牛脂联素基因cDNA克隆

应用RT-PCR方法先提取成牛肝脏外部脂肪和犊牛大网膜前脂肪细胞培养物(第13日龄)总RNA,先后扩增出ADPN cDNA的501 bp片段基因,分别克隆到载体PMD18-T中,构建重组载体PMD18-T/牛ADPN1和PMD18-T/牛ADPN2。筛选出阳性克隆,通过限制性内切酶酶切鉴定和重组质粒PCR鉴定后对其进行测序。结果表明：ADPN1和ADPN2 2次测序结果完全一致；从脂肪组织总RNA中扩增得到501 bp片段ADPN基因,其cDNA序列与GenBank牛ADPN基因序列同源性为85%,其氨基酸同源性为96%。     

金钗石斛花芽cDNA表达文库的构建及鉴定

 cDNA文库是分离、筛选基因的重要平台。利用SMARTTM cDNA library construction技术, 成功构建了金钗石斛花芽cDNA表达文库。结果表明该文库的克隆数为3.02 ×10⁵ pfu, 插入片段的大小在0.5～2.5 kb范围, 插入片段的重组率接近100% , 说明所构建的cDNA文库质量较好。该文库的构建为克隆与金钗石斛花芽分化相关功能基因奠定了基础。     

小麦条锈菌cDNA文库构建和表达序列标签(ESTs)分析

 小麦条锈菌(Puccinia striiformis f. sp. tritici)是全世界范围内小麦生产上的重要病原真菌, 但是对小麦条锈菌的基因组和基因功能却了解甚少。为了促进小麦条锈菌基因组学的发展和大规模基因发现, 我们以噬菌体λTrip1Ex2为载体, 采用SMART技术构建了小麦条锈菌萌发夏孢子的cDNA文库。原始文库的滴度为1.1×10⁶pfu/mL, 平均插入片段长度为750 bp。从文库中随机挑取279个cDNA克隆测序, 分析发现这些ESTs的平均GC含量为45.08%。通过聚类分析, 279个ESTs拼接成31个contigs和80 singletons。BLASTx分析表明, 47%的ESTs与GenBank中报道的功能已知或未知蛋白具有相似性。tBLASTx分析表明12个uniseqs与EST数据库中的序列具有相似性, 其中9个是来自担子菌的cDNA文库。几个EST与已知的真菌致病相关基因具有高度相似性。RT-PCR分析了几个基因在小麦条锈菌侵染过程中的表达水平。这些结果为小麦条锈菌夏孢子萌发以及侵染寄主过程中的基因表达研究奠定了很好的分子生物学基础。     

一种来自鹌鹑的同源异型盒基因qBm-1及其应用

内容介绍：本发明提供一种从鹌鹑胚胎cDNA文库中筛选得到的基因qBm-1和该基因编码的转录调节因子、含有上述基因序列的重组载体及其亚克隆和重组微生物．以及由这些亚克隆获得的反义探针。该基因属于一种新的同源异型盒基因，其表达产物属于一种新的转录调节因子，本领域已部分了解同源异型盒基因及转录调节因子在基因的调控和胚胎发育过程中的重要功能。     

角毛壳菌生物防治相关基因的筛选

采用环保的生物防治技术取代传统的化学防治技术已经在植物病害防治领域中达成共识。角毛壳菌（Chaetomium cupreum）属于子囊菌亚门毛壳菌属，是一种有效的生物防治菌，对一些常见的植物病原菌的防治效果好，例如：粉红镰刀菌（Fusarium roseum）、苹果黑星菌（Venturia inequalis）、稻梨孢（Pyricularia oryzae）、灰葡萄孢（Botrytis cinerea）等。     

大片吸虫成虫cDNA文库的构建和组织蛋白酶L1基因的克隆

目的大片吸虫cDNA文库的构建及组织蛋白酶L1(Fasciola gigantica Cathepsin L1,FgCL1)基因的克隆。方法提取大片吸虫成虫总RNA,运用SMART技术构建大片吸虫cDNA文库。根据文献设计并合成PCR引物,从上述文库中克隆大片吸虫FgCL1基因,定向克隆至原核表达载体pET28a中。结果文库容量为2.08×106pfu/mL,重组率为98%。扩增后的文库滴度为6.23×109 pfu/mL,插入片段平均大小约为1 000 bp。应用两个已知基因(FgCL1 FgGST)从文库中成功钓取到相应的全长基因。将含有FgCL1的阳性克隆测序,用Genebank Blast进行序列比较,证实为FgCL1基因。结论成功构建了cDNA文库,提供筛选大片吸虫基因资源;从该文库中克隆出FgCL1,为进一步表达该基因,研制诊断试剂盒创造了条件。     

中国部分地方品种鸡CD4和CD8α基因cDNA的克隆与序列分析

用Trizol分别提取4～6周龄白莱航鸡、狼山鸡、大骨鸡、北京油鸡、仙居鸡、茶花鸡、固始鸡和隐性白羽鸡胸腺细胞的总RNA，再用Oligo-dT纤维索富集mRNA后，用RT-PCR分别扩增出鸡CD4和cD8α基因cDNA。将PCR产物克隆进T载体后测序。序列分析显示不同品种鸡的CD4 cDNA序列完全一致；中国地方品种鸡与国外品种的白莱航鸡、RPL7系鸡在CD8α胞外区有6～13个氨基酸的差异，仙居鸡与其他5个中国地方品种鸡在CD8α胞外区有4～5个氨基酸的差异，狼山鸡、北京油鸡和隐性白羽鸡CD8α cDNA的核苷酸序列及推导的氨基酸序列完全一致。这些结果表明，中国地方品种鸡CD4基因序列高度保守；中国地方品种鸡与国外品种鸡的CD8α cDNA序列之间具有遗传多态性，而中国地方品种鸡之间CDSα cDNA序列遗传多态性低，为进一步研究CD4分子和CD8α链的结构和功能提供了条件。     

美洲黑杨雄性花芽cDNA克隆测序及表达序列标签(ESTs)特性分析

采用SMART技术构建美洲黑杨雄性花芽cDNA文库.随机挑选4 200个克隆进行序列测定,获得原始序列3 092个ESTs,去除插入片段短于150 bp的序列和污染序列后,获得有效ESTs序列3 087个,平均长度515 bp.对聚类后的416个Clusters分别进行单独拼接,得到相应的Contigs和Singletons分别为451和1 104个,并通过与NCBI等核酸数据库进行比对、查询和注释,获得已知功能和未知功能的基因1 015个,无序列相似性的新基因540个.这些数据为进一步研究高等植物花发育提供了一个极有价值的资源.     

杜氏盐藻MAPK基因cDNA的克隆及其进化分析

以杜氏盐藻Dunaliella salina总RNA为模板,根据其它物种MAPK基因的保守序列设计一对简并引物,通过RT-PCR技术扩增获得1条297 bp的cDNA片段.再以此片段为模板设计引物,通过RACE技术获得杜氏盐藻MAPK基因的全长序列.杜氏盐藻MAPK基因由664个氨基酸组成,大小为1 994 bp.在Genebank中进行Blastp检索,发现其与许多物种的MAPK基因具有较高的相似性(55.6%～69.7%).系统进化分析进一步证明,杜氏盐藻MAPK与衣藻Chlamydomonas reinhardtii MAPK亲缘关系最近.