3种兔球虫ITS-1序列测定与系统发育分析

从河北省兔场分别单卵囊分离孢子化大型艾美耳球虫卵囊、黄艾美耳球虫卵囊及肠艾美耳球虫卵囊,接种无球虫兔后获得纯种卵囊,CTAB法提取孢子化卵囊基因组DNA。利用艾美耳属球虫18SrDNA和5．8SrDNA保守引物,PCR扩增3种兔球虫ITS-1片段,产物纯化后测序。将3种球虫ITS-1测序结果与GenBank发布的兔球虫ITS-1序列进行比对和遗传距离比较,绘制系统发育树。结果表明,大型艾美耳球虫、黄艾美耳球虫及肠艾美耳球虫河北株分别扩增出424、455、434bp的ITS-1片段。大型艾美耳球虫、黄艾美耳球虫及肠艾关耳球虫河北株与GenBank中发布的同种兔球虫ITS-1序列相似性分别为97．4％、97．9％和96．9％。系统发育树显示兔球虫ITS-1序列形成1个单系群,该单系群根据寄生部位分为2个姊妹群。     

黄艾美耳球虫河北株18SrDNA部分序列测定及系统发育分析

为了进一步确定黄艾美耳球虫河北株虫种,试验根据GenBank中发表的黄艾美耳球虫18SrDNA基因序列设计引物,建立PCR方法对黄艾美耳球虫河北株基因片段扩增、测序,并进行系统发育分析.结果表明:扩增出大小为1 465bp的清晰条带;黄艾美耳球虫河北株18S rDNA序列测定结果与GenBank中的黄艾美耳球虫EF69...     

基于ITS-1序列的5种兔球虫系统进化分析

利用核糖体DNA内转录间隔区1(ITS-1)序列对兔艾美耳球虫进行系统进化分析,并探讨生物学和形态学特征在兔球虫进化中的意义。单卵囊分离大型、黄、肠、中型及穿孔艾美耳球虫卵囊,接种无球虫兔获得纯种卵囊,CTAB法提取卵囊基因组DNA,PCR扩增ITS-1区后克隆、测序。将测序结果与GenBank发布的兔球虫ITS-1序列进行比对和遗传距离分析,绘制系统进化树。结果显示:大型、黄、肠、中型及穿孔艾美耳球虫河北株ITS-1序列分别长320、330、351、336和341bp。5种兔球虫河北株与GenBank中同种兔球虫ITS-1序列相似性分别为96.9%、97.3%、96.9%、99.1%和99.4%。兔球虫形成单系群,该单系群分为2个姐妹谱,与卵囊残体有无相对应,其它形态学和生物学特征与系统进化无相关性。研究结果表明外残体的有无可作为兔球虫进化分类的特征。     

兔肠道球虫病三重PCR方法的建立与应用

为建立一种能同时检测兔穿孔艾美耳球虫、黄艾美耳球虫、大型艾美耳球虫的三重PCR方法，试验首先根据GenBank中的兔穿孔艾美耳球虫Eper基因、黄艾美耳球虫Efla基因、大型艾美耳球虫Eman基因序列设计3对特异性引物，通过优化PCR反应的退火温度和引物浓度，建立一种用于检测兔肠道球虫病的三重PCR方法，然后对该方法的特异性、敏感性及重复性进行评价，最后分别采用该方法及单一PCR方法对82份临床样本进行检测，计算两种方法的符合率。结果表明：所建立的三重PCR方法的最佳退火温度为59.7℃,最佳引物(F/R)浓度为0.15/0.15,0.20/0.20,0.20/0.20μmol/L(Eper、Efla、Eman基因);该方法能特异性扩增出兔穿孔艾美耳球虫、黄艾美耳球虫、大型艾美耳球虫三种兔球虫卵囊靶基因，而斯氏艾美耳球虫、大肠杆菌及沙门氏菌的检测结果为阴性；能够检测出穿孔艾美耳球虫、黄艾美耳球虫、大型艾美耳球虫三种兔球虫卵囊基因组DNA的最低限值分别为6.0,6.4,8.0 pg,两种模板浓度组合(60,64,80 ng/μL和6.0,6.4,8.0 ng/μL)批内重复性试验和批间重...     

2种鹅球虫18S rDNA基因克隆测序与系统发育分析

在分析了多种艾美耳球虫18S rDNA序列的基础上,设计1对艾美耳属球虫的通用引物,分别对鹅艾美耳球虫(E.anseris)和赫尔曼艾美耳球虫(E.hermani)18S rDNA部分序列进行PCR扩增、克隆和测序,并用DNAstar软件对这2种鹅球虫与15种艾美耳球虫的18S rDNA序列进行同源性分析,最后以火鸡组织滴虫为外类群,采用邻接法构建了2种鹅球虫与29种艾美耳亚目原虫的18S rDNA序列系统进化树。结果显示:鹅艾美耳球虫和赫尔曼艾美耳球虫的18S rDNA部分序列长度分别为1 695和1 696 bp。虫种间的相似性以2种鹅球虫最高,其次为鹅球虫与鹤球虫。在系统发育树中,艾美耳属球虫与成囊类球虫各形成一个单系分支;锦鲤的艾美耳球虫与其他动物的艾美耳球虫形成姊妹群关系;湿地鸟类的艾美耳球虫聚合为一分支,鸡形目和哺乳类动物的艾美耳球虫形成另一分支。本研究提示18S rDNA序列可用于鹅球虫的分类鉴定。     

四种兔艾美耳球虫卵囊产量的比较

分别用4种兔艾美耳球虫经口接种45日龄无球虫感染兔,接种剂量为1×104个卵囊/兔。感染后4d～20d,以麦克马斯特氏法计数每天排出的卵囊。结果表明,肠艾美耳球虫排卵量最多,为365.76×106个,中型艾美耳球虫为317.26×106个、黄艾美耳球虫为304.36×106个,大型艾美耳球虫排卵量最少,为200.12×106个。大型艾美耳球虫在感染后第6.5天有卵囊排出,第10.5天达到高峰(66.50×106个/只),占总量的33.23%;肠艾美耳球虫在感染后第9天有卵囊排出,第13天达到高峰(138.40×106个/只),占总量的37.83%;黄艾美耳球虫在感染后第9天有卵囊排出,第11天达到高峰(102.80×106个/只),占总量的33.78%;中型艾美耳球虫在感染后第4.5天有卵囊排出,第6.5天达到高峰(167.8×106个/只),占总量的52.89%。     

黄艾美耳球虫单卵囊分离及PCR鉴定

为了获得纯种黄艾美耳球虫,从张家口某兔场的兔粪中分离黄艾美耳球虫孢子化卵囊,单卵囊接种无球虫兔,以饱和盐水漂浮法收集子代卵囊,利用CTAB法提取黄艾美耳球虫卵囊基因组DNA,并根据Gen Bank中发表的艾美耳属球虫保守序列设计引物,PCR扩增ITS并测序,设计特异性引物鉴定黄艾美耳球虫。结果表明:黄艾美耳球虫ITS1序列长330 bp,5.8S r DNA序列长157 bp,ITS2序列长522 bp。在黄艾美耳球虫ITS1/2序列高变区设计种特异性引物,与大型艾美耳球虫和肠艾美耳球虫无交叉反应。说明建立的鉴定黄艾美耳球虫的PCR方法灵敏、特异。     

基于ITS1-5.8S rRNA-ITS2序列兔肝球虫PCR检测方法的建立

通过对多种鸡球虫和松鼠球虫18S rRNA和28S rRNA进行序列比对分析,在18S rRNA 3’端和28S rRNA 5’端保守区设计艾美耳属通用引物,以斯氏艾美耳球虫洛阳分离株LY卵囊基因组DNA为模板首次成功克隆到斯氏艾美耳球虫完整的ITS1-5.8S rRNA-ITS2序列,其大小为1178bp,其中ITS1序列长度为423bp,5.8S rRNA为155 bp,ITS2为600 bp,斯氏艾美耳球虫LY株ITS1/2序列高度变异,与鸡球虫、啮齿动物球虫的序列同源性低于60%。然后在斯氏艾美耳球虫ITS1/2序列超变区设计种特异引物,建立了灵敏、特异的PCR检测方法。本研究结果将为兔球虫强致病种的临床诊断和揭示兔球虫种群遗传特征提供有效的分子工具。     

5株堆形艾美耳球虫线粒体cox3基因的增及序列分析

以5株堆形艾美耳球虫为研究对象,对其线粒体细胞色素c氧化酶第Ⅲ亚基(cox3)的部分基因(pcox3)进行了PCR扩增、测序及序列分析,并与GenBank上已发表的顶复门原虫相关序列进行比较,研究其线粒体cox3基因遗传变异情况.结果每个虫株均获得572 bp的目的片段,利用DNAStar软件进行序列比对,5株堆形艾美耳球虫线粒体pcox3序列完全一致,与疟原虫和住白细胞虫相应序列的相似性分别为51%和50%,而与泰勒虫的相似性少于50%.本研究首次报道了堆形艾美耳球虫pcox3序列,结果显示不同来源的堆形艾美耳球虫pcox3序列没有差异,与毒力无关,为进一步研究艾美耳球虫的群体遗传学奠定了基础.     

斯氏艾美耳球虫ITS1-5.8S rRNA-ITS2序列的克隆及PCR检测方法的建立

通过对多种鸡球虫和松鼠球虫18SrRNA和28SrRNA进行序列比对分析,在18SrRNA 3′端和28SrRNA 5′端保守区设计艾美耳属通用引物,以斯氏艾美耳球虫洛阳分离株LY卵囊基因组DNA为模板首次成功克隆到斯氏艾美耳球虫完整的ITS1-5.8SrRNA-ITS2序列,其大小为1 178bp,其中ITS1序列长度为423bp,5.8SrRNA为155bp,ITS2为600bp,斯氏艾美耳球虫LY株ITS1/2序列高度变异,与鸡球虫、啮齿动物球虫的序列相似性低于60%。然后在斯氏艾美耳球虫ITS1/2序列超变区设计种特异引物,建立了灵敏、特异的PCR检测方法。本研究结果将为兔球虫强致病种的临床诊断和揭示兔球虫种群遗传特征提供有效的分子工具。     

Sequence and Phylogenetic Analysis of rDNA ITS of Three Eimeria Species in Rabbit

In order to study whether the internal transcribed spacers (ITS) sequence could be used as a molecular marker for the species identification of rabbit coccidian, the rDNA ITS of Eimeria intestinalis, Eimeria flavescens and Eimeria magna were amplified by polymerase chain reaction (PCR), and were cloned into pGEM-T Easy vector subsequently. The positive recombinant plasmids were identified by PCR and then sequenced. By sequence comparison and comparative analysis with the relative sequences of rabbit Eimeria spp. available in GenBank, the results showed that the lengths of Eimeria intestinalis, Eimeria flavescens and Eimeria magna were 1065, 1009 and 1047 bp, respectively, and the sequence homologies with the same species sequences were 99.2%, 99.0% and 94.5%, respectively, while were 55.3% to 82.1% compared with corresponding sequences of other different species sequences. The phylogenetic analysis using software Mega 5.0 showed that all rabbit coccidia clustered together in a clade, which was divided into two sister lineages, corresponding to the presence or absence of oocyst residuum. The result demonstrated ITS could be used as a molecular marker for the species identification of rabbit coccidia.     

安徽省肥西县家兔球虫感染情况初步调查

对安徽省肥西县不同地区的家兔球虫种类及感染情况进行调查,结果表明该地区家兔球虫感染率为100%,并均为混合感染。鉴定出9种艾美耳球虫(Eimeria),即大型艾美耳球虫(E.magna)、盲肠艾美耳球虫(E.coecicola)、穿孔艾美耳球虫(E.perforans)、斯氏艾美耳球虫(E.stiedai)、小型艾美耳球虫(E.exigua)、中型艾美耳球虫(E.media)、松林艾美耳球虫(E.matsubayashii)、肠艾美耳球虫(E.intestinalis)和那格浦耳艾美耳球虫(E.nagpurensis),并对家兔球虫的感染强度和优势虫种等进行了记述。     

鸡艾美耳球虫18SrDNA序列与系统进化分析

为了确定鸡艾美耳球虫（Eimeria）不同种以及来自不同地区同种不同株之间的亲缘关系,研究其分类地位,对实验室保藏的柔嫩艾美耳球虫（Etenella）、毒害艾美耳球虫（Eneeatrix）、巨型艾美耳球虫（Emaxima）、堆形艾美耳球虫（Eaaervulina）等4种15株鸡球虫孢子化卵囊的18SrDNA基因进行克隆、测序,并与从GenBank下载的鸡球虫18SrDNA序列一起,使用软件DNAstar 5．0 MegAlign进行系统发育分析。结果显示,4种艾美耳球虫种间同源性在94．6％～99．4％之间,7株柔嫩艾美耳球虫的株间同源性在99．0％-99．9％之间,5株巨型艾美耳球虫的株间同源性在96．9％～99．8％之间。用该4种鸡球虫的18SrDNA序列与GenBank下载的另外4种鸡球虫18SrDNA序列构建系统发育树,显示这8种鸡艾美耳球虫形成2个分支,即堆形艾美耳球虫（EASH）、巨型艾美耳球虫（EMSH）、变位艾美耳球虫（Emivati）、和缓艾美耳球虫（Emitis）、布氏艾美耳球虫（Ebrunetti）、早熟艾美耳球虫（Epraecox）构成1个分支,柔嫩艾美耳球虫（ENSH）、毒害艾美耳球虫（ETAS）构成另1分支。巨型艾美耳球虫、柔嫩艾美耳球虫各株的系统发育树均根据地域关系产生2个分支。柔嫩艾美耳球虫、毒害艾美耳球虫的亲缘关系较近,不同地理区域的同种不同株的亲缘关系相对较远,种间和种内的鉴定结果与普通生物学结果一致。本研究提示18SrDNA基因可用于鸡球虫不同种／株的分类鉴定,为艾美耳球虫分子遗传学鉴定提供了理论基础。     

江苏部分地区奶牛球虫病流行情况调查

为了解江苏省奶牛感染球虫的情况,笔者对6个规模化奶牛场和3个奶牛小区9个牧场的奶牛球虫感染状况进行了随机抽样调查,分别于2008年11月和2009年4月按不同年龄阶段共采集粪样2100份。调查结果显示:9个牧场都有球虫感染,1个奶牛小区牧场的感染率最高达50%,其中11月份调查的感染率为30.10%,4月份调查的感染率为36.95%,两者没有明显的差异;从不同年龄阶段奶牛的感染情况来看,发现感染率最高的2个阶段为1～6月龄和6～12月龄,感染率高达53.81%和49.52%,感染率最低的年龄阶段为1月龄以内的奶牛,感染率为12.86%;从感染强度来看,大部分牧场平均OPG低于1000,占55.56%,只有一个牧场的平均OPG比较高,为2410;从本次调查结果发现9个牧场感染有8种艾美耳球虫(E.imeria),分别是牛艾美耳球虫(E.bovis)、邱氏艾美耳球虫(E.zumii)、椭圆艾美耳球虫(E.ellipsoidallis)、阿拉巴艾美尔球虫(E.alabamensis)、亚球形艾美尔球虫(E.subspherica)、怀俄明艾美尔球虫(E.wyomigensis)、柱状艾美尔球虫(E.cylindrica)、奥博艾美尔球虫(E.auburnensis)。优势虫种为牛艾美耳球虫、邱氏艾美耳球虫、椭圆艾美耳球虫,其他5种球虫所占比例较少。     

皖西白鹅球虫种类及感染情况调查

采用传统的卵囊形态学方法,结合球虫寄生部位,对皖西白鹅球虫的感染率和种类进行了调查和鉴定。共查48个粪样,球虫阳性48份,阳性率100％。共检到1科2属6种球虫,其中艾美耳属（Eimeria）5种,即鹅艾美耳球虫（E．anseris）、棕黄艾美耳球虫（E．fulva）、赫曼艾美耳球虫（E．hermani）、有害艾美耳球虫（E．novcens）和多斑艾美耳球虫（E．stigmosa）;泰泽属（Tyzzeria）1种,即稍小泰泽球虫（T．parvula）。稍小泰泽球虫检出率最高（100％）,其次是赫曼艾美耳球虫（50．0％）,为本次调查的优势种。     

Prevalence of coccidia in pigs in Zimbabwe.

Faecal specimens from 162 piglets, aged 1-5 months, from four farms around Harare were examined for coccidia during 1989-1990. Oocyst count per gram (OPG) of faeces was determined by the McMaster technique. Identification of Eimeria species was done after sporulation of oocysts in 2.5% potassium dichromate solution. Measurements of sporulated oocysts were taken from 20 positive cases by using calibrated eye micrometer. Overall incidence was 25.3% (41/162) varying between 15 and 39.5% at different farms. The OPG ranged between 150 and 11,300. Eight species of Eimeria were identified, namely, Eimeria debliecki, Eimeria perminuta, Eimeria suis, Eimeria polita, Eimeria neodebliecki, Eimeria porci, Eimeria scabra and Eimeria spinosa, shown in the order of their prevalence. Eimeria debliecki was the most predominant, showing highest oocyst counts in 45% of 20 pigs, followed by E. suis (25%) and E. polita (20%). On two occasions only one Eimeria sp. was found while in the other 18 (90%) cases, mixed infections of two to six species were recorded.     

Description of Eimeria pavonina (coccidia) of peafowl in Germany

There are only a few reports about the occurrence of coccidia in peafowl and no reports about the occurrence of Eimeria spp. in peafowl kept in Europe. Here, we describe the occurrence of Eimeria pavonina in diseased peafowl from Germany. In January 2011, one young peacock kept in an aviary showed a marked depression. No parasites were detected in samples from the diseased bird, but in samples of birds from the same and other aviaries, coccidian counts were between 400/g and 66,000/g. All peacocks were treated with toltrazuril. After treatment, the clinical condition of the diseased bird improved but, two weeks afterwards, other birds in the aviary were still shedding coccidia in their feces. Based on morphology, the coccidia were identified as E. pavonina. Parts of the 18s rRNA gene and the cytochrome oxidase subunit 1 (cox-1) gene were sequenced. A phylogenetic tree based on the 18s rRNA sequence placed the Eimeria sp. from peafowl closest to Eimeria spp. found in pheasants and partridges as well as to Eimeria meleagrimitis. A phylogenetic tree based on the sequence of cox-1 in contrast suggested a closer relationship to Eimeria necatrix and Eimeria tenella.