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根据GenBank登录的猪细小病毒NADL-2株和China株序列,利用Oligo 6.0软件设计1对扩增NS1全基因的特异性引物,对从贵州省安顺地区检测到的PPV的NS1基因进行扩增、克隆、测序、序列分析和蛋白质结构预测分析。测序结果表明,扩增的目的基因长度为1986 bp,共编码659个氨基酸,其中NS1基因的1287、1288和1298位碱基发生了缺失,导致429、430和433位氨基酸发生缺失。系统发生树结果表明,本试验测序的NS1基因与NADL-2弱毒株处在同一进化分支;氨基酸同源性与NADL-2弱毒株和Kresse毒株最高,均为98.6%。蛋白质结构预测分析结果表明,非结构蛋白NS1的分子质量为75269.76 u,理论等电点pI为7.25,不稳定系数为41.57,推测其为不稳定蛋白质;脂肪指数为73.58,总体平均亲水性为-0.565,推测该蛋白质是一种亲水性蛋白质;该蛋白质含有丰富的α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规则卷曲,柔性区域较多,呈连续分布;非结构蛋白NS1无跨膜区和信号肽;预测非结构蛋白NS1含有3个N-糖基化位点、3个cAMP和cGMP依赖性蛋白激酶磷酸化位点、5个蛋白激酶C磷酸化位点、22个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、1个酪氨酸激酶磷酸化位点、8个N-肉豆蔻酰化位点、1个酰胺化位点及1个ATP/GTP结合位点基序A(P-环);该蛋白质抗原表位较多,存在10个主要的抗原表位。 相似文献
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猪流行性腹泻病毒基因及其疫苗的研究 总被引:2,自引:0,他引:2
猪流行性腹泻是由猪流行性腹泻病毒引起猪的一种急性肠道传染病.该病由猪流行性腹泻病毒感染猪而引起,以发热、厌食、水样腹泻、呕吐、严重脱水、消化道黏膜发炎及糜烂和食欲下降为主要特征,俗称冬季拉稀病.该病已成为世界流行性的疾病,是各养猪国家导致仔猪早期死亡的重要疫病之一,给养猪业造成严重的经济损失.近几年来,随着分子生物学的发展,人们对猪流行性腹泻病毒的基因结构、基因功能、分子致病机理,检测手段以及疫苗预防方法有了更深入的认识.而对猪流行性腹泻的预防和控制以接种疫苗为主,笔者主要针对猪流行性腹泻病毒基因结构、功能以及疫苗等方面的研究进展进行综述,为猪流行性腹泻病毒基因的深入研究和预防提供一些参考. 相似文献