段,对水稻剑叶和倒二叶进行了研究。通过比较蛋白质组学方法,作者发现一些有趣的现象。处于同一阶段的旗叶与倒二叶相比,蛋白水平上未表现出特别明显的差异,表明二者可能有相同的功能。然而,当比较灌浆过程中处于不同发育阶段的叶子时,他们显示出一些显著不同的蛋白质斑点,尤其在等电范围接近7的地方,这些蛋白点在阶段7大量存在,而在阶段9则消失。质谱分析表明,这些蛋白点均属于核酮糖二磷酸羧化酶大亚基,其功能是光合作用中二氧化碳的同化和光呼吸的碳氧化。这种蛋白质组的动态表达表明水稻在早期的灌浆中主要依赖于该酶进行碳水化合物生产,而在灌浆后期快完成时,该酶则会消失。     

全蛋白组水平预测旋毛虫分泌蛋白及其功能分析

从蛋白组水平预测并分析旋毛虫分泌蛋白的特征。利用软件预测旋毛虫蛋白组范围分泌蛋白,并统计和分析其序列特征,最后利用数据库信息注释分析分泌蛋白功能。结果:预测得到414个经典途径分泌蛋白和245个非经典途径分泌蛋白,占蛋白组2.40%。MEME统计经典分泌蛋白信号肽中存在可能的3个基序。氨基酸组成分析表明,旋毛虫分泌蛋白及其信号肽主要由疏水性氨基酸组成,而信号肽剪切位点主要由亲水性氨基酸组成,信号肽剪切位点-3和-1两个位点氨基酸保守性高,可能是相关酶识别关键点。在对分泌蛋白的功能进行注释分析中发现,与核酸酶活性和蛋白酶活性相关的蛋白比例较高。研究结果为旋毛虫致病机制的深入研究提供理论基础。