禽弱毒疫苗中REV低剂量污染检测方法的比较

使用污染有禽网状内皮组织增生症病毒(REV)的弱毒疫苗是REV感染途径之一,而通常弱毒疫苗中REV的污染剂量较低,难以检测,本研究对不同方法在检测弱毒疫苗中REV低剂量污染进行了比较研究。将定量好的REV以不同剂量分别人为污染一批商品化新城疫病毒(NDV)弱毒疫苗,提取核酸后分别以TaqMan探针荧光定量RT-PCR检测、常规RT-PCR检测以及PCR产物结合核酸斑点杂交检测等不同方法进行检测。结果显示常规RTPCR检测仅可检测到10TCID50/羽份的REV污染,而另外两种方法均检测到1TCID50/羽份的低剂量REV污染。将人为污染1TCID50/羽份和2TCID50/羽份REV的NDV弱毒疫苗各接种10只SPF鸡,定期针对REV抗体及其核酸进行检测,结果显示在免疫污染疫苗后7周内REV抗体全部为阴性,而核酸检测均可以检测到一定比例的阳性,提示通过接种SPF鸡检测弱毒疫苗中REV污染时,仅仅通过抗体判定可能会对一些剂量较低的REV污染造成漏检,通过结合对病原的检测有助于降低漏检率。     

禽网状内皮组织增殖病病毒的实时荧光定量PCR检测

基于Light Cycler平台,利用SYBR GreenI染料能特异与双链DNA结合而发荧光的特性,建立了一种荧光PCR方法检测禽网状内皮组织增殖病病毒(REV)的方法。整个检测过程2 h内可以完成,病毒的最低检出浓度为10-7,在特异性试验中,REV有特异性的扩增曲线,而禽流感病毒和阴性对照一样,没有特异性扩增。对REV患鸡各器官组织进行了荧光PCR检测,各脏器病毒含量从高到低依次是肝、脾、腺胃、肾、肌胃,肝脏中的病毒含量最高,肌胃中的病毒含量最少,肺中没有检测到病毒。基于SYBR GreenI的荧光PCR方法检测REV快速、敏感、特异性好,为开展REV病原学检测提供了一种快速、无污染的方法。     

四川部分鸡场禽网状内皮组织增生症病毒感染情况调查

对四川部分鸡场禽网状内皮组织增生症病毒(REV)感染情况进行调查,为鸡群REV净化和防控提供依据。采用文献报道的PCR方法,分别对来自四川新津、温江、眉山、大邑、崇州和德阳等地6个肉种鸡群共160只外表健康鸡或生长发育不良、具有腺胃炎症状的鸡只样本进行PCR检测,同时将扩增片段克隆测序以确定其正确性。结果表明,6个鸡群REV群体阳性率均为100%(6/6),其中外表健康鸡REV检出率为65.8%(79/120),患腺胃炎病鸡REV检出率为82.5%(33/40);同一只鸡不同组织器官样本的检测结果显示,REV在骨髓和法氏囊中的检出率最高,分别为30%(36/120)和28.3%(34/120),提示骨髓和法氏囊是REV检测的主要靶器官;患腺胃炎鸡的腺胃中REV检出率达25%(10/40),而外表健康鸡腺胃样本REV阳性率仅0.8%(1/120),表明REV是导致鸡腺胃炎的重要病原之一。     

鸡网状内皮细胞增生病的诊断试验

本试验将PCR扩增与核酸探针斑点分子杂交特异性诊断检测技术相结合,对部分疑似REV感染患病鸡群进行了外源性核酸特异性交叉检测诊断试验,提高了REV感染诊断的准确性。应用鸡REV地高辛核酸探针斑点分子杂交特异性诊断检测方法,对860余份血液DNA样本进行了REV感染特异性检测试验。结果表明,贵州地区鸡REV阳性感染率为:高产蛋鸡40.05%(164/390)、杂交肉鸡42.91%(106/247)、绿壳蛋鸡34.97%(57/163)、地方土鸡11.7%(7/60)。     

双重PCR检测禽源生物制品中禽网状内皮组织增生症病毒和禽白血病病毒

为了快速、准确检测禽源生物制品中的禽网状内皮组织增生症病毒(REV)和禽白血病病毒(ALV),根据GenBank中登录的REV参考毒株LTR基因序列和ALV P27基因序列,设计合成2对特异性引物。在建立各病毒单项PCR检测技术的基础上,优化反应条件,建立2种病毒的双重PCR检测方法。结果:可同时扩增REV的467 bp和ALV的675 bp的特异性片段,而对其他5种禽病病原的PCR扩增结果均为阴性。敏感性测定结果表明,该双重PCR技术能检出10 pg的ALV和10 pg的REV模板。用双重PCR技术与REV的间接免疫荧光法及ALV ELISA对245份疫苗株检测,进行同步比较,结果总符合率为100%。表明建立的双重PCR检测方法,具有特异、快速、准确的特点,对这2种外源病毒的同时检测,显示出了较好的可行性。     

SYBR Green Ⅰ实时荧光PCR检测网状内皮增生症病毒方法的建立

根据禽网状内皮组织增生症病毒(REV)长末端重复序列LTR基因保守区域设计并合成一对引物,建立基于SYBR GreenI模式的实时荧光PCR方法(Real-timePCR)。以常规PCR产物为标准品建立标准曲线,并对方法的特异性、敏感性、可重复性以及再现性、检出率进行评价。结果表明,该方法只从REV阳性样本检出扩增信号,不与其它病原出现交叉反应;熔解温度为86.8±0.5℃,无引物二聚体;扩增产物片段大小为270bp,与预期大小相符,测序结果证实为REV靶序列;在1.01×102～1.01×109拷贝之间呈现良好的线性关系,相关系数为0.999,扩增效率为99.7%,最低可检测101拷贝/反应阳性标准品,比常规PCR敏感103倍;组内变异系数、组间变异系数分别为4.80%～5.72%、0.75%～3.87%;对16例临床疑似病例进行检测,阳性率为81.25%(13/16),随机抽取7份阳性扩增产物进行测序,证实为REV序列。本研究建立的SYBR GreenI实时荧光PCR特异性强、通量高、灵敏度高、检测速度快,为REV的快速检测、分子流行病学调查以及监测REV污染疫苗情况提供新方法。     

不同方法对网状内皮组织增殖病病毒的检测

从山东、江苏、上海等地的鸡场中，收集疑为网状内皮组织增殖病病毒（REV）感染鸡的脾脏、肝脏56份，分别通过聚合酶链式反应（PCR）、斑点杂交试验（Dot-blot)和间接免疫荧光试验（IFA）对其进行REV检测。结果有21份呈PCR阳性，20份呈Dot-blot阳性，15份呈IFA阳性，且所有IFA阳性样品，PCR和Dot-blot检测都呈阳性，20份Dot-blot阳性样品中有19份呈PCR阳性。研究表明，PCR检测REV较其他方法敏感，可作为REV的常规检测方法之一。     

SYBR GreenⅠ实时荧光PCR法检测禽活疫苗中禽网状内皮组织增生症病毒

为快速、准确检测禽活疫苗中的禽网状内皮组织增生症病毒(REV),根据REV p30基因上的一段保守序列,利用Primer Premier 5.0软件设计合成了1对特异性引物,建立了基于SYBR Green I模式的实时荧光PCR方法,并以常规PCR产物为标准品绘制了标准曲线,对方法的特异性、敏感性、重复性、与经典方法的符合率进行了评价。结果表明:扩增产物片段大小为222 bp,与预期片段大小相符,测序结果证实为REV靶序列;标准曲线具有良好的线性关系,相关系数为1.0,扩增效率为94.2%,溶解温度Tm=(86.0±0.50)℃,无引物二聚体;该方法只从REV阳性样本检出扩增信号,其他病原无扩增信号,特异性好;最低可检测26.97拷贝数的阳性标准品,比常规PCR敏感1000倍;组内变异系数、组间变异系数分别为0.79%~5.36%,1.61%~5.25%。运用建立的实时荧光PCR方法对17批禽用活疫苗进行检测,并与间接免疫荧光法(IFA)进行同步比较试验,结果两者符合率为100%。且实时荧光PCR法更快捷、更方便,结果判定更为直观可用于疫苗中REV污染情况的监测。     

鸡网状内皮细胞增生病PCR特异性诊断方法的建立

为了便于生产中对RE和其他相关免疫抑制性疾病进行特异性鉴别检测诊断,试验根据GenBank中的鸡网状内皮细胞增生病毒(REV)pol基因序列设计了1对引物,建立了检测REV的PCR方法,通过对REV进行检测,其结果与预期相符,与鸡ALV-J、NDV和MDV的扩增结果均为阴性,REV DNA最小检出量为0.095 pg。说明建立的PCR检测方法具有较好的敏感特异性,可用于REV感染的检测诊断和分离毒株的快速鉴定。     

用单抗介导的免疫荧光试验检测组织切片中的禽网状内皮组织增生病病毒

以禽网状内皮组织增生病病毒(Reticuloendotheliosis virus，REV)的单克隆抗体11B154作为一抗，建立了从组织病理切片中检测REV的免疫荧光技术(Mc-IFA)。运用该技术对人工接种REV的肉鸡和疑似REV病鸡的肝脏、脾脏、心脏和肾脏等器官的组织切片进行了检测，并与病毒分离和斑点杂交试验的敏感性和特异性进行了比较。结果表明，在人工接种的感染肉鸡中，3种方法均为阳性；在30份疑似REV的病料中，用Mc-IFA可以检测出10份阳性，而病毒分离只有8份样品为阳性。由此表明，Mc-IFA的特异性和敏感性均较高，完全可以用于REV的检测。     

PCR、斑点杂交及间接免疫荧光试验对鸡传染性贫血病临床诊断的应用比较

应用能特异性扩增出鸡传染性贫血病毒（ Ｃ Ａ Ｖ） ０５８ ｋｂ Ｄ Ｎ Ａ 的已知引物，对江苏某地区疑为 Ｃ Ａ Ｖ感染的 １５～３０ 日龄病鸡的肝 Ｄ Ｎ Ａ 样品进行了 Ｐ Ｃ Ｒ 扩增。结果，在被检的 ２０ 份样品中，有 ６ 份为 Ｐ Ｃ Ｒ 阳性，阳性率 ３０％ 。利用地高辛标记的 ０８５ ｋ ｂ 的 Ｃ Ａ Ｖ 核酸探针对相同样品进行斑点杂交，结果与 Ｐ Ｃ Ｒ 扩增相同。对应的病鸡血清经间接免疫荧光试验（ Ｉ Ｉ Ｆ Ａ）发现，有 ７ 份为 Ｃ Ａ Ｖ 抗体阳性，与 Ｐ Ｃ Ｒ 扩增结果的符合率为 ７７％ 。初步结果表明，江苏某地区存在 Ｃ Ａ Ｖ 感染， Ｉ Ｉ Ｆ Ａ 与 Ｐ Ｃ Ｒ 的结果有差异     

Development of a semi-nested PCR for the improved detection of Mycoplasma bovis from bovine milk and mucosal samples

A new forward primer, Mb-F, was designed to improve the sensitivity and reproducibility of the Mycoplasma bovis-specific PCR developed by Ghadersohi et al. [Vet. Microbiol. 56 (1997) 87] for testing clinical samples. A semi-nested (SN) PCR configuration was developed and this provided enhanced sensitivity and reproducibility. The detection limit of the SN PCR was in the range of 10-100cfu/ml and the correct amplicon was amplified from 9.15pg/microliter of total extracted DNA (mixture of M. bovis and bovine cellular DNA). A dot blot assay was also developed and compared with the SN PCR on a number of randomly selected milk and mucosal samples. The dot blot had the same level of detection as the SN PCR. The specificity of the SN configuration was confirmed by Southern blot analysis and automated sequencing of the PCR product. The results from the tests on the samples from cattle, together with those from sheep, provided evidence that M. bovis is host-specific and that most cattle are colonised. The assay was shown to be specific, sensitive and reproducible and could be used successfully to detect M. bovis directly from clinical material without pre-enrichment.     

禽偏肺病毒地高辛核酸探针的制备与应用

根据GenBank中已经发表的B亚型禽偏肺病毒F基因的保守序列设计并合成1对引物,利用RT—PCR扩增出1条与目的片段大小一致的725bp基因片段,回收、纯化PCR产物,用地高辛标记,制备出地高辛标记的aMPV核酸探针。特异性检测结果表明,该探针能与aMPV核酸发生特异性杂交,而与H9N2亚型AIV、NDV、IBV、ORT和E．coil的核酸杂交反应均为阴性;敏感性检测结果表明,该探针对aMPV的最低检出量为5Pg。应用制备的探针对山东省不同地区的605份商品肉鸡和122份商品肉鸭进行了核酸探针检测,阳性检出率分别为36．59％和34．51％。本试验制备的aMPV地高辛探针特异性强、敏感性好,对样品的检测结果表明山东省部分地区的商品肉鸡、肉鸭中普遍存在aMPV感染。     

Rapid PCR detection of Salmonella in horse faecal samples

A rapid polymerase chain reaction (PCR) assay was developed for detecting Salmonella in faeces of horses and assessed on samples from horses admitted to a veterinary hospital. Direct detection was achieved by amplification of part of ompC after extraction of DNA from faeces using a spin column method to reduce the amount of inhibitory substances in samples. An internal positive control was included to detect false negative results. While the sensitivity of the PCR assay was less than culture when assessed on faeces inoculated with Salmonella, its sensitivity on faecal samples obtained from horses was much greater than culture. Salmonella DNA was detected in 40% of faecal samples using the PCR assay while Salmonella were cultured from only 2% of the samples. The PCR assay has potential for use in either routine diagnosis or for detection of the carrier status in animals.     

PCR和斑点杂交检测鸡传染性贫血病毒

通过聚合酶链反应（ｐｃＲ）扩增鸡传染性贫血病毒（ｃＡＶ）ＤＮＡ特定片段，将此ｐｃＲ产物用Ｄｉｇｏｘｉｇｅｎｉｎ标记后作为探针进行斑点杂交，以此检测ＣＡＶ并作流行病学调查。对从江苏省不同地市随机采集的２月龄左右不同疾病的病鸡ＤＮＡ样品进行检测，在被检的５２个不同鸡群来源的病料中，有３６个鸡群来源的病料ＤＮＡ显示ＣＡＶ阳性（群阳性率为６９．２％）；备组织中ＣＡＶＤＮＡ含量有所差异，依次为胸腺＞脾、骨髓、肝＞肾、法氏囊、脑。用ＰＣＲ检测得到的阳性鸡的组织病料感染ＳＰＦ鸡，在感染后第２４天检查，出现贫血症状。初步调查表明，在江苏一些地区ＣＡＶ感染已相当普遍，但它与发病的关系还有待于进一步研究。     

Detection of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis by buoyant density centrifugation, sequence capture PCR and dot blot hybridisation

Detection of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (M. paratuberculosis) by polymerase chain reaction (PCR) is often hampered by the lack of efficient methods for sample treatment. We report a protocol for analysis of faecal samples based on buoyant density centrifugation in Percoll and IS900 sequence capture PCR combined with a dot blot assay for detection of low-grade infection of M. paratuberculosis. Serial dilutions of M. paratuberculosis genomic DNA and M. paratuberculosis bacteria were used to assess the sensitivity of the method. The final evaluation was performed with spiked faecal samples, which also were analysed by culture. The presence of PCR inhibitory substances in processed faecal samples was evaluated by including a PCR internal control. By using buoyant density centrifugation, sequence capture PCR, and dot blot hybridisation, we achieved a sensitivity of 10(3)CFU (colony forming units)/g of faeces. The detection limit by culture was assessed to 10(2)CFU/g of faeces. We conclude that the described protocol is a fast and sensitive alternative to bacterial culture of faecal samples.     

猪链球菌2型荧光PCR检测方法与常规检测方法的比较

为验证猪链球菌2型荧光PCR检测方法对临床样品检测的敏感性和适用性以及该方法所拥有的独特优点,分别用荧光PCR法、常规PCR法和细菌分离法对人工感染猪链球菌2型的小鼠肝脏和发病猪的心、肝、脾、肾等实质器官和血液、喉拭子进行抗原检测。结果显示,荧光PCR法检出率为70.8%,明显高于普通PCR法（检出率为20.8%）,也高于常规细菌分离法（检出率为45.8%）。由于临床样品常常会被其他细菌污染,细菌分离法很难准确分离到链球菌。但荧光PCR法不受其他细菌污染的影响,对实验室培养的猪链球菌2型菌液,该方法检测滴度可达10-6/0.1mL（42～52 CFU/0.1 mL）,而普通PCR方法检测滴度仅为10-4。     

布鲁氏菌环介导等温扩增（LAMP）可视化检测方法的建立

应用环介导等温扩增(LAMP)技术建立了布鲁氏菌可视化快速检测方法。针对布鲁氏菌外膜蛋白OMP25基因保守区设计6条特异引物,反应前加入染料羟基萘芬蓝(HNB)作为LAMP扩增的指示剂,63℃恒温反应60min,根据HNB的颜色变化进行结果判定。分别评价所建立LAMP方法的特异性和灵敏性,并对60份牛布鲁氏菌病虎红平板凝集试验(RBT)阳性血清样本,经LAMP和B4/B5-PCR方法进行平行检测。结果显示,本方法最低检出限约为17fg布鲁氏菌基因组DNA。本方法特异性良好,布鲁氏菌反应管均出现特异性LAMP扩增反应,而猪大肠杆菌K99、巴氏杆菌C48-1、猪链球菌ST171、绿脓杆菌等对照组均未出现扩增。针对60份RBT阳性血清的平行检测结果显示,LAMP和B4/B5-PCR这两种方法间的结果符合率为85.0%。B4/B5-PCR检测为阳性的43份样品,经本方法检测全部为阳性;B4/B5-PCR检测为阴性的17份样品,经本方法检测,9份为阳性,8份为阴性。LAMP的敏感性高于B4/B5-PCR方法。实验表明,本文所建立的基于颜色判定的布鲁氏菌LAMP检测方法具有特异、灵敏、设备要求简单等特点,适用于基层兽医部门进行布鲁氏菌的快速检测。     

鸡白痢沙门氏菌PCR检测技术的建立与应用

为鸡沙门氏菌的临床检测提供了一种更快速、敏感、特异的诊断,参照GeneBank中已公布的的鸡白痢沙门氏菌fliC基因序列,合成出了一对引物,使用PCR法对1株沙门氏标准菌株和其他3株非沙门氏菌标准菌株进行DNA抽提扩增并检测其敏感度。采用上述技术,对12份可疑病料及10份饲料进行PCR检测,同时与传统检测方法进行比较。结果表明1株沙门氏菌PCR产物出现600 bp的特异性DNA扩增带,而非沙门氏菌均未出现扩增条带,证明所设计引物具有沙门氏菌特异性;通过敏感度检测,此PCR体系能检出50 pg以上的细菌DNA,敏感性较高。运用PCR法阳性检出率及敏感性均高于常规检测方法。由此可见,沙门氏菌PCR检测是一种快速、敏感和高度特异的诊断方法。     

PCV2、PRV和PRRSV多重PCR方法的建立及其应用

根据GenBank登录的猪伪狂犬病毒（PRV）、猪圆环病毒2型（PCV2）和猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）的参考基因序列,设计3对引物分别用于扩增PCV2的ORF2基因、PRV的gE基因、PRRSV的N基因的目的片段,通过优化反应中各个影响因素,建立了PRV、PCV2、PRRSV的多重PCR（mPCR）检测方法。敏感性和特异性的结果表明,该方法对这3种病毒的最低核酸检出量分别为32.5（PRV）、25.2（PCV2）、35.9pg（PRRSV）。该方法对猪流感病毒（SIV）、猪圆环病毒1型（PCV1）、大肠杆菌、猪瘟病毒（CSFV）、猪流行性腹泻病毒（TGE）等病毒的检测结果均为阴性。200份临床样品的多重PCR结果表明,PCV2感染率为80%（160/200）,PRV感染率为21%（42/200）,PRRSV的感染率为78%（156/200）。200份临床样品主要为PCV2和PRRSV混合感染,阳性率达56.0%（112/200）。该方法的建立对这3种病毒病的早期快速检测和指导临床实践具有十分重要的意义。