猪氟烷基因的检测及其对生长与肉质的影响

对中国瘦肉猪新品系ＤＩ和ＳＪ系３０１头仔猪进行氟烷测验,阳性率为１．３３％。随机抽取氟烷阴性猪３４头进行基因型检测,有６头为杂合子,由此推知ＮＮ、Ｎｎ和ｎｎ的频率分别为８１．２６％１７．４１％和１．３３％,Ｎ和ｎ的频率分别为８９．９７和１０．０３％。对三种基因型的肉质进行评定结果显示,４头氟烷阳性猪（ｎｎ）肉质最差,出现３头严重ＰＳＥ肉和一头轻度ＰＳＥ肉,而氟烷阴性猪未发生ＰＳＥ肉。２８头ＳＪ系氟烷阴性猪用阳性公猪测交,对产出的２０窝２０８头后代进行氟烷测定,共检出４窝中的２１头阳性猪,对测交后代进行肥育性能和肉质测定,结果阳性猪的日增重和饲料转化率等较低,屠宰率、眼肌面积和瘦肉率等较高,肉质较差。     

撒坝猪及其配套系氟烷基园检测与遗传效应分析

利用ＰＣＲ－ＲＦＬＰ技术对云南省楚雄州种猪场１０４头种猪包括撒坝纯种７１头,加系大约克１０头,丹系长白８头,美系杜洛克９头及三元杂大长撒６头）进行了氟烷基因检测。发现杂合子猪（Ｎｎ）４头,包括２头大约克,２头大长撒,未发现阳性猪（ｎｎ）,其余皆为阴性（ＮＮ）。对大长撒氟烷基因杂合子与同群阴性猪作生长和肉质性状比较,显示其杂合子在瘦肉率、日增重和料重比等有优势,而肉质性状无明显差异。本文还就氟烷基因     

猪MyoG基因的多态性及其对岔路黑猪胴体和肉质的影响研究

应用PCR-RFLP技术分析了岔路黑猪（56头）、嘉兴黑猪（50头）和Ⅰ系金华猪（109头）群体中MyoG基因的基因频率和基因型频率分布,测定了21头纯种岔路黑猪的胴体和肉质性状,并采用一般线性模型分析了MyoG基因型与以上性状的相关性。结果表明：岔路猪群体中AA型纯合子占绝大多数（84％）,BB型纯合子最少（4％）,A基因频率占90％;嘉兴黑猪群体中只有一种基因型（AA）;而金华猪（Ⅰ系）群体中BB与AB基因型频率相当（分别为45％、46％）,B基因频率大约为A基因频率的2倍。MyoG基因对岔路猪胴体重、后腿重、胴体长等胴体性状有显著影响,但对岔路猪肉质性状无显著影响。     

猪恶性高温综合征（MHS）基因群体检测及部分片段DNA序列研究

本研究主要包括：（１）建立了猪ＭＨＳ基因检测的ＰＣＲ－ＲＦＬＰ方法。该方法具有准确、快速和无侵害的特点；（２）利用猪ＭＨＳ基因的ＰＣＲ－ＲＦＬＰ方法对中国现有猪种２０个群体的ＭＨＳ基因座位的基因和基因型频率进行了检测。结果表明，属于中国的本地品种五指山猪、香猪，引进品种约克夏猪，均不含有ＭＨＳ基因；在中国本地品种二花脸猪和民猪中，发现存在ＭＨＳ基因，且民猪的频率较高（０．１５６２）；培育品种北京花猪，引进品种丹系长白猪和杜洛克猪，均有ＭＨＳ基因；引进品种皮特兰猪、比系长白猪，ＭＨＳ基因频率最高，分别为０．９５２０和０．９４３２；（３）猪ＲＹＲ１／ＣＲＣ基因部分ＤＮＡ序列品种间比较，ＭＨＳＮＮ香猪和二花脸猪的１８４３位为“Ｃ”，而ＭＨＳｎｎ为“Ｔ”；同时还发现一些单碱基的差异     

Leptin基因第3469位点基因型对合作猪繁殖性能和体尺的影响

以Leptin基因作为控制猪产仔性状和生长性状的候选基因,采用PCR-SSCP技术在合作猪群体中进行单核苷酸多态性(SNPs)检测,分析Leptin基因的遗传多样性及突变位点基因型频率与基因频率。同时,结合生长性状和母猪产仔性状记录,研究了不同基因型对产仔性状、生长性状的遗传效应。结果:通过对合作猪Leptin基因SNPs分析,检测到了2个等位基因,3种基因型。Leptin基因第3469位点的基因型效应对合作猪体重、体高、胸围、头长、头胎总产仔数、2胎总产仔数、2胎活产仔数、3胎总产仔数、3胎活产仔数和4胎活产仔数影响均显著(P0.05),而对体长、头胎活产仔数和4胎总产仔数影响不显著(P0.05)。这表明Leptin基因第3469位点的突变与合作猪的产仔数和生长性状有密切关系,Leptin基因可作为控制合作猪产仔性状和生长性状的候选基因。     

松辽黑猪IGF-Ⅰ基因外显子4多态性及与部分生产性能的关系

以IGF-Ⅰ基因作为松辽黑猪生长和胴体性状的候选基因,采用PCR-SSCP方法检测30头松辽黑猪IGF-Ⅰ基因外显子4(179 bp)的多态性,对该基因的不同基因型与生长和胴体性状的关系进行分析。结果表明,IGF-Ⅰ基因的2个等位基因和3种基因型在松辽黑猪中均有不同频率的分布,遗传多态性较高;IGF-Ⅰ不同基因型对断奶后日增重有显著影响,AA型显著高于AB型和BB型(P<0.01)。AA型猪的瘦肉率显著低于AB型和BB型(P<0.01),而AA型猪的平均背膘厚显著高于AB型和BB型(P<0.01),对其它性状的影响差异不显著。因此,IGF-Ⅰ基因的遗传分析结果说明该基因对松辽黑猪的平均日增重、瘦肉率和平均背膘厚等3个性状有显著的遗传影响,可以初步推断IGF-Ⅰ基因可能是影响猪生长和胴体性状的一个主效基因或是一个与影响猪生长和胴体性状的QTL连锁的基因。     

松辽黑猪IGF-Ⅰ基因外显子4多态性及与部分生产性能的关系

以IGF-Ⅰ基因作为松辽黑猪生长和胴体性状的候选基因，采用PCR-SSCP方法检测30头松辽黑猪IGF-Ⅰ基因外显子4(179 bp)的多态性，对该基因的不同基因型与生长和胴体性状的关系进行分析。结果表明，IGF-Ⅰ基因的2个等位基因和3种基因型在松辽黑猪中均有不同频率的分布，遗传多态性较高; IGF-Ⅰ不同基因型对断奶后日增重有显著影响，AA型显著高于AB型和BB型(P<0.01)。AA型猪的瘦肉率显著低于AB型和BB型(P<0.01)，而AA型猪的平均背膘厚显著高于AB型和BB型(P<0.01)，对其它性状的影响差异不显著。因此，IGF-Ⅰ基因的遗传分析结果说明该基因对松辽黑猪的平均日增重、瘦肉率和平均背膘厚等3个性状有显著的遗传影响，可以初步推断IGF-Ⅰ基因可能是影响猪生长和胴体性状的一个主效基因或是一个与影响猪生长和胴体性状的QTL连锁的基因。     

撒坝猪胰岛素样生长因子-Ⅰ基因多态性及其与部分生长性状的关联分析

胰岛素样生长因子-Ⅰ(insulin-like growth factor-Ⅰ,IGF-Ⅰ)基因的表达产物对猪肌肉的生长有着重要的调控作用。以IGF-Ⅰ基因作为撒坝猪生长性状的候选基因,运用PCR-RFLP技术对其HhaⅠ位点的多态性进行了检测,并对IGF-Ⅰ基因的多态性与12个阶段体重、日增重和体尺性状的关系进行了分析。结果表明,撒坝猪IGF-Ⅰ基因的多态性较为丰富,产生AA、AB和BB 3种基因型,其基因型频率分别是0.3473、0.5149、0.1378,等位基因A和B的频率分别是0.6048、0.3952,且该基因座位处于Hardy-Weinberg平衡状态,撒坝猪IGF-Ⅰ基因的遗传变异对其生长性状有着显著的影响(P<0.05或P<0.01),其中,不同阶段体重和日增重的增效基因型为AB基因型,180日龄体尺性状的增效基因型多为BB基因型(部分性状表现为AB基因型最高)。结合前人的研究,初步推断IGF-Ⅰ基因可能是影响猪生长性状的一个主效基因或是一个与影响猪生长性状的数量性状座位(quantiative trait locus, QTL)连锁的基因。     

猪PPARGC1A基因多态性与生长性状的关联分析及其表达

本研究通过直接测序检测PPARGC1A基因启动子区多态位点g.17949513GA在535头杜洛克猪、长白猪以及大约克猪中的遗传结构,并与达到目标体重日龄、平均日增重等生长性状进行关联分析。利用实时荧光定量PCR检测PPARGC1A基因在大约克猪和金华猪背脂和背最长肌组织中的表达量。结果表明,在试验群体中G等位基因的频率高于A等位基因。在长白猪中基因型频率最高的是GG,而杜洛克猪和大约克猪中GA基因型的频率最高。GG基因型个体达到目标体重日龄低于AA基因型和GA基因型,平均日增重高于AA基因型。不同基因型个体之间的100 kg体重活体背膘厚和料重比差异不显著(P0.05)。PPARGC1A基因mRNA水平在大约克猪中显著高于金华猪(P0.05)。综上所述,PPARGC1A基因g.17949513GA位点与生长性状显著关联,该基因的差异表达对生长发育具有一定的影响,可作为猪生长性状选育的潜在分子标记。     

猪MyoG基因的多态性及其对岔路黑猪胴体和肉质的影响研究

应用PCR--RFLP技术分析了岔路黑猪(56头)、嘉兴黑猪(50头)和I系金华猪(109头)群体中MyoG基因的基因频率和基因型频率分布,测定了21头纯种岔路黑猪的胴体和肉质性状,并采用一般线性模型分析了MyoG基因型与以上性状的相关性.结果表明:岔路猪群体中AA型纯合子占绝大多数(84%),BB型纯合子最少(4%),A基因频率占90%,嘉兴黑猪群体中只有一种基因型(AA);而金华猪(I系)群体中BB与AB基因型频率相当(分别为45%、46%),B基因频率大约为A基因频率的2倍.MyoG基因对岔路猪胴体重、后腿重、胴体长等胴体性状有显著影响,但对岔路猪肉质性状无显著影响.     

SIRT3基因多态性与猪肉质性状的关联分析

为了探索SIRT3基因多态性与猪肉质性状的关联性,通过引物设计、PCR扩增、测序以及酶切分型,对SIRT3基因的突变位点进行检测和分析,确定了SIRT3基因的三种基因型,并将SIRT3基因的三种基因型与湘村黑猪、大围子猪的肉质性状进行了关联分析。结果表明:在猪SIRT3基因的第五外显子上存在一处A/G突变位点,形成AA、AG和GG三种基因型。进行猪SIRT3基因多态性分析可知,GG基因型频率和等位基因频率在两猪种中占有绝对优势,且在湘村黑猪中并未检测出AA基因型突变个体;进行猪SIRT3基因突变位点遗传多样性分析可知,湘村黑猪的多态信息含量(PIC)小于0.25,为低度多态,大围子猪的PIC含量在0.25～0.50之间,为中度多态。进行基因多态性与猪肉质性状的关联分析,在大围子猪24小时滴水损失、失水率和肌内脂肪含量三个性状中,AA基因型与AG、GG基因型相比差异显著(P0.05);而湘村黑猪仅有肌肉色值中的亮度值(L~*值)在各基因型之间存在显著性差异(P0.05),其余性状之间并不存在差异显著性(P0.05)。由此得出,SIRT3基因突变基因型可以提高猪肉品质,SIRT3基因可作为影响猪肉质性状的候选基因进行深入研究分析。     

五指山猪H-FABP基因不对称PCR-SSCP研究

以海南五指山猪为试验材料,采用不对称PCR-SSCP和测序相结合技术,对海南五指山猪心脏脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因第3内含子(intron 3)进行多态检测,并分析其与生长性状(体重、体高、体长、胸围)的相关性。结果表明:在五指山猪H-FABP基因in-tron 3中发现了3种基因型,分别命名为AA、AB、BB,对其中的纯合子AA、BB进行测序,发现intron 3的第335位点处发生了突变,都是由碱基A→G的转换造成。AA、AB、BB三种基因型频率分别为63.5%,18.2%,18.2%,A、B等位基因频率分别为73%和27%。不同基因型个体各生长性状的方差分析表明,不同基因型之间的生产性状无显著差异。     

五指山猪H—FABP基因不对称PCR—SSCP研究

以海南五指山猪为试验材料,采用不对称PCR-SSCP和测序相结合技术,对海南五指山猪心脏脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因第3内含子(intron 3)进行多态检测,并分析其与生长性状(体重、体高、体长、胸围)的相关性.结果表明:在五指山猪H-FABP基因intron 3中发现了3种基因型,分别命名为AA、AB、BB,对其中的纯合子AA、BB进行测序,发现intron 3的第335位点处发生了突变,都是由碱基A→G的转换造成.AA、AB、BB三种基因型频率分别为63.5%,18.2%,18.2%,A、B等位基因频率分别为73%和27%.不同基因型个体各生长性状的方差分析表明,不同基因型之间的生产性状无显著差异.     

大河乌猪磷酸酯转移蛋白基因内含子4的SNPs检测及其与生产性能的关联分析

本研究旨在阐明猪磷酸酯转移蛋白(phospholipid transfer protein,PLTP)基因第4内含子多态性及其与生长性状之间的关系。结果表明,该位点具有2种等位基因A/a,F4、F5、F6各群体中的基因频率分别为0.4172/0.5828、0.4155/0.5845、0.4309/0.5691。取不同基因型纯合子样品进行测序,共发现4个单核苷酸多态位点(SNPs),其有3个突变为转换,1个为颠换,多态位点分别为1085、1192、1286和1305 bp。应用最小二乘模型分析不同基因型对生长性状(初生重、45日龄体重、4月龄体重及6月龄体重、体高、体长、管围、背膘厚)的影响。结果显示,F4代各性状基因型间差异不显著(P>0.05);F5代Aa基因型个体初生重及背膘厚显著高于AA基因型(P<0.05),与aa基因型个体间差异不显著(P>0.05);F6代aa基因型个体4月龄体重及Aa基因型个体6月龄管围都极显著高于AA基因型(P<0.01),aa基因型个体6月龄体高显著高于AA基因型(P<0.05),Aa基因型个体初生重显著高于AA基因型(P<0.05)。另外,Aa基因型的雌性个体对初生重及膘厚性状的影响较AA基因型高(P<0.05);Aa基因型雄性个体对管围性状的影响较AA基因型高(P<0.01)。研究结果提示猪PLTP基因Aa基因型对生长性状有着重要的影响,该SNP可能是改良猪经济性状的重要分子标记位点。     

Myostatin基因5'调控区的多态与猪生长性能的关系

采用PCR-RFLP技术对45头金皮(金华猪×皮特兰猪)F代猪Myostatin基因5'调控区的多态性进行检测,根据酶切结果将其分为AA、TT和AT 3种基因型,结果显示A等位基因频率为0.467,T等位基因频率为0.533.对这些个体进行生长和屠宰性能测定以及对背最长肌进行免疫组化分析,进而采用SPSS程序分析Myo-statin不同基因型对金皮F2代猪生长性状,肌纤维组织学特性及胴体性状的影响.结果表明:Myostatin基因对金皮F2代猪肌纤维直径、MHC Ⅰ型肌纤维比例、肩部背膘厚、眼肌肉色亮度及出生至4月龄平均日增质量的影响均达到显著水平(P＜0.05).     

猪PGC1基因多态性与胴体性状的相关性分析

通过PCR-RFLP方法,检测外来品种大约克猪和江苏地方品种梅山猪、二花脸猪、姜曲海猪以及培育品种苏钟猪共144头,结果表明PGC1基因第8外显子序列经Aul I酶切后存在AA、AT和TT 3种基因型,其中大约克猪中AA基因型占优势,A等位基因频率为0.7, 而江苏地方品种猪中,TT占绝对优势.分析PGC1基因型与胴体性状相关性发现,AA基因型猪的左胴重、右胴重和脂肪重均高于TT基因型猪,差异达到显著水平(P＜0.05).倒数第三、四腰椎间背膘厚AA基因型显著高于TT基因型猪,差异达到极显著水平(P＜0.01),AT基因型与TT基因型差异达到显著水平(P＜0.05).     

京海黄鸡POU1F1基因多态性及其与生长性能的遗传效应分析

采用PCR-SSCP和DNA测序技术检测POU1F1基因在京海黄鸡中的单核苷酸多态性(SNPs),并对不同基因型与京海黄鸡生长性能的相关性进行了分析.结果表明:在POU1F1基因第三外显子第5 231 bp位置有A→T碱基的点突变,在京海黄鸡群体中检测到AA、AB、BB 3种基因型,A等位基因的频率为0.500,B等位基因的频率为0.500.基因型与生长性能的关联分析得知:POU1F1基因不同基因型显著影响京海黄鸡各周龄体重,AB型显著高于从型和BB型(P<0.01).因此,推测POU1F1基因可能是影响鸡生长性状的主效基因或与主效基因紧密连锁的标记基因,并且能够在分子标记辅助选择中用于对鸡生长性状的遗传改良和固定.     

湘黄猪Atrn基因的PCR-RFLP及其与生长和胴体性状间的关系

以129头湘黄猪为试验材料,采用PCR-RFLP技术,对Haln基因和Atrn基因进行了检测分析,检测到NN、Nn2种Haln基因型和AA,AB和BB3种Atrn基因型,其频率相应为0.9612、0.0388和0.1783、0.6047、0.2170;同时分析了NN基因型群体中,不同Atrn基因型间生长速度和胴体性状的关系,结果表明:BB基因型猪的平均日增重、平均背膘厚和估测瘦肉率明显优于AB基因型猪,AA基因型猪处于中间状态,即:BB>AA>AB。这一结果与140头丹麦资源家系猪样本的检测结果基本一致,表明Atrn基因对猪重要经济性状具有影响作用。     

猪乳铁蛋白基因多态性与仔猪腹泻及生产性能关系的研究

试验采用PCR-RFLP结合测序的方法,检测民猪和长白猪群体乳铁蛋白基因多态性,并分析母猪乳铁蛋白基因多态性对仔猪腹泻和生长性状的影响。结果表明:猪乳铁蛋白基因第12外显子第140位发生C→T的同义突变。民猪与长白猪群体中该位点皆存在AA,BB,AB三种基因型,两群体基因型分布差异显著(P0.05),母猪不同基因型对部分仔猪腹泻和生长性状有显著影响(P0.05)。     

Myostatin基因5′调控区的多态与猪生长性能的关系

采用PCR-RFLP技术对45头金皮（金华猪&#215;皮特兰猪）F2代猪Myostatin基因5′调控区的多态性进行检测,根据酶切结果将其分为AA、TT和AT 3种基因型,结果显示A等位基因频率为0.467,T等位基因频率为0.533。对这些个体进行生长和屠宰性能测定以及对背最长肌进行免疫组化分析,进而采用SPSS程序分析Myo-statin不同基因型对金皮F2代猪生长性状、肌纤维组织学特性及胴体性状的影响。结果表明：Myostatin基因对金皮F2代猪肌纤维直径、MHC Ⅰ型肌纤维比例、肩部背膘厚、眼肌肉色亮度及出生至4月龄平均日增质量的影响均达到显著水平（P〈0.05）。