中国农业科学院哈尔滨兽医研究所——马传染病与慢病毒病创新团队

<正>研究内容1.病毒与宿主天然免疫相互作用研究揭示宿主天然免疫与病毒间的相互作用分子机理,重点关注宿主免疫压力对病毒进化的促进作用及机制、病原跨种间感染机制。2.马属动物传染病病原的致病与免疫机制研究深入开展马传贫病毒、马流感病毒和马疱疹病毒等病原的基因功能研究,病毒致病的分子机理,以及疫苗免疫保护机理研究。3.马属动物重要传染病的流行病学和防控应用技术研究     

A型流感病毒与宿主互作的研究进展

为成功建立感染并在宿主体内进行高效复制和扩散,流感病毒需要与宿主蛋白进行紧密的互作。因此,鉴定与流感病毒生命周期密切相关的宿主蛋白,对阐明流感病毒的致病机理以及发现新的抗病毒靶点非常关键。随着后基因组时代研究技术的不断更新,尤其是高通量生物技术以及生物信息学技术的迅猛发展,加速了对流感病毒与宿主相互作用的深入了解。而用系统生物学手段来分析病毒与宿主的相互作用也为了解流感病毒感染宿主的潜在机制提供基础。文章在简要介绍目前研究病原与宿主相互作用相关技术的基础上,系统地论述了当前流感病毒与宿主相互作用的研究进展,并提出未来研究流感病毒与宿主相互作用可能的发展方向。     

中国农业科学院哈尔滨兽医研究所——马传染病与慢病毒病创新团队

<正>研究内容1.病毒与宿主天然免疫相互作用研究揭示宿主天然免疫与病毒间的相互作用分子机理,重点关注宿主免疫压力对病毒进化的促进作用及机制、病原跨种间感染机制。2.马属动物传染病病原的致病与免疫机制研究深入开展马传贫病毒、马流感病毒和马疱疹病毒等病原的基因功能研究,病毒致病的分子机理,以及疫苗免疫保护机理研究。3.马属动物重要传染病的流行病学和防控应用技术研究重点关注马属动物传染病的诊断和防控用生物制品的研发,创建新型传染病诊断试剂盒、预防及     

基于RNA-Seq筛选新型鸭细小病毒感染鸭胚成纤维细胞的差异表达基因

为筛选鸭细小病毒(DPV)感染鸭胚成纤维(DEF)细胞后的差异表达基因,本研究利用DPV接种DEF细胞作为试验组,对照组加入相同体积的2%DMEM,培养至72 h后提取2组样品的总RNA,利用RNA-Seq技术筛选出DEF细胞感染DPV后的差异表达基因,并对其进行生物信息学GO功能分类和KEGG分析。结果显示,差异表达水平变化倍数(fold change,FC)在2倍以上的基因共有4 073个,其中上调表达基因1 904个,下调表达2 169个。GO功能分析显示,这些基因主要涉及到炎症反应、免疫反应、蛋白结合、转运活动等功能。KEGG信号通路分析表明,这些差异表达基因参与细胞因子受体相互作用、新陈代谢、TNF、NF-κB、Jak-STAT、Toll样受体等信号通路。应用荧光定量PCR(Real-time FQ-PCR)验证部分差异表达基因的检测结果显示,差异基因的相对表达量与RNA-Seq技术测序结果基本一致,表明了RNA-Seq检测结果的可靠性。本研究为进一步研究DPV的致病作用及宿主抗病机制奠定了基础。     

抗病毒免疫中宿主细胞的自溶作用以及病毒的进化

多种病原体能够侵害宿主细胞并从宿主的机体免疫系统的防御下得以逃逸。在宿主细胞中,病原体利用一些复杂的方法和途径避免了细胞对入侵者强有力的攻击。近年来的研究表明,自噬作用是细胞内宿主细胞杀灭入侵病原微生物的防御结构中最显著的工具之一,有些病原体却可以在分子水平阻滞这种自噬通路而使持续感染成为可能。宿主抗病毒反应中自噬作用与先天免疫和获得性免疫之间,以及病毒与自噬作用之间存在着复杂的相互关系,这些关系主导了自噬作用和病原菌之间的相互作用。     

免疫增强重组流感病毒体

自英国医生Edward Tenner提出免疫接种的概念之后,疾病的预防已成为提高人类生活质量的最高要求.由于病原不断进化,自然免疫反应不可能实现理想的免疫保护,而且由于病原体可能影响宿主的免疫反应,甚至在一定程度上抑制宿主免疫系统的抗感染能力,因此,需要在对病原分子生物学、致病机理以及病原与免疫系统间相互作用的综合理解基础上,研究更安全、有效的免疫方法.     

NDRVσC蛋白互作的宿主因子筛选及生物信息学分析

研究鸭呼肠孤病毒(Duck reovirus,DRV)σC蛋白与宿主因子之间的相互作用,对揭示σC蛋白在病毒复制过程中的功能及该病毒的致病机理具有重要作用。本研究采用免疫共沉淀法及质谱分析技术,筛选出与σC蛋白可能发生互作的宿主相关蛋白,并对所筛选出的宿主细胞蛋白进行了GO注释和KEGG代谢通路注释。结果表明,与空白对照组比较,获得与σC蛋白相互作用的宿主细胞蛋白有100个;筛选出的这些宿主细胞蛋白中,在病毒感染后不同时间点差异表达量均上升3倍以上的蛋白有6个,分别与病原致病性、蛋白质代谢途径、细胞信号通路转导有关。该研究结果为进一步探讨σC蛋白的生物学功能奠定了基础,也为揭示σC蛋白与宿主因子相互作用进而调控DRV复制等机制研究提供线索。     

筛选细菌毒力基因方法的研究进展

细菌的致病过程涉及多个毒力基因表达产物的相互作用。然而,随着越来越多的微生物基因组测序工作的相继或即将完成,对其毒力基因的研究却相对滞后。这不但影响了致病机理等基础研究的进展,还成为制约抗菌药物和疫苗研发的瓶颈。本文从生物信息学、筛选差异表达基因等4个方面介绍了筛选细菌毒力基因的方法及其应用,并综合了研究致病菌与宿主间相互作用关系的方法。为发现和研究致病菌新的毒力因子,理顺病原与宿主关系开拓了思路。     

哈兽研学者在传染性法氏囊病病毒与宿主相互作用研究中取得重要进展

<正>中国农业科学院哈尔滨兽医研究所王笑梅研究员率领的研究团队一直从事禽免疫抑制病的病原基础及防控技术研究。近期,在国家自然科学基金重点项目和兽医生物技术国家重点实验室自主研究课题的资助下,团队王永强博士和韩春燕硕士在禽类重要免疫抑制病毒——传染性法氏囊病病毒(IBDV)与宿主相互作用研究中取得重要进展,揭示了宿主蛋白VDAC1通过增强RNPs复     

鸡肠道菌群平衡的影响因素及其调控

肠道微生物参与鸡的生长、发育及营养物质消化吸收等全过程,对宿主健康起重要作用。综述了影响鸡肠道微生物平衡的因素(宿主、日龄、饲养环境、日粮、病原微生物感染等)及其调控措施,以期为研究肠道菌群与宿主的相互作用机制提供依据。     

细菌多糖的生物合成机制研究进展

多糖是细菌细胞的主要组成部分,在细菌与宿主的相互作用中起到重要作用,在参与细菌与宿主的识别,帮助细菌产生毒力,调节宿主免疫反应等生物过程中扮演着重要的角色。随着基因组学的发展,人们发现尽管细菌多糖的种类很多,但它们的合成机制具有相似性。多糖生物合成的研究主要基于基因组的序列分析预测,结合代谢产物研究的基因分析,不够详尽。随着研究的深入,人们越来越关注细菌多糖的合成机制,这种机制的研究将为进一步阐明细菌多糖多样性的形成机制及与宿主间的相互作用机制奠定基础,为开发针对相应病原菌的新型疫苗和治疗方法,及进一步实现分子水平的相关疾病防控和资源开发提供技术支持。作者以肽聚糖、O-抗原和夹膜多糖为代表,阐述了其生物合成及体外生物合成机制的研究进展和相关问题,并总结了细菌多糖合成途径的研究在寻找候选抗原和控制病原细菌靶位以及研究细菌遗传进化和生物合成方面的作用。     

蛋白质组学技术在病毒及其感染机制研究中的应用

在病毒学领域中,如双向差异凝胶电泳、偶联应用质谱和稳定同位素标记等的蛋白质组学技术正在被广泛应用,可从整体层面上分析组织或细胞内动态变化的蛋白质组成、表达水平与翻译后修饰,探索蛋白质的功能及蛋白质之间相互作用与联系,有助于病毒感染及病毒与宿主间的相互作用机制的研究,推动病毒相关疾病诊断和治疗的发展。作者简要论述了近年来蛋白质组学技术在病毒及其感染机制研究中的应用,并对其在病毒学研究中的应用前景作了展望。     

iTRAQ标记技术及其在微生物比较蛋白质组学中的研究进展

病原微生物的致病作用是由多种蛋白质共同参与下的病原微生物-宿主相互作用的复杂过程,因此应用比较蛋白质组学方法动态、整体和定量地分析病原微生物致病过程中蛋白质的差异表达谱,对于解析病原微生物的致病机制具有至关重要的作用.相对和绝对定量的等量异位标签技术(Isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)以其高通量、重复性好、能够处理复杂样本和同时进行定性、定量分析的优点,在生命科学各个领域中得到了广泛的应用.     

鱼类铁限制及相关病原竞争获取铁离子机制研究进展

正铁是所有生命体不可或缺的微量元素之一,它参与到氧气运输、电子转移、能源物质ATP合成、DNA复制及细胞增殖分化等基础生命过程中。对铁元素的共同需求形成了病原与宿主的相互作用关系~([1])。机体内铁离子环境稳态受宿主的严格调控,宿主铁代谢过程中多种分工明细的铁代谢相关蛋白极大地限制了入侵病原对宿主体内铁离子的获取及利用,一定程度上抑制了病原的侵害~([2])。同时,宿主机体中极为有限的铁离子环境促使病原平行进化出多     

宿主蛋白TRIB2与流感病毒NP蛋白相互作用的研究

流感病毒的核衣壳蛋白(NP)是病毒粒子中重要的结构蛋白,参与流感病毒生命周期的多个过程。为筛选与流感病毒NP相互作用的宿主蛋白,本研究应用酵母双杂交技术(Y2H)技术从A549细胞cDNA文库中筛选到与其相互作用的宿主蛋白Tribble 2(TRIB2),并通过免疫共沉淀技术(Co-IP)试验和GST pull down试验进一步证实NP与TRIB2之间存在特异性的直接相互作用。此外,利用激光共聚焦试验证实NP与TRIB2共定位于A549细胞的细胞质内。在A549细胞中过表达TRIB2蛋白后,能够降低流感病毒的滴度,表明TRIB2具有抑制流感病毒的复制功能。本实验为研究流感病毒的复制机理奠定了基础,完善了病毒与宿主相互作用网络。     

反向遗传学技术在负链RNA病毒中的应用

反向遗传操作(又称感染性克隆)在DNA水平上研究RNA病毒的基因组结构及功能和病毒宿主相互作用提供了重要手段,纵观反向遗传学技术研究进展,讨论反向遗传学技术在部分负链RNA病毒研究中的应用,将会为RNA病毒的分子生物学研究提供有效的方法。     

利用宿主免疫应答防制动物寄生虫病

根据诱发宿主的免疫应答来控制寄生虫的发育,构成了一个庞大而活跃的研究领域。然而,这一领域中的进展与病原微生物疫苗的发展相比,却十分缓慢。其原因是复杂的,尚未充分了解。但可能在于基础问题(至少其部分原因如此),即宿主与寄生虫的相互关系的本质问题,这是寄生虫在其长期进化过程中所形成的宿主与寄生虫的相互作用。寄生虫感染在临诊上一般都不是急性表现的。寄生虫感染的亚临诊性质,乃是调节宿主体内的寄生虫寄生频度和数量的各种机理使然。这些调节因素中,有许多是环境性质的,它们影响寄生虫传播的水平。宿主内部的多种     

鸡肠道微生物的影响因素及其对宿主代谢的作用

肠道菌群的组成对宿主健康具有重要的作用。肠道菌群与宿主肠道内营养物质相互作用,参与动物体生长、发育及营养物质消化吸收等全过程。文章通过综述鸡肠道微生物的影响因素(年龄、饲养环境、日粮及病原微生物感染等方面)及肠道菌群与物质能量代谢,肠道菌群与脂类、矿物质、纤维素相关关系综合解析肠道菌群对宿主代谢的作用,为人们了解、认识肠道菌群与宿主的代谢相互作用提供依据。     

引起猪呼吸道病钥匙病的防控

经研究证明：多种病原间相互作用．往往有一种或一种以上病原为钥匙病原．率先通过降低宿主局部或全身的防御机制而使其它病原相继侵袭感染．如猪肺炎支原体、猪繁殖与呼吸系统障碍综合症（蓝耳病）、猪的Ⅱ型圆环病毒、猪伪狂犬、猪流感、肺炎放线杆菌被认为是猪呼吸系统疾病的钥匙病。     

长链非编码RNA——病毒与宿主相互作用中的新型调控因子

长链非编码RNA（long non-coding RNAs，lncRNAs）是一类长度>200 nt的非编码RNA，在多种生物学过程中发挥重要调控作用。近年来研究表明，lncRNAs可被病毒诱导表达，其作为一类新型的调控因子介导宿主与病毒相互作用，通过病原识别受体，以不同机制激活或抑制天然免疫应答反馈病毒感染。本文阐述了lncRNAs介导病毒与宿主相互作用中的调控机制，归纳了它们在宿主抗病毒天然免疫应答过程中的调控网络，以期为研究lncRNAs在抗病毒中的作用提供参考，为揭示病毒的致病机制和发现新的抗病毒靶标奠定基础。