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宽皮柑橘单核苷酸多态性的高分辨率熔解曲线分型 总被引:4,自引:1,他引:3
高分辨率熔解曲线分析(High resolution melting analysis,HRM)可以检测单碱基改变引起的DNA双链熔解温度(Tm)值变化,从而可以对样本在单核苷酸多态性分子标记(Single nucleotide polymor- phism,SNP)上进行基因分型。通过分析NCBI数据库中宽皮柑橘的表达序列标签(Expressed sequence tag,EST)数据鉴别SNP位点,并用小片段扩增法高分辨率熔解曲线分型技术(High resolution melting analysis of small amplicons)分析11个宽皮柑橘(Citrus reticulata)品种以及柳橙(Citrus sinensis Osbeck var.‘Liucheng’)的5个SNP位点的基因型。结果显示,小片段扩增法高分辨率熔解曲线分型可以快速、清楚地分辨纯合与杂合基因型,在校正温度差异后也可以很好地分辨同一个SNP位点不同的纯合型。统计分析表明样本在所有SNP位点上均存在多态性,5个SNP位点的平均多态性信息含量(PIC)为0.3190,显示样本在这组SNP位点上具有较高的杂合率。 相似文献
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为分析黄龙病(Citrus Huanglongbing,HLB)病菌侵染对茶枝柑(Citrus reticulata cv. chachiensis)果实品质的影响,采用高效液相色谱法和气相色谱-质谱联用技术,分析了花后180 d感病与正常茶枝柑果实中类黄酮物质和挥发性物质的差异。结果表明:茶枝柑感染黄龙病病菌后,果皮中橘皮素等4种聚甲氧基黄酮以及α-蒎烯、辛醛等39种挥发性物质含量显著升高,而氮甲基邻氨基苯甲酸甲酯、胡椒烯等16种挥发性物质显著降低;果肉中川陈皮素等2种聚甲氧基黄酮及D-柠檬烯、β-芳樟醇等27种挥发性物质含量显著降低。因此,黄龙病病菌侵染可能会显著影响茶枝柑果皮和果肉中的次生代谢,进而改变其苦味和香味品质,其改变可能与其感病防御应答机制有关。 相似文献
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玻璃化法超低温保存荔枝胚性悬浮细胞 总被引:3,自引:0,他引:3
研究荔枝(Litchi chinesis Sonn)胚性悬浮细胞玻璃化法超低温保存的一些因素,建立玻璃化法超低温保存荔枝胚性悬浮细胞的冻存程序:继代培养3 d的胚性悬浮细胞,在含有O.4 mol/L山梨醇培养基上预培养2 d后,先在室温下用60%玻璃化溶液(PVS2)装载15 min,再用PVS2于0℃下处理15~20 min,换1次新鲜的PVS2溶液后.迅速投入液氮,保存24 h后,在40℃水浴中快速化冻,用1.2 mol/L蔗糖培养液洗涤2次,经TTC检测,相对存活率达到27.1%. 相似文献
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对香蕉束顶病毒(BBTV)广州分离物MGH DNA组分6全序列进行了克隆及序列分析。并对来自广州、海南、台湾、澳大利亚及印度的BBTV组分6进行了分析,结果表明:BBTV组分6都含有CR-SL(stem-loopcommon regions),CR-M(major common regions)结构等典型的特征序列。BBTV组分6的核苷酸全序列、开放阅读框(ORF)核苷酸、CR-M核苷酸序列及其氨基酸序列系统进化树结果显示,BBTV分离物可分为2个组群:亚洲组和南太平洋组。CR-M结构在2个组群间有明显的差异,南太平洋组分离物的CR-M结构中有一段不完全保守的16个核苷酸的重复序列,而在亚洲组的分离物中这个序列并不重复。对BBTV组分6蛋白质进行了二级结构预测和理化性质分析发现,这2个类群蛋白质的二级结构有差异,但是理化性质无明显差异。 相似文献
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菠萝种质鉴定及亲缘关系的AFLP分析 总被引:3,自引:1,他引:2
从FISH-AFLP试剂盒(PSTI/MseI型)64对引物中,筛选出8对AFLP选择性引物P-GAA/M-CTA、P-GAC/M-CTG、P-GAC/M-CTT、P-GAG/M-CAT、P-GAG/M-CTA、P-GAT/M-CAT、P-GAT/M-CTA、P-GAT/M-CTC,对39份菠萝种质进行了AFLP分析,都得到了清晰的多态性指纹图谱。8对引物共获得454个遗传位点,其中多态性位点332个,多态性比例平均为73.1%。UPGMA聚类表明,各种质间的相似系数为0.73~0.98,说明39份菠萝种质遗传关系相对较近。依相似系数0.80的水平,将供试的39份菠萝种质分为4类。研究结果可以作为菠萝分类的理论依据和基础。 相似文献
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奥兰柚是由二倍体无酸柚和四倍体白子葡萄柚杂交获得的三倍体柚品种,广东省农科院果树研究所于1996年从以色列引进,先后在广州、阳山、梅州等地进行种植试验。表现出树形开张,树势壮旺,适应性较强,丰产性较好;成熟期特早,8月下旬至9月上旬成熟;平均单果重489.3g,果形扁平或圆形,端正,果皮绿色,有光泽;果实无子,果肉柔嫩,汁多,化渣,风味良好;可溶性固形物含量11.5%,总糖含量8.26%,可滴定酸含量0.55%,维生素C含量49.2mg/100g,固酸比高。 相似文献