狼山鸡MHC多态性及血型与部分抗性性状关联的研究

为探究血型与抗病性状的关系,本研究利用微卫星标记技术对狼山鸡MHC-Ⅰ和MHC-Ⅳ区遗传多样性及血型进行研究;同时检测了部分抗性性状,并分析不同血型与抗性性状的相关性。结果表明:狼山鸡MHC-I位点期望杂合度为0.4891,多态信息含量平均为0.3695;MHC-IV位点期望杂合度为0.6357,多态信息含量平均为0.5628。狼山鸡中共发现6种常见血型,即纯合型B4、B21、B13及其杂合型B4/B21、B4/B13和B13/B21;免疫性状检测结果发现B21综合抗性指标显著好于其他血型(P<0.05)。实验提示,可利用MHC-Ⅰ和MHC-Ⅳ区进行血型判定,且血型与免疫性状存在关联性。     

4个微卫星标记的多态性与鸭肉用性能杂种优势的相关性研究

对四川农业大学水禽课题组育成的3个肉鸭品系(D1、D2和S)在4个微卫星标记基因座(CAUD054、CAUD081、CAUD091、CAUD133)的等位基因频率、多态信息含量、有效等位基因数、杂合度及品系间的遗传距离进行检测,并分析S系与D1系和D2系的杂交效果。结果表明:4个微卫星标记在3个群体中存在不同程度的多态性,其中有3个标记可以用于遗传多样性评估;从不同群体来看,S系的变异程度最大,而D1系的遗传变异程度最小,D1系与S系的遗传距离大于D2系与S系的遗传距离,同时,D1系与S系的杂种优势高于D2系与S系的杂种优势,表明所选微卫星标记可以用于鸭肉用性能杂种优势的预测。     

利用微卫星标记对地方鸡种群体遗传结构的聚类分析

利用29个微卫星标记,通过计算亚群体杂合度（Hs）、总群体杂合度（Ht）、遗传分化系数（Gst）和基因流（Nm）,并基于Reynolds遗传距离、Nei遗传距离运用NJ和UPGMA聚类法构建4类聚类图,比较分析国家地方禽种遗传资源基因库保存的7个地方鸡品种（仙居鸡、鹿苑鸡、固始鸡、大骨鸡、河南斗鸡、狼山鸡、萧山鸡）间的遗传分化和亲缘关系。结果表明,7个地方鸡种29个微卫星座位的总群体杂合度、亚群体杂合度的平均值为0.642,0.551;平均遗传分化系数为0.142。7个地方鸡品种间,萧山鸡与鹿苑鸡的基因流动最大,为5.832 7;狼山鸡与固始鸡的基因流动最小,为0.805 3;基于Reyonalds遗传距离运用NJ聚类法获得的7个鸡种间的亲缘关系聚类图较为准确地反映了7个地方鸡种间的遗传分化和亲缘关系。     

微卫星引物PCR快速鉴定兔皮肤病原真菌方法的建立及应用

本研究旨在借助微卫星引物PCR和聚类分析软件,建立一种快速准确鉴定兔皮肤病原真菌的分子生物学方法.本试验以寡核苷酸重复序列(GACA)4为引物,首先对3种常见兔皮肤病原真菌(须癣毛癣菌、犬小孢子菌和石膏样小孢子菌)标准菌株的DNA进行扩增,然后用NTSYS-pc2.10软件分析其DNA指纹的多态性,并根据其多态性的差异进行鉴定分析.最后,用上述方法对临床上的分离株进行鉴定分析,并与传统的形态学鉴定方法进行比较.结果表明,3种不同的兔皮肤病原真菌均呈现不同的DNA指纹,且条带差异明显;聚类分析图显示,同种病原真菌的DNA指纹有很高的相似性(90％～100％);该方法对分离株的鉴定结果与形态学鉴定结果一致.可见,通过微卫星引物PCR结合聚类分析软件可以准确、快速地鉴定兔皮肤病原真菌.     

模型分类法对动物个体鉴定效率影响的因素

1材料与方法1.1试验材料以北京鸭和高邮鸭为试验材料,在各自保种场或者繁育场每个鸭种随机采取60个个体。取样尽量分布在不同家系,以避免较近的血缘关系,公、母比例1∶4,翅静脉采血。血液DNA提取采用酚-氯仿抽提法,见参考文献1。1.2微卫星标记选择及PCR检测取分布在不同染色体上的20个微卫星座位(APH01、APH09、APH10、APL2、APL11、APL23、APL26、APL36、APL79、APL80、APL82、APL83、CMO11、CMO12、SMO6、SMO7、SMO9、SMO10、SMO11、SMO12)作为试验位点。所有引物均由上海生工生物工程技术服务有限公司(Sangon)合成。PCR反应体系     

鸡MHC多态性及血型与部分免疫指标的关联分析

利用荧光标记微卫星技术对雪山鸡MHC基因Ⅰ~Ⅳ区进行遗传多样性及血型判断进行检测,并分析不同血型与部分抗性性状的相关性。结果发现:雪山鸡MHC-Ⅰ基因观察杂合度为0.6075,多态信息含量为0.5382;MHC-Ⅳ基因观察杂合度为0.7975,多态信息含量为0.7668。雪山鸡血型较为复杂,主要血型有B2、B5、B13、B21、B22、B76。其中,B2综合抗性指标显著好于其他血型(P<0.05)。该结果为利用血型进行抗病育种提供了基础资料。     

12个微卫星DNA标记在江口萝卜猪群体中的遗传多样性研究

采用12对微卫星引物对江口萝卜猪群体的遗传多样性进行研究。结果发现12个微卫星位点在江口萝卜猪群体中均具有多态性,平均基因杂合度、多态信息含量和有效等位基因数分别为0.760 1、0.707 9和4.173 7。实验结果表明,江口萝卜猪群体具有较高的遗传多样性,群体内部变异较大,若通过家系育种有较大的选育潜力。     

云南肉山羊黑色品系内不同家系遗传多样性分析

应用QIAxcel全自动遗传分析仪进行毛细管电泳,对云南肉山羊黑色品系5只公羊134只后代的基因组DNA进行了11个微卫星位点多态性分析,以期为这一品系的选育提高和合理选配提供科学依据。结果表明,在11个微卫星位点共检测到101个等位基因,片段大小在115～249 bp之间,全群平均期望杂合度和平均多态信息含量均在0.5以上,表明云南肉山羊黑色品系遗传多样性丰富。对5只公羊UPGMA聚类分析表明:5只公羊间遗传一致度较高,说明云南肉山羊黑色品系具备了相对统一的遗传基础;系统聚类图直观地显示出公羊N7379和N7373存在较近的亲缘关系,被聚为一支,而公羊N5043、N7303、N5049间也存在较近的亲缘关系,被聚为另一支,分属于不同分支的公羊间亲缘关系相对较远。     

陶赛特羊Carwell基因微卫星标记多态性与体重和体尺指标的相关性分析

据相关研究报道,在澳洲无角陶赛特羊18号染色体末端微卫星标记CSSM18和TGLA122之间的区域有控制其肌肉生长发育的Callipyge和Canvell基因。研究选择了微卫星标记CSSMl8和TGLAl22之间的TGLA122、LS33、ILSTS54、MCMA26四个微卫星标记,测定了新疆引进的澳洲无角陶赛特羊所产后代163只羔羊早期生长发育性状指标,采用PCR—SSCP技术检测了上述4个标记在研究群体中的多态性,分析了研究群体中4个微卫星标记不同基因型与早期生长发育性状的相关性。结果显示：微卫星标记TGLA122的杂合度0．4301,多态信息含量0．2733,有效等位基因数1．3761;微卫星标记MCMA26的杂合度0．4824,多态信息含量0．3660,有效等位基因数1．577O;微卫星标记LS33的杂合度0．3283,多态信息含量0．2744,有效等位基因数1．3780。微卫星标记TGLA122的3种基因型（AA／BB／AB）对90日龄母羔臀宽影响显著（P〈0．05）,对其他生长指标均无显著影响;微卫星标记MCMA26的3种基因型（GG／Tr／GT）对60日龄母羔胸围和臀宽有显著影响,对其他生长指标均无显著影响;微卫星标记LS33的2种基因型（EE／EF）个体的体重和体尺均无显著性差异;微卫星标记ILSTS54在该群体中无多态性。     

8个微卫星座位在海北金银滩藏羊群体中的多态性分析

研究旨在分析金银滩藏羊的微卫星DNA多态性,以期了解该品种的遗传多样性,为该品种的保种选育和品质的进一步提高提供有益资料。利用8对微卫星引物,以金银滩藏羊为研究对象,通过计算基因频率、多态性信息含量、有效等位基因数和杂合度,评估其品种内的遗传变异。结果表明：在8个微卫星座位中,共检测到83个等位基因,每个座位平均10.38个等位基因;平均杂合度0.893;平均有效等位基因数9.06;平均多态性信息含量0.871。结果提示,金银滩藏羊群体存在丰富的遗传多样性,所选微卫星标记可用于绵羊遗传多样性评估。