ESR与PRLR基因对民猪产仔数的影响

采用PCR－SSCP，检测ESR与PRLR基因的多态性，并采用混合模型统计了基因型与表型值（产仔数）的相关性，分析了民猪ESR与PRLR基因各基因型及其合并基因型对民猪产仔数性状的影响。结果表明：就民猪总产仔数、活产仔数的最小二乘均值而言：ESR基因基因型间，AB型较AA和BB高，差异不显著（P＞0.05）；PRLR基因基因型间，AA＞BB＞AB，差异也不显著（P＞0.05）；两基因的互作效应显著（P＜0.05），其中ESR与PRLR基因的合并基因型AAAA为最佳的合并基因型（P＜0.05）。     

宁夏滩羊与四种引进羊种血液蛋白遗传标记特征及聚类分析

采用聚丙烯酰胺不连续梯度凝胶电泳法，对宁夏滩羊及4种引进羊种的血清转铁蛋白（Tf）、后白蛋白（Po）、清蛋白三个位点的蛋白质多态性进行了测定。研究表明：宁夏滩羊与引进羊种的血清转铁蛋白、后白蛋白2个位点的基因型有所差别，清蛋白位点基因型相同。计算各羊种的基因型频率、基因频率以及宁夏滩羊与引进羊种之间的遗传距离，对所研究的5个羊种进行了聚类分析。结果表明：宁夏滩羊与陶塞特最近，其次为萨福克、小尾寒羊，与特克萨尔最远。     

湖北白猪Ⅳ系毛色纯合方法的研究

在湖北白猪Ⅳ系世代选育过程中，采用毛色测交、后裔调查和系谱鉴定法，以准确判定个体的毛色基因型；通过严格的选择与淘汰，逐代减少毛色杂合子和基因型未知的个体，使群体中非白毛基因频率迅速下降，并达到了毛色纯合之目的。在品系世代选育初期，宜采用测交和后裔调查法来判定个体的毛色基因型，后期可选用系谱鉴定法，以减少饲喂测交猪的生产成本。     

撒坝猪血清蛋白基因型交配组合与繁殖性能的关系

采用聚丙烯酰胺凝胶电泳法（ＰＡＧＥ） 对撒坝猪前白蛋白（ＰＡ） 、转铁蛋白（ＴＦ） 、酯酶（ＥＳ） 、淀粉酶（ＡＭ） 和碱性磷酸酶（ＡＫＰ）５ 个血清蛋白位点的多态性进行了检测，并根据最小二乘原理对不同蛋白基因型交配组合与繁殖性能的关系进行了分析。结果表明，所检测的５ 个血清蛋白位点均处于Ｈａｒｄｙ －Ｗｅｉｎｂｅｒｇ 平衡状态；除ＡＫＰ 位点外，ＰＡ、ＴＦ、ＥＳ 和ＡＭ 不同基因型交配组合在部分繁殖性状上均表现出显著差异。表明血清蛋白基因型交配组合与繁殖性能之间存在着一定的相关。     

猪育种中基因型与环境互作研究(综述)

国内外有关基因型与环境互作的研究大多数是从不同的饲养方式、能量水平和蛋白质水平出发的。Warren等（1952）用8个杂交组合的猪分别按自由采食或减喂20％进行试验，发现日增重上存在显著的互作。Plank等（1963）用约克夏、拉康比或长白公猪配约克夏母猪所产生的后代进行了基因型与营养水平的研究，使用了NRC推荐量的75％至自由采食范围内的3种饲喂水平，结果表明生长速度、日采食量存在着显著的基因型与饲喂水平的互作。Panaiotov1985用4个杂交组合的猪进行了自由采食与减喂20％两种饲养方法的试验，结果表明饲养方法与基因型对日…     

白三叶耐冻性的遗传力

用草地Huia非选择基因型不同组合间成对杂交来选择耐冻和敏感必珠白三叶基因型，在人工冷冻至-8℃时，统计子代品系和亲本基因型的伤叶率。由耐冻基因型之间杂交的子代要比含有敏感性基因型或草地Huia非选择基因型之一的杂交子代冻害轻，依靠计算方法耐冻性或敏感性的遗传力估计值偏高，范围在0.75和0.93之间，在冻伤的统计中排除叶片大小的因素。遗传力估算值降至0.54-0.73。由于耐冻性遗传力较高。可以断定通过选择具这种性状和一致性耐冻的适宜农业的非敏感性品种是可行的。     

INHA基因多态性与猪产仔数的相关性分析

研究选取抑制素α(INHA)基因为候选基因,采用PCR-RFLP和不对称PCR-SSCP技术检测其在大白猪、长白猪中的多态性,并对大白猪、长白猪不同基因型、合并基因型与猪产仔数的关系进行了分析。结果表明:INHA基因在长白、大白猪中存在外显子ⅡG262A位点突变,该位点引起Hin6Ⅰ限制性内切酶酶切位点的改变,G等位基因为优势等位基因,GG型为优势基因型。利用不对称PCR-SSCP结合测序发现外显子ⅡA852G位点产生突变,研究表明,B为优势基因,BB为优势基因型。基因型合并分析表明,BBGG基因型为优势合并基因型,在大白猪中,总产仔数BBGG基因型要比BCGG基因型高0.7头,产活仔数BBGG基因型要比BCGG基因型高1.5头;而在长白猪中,总产仔数BBGG基因型比BCGG总产仔数高2.0头,产活仔数BBGG基因型要比BCGG基因型高1.73头。合并基因型的遗传效应并不是各基因效应的简单相加,但却要稍高于最好的单个基因型效应。     

我国猪群中多杀性巴氏杆菌的基因型分析

本研究旨在了解我国猪群中流行的多杀性巴氏杆菌(Pm)的主要基因型。利用荚膜基因分型、脂多糖(LPS)基因分型、多位点序列分型(MLST)对2013年12月—2017年12月4年间来源于我国各地区规模化猪场患有疑似呼吸系统疾病的病死猪肺、鼻拭子、气管、肝等样品中分离鉴定的Pm进行基因型分析,并对23种主要毒力基因进行检测。结果表明,当前在我国猪群中流行的Pm的荚膜基因型为A(48.85%)、D(42.75%)、F(2.67%),优势基因型为A和D;LPS基因型为L3(25.00%)和L6(75.00%)型,优势基因型为L6;MLST基因型为ST3(21.25%)、ST10(27.50%)、ST11(42.50%)、ST12(2.50%)、ST16(2.50%)、ST74(1.25%)及ST75(2.50%),优势基因型为ST3、ST10和ST11。如果将荚膜基因型、LPS基因型和MLST基因型组合起来看,当前在我国猪群中流行的Pm的主要基因型为荚膜:脂多糖:MLST基因型A:L3:ST3(20.00%)、A:L6:ST10(26.25%)及D:L6:ST11(42.50%)。毒力基因检测的结果发现部分毒力基因的分布表现出一定的"基因型偏好性"。结果提示,D:L6:ST11是我国猪群中流行的多杀性巴氏杆菌的主要基因型,可能与我国猪群中由多杀性巴氏杆菌导致的呼吸道疾病密切相关。     

多位点基因型遗传距离的估测精度

用计算机随机取样研究了多位点基因型遗传距离的估测精度，指出：（１）在所研究遗传距离期望值范围内，遗传距离期望值对遗传距离的估测精度没有明显影响，这表示品种间不论远近，在相同条件下都有相似的测定精度；（２）随着取样个体数增加，遗传距离测定精度增加，多位点基因型遗传距离的测定精度高一同样条件下的Ｎｅｉ氏标准遗传距离测定精度，这表示多位点基因遗传距离的测定可以使用较少个体，另外，本文讨论了多位点基因型遗     

皮埃蒙特杂种肉牛生长激素基因型与体重、日增重的相关性研究

本研究利用PCR-RFLPs标记技术，对63头杂种肉牛的生长激素基因的第5外显子和3’端区域进行了分析寿终正寝分现HaeⅢ酶切位点具有多态性，并分为三种基因型（AA、BB和AB）。通过构建最小二乘线性模型。分析了生长激素基因型与杂种肉牛高于12月龄体重和6-12月龄日增重的关系。结果表明：生长激素AB基因型的效应稍高于AA、BB型，但差异不显著。     

Genotypes of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis from South American countries determined by two methods based on genomic repetitive sequences

Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (MAP) is the causal agent of Johne's disease or paratuberculosis of ruminants and has been associated with Crohn's disease in humans. In this study, the genotypes of MAP obtained so far in South American countries using a combination of the subtyping methods Mycobacterial Interspersed Repeats Units-Variable Number of Tandem Repeats (MIRU-VNTR) and Multilocus Short Sequence Repeats (MLSSR) were analyzed. Through this analysis, seven different MIRU-VNTR genotypes and seven MLSSR genotypes have been detected. If both methods were combined, nine different genotypes were found. Results revealed the predominance of MIRU-VNTR genotype 1 (INMV 1) and MLSSR genotype A (7 g-10 g-4ggt) among MAP isolates from different host species in South America. These predominant MAP genotypes are also commonly detected in Europe and the United States. This predominance could be the result of higher animal infection ability or better culturability on solid media used for isolation. Further studies on molecular epidemiology of MAP must be carried out in South America to increase our knowledge of the global distribution of MAP.     

饲草型小黑麦遗传多样性的ISSR分析

本研究利用ISSR分子标记对30份饲草型小黑麦种质进行遗传多样性分析,以了解不同饲草型小黑麦种质间的遗传差异,为小黑麦种质资源保护、品种选育及分子鉴定提供理论依据。结果表明:参试小黑麦种质遗传多样性较丰富,利用ISSR的12条引物共检测到124条扩增条带(位点),平均多态性比率(PPB)为77.42%。30份小黑麦种质的遗传相似系数(GS)为0.66~0.91。在GS=0.765处将30份小黑麦种质分为6类,其中8809及81S37与其他种质的遗传距离最大,单独聚为一类;826126和北联3号为第Ⅴ类;33RD ITSN、CHEROKEE和新小黑麦5号为第Ⅰ类;北联4号、PH389、DH796、中拉一号和安83-25为第Ⅳ类;其余种质聚为第Ⅱ类。第Ⅳ类与第Ⅴ类小黑麦种质的遗传相似系数均较小,如果其他性状符合育种目标,可相互进行杂交。     

澳洲白绵羊美丽臀和肌肉生长抑制素基因基因型的检测

美丽臀(callipyge,CLPG)及肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)是全世界公认的与肌肉生长发育相关的基因,突变后分别产生“美丽臀”和“双肌”的优良性状。为研究国外进口品种澳洲白绵羊是否携带2种基因的突变位点,本试验以澳洲白绵羊为试验动物,采用PCR-RFLP技术对CLPG、MSTN基因的多态性进行分型。结果发现:CLPG基因上有1个C→T的SNP位点,澳洲白绵羊群体中有CC和CT 2种基因型;MSTN基因在3'-UTR区发现1个G→A的SNP位点,澳洲白绵羊群体中有GG和GA 2种基因型。用R语言程序对所测数据进行性别间不同基因型与生长发育状况的单因素方差分析得知,CLPG和MSTN基因不同基因型对澳洲白公羊体重、体高、体斜长、尻宽、背膘厚和眼肌面积均无显著性影响(P>0.05);CLPG基因CT基因型在母羊体重上显著高于CC基因型(P<0.05),在体斜长上极显著高于CC基因型(P<0.01),MSTN基因GA基因型母羊眼肌面积极显著高于GG基因型(P<0.01)。澳大利亚进口澳洲白绵羊中筛选到含有CLPG和MSTN基因的突变位点,且该突变位点对绵羊体尺性状有显著性作用,因此澳洲白绵羊引进后可以作为改良本地羊品种、基因聚合及三元配套系的终端父本。     

新疆地方绵羊品种PRNP基因多态性研究

从新疆采取了8个地方绵羊品种的血液样品171份,提取绵羊基因组DNA,用PCR方法扩增绵羊PRNP基因,通过序列测定,对它们的PRNP基因型进行研究,确定了PRNP基因136、154、171位密码子的多态性为136(A/A),154(H/R)和171(Q/R/H/K),结果发现所检测的新疆地方绵羊品种PRNP基因136位密码子均为A,其基因型均为A型痒病抵抗性基因型。     

湘黄猪Atrn基因的PCR-RFLP及其与生长和胴体性状间的关系

以129头湘黄猪为试验材料,采用PCR-RFLP技术,对Haln基因和Atrn基因进行了检测分析,检测到NN、Nn2种Haln基因型和AA,AB和BB3种Atrn基因型,其频率相应为0.9612、0.0388和0.1783、0.6047、0.2170;同时分析了NN基因型群体中,不同Atrn基因型间生长速度和胴体性状的关系,结果表明:BB基因型猪的平均日增重、平均背膘厚和估测瘦肉率明显优于AB基因型猪,AA基因型猪处于中间状态,即:BB>AA>AB。这一结果与140头丹麦资源家系猪样本的检测结果基本一致,表明Atrn基因对猪重要经济性状具有影响作用。     

基于MaxEnt分析我国羊草分布区的生物气候特征

羊草（Leymus chinensis）是欧亚大陆草原区东部草甸草原及干旱草原上的重要建群种之一。利用生物气候数据分析我国羊草的适生气候特征,客观反映我国羊草的地理分布范围及主导其分布的生物气候因子,能为我国羊草的分布潜力提供科学依据。本研究从我国数字植物标本馆获取204个羊草标本记录数据,并从WorldClim获取生物气候数据（1950-2000年）,用最大熵模型（MaxEnt）模拟羊草的地理分布,检测其生物气候主导因子及其适宜值。结果表明,冷季降雨量（bio19）对羊草分布的增益最大,干季降雨量（bio17）和最干月降水量（bio14）依次次之。同时羊草分布概率分别与冷季降雨量（bio19）,干季降雨量（bio17）和最干月降水量（bio14）为单峰响应关系。较纬度和海拔因子,经度是影响我国羊草分布格局的主要因子。     

气候变化下子午沙鼠在中国的潜在分布分析

为探究气候变化下子午沙鼠在中国的潜在分布和时空变化,本研究利用子午沙鼠分布数据以及气候、地形等环境数据,基于最大熵模型(The maximum entropy,MaxEnt)和地理信息系统(Geographic information System,GIS)技术,分析大空间尺度上限制子午沙鼠地理分布的主导环境因子。结果表明：当前气候下子午沙鼠高适生区主要分布在甘肃河西走廊、内蒙古西南部、宁夏北部,以及新疆塔里木盆地和天山山脉之间、伊犁州和塔城等地区,中适生区主要分布在甘肃酒泉的北部,内蒙古西北部,青海中部以及新疆的大部分地区;温度是限制子午沙鼠分布的主导气候因子,其次是海拔,降水量也有一定影响。随着全球气候变暖,子午沙鼠生境适宜度提高,在中国的潜在分布范围将扩大。本研究对子午沙鼠危害监测预警和精准防控具有重要的指导意义。     

牛副流感病毒3型3种基因型多重RT-PCR检测方法的建立

为建立检测牛副流感病毒3型（bovine parainfluenza virus type 3,BPIV3）3种基因型的多重RT-PCR方法,根据GenBank上发表的BPIV3 3种基因型病毒株的HN基因序列设计特异性引物,优化反应体系建立多重RT-PCR方法。结果显示,方法可同时扩增出BPIV3 A型150 bp、B型253 bp和C型342 bp的特异性片段,与牛传染性鼻气管炎病毒（IBRV）、牛呼吸道合胞体病毒（BRSV）、牛病毒性腹泻病毒（BVDV）、小反刍兽疫病毒（PPRV）、牛支原体、牛布鲁氏菌、羊布鲁氏菌、牛源多杀性巴氏杆菌A型和B型均无交叉反应,A、B、C基因型BPIV3最低阳性质粒检测量分别为0.89×10⁴、0.92×10⁴和1.53×10⁴拷贝/μL。本试验建立的多重RT-PCR检测方法操作方便、特异性强,应用于临床样本的检测,可快速检测BPIV3 3种基因型。     

胰岛素样生长因子-1基因多态性与猪部分生产性能的关系

采用PCR－RFLP对南昌白猪（92头）和大约克夏猪（170头）的IGF－1基因的179bp片段进行了扩增，并用HhaI酶切，产生两个等位基因A（151＋28bp)和等位基因B（116＋35＋28bp)。分析了不同基因型对个体初生重、2月龄重、4月龄重、6月龄重、料重比、背膘厚和瘦肉率等生产性能的影响。结果表明，在南昌白猪中，AA型猪比AB型猪初生重大，差异显著（P＜0.05)；在大约克夏猪中，BB型猪比AB型猪的6月龄体重大，差异显著（P＜0.05)；AA型猪比AB型和BB型猪瘦肉率低，差异极差著（P＜0.01)。     

Genotypes and antibiotic resistance of canine Campylobacter jejuni isolates

Campylobacter jejuni is the most important cause of bacterial gastroenteritis in humans. It is a commensal in many wild and domestic animals, including dogs. Whereas genotypes of human and chicken C. jejuni isolates have been described in some detail, only little information on canine C. jejuni genotypes is available. To gain more information on genotypes of canine C. jejuni and their zoonotic potential, isolates from routine diagnostics of diarrheic dogs as well as isolates of a prevalence study in non-diarrheic dogs were analyzed. Prevalence of thermophilic Campylobacter among non-diarrheic dogs was 6.3% for C. jejuni, 5.9% for Campylobacter upsaliensis and 0.7% for Campylobacter coli. The C. jejuni isolates were genotyped by multi locus sequence typing (MLST) and flaB typing. Resistance to macrolides and quinolones was genetically determined in parallel. Within the 134 genotyped C. jejuni isolates 57 different sequence types (ST) were found. Five STs were previously unrecognized. The most common STs were ST-48 (11.2%), ST-45 (10.5%) and ST-21 (6.0%). Whereas no macrolide resistance was found, 28 isolates (20.9%) were resistant to quinolones. ST-45 was significantly more prevalent in diarrheic than in non-diarrheic dogs. Within the common time frame of isolation 94% of the canine isolates had a ST that was also found in human clinical isolates. In conclusion, prevalence of C. jejuni in Swiss dogs is low but there is a large genetic overlap between dog and human isolates. Given the close contact between human and dogs, the latter should not be ignored as a potential source of human campylobacteriosis.