CIRP对冷应激小鼠血清生化指标、相关细胞免疫因子及能量代谢的影响

将45只6周龄体质量(18±2)g SPF级雄性SD小鼠随机分为5组(n=5),常温对照组5只(A组);低温对照组冷刺激4、8h各5只(B组);冷诱导RNA结合蛋白(cold-inducible RNA binding protein,CIRP)过表达组冷刺激4、8h各5只(C组),注射CIRP过表达慢病毒液0.1mL;CIRP干扰组冷刺激4、8h各5只(D组),注射CIRP干扰病毒液0.1mL;阴性对照组冷刺激4、8h各5只(E组),注射空载体病毒液0.1mL。A组置于常温(21±0.1)℃条件下饲养,后4组置于低温(4±0.1)℃环境饲养,分别在4h及8h后通过摘除眼球的方法采取血液。采用ELISA法检测血清中IL-1、IL-2、IL-6、GSH-PX、SOD、T-AOC、MDA、丙酮酸、PFK-1、LDH的含量。结果显示:(1)冷应激处理后,小鼠血清中相关细胞因子水平出现明显变化,人为的致使CIRP在小鼠体内出现不同的表达对血清中相关细胞因子的影响差异显著(P0.05);(2)冷应激处理后,小鼠血清中氧化还原指标GSH-PX、SOD、T-AOC、MDA变化非常明显,人为的致使CIRP在小鼠体内出现不同的表达对血清中相关氧化还原指标的影响差异极显著(P0.01);(3)冷应激处理后,血清当中能量代谢相关指标无明显变化,人为的致使CIRP在小鼠体内出现不同的表达对血清中相关能量代谢指标的影响差异不显著(P0.05)。结果表明:在不影响动物机体能量代谢的情况下,CIRP可以有效地抑制细胞内氧自由基的生成,从而提高小鼠抗氧化能力,以及调节动物机体的相关免疫因子,对小鼠抵抗低温应激起到积极地保护作用。     

加味生脉散对小鼠抗运动性疲劳能力的影响

目的:探讨加味生脉散在改善小鼠抗运动性疲劳能力方面的作用。方法:选取60只昆明雄性小鼠,并按随机分为4组,加味生脉散低剂量组、中剂量组、高剂量组每日经1h游泳后分别灌服0.4mL加味生脉散低、中、髙剂量水煎液,对照组每日同时灌胃等量生理盐水,共给药2周。2周后评估各组小鼠的抗运动性疲劳情况。结果:末次给药后,加味生脉散低剂量组、中剂量组、高剂量组小鼠的体质量与对照组相比差异不显著(P>0.05)。末次给药后,加味生脉散高剂量组的力竭时间明显长于其他3组(P<0.05),中剂量组的力蝎时间明显长于低剂量组与对照组(P<0.05),而低剂量组与对照组力竭时间相比差异不显著(P>0.05).末次给药后,加味生脉散髙剂量组的血乳酸水平相比其他3组显著降低(P<0.05),中剂量组的血乳酸水平相比低剂量组、对照组明显降低(P<0.05),而低剂量组与对照组血乳酸水平相比基本接近(P>0.05).结论:较大剂量(中、高)的加味生脉散对延长游泳力蝎时间、减少血乳酸堆积有明显帮助,能够增强抗运动性疲劳能力。     

家蝇早期胚胎转基因前后的表达差异

以转基因处理的家蝇卵为对象，采用银染差异显示技术（DDPCR）．对携带绿色荧光蛋白（GFP）和抗菌肽（ABP）融合基因的真核表达质粒以电转移的方式进入家蝇受精卵后，卵内基因的表达情况做了初步研究。结果表明，转基因处理的蝇卵与未经转基因处理的蝇卵在分化开始之前基因的表达存在差异；以T11MA为锚定引物，在转基因处理组发现6条差异表达的片段，成功地克隆得到其中3夸。序列分析证实其中2条为新基因片段，另1条为家蝇细胞色素C的编码片段；斑点杂交证实了新基因片段仅在转基因处理组得到表达，而细胞色素C在2组中都有表达。获得的新基因片段登录于GenBank，登录号分别为AY030235和AY030236。本试验结果为解释外源基因在宿主细胞内的去向．发现宿主内部对目的基因整合和分解的相关因素提供了可能，并为系统地开展发育相关研究打下了基础。     

黑大蒜粗多糖缓解小鼠体力疲劳作用研究

为探讨黑大蒜粗多糖对运动训练小鼠体力疲劳的缓解作用,以黑大蒜为原料,通过水提醇沉法获得粗多糖,采用苯酚-硫酸法测定其中粗多糖含量为6.89 mg/g;将小鼠随机分为空白对照组、运动训练组、黑蒜多糖低、中、高剂量组,通过连续28 d的游泳训练,建立小鼠运动训练模型后,进行缓解体力疲劳试验。结果表明,黑大蒜粗多糖能显著延长小鼠力竭游泳时间,降低血清尿素氮和血乳酸含量,提高肝糖原和肌糖原水平,增强肝脏和腓肠肌SOD、T-AOC活力,减少脂质过氧化产物MDA含量。上述结果说明,黑大蒜粗多糖可提高运动训练小鼠的运动耐力,增加糖原储存,加速代谢产物清除,提高肝脏和肌肉抗氧化水平,具有明显的体力疲劳缓解功能。     

表达序列标签(ESTs)及其应用

表达序列标签(ESTs)是指从(ESTcDNA文库中随机挑取克隆并对其3'或5'端进行单轮自动测序所获得的短cDNA库列,一般长度为300～500bp.要有效获取ESTs,必须对cDNA文库进行预处理,处理方法有衰减杂交法、均一化法和差异显示法.在dbEST中收录了大量各种生物的ESTs.ESTs广泛应用于鉴定基因、发现新基因、电子克隆、构建遗传学图谱、制备DNA芯片、分子标记、研究基因的差异表达及检验病原微生物等方面.     

山羊胎盘复方制剂对小白鼠缓解疲劳和抗氧化功能的影响

研究了山羊胎盘复方制剂对小鼠抗疲劳和抗氧化功能的影响。将40只小鼠随机等量分成高、中、低3个试验组（剂量分别为2mg／d、10mg／d、20mg／d）和1个对照组（生理盐水）,每组雌雄各半,30d后对试验组小鼠的负重游泳时间、血尿素氮水平、血细胞SOD活性和MDA含量进行测定。抗疲劳试验中,仅高剂量组小鼠游泳时闯明显高于对照组（P〈0．05）,中、高剂量组小鼠的血清尿素氮水平与对照组相比差异极显著（P〈0．01）;抗氧化功能试验中,中、高剂量组小鼠红细胞SOD活性与对照组相比达到极显著水平（P〈0．01）,且与对照组相比．这两组小鼠的血清MDA含量明显减少（P〈0．05）。山羊胎盘复方制剂对小鼠具有缓解机体疲劳,提高机体抗氧化能力的作用。     

羊胎盘复方制剂对小白鼠缓解疲劳和抗氧化功能的影响

研究了山羊胎盘复方制剂对小鼠抗疲劳和抗氧化功能的影响。将40只小鼠随机等量分成高、中、低3个试验组（剂量分别为2mg／d、10mg／d、20mg／d）和1个对照组（生理盐水）,每组雌雄各半,30d后对试验组小鼠的负重游泳时间、血尿素氮水平、血细胞SOD活性和MDA含量进行测定。抗疲劳试验中,仅高剂量组小鼠游泳时闯明显高于对照组（P〈0．05）,中、高剂量组小鼠的血清尿素氮水平与对照组相比差异极显著（P〈0．01）;抗氧化功能试验中,中、高剂量组小鼠红细胞SOD活性与对照组相比达到极显著水平（P〈0．01）,且与对照组相比．这两组小鼠的血清MDA含量明显减少（P〈0．05）。山羊胎盘复方制剂对小鼠具有缓解机体疲劳,提高机体抗氧化能力的作用。     

籽鹅卵巢组织差异表达基因的研究

本研究旨在筛选产蛋前期和产蛋期籽鹅卵巢组织差异表达的基因,并进行功能分析,从而探讨鹅产蛋的分子调控机理。利用抑制性消减杂交技术筛选籽鹅卵巢组织中的差异表达基因,用GOTM软件将所得ESTs从分子功能水平进行GO分类。结果表明,所构建的籽鹅卵巢组织消减cDNA文库的削减效率在20倍以上,片段大小主要在300～750bp;挑选86个阳性克隆测序,获得15个ESTs,其中有11个为已知的ESTs,4个未知的ESTs;11个已知的ESTs被分成结合功能、催化活性、酶调节活性、转运蛋白活性和其它功能。本研究成功构建了籽鹅卵巢组织消减cDNA文库,并筛选得到了15个可能在产蛋前期和产蛋期籽鹅卵巢组织中差异表达的ESTs,它们可能在鹅产蛋过程中起着重要的调控作用。     

日本血吸虫7d童虫cDNA文库构建及免疫筛选

为了从7 d童虫cDNA文库筛选出童虫发育阶段特异性表达抗原基因。本研究首先构建了日本血吸虫7 d童虫cDNA文库,其次再采用日本吸血虫感染血清进行筛选。结果显示:建立的文库插入片段为0.5~3.0 kb,文库重组率为98%,初始文库滴度为2.4×10~6 pfu/mL,扩增后滴度为1.6×10~9 pfu/mL,利用感染日本血吸虫10 d和42 d的小鼠血清免疫筛选该文库,初筛和复筛后获得17条有效EST序列,其编码7个基因,分别为复制蛋白(2 ESTs)、肝再生增强因子(3 ESTs)、血小板活化因子(6 ESTs)、钙调理蛋白基因(3 EST)、丝束蛋白(1 ESTs)、核糖体RNA(1 EST)和还原型辅酶脱氢酶基因(1 EST)。该研究结果对今后探讨血吸虫的生长发育机制及筛选血吸虫早期诊断抗原具有重要意义。     

中药复方制剂对小鼠抗疲劳作用的影响

健康成年昆明种雄性小鼠300只,随机分为5组,分别为复方一组、复方二组、复方三组、阳性对照组、空白对照组。连续给药2周后,让小鼠进行负重游泳试验,并测定游泳时间、血乳酸、肝糖原、肌糖原、血清尿素氮、血清肌酸激酶、乳酸脱氢酶各指标的变化。结果表明,3个中药复方制剂均能不同程度延长小鼠负重游泳时间,复方二对小鼠的抗疲劳作用最明显(P<0.05)。     

亚洲璃眼蜱唾液腺一新功能基因的克隆与测序

HaB1是亚洲璃眼蜱雌成蜱唾液腺差异表达基因文库中的一个片段,根据其序列设计引物HaB1-GSP1和HaB1-GSP2,以唾液腺总RNA为模板,RACE法扩增获得HaB1的未知3′-末端。测定该末端序列,进行序列拼接,设计全长引物5-′CCAGTCCGAAGGAAGGGCG-3′和5-′TCTC-CGGGCACGTGAAGTGTC-3′。以cDNA第一链为模板,扩增获得基因全长。经核查表明,该基因为一新基因(登录号AY803896)。     

乙型脑炎病毒感染PK15细胞的lncRNA差异表达谱分析

旨在分析乙型脑炎病毒(Japanese encephalitis virus,JEV)感染猪肾上皮细胞PK15后的lncRNA差异表达谱,探究宿主lncRNA在JEV感染和宿主防御中的潜在功能.本研究中利用JEV感染PK15细胞,感染36 h,收集细胞,同时设立未感染对照组,每组3个生物学重复.提取细胞总RNA,构建c...     

基于转录组数据分析环形泰勒虫对诱导宿主细胞转化相关基因的影响

本试验主要通过研究布帕伐醌(BW720)处理前后,环形泰勒虫转化牛单核细胞(TaNM Ⅰ)转录组数据的变化情况,为进一步研究环形泰勒虫诱导宿主细胞转化的分子机制奠定基础。以环形泰勒虫感染的牛单核细胞为试验材料,设置对照组(二甲基亚砜,DMSO)和试验组(BW720),利用Illumina HiSeq4000测序平台进行高通量测序,将测序得到的原始数据(Raw reads)与GenBank和Rfam数据库进行比对过滤,通过质控获得最终数据(Clean read)。利用Venn分析软件筛选出DMSO组和BW720组中差异表达明显的基因,进行功能注释(GO)以及信号通路(KEGG)分析。随机选择10个基因,利用荧光定量PCR (qPCR)检测基因在不同处理条件下细胞中的表达量。在验证测序结果的准确性后,选出差异表达明显的基因,分析其在TaNM Ⅰ细胞的凋亡、增殖等信号通路方面的作用。结果显示：BW720组和DMSO组中分别得到6 854 019 704和6 627 265 854条Raw reads,过滤、质控后分别得到22 925 606和22 171 427条Clean reads。BW720组和DMSO组中筛选出差异表达明显的基因共计4 054个(P＜0.05),其中,2 146个基因显著上调,1 908个基因显著下调;进一步筛选出共同差异表达的基因367个,其中,显著上调的196个,显著下调的171个。同时,qPCR验证随机选择10个基因的表达趋势与转录组测序结果一致,表明测序结果可靠。然后对差异表达基因进行GO功能注释,筛选到与细胞增殖相关的20个生物学过程、15个细胞组分以及11个分子功能条目。KEGG富集分析结果显示,在Top20的信号通路中筛选出与环形泰勒虫转化细胞有关的一些信号通路,如：癌症信号通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路等。对这些信号通路进一步分析发现：PI3KR3、FOXO1、IL23A、FZD3、AKT、MMP9等基因在环形泰勒虫转化细胞的研究中也有相关文献的报道。本研究表明,在TaNM Ⅰ细胞中DAPK1、FZD3、FOXO3、PI3KR3等可能在感染细胞无限增殖的过程中发挥作用,为后续研究TaNM Ⅰ细胞无限增殖机制奠定了基础。     

基于猪小肠上皮细胞炎症模型分析产肠毒素大肠杆菌诱导的转录组表达变化

【目的】分析产肠毒素大肠杆菌（enterotoxigenic Escherichia coli，ETEC）诱导猪小肠上皮细胞（IPEC-J2）炎症反应的主要宿主调控基因及相关分子通路，为进一步揭示ETEC感染引发炎症反应的作用机制提供理论依据。【方法】用感染复数（multiplicity of infection，MOI）为100的ETEC菌液感染IPEC-J2细胞，18 h后收集细胞上清，通过ELISA方法检测炎性因子白细胞介素1β（interleukin 1 β，IL-1β）的分泌水平。由Illumina PE150测序平台进行高通量转录组测序，通过edgeR v 3.12.1软件对测序结果进行差异表达分析，利用GOseq和KOBAS 2.0软件对得到的差异表达mRNA进行GO功能和KEGG通路富集分析，随机挑选5条差异表达mRNA，利用实时荧光定量PCR对其验证。【结果】试验成功建立了ETEC感染诱导的IPEC-J2细胞炎症模型。与对照组相比，炎症模型组共发现529条差异表达mRNA，其中236条表达上调，293条表达下调，包括HSP90AA1、CGNL1、CADPS2、EHBP1等免疫相关基因。GO功能分析表明，ETEC感染后差异表达mRNA显著富集于细胞组分和生物过程，包括细胞内成分（intracellular part）、细胞质（cytoplasm）、核成分（nuclear part）、胞内膜结合细胞器（intracellular membrance-bounded organelle）、膜结合细胞器（membrance-bounded orgabelle）及细胞进程（cellular process）等。KEGG通路分析表明，炎症模型中差异表达基因大多数被注释到疾病相关通路及Toll样受体信号通路、mTOR信号通路、细胞周期、黏附连接等免疫相关信号通路。利用实时荧光定量PCR验证随机挑选的5条差异表达mRNA，结果与测序报告中差异表达mRNA变化趋势一致，证明测序结果可信。【结论】HSP90AA1、CGNL1、CADPS2和EHBP1等基因可能在ETEC黏附IPEC-J2细胞并诱导炎症反应中发挥关键作用，并通过Toll样受体、mTOR等信号通路进行免疫调控。研究结果为进一步揭示ETEC感染诱导炎症反应的分子机制及相关调控网络提供参考依据。     

gga-miR-155对MDCC-MSB1细胞转录组的影响

旨在探讨gga-miR-155对马立克病病毒转化的肿瘤细胞系MDCC-MSB1细胞转录组水平变化的影响。本研究以MDCC-MSB1细胞为研究对象，首先将gga-miR-155模拟物及其阴性对照转染MDCC-MSB1细胞，在转染后48 h提取总RNA，用安捷伦2100核酸检测仪分析各组细胞总RNA的完整性，采用RT-qPCR分析gga-miR-155在MDCC-MSB1细胞中的过表达情况；然后利用高通量测序技术，分析gga-miR-155过表达后MDCC-MSB1细胞转录水平的变化，筛选差异表达基因，结合生物信息学分析预测差异表达基因中gga-miR-155靶mRNA。结果显示：制备了gga-miR-155在MDCC-MSB1细胞过表达样本并构建了高通量测序文库；与对照组相比，gga-miR-155过表达组的差异表达基因有87个，其中，上调表达的基因有47个，下调表达的基因有40个；GO与KEGG分析显示，这些差异表达基因显著富集于代谢和蛋白结合过程/信号通路；通过Targetscan和miRada软件预测下调表达基因中鸡BACH1为gga-miR-155的靶mRNA （P<0.05）。综上，过表达gga-miR-155可调控MDCC-MSB1细胞的转录组水平，差异表达基因中BACH1基因可能在gga-miR-155的作用下参与了MDCC-MSB1细胞的代谢过程。     

Apelin-13对小鼠血脂代谢的影响及其机制研究

本研究旨在探索Apelin-13调控小鼠血脂代谢的生理机制。试验选取体重相近的小鼠96只,随机分为4个处理,每个处理4个重复。对照组和3个试验组小鼠分别每天皮下注射100 μL 0.9%的生理盐水、10、20和50 μg·kg^-1的Apelin-13,试验期为14 d。测定小鼠的生长性能、血清Apelin-13和血脂含量,并采用Illumina Novaseq测序平台进行小鼠肝组织转录组测序（RNA-seq）。结果表明,与对照组相比,皮下注射Apelin-13极显著提高了血清Apelin-13和高密度蛋白胆固醇含量（P<0.01）,显著降低了血清甘油三酯含量（P<0.05）。试验组和处理组共检测到340个上调和350个下调的差异表达基因（differentially expressed genes,DEGs）。这些DEGs最显著富集的信号通路为视黄醇代谢,该通路中的细胞色素P450（Cyp）和尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶（Ugt）两个超家族基因大部分上调表达。试验结果表明,Apelin-13可能通过调控视黄醇代谢信号通路中的Cyp和Ugt两个超家族基因的表达来调控小鼠的血脂代谢。     

外源注射miR-499-5p对肉鸡腓肠肌转录组的影响

旨在探讨外源注射miR-499-5p对肉鸡腓肠肌肌纤维直径及基因表达的影响，完善miR-499-5p对肉鸡骨骼肌发育的分子调控机制。本研究选用14日龄健康大恒肉鸡公鸡16只，随机分为2组，每组8个重复，均正常饲喂日粮，分别在腓肠肌部位肌肉注射agomiR-NC（对照组，5 nmol）和agomiR-miR-499-5p（注射组，5 nmol），为保证试验效果，每3 d注射1次，共注射6次。注射完成后将16只肉鸡屠宰，采集腓肠肌组织进行肌纤维直径测定和转录组学（RNA-seq）分析。结果显示，注射miR-499-5p可导致肉鸡腓肠肌肌纤维直径显著减小（P<0.05）。转录组测序结果显示，注射组和对照组分别获得308 263 164和316 696 152条clean reads，与鸡参考基因组的比对率分别为90.29%和89.57%。与对照组相比，注射组共有差异表达基因18个，其中上调基因12个，下调基因6个（P<0.05）。其中差异表达最大的两个基因分别是原癌基因FOS（fos proto oncogene，FOS）和早期生长应答蛋白基因（EGR1）。GO富集分析发现，差异表达基因显著富集于跨膜受体蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶信号通路、转录调控、脂质合成和骨骼肌再生等过程。KEGG富集分析结果显示，差异表达基因显著富集于丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）信号通路和Wnt信号通路。利用生物信息学软件预测到miR-499-5p的靶基因共78个，GO富集分析发现，靶基因也显著富集于丝氨酸/苏氨酸激酶活性的负调控和转录因子活性等过程。本研究表明，注射miR-499-5p可改变肉鸡腓肠肌肌纤维直径从而影响肌纤维特性，差异表达基因中的FOS、EGR1、CYR61和WNT7A基因可能在miR-499-5p的作用下通过上述通路参与了脂肪沉积和肌肉发育的调控。     

多浪羊与小尾寒羊皮下脂肪组织转录组分析

旨在探索多浪羊（D组）与小尾寒羊（X组）皮下脂肪组织中的特异性表达基因,并研究其潜在的作用,为理解绵羊脂肪组织发育规律以及对脂代谢相关疾病的预防和治疗研究提供依据。本研究选取脂肪沉积能力存在差异、健康无病、体况良好、种内个体体重相近（约50 kg）的雌性成年多浪羊和小尾寒羊为试验材料,分为D组（试验组）和X组（对照组）,每组3个重复,采集位于背最长肌的皮下脂肪组织,应用RNA-Seq技术和生物信息学方法进行转录组测序并对结果进行分析。以|Fold change|≥2,P adjust≤0.05为标准筛选差异表达基因,通过对差异表达基因进行GO功能注释和KEGG通路富集分析,得到与脂肪沉积和脂代谢有关的差异基因。为了验证测序数据的可靠性,本研究随机选取了6个差异表达基因进行qRT-PCR验证。结果显示,在6个样本中共检测到38 672个已知的mRNAs,新的mRNAs为1 606个,在两组中共有839个差异表达基因,其中有320个差异基因在多浪羊组中上调表达,有519个差异基因在多浪羊组中下调表达。通过GO功能注释分析发现,差异表达基因主要参与脂质分解代谢过程、脂质生物合成过程、脂质分解代谢负调控过程、MAPK级联反应调控、对甘油三酯的反应等生物学过程。KEGG通路富集结果显示,差异表达基因显著富集到了PI3K-Akt、MAPK、胰岛素以及PPAR等信号通路中。qRT-PCR结果与测序结果一致,表明测序结果可靠。通过对多浪羊和小尾寒羊皮下脂肪组织进行转录组测序以及生物信息学分析,筛选到与脂肪沉积和脂代谢相关的差异表达基因,这些基因主要参与脂质生物合成、脂质代谢等过程,其中COL1A1、AKT2、SCD、LPL、PCK1与PPP2R5A可能在多浪羊与小尾寒羊的皮下脂肪组织的沉积与代谢中发挥重要作用。