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【目的】 筛选不同温度下烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)侵染后枯斑三生烟(Nicotiana tabacum var. Samsun NN)差异表达的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),研究lncRNA在枯斑三生烟抗性反应中的作用。【方法】 N基因的温度敏感性使枯斑三生烟在25℃时具备对TMV的抗性、在31℃抗性丧失,在这两个温度条件下对枯斑三生烟接种TMV和磷酸盐缓冲盐水(phosphate buffered saline,PBS),48 h后提取系统叶总RNA,构建链特异性文库后进行深度测序。对测序结果进行过滤后利用HTSeq将有效数据与近缘品种TN90(N. tabacum var. TN90)基因组比对,筛选得到lncRNA后利用FPKM法估计lncRNA的表达水平。通过edgeR筛选差异表达lncRNA(differentially expressed lncRNA,DElncRNA),并利用qRT-PCR技术对这一结果进行验证。通过共定位及共表达分析预测DElncRNA的靶基因,通过参考基因组注释、GO和KEGG富集分析研究靶基因的功能。【结果】 4个处理共12个样本经lncRNA-seq各测得约8 000万条clean reads,共获得4 737条已知lncRNA、40 169条新lncRNA。其中64个lncRNA在不同温度条件下TMV侵染后存在差异表达,qRT-PCR测定结果显示这些lncRNA的测序正确率在80%左右,表明本研究所得测序数据具备较高的可信度。对DElncRNA进行靶基因预测,发现一些基因同时被25℃下调和31℃上调的DElncRNA靶向。靶基因注释功能丰富,主要参与植物抗病、激素和代谢等生理过程。部分可能与激素通路相关的lncRNA,在25℃下TMV侵染时呈现下调趋势,而在31℃下TMV侵染则呈现上调趋势。GO富集分析显示靶基因主要参与构成膜、囊泡等组分,具备钙、钾离子通道抑制剂活性等分子功能,使相应离子得以转运引发随后的反应,同时也参与发病、抗原加工和呈现、细胞分裂素代谢等生理过程。KEGG分析发现靶基因显著富集在植物激素信号转导通路,25℃下调和31℃上调的DElncRNA靶基因同时富集在激素信号传导、ABC运输蛋白、苯丙烷类生物合成等通路。【结论】 不同温度(25℃和31℃)条件下TMV侵染枯斑三生烟后,长链非编码RNA差异表达,DElncRNA通过作用于激素信号传导、物质转运等过程参与寄主系统获得性抗性反应。研究结果可为揭示植物系统获得性抗性中lncRNA的调控功能以及新型抗病毒技术开发提供依据。 相似文献
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黏虫蛹性别的快速鉴别方法 总被引:1,自引:0,他引:1
根据黏虫Mythimna separata(Walker)蛹生殖孔的位置、腹部腹节的外部形态学特征、生殖孔(产卵孔)至排泄孔之间的距离,快速、准确鉴别黏虫蛹性别。雌蛹第8腹节腹面中央的生殖孔与第9腹节的产卵孔连接形成一纵裂缝,裂缝两侧平坦,无突起。生殖孔下端与第9腹节的前缘连接、产卵孔下端与第10腹节的前缘连接,形成2个明显的"人"字纹。雄蛹第8腹节无纵裂缝,在第9腹节腹面中央的生殖孔呈现的纵裂缝连接第10腹节,裂缝两边各有一个半圆形瘤状突起。雌雄蛹排泄孔均在第10腹节腹面,雌蛹产卵孔下端至排泄孔上端之间的距离为(400.85±151.10)μm,雄蛹生殖孔下端至排泄孔上端之间的距离为(178.21±93.59)μm,约为雌蛹相应距离的一半。采用该方法观察的270头羽化蛹的性别鉴别准确率100%。该方法对于快速鉴别黏虫蛹的性别、开展黏虫相关的生物学研究以及预测预报等具有重要的参考价值。 相似文献
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以神东矿区采煤沉陷地种植的复垦植物(野樱桃、文冠果、欧李和山杏)为试材,采用野外原位监测方法,研究覆盖紫花苜蓿和未覆盖处理(对照,CK)对植物生长及土壤化学和生物性状的影响。结果表明:覆盖紫花苜蓿处理的野樱桃、文冠果、欧李和山杏苗木地上部干质量比未覆盖处理显著增加31.7%~54.6%,根干质量增加25.6%~41.0%;同样地,植物成活率和叶色值分别增加到85%和32.0以上,显著高于对照;覆盖处理的土壤碱解氮、有机质、速效磷、速效钾含量增幅较对照分别达到12.5%~17.9%、14.0%~17.8%、14.0%~23.2%、13.6%~28.4%,差异显著;土壤酸性磷酸酶、蔗糖酶、脲酶和硝酸还原酶活性分别比对照显著提高36.4%~41.6%、21.8%~51.2%、33.6%~44.7%、20.5%~39.9%。因此,覆盖紫花苜蓿有利于改善神东采煤沉陷区复垦植物生长、提高土壤化学和生物学性状水平,为矿区生态恢复提供依据。 相似文献
125.
小榄菊花会是广东省中山市小榄镇一项重要的民俗活动。以菊花会200周年景点之一的榄溪菊韵为例,从园林景观的角度分析了菊花与湿地景观融合、菊花与园林造景等方面的关系,为菊花在园林中的应用提供了新的思路,阐述弘扬小榄菊花文化和保护湿地的重要性。 相似文献
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CHE Sheng-guo ZHAO Bing-qiang LI Yan-ting YUAN Liang LIN Zhi-an HU Shu-wen SHEN Bing 《中国农业科学(英文版)》2016,(4):907-917
Improved estimates of nutrient requirements for rice(Oryza sativa L.)in China are essential to optimize fertilization regulation for increasing grain yields and reducing the potential of environmental negative influences,especially under high-yielding intensive systems.A database involving rice grain yields,nutrient concentrations and accumulations collected from on-field station experiments in the literatures published from 2000 to 2013 in China was developed to understand the relationships between grain yields and plant nutrient uptakes,and to quantify nutrient requirements for different yield levels.Considering all data sets,rice grain yield ranged from 1.4 to 15.2t ha-1with the mean value of 7.84t ha-1,and ca.10.4%of yield observations were higher than the yield barrier level of 10 t ha-1.N requirement to produce one ton grain was 21.10 kg for the yield range<4.0t ha-1with a high variation of 45.8%.Except of the yield range<4.0t ha-1,the values of N requirement,firstly increased from 18.78 kg for yield range 4.0-5.5 t ha-1to 20.62 kg for yield range 7.0-8.5 t ha-1,then decreased slightly to 19.67 and19.17 kg for the yield range 8.5-10 and>10 t ha-1,respectively.Phosphorus(P)and potassium(K)requirements showed increasing trends,from 3.51 and 19.87 kg per t grain for<4.0 t ha-1yield range to 4.10 and 21.70 kg for>10.0t ha-1range.In conclusion,nutrient requirement varied with increasement of grain yield,and N,P and K presented various response trends,increasing,declining or stagnating,which would be of great benefit for improving fertilizer strategies. 相似文献