动物冠状病毒的研究进展

冠状病毒(Coronavirus)在自然界中普遍存在,其宿主广泛,可感染哺乳动物和鸟类,是一种严重危害人类健康和畜牧业发展的病原微生物。本文主要介绍了已知动物冠状病毒的分类、基因组结构、常见的几种动物冠状病毒及其诊断与防治技术,并对动物冠状病毒与最新发现的新型冠状病毒SARS-CoV-2进行了比较,旨在更好的了解和认识冠状病毒及其危害,为防控冠状病毒引起的相关感染提供借鉴。     

冠状病毒非结构蛋白的研究进展

冠状病毒（Coronavirus）家族成员是许多家畜、宠物包括人类的重要病原,引起多种急性和慢性疾病。冠状病毒有一巨大的基因组RNA,全长27~32 kb,编码结构蛋白、非结构蛋白和一些辅助蛋白。冠状病毒非结构蛋白（nonstructural prtein, nsp）由病毒编码的多聚蛋白1a/1ab水解而来,共有15或16个。这些非结构蛋白参与调节病毒基因组RNA的复制和亚基因组RNA的转录,或作为转录/复制复合体参与基因组的复制转录,并参与感染宿主等过程,是冠状病毒重要的功能蛋白。随着冠状病毒引起的严重急性呼吸系统综合症(severe acute respiratory syndrome,SARS）在中国乃至全球的爆发,对冠状病毒尤其是其非结构蛋白的研究得到越来越多的重视。本文就冠状病毒非结构蛋白的研究进展做一综述。     

冠状病毒与宿主细胞受体相互作用的研究进展

<正>冠状病毒(Coronavirus)是一类有囊膜的单股正链RNA病毒，具有复杂的进化历史，属于套式病毒目，冠状病毒科，冠状病毒亚科，冠状病毒属，这类病毒能广泛感染野生、家养禽类和哺乳动物^[1]。冠状病毒是目前已知的RNA病毒中基因组最大的病毒，成熟的冠状病毒直径为60～220 nm，分为4个不同的属:α、β、γ和δ冠状病毒(图1)。冠状病毒粒子多呈现球形或不规则形，其基因组大小介于26 000～32 000 bp，长度约为30 kb^[2]，包含6～11个开放阅读框(Open reading frame,ORF)，第一个ORF占整个基因组约67%，编码16种非结构蛋白(Nonstructural protein)^[3]，其余的ORF编码辅助蛋白和结构蛋白。4种主要的结构蛋白为刺突表面糖蛋白(S)、包膜蛋白(E)、基质蛋白(M)和核衣壳蛋白(N)^[4](图2A、2B)。S蛋白在结合宿主细胞上的受体中起着至关重要的作用，也决定了病毒的宿主向性^[5,6]。冠状病毒可以通...     

新型冠状病毒2019-nCoV与动物冠状病毒进化关系分析

新型冠状病毒(2019-nCoV)感染肺炎疫情自2019年12月在湖北省武汉市发生以来,已在我国和世界多个国家传播,引发全球关注。为阐明2019-nCoV与已知动物冠状病毒的关系,从冠状病毒的宿主分布、遗传进化分析、宿主受体分析等角度,对2019-nCoV的可能来源进行了综合分析。结果显示:2019-nCoV与从云南省中菊头蝠中检测到的冠状病毒分离株RaTG13基因组同源性最高,为96.2%,两者遗传进化关系也较为接近;从我国广东省和广西壮族自治区查获的走私穿山甲中检测到的冠状病毒则与2019-nCoV遗传关系相对稍远,与2019-nCoV基因组同源性分别为90.4%和85.5%;2019-nCoV与已知家畜、家禽,以及犬猫等宠物中检测到的冠状病毒基因组同源性≤54.2%,遗传进化关系较远。结合监测结果,基本排除2019-nCoV来源于已知家畜、家禽以及犬猫等宠物冠状病毒的可能性。     

人与动物源冠状病毒的流行病学特征

为全面了解冠状病毒的流行病学研究进展及其造成的影响,本文综述了人与动物源冠状病毒的流行病学特征,冠状病毒的宿主特性、病毒变异和病毒的跨物种传播;阐述了多种禽源、猪源、犬源、牛源、马源及人源冠状病毒的流行状况、发病特点和流行过程,冠状病毒在流行过程中所出现的遗传变异特性;明确了这些人与动物源冠状病毒对于人类健康、公共卫生和畜牧业安全所造成的影响。研究表明,冠状病毒在感染动物间广泛存在,存在病毒变异引起的跨种属宿主感染,病毒变异致病毒多样性。研究结果对于深入开展冠状病毒的基础研究、应用研究和有效防控措施提供借鉴和帮助。     

浅谈冠状病毒与其动物宿主

冠状病毒危害人类和动物健康。时下肆虐的新冠肺炎动物宿主尚未有确切定论。文章就冠状病毒与动物宿主的关系进行了概述,以期为临床防治和理论研究提供借鉴。1病毒概述冠状病毒,又名日冕病毒,因在电子显微镜下病毒表面突起形似王(花)冠而得名。它是一种有囊膜的单链线性正链RNA病毒,隶属于套式病毒目冠状病毒科冠状病毒属,病毒颗粒直径约80~160nm,其基因组约为30kb,是RNA病毒中最大的。     

新型冠状病毒及其与猪冠状病毒的相关性和启示

2019年底新型冠状病毒(SARS-Co V-2)造成了对人类健康构成了巨大威胁的疫情,但其与猪冠状病毒基因组序列相似性低,在决定病毒宿主嗜性和毒力的纤突(spike,S)蛋白结构上具有较大差异,据此推测不能构成跨种传播。对蝙蝠携带冠状病毒多样性和分布区域的研究可有助于分析其对人类和养殖业的威胁,在公共卫生中具有积极意义。针对突发疫病,快速响应获得原始材料数据有助于疫病诊断、治疗和预防研究的开展。多种人冠状病毒S蛋白被证明是最适合开发的疫苗及治疗性抗体靶标,可在动物疫苗等产品的设计中借鉴。     

犬猫冠状病毒研究进展

犬冠状病毒（canine coronavirus,CCoV）与猫冠状病毒（feline coronavirus,FCoV）同属于冠状病毒科冠状病毒属α属,与其同属的病毒还有猪传染性胃肠炎病毒（porcine transmissible gastroenteritis virus,TGEV）、猪流行性腹泻病毒（porcine epidemic diarrhea virus,PEDV）等。遗传进化分析表明,该种属不同基因型病毒通过基因重组能产生新型变异毒株,为疾病的诊断与防控造成了很大的阻碍。β属冠状病毒包括牛冠状病毒（bovine coronavirus,BCoV）、犬呼吸道冠状病毒（canine respiratory coronavirus,CRCoV）、严重急性呼吸综合征冠状病毒（severe acute respiratory syndrome coronavirus,SARS-CoV）等,其中CRCoV与BCoV同源性较高,该类病毒与α属冠状病毒在基因组结构、致病机制、感染症状等方面差异较大。CCoV与FCoV在全球范围内广泛传播,具有发病率高、死亡率低的特点。由于RNA病毒本身的特点和环境选择压力的影响,这两种病毒不断变异进化,新的强致病力毒株相继出现。经FCoV基因突变演化而来的猫传染性腹膜炎病毒（feline infectious peritonitis virus,FIPV）毒力大大增强,病毒基因组中某些特异性的点突变使得针对宿主的细胞嗜性发生改变,该病毒的致病机制主要依赖于病毒感染后诱导机体产生的抗体依赖性增强作用（ADE）。针对犬猫冠状病毒的流行病学调查及防控不能仅依赖于疫苗免疫单一因素,还应综合考虑病毒毒力、环境条件、宠物自身免疫抵抗力状态等。针对犬猫冠状病毒的诊断应根据临床症状,结合常规血液学检查、血清生化检查和实验室诊断技术来进行全面的鉴定,防止出现假阳性及假阴性结果。     

中国流行的PEDV:共感染和遗传多样性

猪流行性腹泻(PED)是由猪流行性腹泻病毒(PEDV)引起的一种肠道传染病,对哺乳仔猪致死率可达100%,是导致我国哺乳仔猪高死亡率的“头号杀手”。PEDV属于冠状病毒科、冠状病毒属,是一种具有囊膜的单股正链RNA病毒,其基因组由4个结构蛋白和17个非结构蛋白组成。其中,S蛋白在病毒侵入宿主细胞和诱导机体产生中和抗体过程中发挥重要作用,因此S蛋白的突变与病毒的致病性高度相关。PEDV的变异以及PEDV与其它病原的共感染是难以防控PED的重要因素。     

动物冠状病毒感染与肠道菌群间的互作关系研究进展

冠状病毒感染已造成多次全球大流行性疾病，严重威胁人类生命健康，阻碍社会经济发展。动物冠状病毒病的普遍流行，严重制约着畜牧业和宠物行业的发展。肠道菌群在人和动物健康维持、免疫机能调节及各种疾病中发挥着重要作用。冠状病毒感染显著改变宿主肠道菌群的结构、组成和功能，而肠道菌群在人和动物冠状病毒病的发生发展及宿主的抗感染免疫中发挥着重要调节作用。以肠道菌群为靶点的策略为冠状病毒病的预防和治疗提供了新思路。本文对冠状病毒感染及其致病机制、冠状病毒感染与肠道菌群的互作关系、以肠道菌群为靶点防治冠状病毒病的新方法等进行综述，以期为肠道菌群与冠状病毒感染及冠状病毒病间的作用机制研究提供思路。