绒山羊11号染色体7个微卫星标记的连锁图谱的构建

本试验利用内蒙古白绒山羊5个家系中的632个个体,用11号染色体上的7个微卫星标记,构建绒山羊11号染色体遗传连锁图。结果表明,7个标记的等位基因数变化范围为8~14,杂合度在0.5886~0.9348之间,平均杂合度为0.8612,各标记的多态信息含量在0.7712~0.8990之间,平均多态信息含量为0.8472。构建的遗传连锁图总长度127.7 cM,其中标记ILSTS028与INRA108间距最大,为41.2 cM;ILSTS049和INRA131间距最小,为5.1 cM。     

山羊品种遗传多样性的分析

利用6个微卫星标记对中西部7个山羊品种(陕南白山羊、陕北白绒山羊、西农萨能羊、关中奶山羊、太行山羊、黄淮山羊、伏牛山羊)共计322个个体进行了遗传多样性检测,并根据Nei氏遗传距离进行了聚类分析。结果表明:6个微卫星标记在这7个品种中存在高度多态性;陕北白绒山羊的遗传变异程度最大,平均杂合度和平均多态信息含量分别为:0.8401和0.8244;而关中奶山羊的遗传变异程度相对较小,平均杂合度和平均多态信息含量分别为:0.7990和0.7784。UPGMA聚类分析表明,黄淮山羊和伏牛山羊聚为一类,陕南白山羊,太行山羊,陕北白绒山羊依次加入,西农萨能羊和关中奶山羊作为一类最后加入。     

凉山半细毛羊3号染色体遗传连锁框架图的构建

研究基于四川凉山半细毛羊资源参考家系,选取位于绵羊3号染色体的9个多态微卫星位点,共275个个体,构建了凉山半细毛羊3号染色体的遗传连锁框架图。结果表明:9个位点等位基因数目为3~9个,杂合度为0.404~0.766,多态信息含量为0.378~0.738。构建的3号两性平均遗传连锁框架图的总长为339.7cm,与USDA图谱位点顺序一致,图谱总长较USDA长。可在此基础上增加标记和群体样本数构建更精细的遗传连锁图,并对具有重要经济性状的基因座进行精细定位。     

绵羊3号染色体11个微卫星位点的遗传研究

从已经公布的绵羊3号染色体连锁图谱中选取11个微卫星位点，分析这些位点在四川凉山半细毛羊参考群体中的580只父母代及其后代在个体上的多态性，利用MultiQTL程序构建绵羊3号染色体两性平均连锁图谱。结果表明：11个微卫星位点的等位基因数为5-11个．杂合度为0．3232～0．8179，多态信息含量为0．3125～0．8410。本研究所构建的连锁图谱在不同家系之间存在差异，并且与已公布的第二、三代遗传连锁图谱的总长度、标记位置都有差异。     

辽宁绒山羊7个微卫星位点的遗传多样性分析

试验分析了7个微卫星基因座位OarAE101、OarJMP8、BM143、BM6506、BM1824、BM6438I、LSTS004在辽宁绒山羊4个家系中的遗传多态性。结果表明,7个微卫星标记中仅有4个微卫星位点(OarAE101、OarJMP8、BM143、BM6506)表现出了多态性。OarAE101位点多态信息含量最高,为0.727;BM143位点多态信息含量最低,为0.526。在所标记群体中平均有效等位基因数为3.249个;平均多态信息含量为0.635;遗传杂合度均值为0.638。说明辽宁绒山羊品种内的遗传变异处于一个较高的水平,遗传多样性丰富,选择潜力很大。     

布拖黑绵羊微卫星标记遗传多样性研究

本文旨在研究布拖黑绵羊群体的遗传特性,选择了位于绵羊染色体上的30个微卫星标记,统计等位基因、多态信息含量、杂合度等,分析布拖黑绵羊群体的遗传多样性。结果表明,布拖黑绵羊群体30个微卫星标记具有4~13个等位基因,平均为7.27个等位基因;30个微卫星标记的观察杂合度为0.3269~0.8846,平均为0.6269;期望杂合度为0.3620~0.8865,平均为0.6769;多态信息含量为0.3338~0.8660,平均为0.6257,显示布拖黑绵羊群体具有丰富的遗传多样性。     

辽宁绒山羊七个微卫星位点遗传多样性分析

分析了7个微卫星基因座位OarAE101、OarJMP8、BM143、BM6506、BM1824、BM6438、ILSTS004在辽宁绒山羊4个家系中的遗传多态性.结果表明:7个微卫星标记中仅有4个微卫星位点(OarAE101、OarJMP8、BM143、BM6506)表现出了多态性.OarAE101位点多态信息含量最高,pic为0.727,BM143位点多态信息含量最低,PIC为0.526.在所标记群体中平均有效等位基因数为3.249个±1.318个;平均多态信息含量为0.635±0.087;遗传杂合度均值为0.638±0.182.说明辽宁绒山羊品种内的遗传变异处于一个较高的水平,遗传多样性丰富,选择潜力很大.     

陇东绒山羊微卫星DNA遗传多样性的研究

利用9个微卫星座位,8％非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳PCR扩增产物,对120只陇东绒山羊基因组DNA的遗传多样性进行了检测,对其群体遗传学特性进行分析。结果表明：陇东绒山羊在9个微卫星座位中共检测到90个等位基因,其中微卫星座位LSCV24等位基因数最多,为14个;BMS1248多态信息含量最高,PIC为0．88;DB6座位多态信息含量最低,PIC为0．79。在所标记群体中平均有效等位基因数为7．69±1．65个,平均多态信息含量为0．84±0．03;遗传杂合度均值为0．86±0．03,均高于国内外部分研究结果。说明陇东绒山羊品种遗传多样性丰富,群体遗传变异程度高,育种潜力大。     

内蒙古绒山羊4个群体微卫星特征

利用30个微卫星标记,对内蒙古绒山羊4个群体(阿尔巴斯、二狼山、乌珠穆沁、阿拉善),共计176个个体的遗传多样性进行了分析和研究.计算了各群体的等位基因频率,并以其为基础获得了各群体的平均杂合度、平均多态信息含量和平均有效等位基因数,分别为0.367～0.467、0.533～0.624、2.571～4.915.这些数据为进一步对山羊品种的保存和利用提供了科学的依据.     

5个山羊品种的遗传结构及多样性研究

用25个微卫星标记,对5个山羊品种进行遗传多样性分析。共检测到199个等位基因,并进行哈代-温伯格平衡检验,5个群体基本处于遗传不平衡状态。在25个座位中,除BMS1943在罕山白绒山羊上（PIC为0.493）表现为中度多态外,其余座位均为高度多态。以等位基因为基础,得出座位的平均杂合度为0.436-0.820之间,群体平均杂合度在0.592-0.738。对各微卫星标记进行F-统计分析,Fst的变化范围是从BMC1206的0.011到BMS1943的0.078;群体每代迁移数在2.972-23.115,平均值为8.884。计算了遗传分化系数,结果表明群体间变异程度不高。内蒙的罕山白绒山羊和乌珠穆沁绒山羊有较大的基因流值（15.753）,说明其交流比较活跃。计算了共祖遗传距离,并进行了UPGMA和NJ聚类分析,内蒙的罕山白绒山羊和乌珠穆沁绒山羊聚到一起。     

柴达木绒山羊八个微卫星位点遗传多样性分析

以柴达木绒山羊为研究对象,对其8个微卫星位点进行遗传多样性分析,计算各位点的等位基因频率(P)、杂合度(H)、多态信息含量(PIC)和有效等位基因数(N)。结果表明:8个微卫星位点在柴达木绒山羊均呈高度的多态性(PIC>0.5);位点LSCV 24基因杂合度、有效等位基因和多态信息含量都最高(H=0.796,N=6.916,PIC=0.766);位点BM 3413的基因杂合度、多态信息含量都最小(H=0.676,PIC=0.615);位点MAF-70的有效等位基因最小(N=0·7672)。因此,柴达木绒山羊群体中遗传背景复杂,遗传多样性较丰富;这8个微卫星位点也可用于柴达木绒山羊羊绒性状的进一步研究。     

荧光标记微卫星分析广西树鼩群体的遗传多态性

选取10个微卫星位点,结合荧光标记(FAM) PCR扩增技术,运用毛细管电泳检测扩增产物,利用Microsatellite Toolkit、PopGene软件计算遗传相关指标,探讨广西树鼩群体的遗传多态性。结果发现,在10个微卫星基因座中,共检测到64个等位基因,平均等位基因数为6.4个,平均有效等位基因数为3.7892,平均观察杂合度和平均期望杂合度为0.6156和0.6963,平均多态信息含量为0.6367,其中7个是高度多态位点,3个属中度多态位点。此外,在10个微卫星基因座中,有5个位点偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.01)。结果表明广西树鼩遗传多态性较丰富,所选微卫星位点基本可用于评估广西树鼩群体遗传多样性。     

The Genetic Polymorphism Analysis in Tree Shrew(T.belangeri chinensis) based on Fluorescent Microsatellite

A total of 10 fluorescent labeling microsatellite markers detected by capillary electrophoresis were selected to analyze the genetic diversity of tree shrew(T.belangeri chinensis).Microsatellite Toolkit and PopGene softwares were used to calculate the genetic correlation indexes to assess the genetic diversity of the population.64 alleles with 6.4 alleles per locus were identified among 10 microsatellite loci.The average effective number of alleles, observed heterozygosity, expected heterozygosity and polymorphic information content were 3.7892, 0.6156, 0.6963, and 0.6367, respectively.Seven of all loci were high polymorphic, and three were moderate polymorphic.Five loci extremely significantly deviated from Hardy-Weinberg equilibrium(P<0.01).These novel polymorphic microsatellite markers indicated high genetic diversity, which will be used to evaluate genetic diversity in tree shrew.     

家鸡豆冠基因定位的研究

构建家鸡1号染色体短臂部分连锁图谱及豆冠冠型基因的定位。通过测交选择豆冠冠型基因型纯合的2只吐鲁番斗鸡(♂)和6只玫瑰冠鸡(♀)为亲本,采用F2代试验设计建立F2代494只,依据己公布的家鸡遗传连锁图谱,分别在1号染色体上筛选了13对微卫星标记,运用MapMaker/EXP 3.0和MapDraw 2.1软件绘制遗传连锁图谱,并结合记录的表型性状值对冠型性状进行定位分析。经卡方检验F2代冠型符合9∶3∶3∶1的遗传定律。在连锁分析中除MCW0007位外,其余12个微卫星座位在试验群体中均表现较高的基因杂合度和多态信息含量。对冠型性状进行初步的分析,结果显示,MCW0428、ADL0319、LEI0174和MCW0058标记位点LOD值＞3,表明这4个微卫星位点与豆冠冠型基因存在连锁关系,其中LEI0174与豆冠基因遗传距离最近为0.12 cM。     

长江三角洲白山羊群体遗传结构研究

应用结构基因座和微卫星DNA两种遗传标记探讨长江三角洲白山羊群体遗传结构。结果表明,检测的9个结构基因座位上7个存在多态性,座位的基因平均杂合度、多态信息含量及有效等位基因数分别为0.1767、0.1457和1.2837;7个微卫星位点上共检测到110个等位基因,位点的基因平均杂合度、多态信息含量及有效等位基因数分别为0.8867、0.8774和11.2907。群体内的遗传变异程度相对较高,反映出丰富的遗传多样性,而且微卫星DNA标记揭示的遗传变异高于结构基因座。     

鹿苑鸡微卫星和AFLP指纹分析

利用20个微卫星标记和6对AFLP引物组合对地方鸡种鹿苑鸡进行了遗传检测,结果表明鹿苑鸡在20个微卫星位点上共检测到118个等位基因,基因频率分布在0.0125～0.5500之间,平均每个座位检测到5.9个等位基因.20个微卫星座位的平均杂合度为0.7366,平均多态信息含量为0.6953;6对AFLP引物组合在该鸡种中共检测到245条多态性条带,平均每个引物组合产生40.8条多态性条带;鹿苑鸡群体变异大,具有丰富的遗传多样性.     

盘羊及其杂交后代微卫星遗传多样性分析

为了更好地了解盘羊及其杂交后代（盘羊♂×欧拉羊♀）的遗传信息,为盘羊遗传资源评价及欧拉羊的复壮改良提供理论依据。本试验选取24对微卫星引物,应用PCR扩增和毛细管电泳的方法对24只盘羊和24只杂交羊个体进行遗传多样性分析。结果显示,在24只盘羊中,24个微卫星位点上共检测到167个等位基因,平均等位基因数目为6.9583,平均有效等位基因数为3.3665,平均观测杂合度为0.4497,平均期望杂合度为0.6779,平均多态信息含量为0.6265,其中,等位基因数目最多的是位点MAF70,有效等位基因数目、期望杂合度、多态信息含量最高的是位点OarFCB193,观测杂合度最高的是位点ILSTS11;在24只杂交羊中,24个微卫星位点上共检测到154个等位基因,平均等位基因数目为6.4166,平均有效等位基因数为3.4061,平均观测杂合度为0.4566,平均期望杂合度为0.6751,平均多态信息含量为0.6265,其中,等位基因数目、有效等位基因数目、期望杂合度、多态信息含量最高的是位点MAF70,观测杂合度最高的是位点OarJMP58。从遗传学角度得出,盘羊和杂交羊遗传指标结果相近,试验所得数据可用于盘羊遗传资源评价及欧拉羊的复壮改良。     

四倍体紫花苜蓿遗传图谱的初步构建

分别以早熟低产和晚熟高产苜蓿单株为父母本,通过人工杂交构建了四倍体紫花苜蓿(Medicago Sativa)F1遗传作图群体,采用单因子变量分析法,以降落式PCR和常规PCR结合的反应程序,建立了适宜于紫花苜蓿的分子标记扩增体系;应用130对SSR引物进行筛选,获得60对引物在父母本间存在多态性而被用于绘制遗传连锁图。采用PAGE电泳分析,对作图群体进行基因型分析。通过TetraploidMap软件对60个SSR标记进行连锁作图分析,有44个标记可以定位在8个连锁群上,占总标记数的33.8%,覆盖遗传距离979 cM,两标记间平均图距为22.25 cM,初步构建了四倍体紫花苜蓿遗传图谱的框架图,还需要进一步添加标记数量增大其饱和度,为重要性状的QTL定位奠定基础。