黔北麻羊KISS1基因多态性及组织差异表达研究

转移抑制素(kisspeptins,KISS1)被认为是哺乳动物繁殖机制的调控者。KISS1基因编码的蛋白,可以影响促性腺激素释放激素的释放,具有调节动物性腺产生性激素与生殖细胞的能力。本研究以黔北麻羊(Capra hircus)为研究对象,对KISS1基因的多态性及其在繁殖相关组织的表达量进行研究,旨在揭示KISS1基因对黔北麻羊产羔性状的影响。结果表明,在黔北麻羊内含子1处检测到3个SNPs,分别为G277C,G436T和T486A,其中在G277C、T486A位点,黔北麻羊3种基因型个体间的产羔数达到显著差异水平。qRT-PCR结果显示,在检测的黔北麻羊的5个组织中KISS1基因均有表达,其中下丘脑的表达量显著高于其他各组织(P0.05),但子宫、卵巢、输卵管3个组织间的KISS1基因的表达量差异不显著(P0.05)。结果表明,KISS1基因中的G277C、T486A位点的突变对黔北麻羊的产羔数有一定的关联,对其进行研究可为黔北麻羊高繁殖力品系的培育提供一定的基础。     

番鸭下丘脑组织的RNA-Seq特征分析

为筛选番鸭下丘脑组织中的基因组信息,本研究以NCBI数据库中已标注的绿头鸭基因组（登录号：BGI_duck_1.0）为参照,利用RNA-Seq技术对番鸭下丘脑组织基因表达水平,以及可变剪切事件、SNPs及InDel进行筛选。结果显示,共鉴定出14 619个基因表达（FPKM ≥ 1）,占筛选出总基因数的72.7%。共有5 034个基因发生了7 528次可变剪切,其中外显子跳跃占92.76%,第一个外显子可变剪切和内含子滞留所占比例最小,共占总数的0.027%。通过RNA-Seq技术,本研究还筛选到646 423个SNP位点和77 712个InDel位点。对SNPs和InDel所在的基因进行功能注释发现,这些基因主要参与分子功能、生物过程和细胞组成过程。通过KEGG通路分析发现,出现SNPs和InDel所在基因主要富集在内分泌调节和神经行为调节的相关通路上,表明下丘脑既可参与内分泌调节,又参与动物的神经行为调节。本研究筛选出的数据不仅丰富了番鸭的遗传信息,而且也建立了番鸭相关基因的SNPs和InDel的数据库,这为番鸭的遗传育种工作及相关功能基因的具体定位提供了可靠依据,同时也为以后番鸭行为的研究提供了一定的参考价值。     

兴义鸭血清生化指标和肉质性状的相关性分析

对成年兴义鸭进行肉质性状和血清生化指标测定袁并对所测性状和指标进行显著性检验及相关性分析,结果表明,兴义鸭雄性和雌性肉质性状差异不显著,公鸭的球蛋白、白球比值、碱性磷酸酶、甘油三酯、总胆固醇、总蛋白与母鸭的差异显著（P约0.05）,其中只有白球比值公鸭低于母鸭,其他各差异显著性状均为公鸭高于母鸭。肉色与酸度呈极显著正相关（P约0.01）,与嫩度呈显著正相关（P约0.05）;总蛋白与白蛋白、球蛋白、乳酸脱氢酶、总胆固醇呈极显著正相关（P约0.01）,总胆固醇与甘油三酯呈极显著正相关（P约0.01）;酸度与白球比值呈显著负相关,与乳酸脱氢酶呈显著正相关（P约0.05）, 失水率与乳酸脱氢酶呈极显著负相关（P约0.01）。该结果对鸭肉质的改善起到参考作用,为更深入开展血清生化指标与肉质性状的研究奠定理论基础,为兴义鸭的生化遗传标记辅助选择提供理论依据。     

樱桃谷鸭DRD1基因CDS 区域多态与生长性状的关联性分析

采用PCR-SSCP法与DNA直接测序技术相结合,对90只樱桃谷鸭DRD1基因编码区572～980 bp区域的多态性进行检测,并分析其多态与生长性状的关联性.结果表明,在樱桃谷鸭DRD1基因编码区572～980 bp区域内检测到6种基因型AA、BB、CC、AB、AC和BC,3个等位基因A、B和C,基因型CC和等位基因C分别为优势基因型和优势等位基因,频率分别为0.5222和0.6667,多态信息含量为0.4489,属中度多态位点,基因型分布偏离了Hardy-Weinberg平衡(P＜0.01),序列比对发现2个沉默突变A765T和A912G.最小二乘法分析显示,AB基因型的胫长显著高于BB和BC基因型,AB基因型的胫围显著高于BC基因型,其余各性状各基因型间差异未达到显著水平.研究结果揭示,该多态座位可能是鸭的胫长和胫围的一个标记辅助选择位点.     

野乔菜替代部分精料对从江香猪生长性能、屠宰性能及肉质的影响

为探究野乔菜替代部分精料对从江香猪生长性能、屠宰性能及肉质的影响,试验选取体重约20kg的从江香猪40头,随机分为4组,每组10头。对照组饲喂基础日粮,试验组以野乔菜替代部分基础日粮,替代比前期分别为10%、20%、30%,后期分别提高到20%、30%、40%。结果表明:野乔菜替代部分精料可显著降低从江香猪平均日增重,减缓生长速度;显著降低6~7胸椎间膘厚及胴体脂肪比例,显著提高瘦肉率;显著提高肌肉熟肉率,粗蛋白含量随着替代量的升高而提高,肉质得到提高。研究显示,野乔菜替代部分精料可降低从江香猪生长速度,提高胴体品质及肉品质,其适宜替代量为前期20%、后期30%。     

宗地花猪H-FABP基因mRNA的表达与肉质性状的相关研究

为研究不同饲养条件对地方猪种宗地花猪心脏型脂肪酸结合蛋白(heart fatty acid binding protein,H-FABP)基因表达及肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)含量的影响,试验利用实时荧光定量PCR技术,分别测定放养型和圈养型宗地花猪背最长肌中H-FABP基因的表达水平,并测定背最长肌的IMF、大理石纹、嫩度.结果发现,圈养型宗地花猪的IMF、大理石纹、嫩度均高于放养型宗地花猪(P >0.05),pH、肉色极显著高于放养型宗地花猪(P <0.01);放养型宗地花猪背最长肌中H-FABP mRNA 水平显著高于圈养型宗地花猪(P <0.05);放养型、圈养型宗地花猪H-FABP基因表达与IMF均无显著相关性(P >0.05).以上结果表明,不同饲养条件影响H-FABP基因表达并在一定程度上影响IMF,但影响不显著.     

生长激素（GH）基因在不同胫长性状 鸡种中的差异表达分析

为研究生长激素(GH)基因与鸡胫长之间的相关性及其表达规律,利用实时荧光定量PCR技术对胫长差异较大的高脚鸡、矮脚鸡和百宜黑鸡3个品种的心脏、肝脏、胸肌、腿肌中GH基因的相对表达量进行了检测,结果发现相同品种不同组织GH基因表达量均以腿肌最高;不同品种相同组织中,高脚鸡各组织的GH基因表达量均为最高.结果表明,GH基因在不同品种及不同组织间存在差异表达,且其表达量与鸡的胫长间存在正相关.     

平坝灰鹅体尺性状的相关分析

随机抽取相同放养条件下同批出雏、健康无病及体况相近的14周龄平坝灰鹅66只(♂ 35,♀31)进行体尺性状测定,结果表明,公鹅的体重、胸宽、胫围和胫长均显著或极显著高于母鹅,其他体尺指标没有呈现出差异显著水平;相关分析结果显示,体斜长与龙骨长及胸深与胫围间不存在显著相关,其他各体尺指标间均达到了显著或极显著相关水平;体重与各体尺指标间的回归分析结果表明,最优回归方程为Y=-787.718+61.742X2+94.298X4+234.253X6,模型决定系数(R2)_--0.557,其中龙骨长(X2)、胸宽(X4)和胫围(X6)的系数估计值均达到极显著水平.     

兴义鸭MEF2D基因的多态性及组织差异表达研究

肌细胞增强因子2D(myocyte enhancer factor 2D,MEF2D)是属于肌细胞增强因子2(myocyte enhancer factor 2,MEF2)基因家族一员,被认为与骨骼肌生长发育有关。为研究MEF2D基因的多态性对兴义鸭(Anas platyrhynchos domestica)屠宰性状的影响,本研究利用PCR扩增结合测序的方法对90日龄兴义鸭MEF2D基因外显子区域进行SNP位点筛选,同时运用q RT-PCR对0~150日龄兴义鸭不同组织中该基因m RNA表达规律进行探究。结果显示,在MEF2D基因外显子区域共发现6个SNPs,均为同义突变;群体遗传学分析显示,6个多态位点均表现为中度多态(0.25PIC0.5),经χ2检验表明兴义鸭群体在这6个多态位点均处于Hardy-weinberg平衡状态(P0.05);各SNPs与屠宰性状关联分析发现,T16236C位点的不同基因型在活重和屠体重存在显著差异(P0.05),A16305C和A21071G位点对多项屠宰指标存在显著或极显著影响(P0.05或P0.01),G16359C位点的CC基因型个体半净膛重、全净膛重显著高于GG基因型个体(P0.05),其余SNPs对屠宰性状无显著影响(P0.05);单倍型分析结果表明,兴义鸭CGCCCG单倍型的半净膛重和半净膛率显著或极显著高于其他单倍型(P0.05或P0.01);TACCCA单倍型的腿肌重显著高于其他单倍型(P0.05);TATAGA单倍型的全净膛率显著高于其他单倍型(P0.05);q RT-PCR结果显示,在10个组织中均检测到了MEF2D基因的表达,说明该基因的表达具有广谱性,且公母差异显著,母鸭腿肌中的表达量最高,心、肝脏、肺脏、肾脏、十二指肠、大脑、胸肌、腺胃中的表达量较高,而公鸭心肌、肝脏中的表达量最高,十二指肠、大脑、胸肌、腿肌、腺胃中的表达量较高。研究结果可为兴义鸭屠宰性状的分子标记辅助选育提供参考,同时为鸭MEF2D基因结构功能的进一步研究提供理论基础资料。