水貂多态蛋白位点与经济性状相关的研究

通过建立一般线性模型对美国短毛黑、大连金州黑和左家型水貂遗传标记的筛选,方差分析表明,Pi-3对左家型水貂皮张长度有显著影响,Pi-3位点与美国短毛黑针绒毛长度比之间存在显著相关,Est是对金州黑水貂体重影响较大的位点,Po是对金州黑水貂针绒毛长度比影响较大的位点,Po和Est对金州黑水貂绒毛长度有显著影响。最小二乘均数结果表明,左家型水貂Pi-3的AA型与AB型间皮长差异显著,美国短毛黑中Pi-3的AA型与AB型间针绒毛长度比差异显著,金州黑水貂Est的AB和BB型体重之间也有显著差异,金州黑水貂Po的AA型与AB型的针绒毛长度比有显著差异,金州黑水貂Po的AA型与BB型和Est的AB和BC基因型之间的绒毛长度也有显著差异。     

松辽黑猪L-FABP基因C276A位点多态性及其与肉质性状的相关性分析

本研究采用PCR-SSCP技术对松辽黑猪L型脂肪酸结合蛋白（L-FABP）基因C276A位点单核苷酸多态性（SNP）进行检测,并对其肉质进行了分析。结果表明,内含子1第276位点处发生C→A突变,导致编码的氨基酸发生改变,由亮氨酸变为蛋氨酸,分为3种基因型AA、BB、AB。松辽黑猪群体中L-FABP基因基因型频率AB〉AA〉BB,等位基因频率A〉B,且处于Hardy-Weinberg平衡。在肉质方面,松辽黑猪肌内脂肪含量,AA、AB基因型极显著高于BB基因型;大理石纹,AA型高于AB型,AB型高于BB型,均差异显著;滴水损失,BB型显著高于AA型和AB型,而AA型和AB型差异不显著;其他肉质性状差异不显著。     

三江白猪OB基因多态性及其与繁殖性能的相关性分析

试验利用PCR-RFLP法研究了三江白猪OB基因3 469位点的多态性及其与繁殖性能的相关性。结果表明:OB基因经HinfⅠ酶切后出现3个条带,表现为3种基因型(AA型、AB型和BB型)和2个等位基因(A和B),A等位基因为优势基因,基因频率为67.6%;头胎产活仔数BB型极显著高于AA型(P<0.01),BB型高于AB型,AB型高于AA型,但差异都不显著(P>0.05),BB基因型比AB型和AA型的头胎产活仔数分别高出1.65头、2.19头;不同的基因型对前5胎最高产仔数的影响差异不显著(P>0.05)。     

KAP8.1基因多态对内蒙古绒山羊绒毛性状的影响

以角蛋白关联蛋白8.1(KAP8.1)基因为候选基因,采用PCR-SSCP技术,在内蒙古绒山羊群体中进行基因多态性检测.结果检测到AA、AB、AC、BB、BC和CC六种基因型,A、B和C三种等位基因;测序结果验证融P8.1基因编码区存在T113G和G116C两个SNP位点(GenBank accession no.AY510122),这两个突变未改变KAP 8.1蛋白氨基酸序列;关联分析结果表明,不同基因型对产绒量、绒长度和毛长度有显著影响(P＜0.05),但对绒细度没有影响(P＞0.05);AB基因型和BB基因型产碱量显著高于其它基因型.分析认为该效应是由于T113G突变所造成,表明KAP8.1基因多态性可能是缄山羊产绒量的一个分子标记.     

家兔HSL基因多态性及其与生产性状关联性分析

本实验采用PCR-SSCP方法对齐卡巨型白兔和齐兴肉兔HSL基因外显子1的遗传多态性进行研究,并进一步分析HSL基因对生产性状的遗传效应。结果表明:HSL基因外显子1第784位处发生了碱基突变(A→C),共出现AA、AB和BB 3种基因型,在2个品种兔群体中AA型均为优势基因型,A均为优势等位基因;卡方适合性检验表明,2个品种兔群体均显著偏离哈代-温伯格平衡(P0.05);在齐卡巨型白兔中,HSL基因AA型和AB型个体的宰前活体重均显著高于BB型个体(P0.05),AA、BB型个体的全净膛屠宰率和半净膛屠宰率均显著低于AB型个体(P0.05);在齐兴肉兔中,HSL基因AA型个体的宰前活体重显著高于AB、BB型个体(P0.05),BB型个体的全净膛屠宰率和半净膛屠宰率均显著低于AA、AB型个体(P0.05);在2个品种兔群体中,不同基因型个体的滴水损失和剪切力差异均不显著(P0.05)。     

申农I号猪ESR基因的多态性及其与繁殖性能相关性分析

本研究采用PCR-RFLP的方法,对申农I号144头母猪进行ESR基因的多态性进行检测,分析ESR基因型对头胎总产仔数与产活仔数的遗传效应。结果表明,在申农I号母猪群中,ESR基因存在遗传多态性,可分为AA、AB和BB三个基因型,A、B等位基因频率分别为0.5069和0.4931。AA型、AB型和BB型的频率分别为0.2639、0.4861和0.2500,但AA、AB和BB三种基因型与产仔数之间差异均不显著。     

改良型黑水貂和纯繁短毛黑水貂毛绒品质比较

为了研究改良型短毛黑水貂和纯繁短毛黑水貂的毛绒品质的差异,试验选取健康、体型相近的纯繁短毛黑水貂公母貂各20只,5代改良型短毛黑水貂(美国短毛黑水貂与原苏联标准貂杂交5代)公母貂20只,分别采集水貂背中部、臀部、腹中部的1 cm2的毛样,利用刻度尺和数显外径千分尺测量针毛、绒毛长度和细度,测量母貂的被毛密度,统计相关数据并得到针绒毛长度比。结果表明:改良型短毛黑水貂母貂的被毛密度稍小于纯繁水貂,差异不显著(P0.05);改良型公母貂的针毛长度稍长于纯繁水貂,差异不显著(P0.05);针毛细度极显著大于纯繁水貂(P0.01);绒毛长度极显著小于纯繁水貂(P0.01);绒毛细度稍小于纯繁水貂,差异不显著(P0.05);针绒毛长度比稍小于纯繁水貂,差异不显著(P0.05)。以上数据均在最适范围内,说明改良5代的短毛黑水貂被毛密度、针毛长度、绒毛细度和针绒毛长度比指标接近于纯繁水貂,但绒毛长度、针毛细度指标还需探讨改良,需加强对优良亲代的选育以及饲料营养配方的完善。     

申农1号猪ESR基因的多态性及其与繁殖性能相关性分析

本研究采用PCR—RFLP的方法,对申农1号144头母猪进行ESR基因的多态性进行检测,分析ESR基因型对头胎总产仔数与产活仔数的遗传效应。结果表明,在申农1号母猪群中,ESR基因存在遗传多态性,可分为AA、AB和BB三个基因型,A、B等位基因频率分别为0．5069和0．4931。AA型、AB型和BB型的频率分别为0．2639、04861和0．2500,但AA、AB和BB三种基因型与产仔数之间差异均不显著。     

新吉细毛羊KAP24.1基因多态性及羊毛性状的相关性分析

为了解角蛋白关联蛋白(KAP)24.1基因在新吉细毛羊群体中的多态性与其毛用性状的关联性,试验采用DNA测序法对新吉细毛羊基因组编码区进行测序,找出基因突变位点,然后采用PCRSSCP技术对497只新吉细毛羊KAP24.1基因编码区序列进行多态性分析,并利用最小二乘模型对其多态性与产毛量、纤维直径、拉伸长度进行关联性分析。结果表明:在编码区有两处突变点,一处在348 bp处发生C→T的突变,脯氨酸突变为亮氨酸;另一处在414 bp处发生T→C的突变,丝氨酸突变为脯氨酸,均属于错义突变,KAP24.1基因的AA、AB、BB和CC基因型与纤维直径不相关(P0.05),BB基因型的产毛量和拉伸长度显著大于AB基因型、CC基因型(P0.05)。说明KAP24.1基因可以作为新吉细毛羊产毛量和拉伸长度主要候选基因之一,BB基因型可以作为分子标记用于预测绵羊产毛量和拉伸长度。     

鸡CAST基因编码区的单核苷酸多态与肌纤维性状的相关研究

为了探讨CAST基因作为影响鸡肌肉嫩度性状候选基因的可能性,本研究以四川大恒家禽育种有限公司培育的优质鸡新品系为试验材料,采用PCR-SSCP方法对鸡钙蛋白酶抑制蛋白（Calpastatin,CAST）基因的部分编码区进行单核苷酸多态性（SNPs）检测。结果发现了1个多态性位点（G—T）,且在试验鸡群中检测出AA、BB和AB3种基因型。利用SAS（8．01）软件统计分析了3种基因型与优质鸡肌纤维性状的相关性。结果表明：CAST基因的多态性对鸡肌纤维密度和直径有着显著的影响（P〈0．05）,同日龄鸡群AA型个体的肌纤维密度高于AB型、肌纤维直径低于AB型,且均达到显著水平（P〈0．05）,而AA与BB型、BB与AB型间差异不显著（P〉0．05）;同体重鸡群BB型个体的肌纤维密度高于AB型、肌纤维直径低于AB型,且均达到显著水平（P〈0．05）,而AA与BB型、AA与AB型间差异不显著（P〉0．05）。试验结果提示：CAST基因对鸡肌纤维性状具有重要作用,推测可以利用该位点对鸡肌肉嫩度性状进行标记辅助选择。     

不同猪种ADIPOQ基因外显子2多态性及其与山西白猪体重和体尺性状的关联分析

本研究旨在检测猪脂联素（adiponectin,ADIPOQ）基因外显子2的多态性,并分析其对山西白猪体重和体尺性状的影响。采用PCR-SSCP技术检测了长白猪、大白猪、杜洛克猪、山西白猪、山西黑猪和马身猪6个猪种392个个体ADIPOQ基因外显子2的多态性,并采用GLM程序分析了ADIPOQ基因外显子2多态性与山西白猪体重和体尺性状的关联性。结果显示,在ADIPOQ基因外显子2的89 bp处检测到G→A错义突变,引起缬氨酸（Val）向异亮氨酸（Ile）的转变。ADIPOQ基因外显子2存在3种基因型：AA、AB、BB,2个等位基因：A和B。杜洛克猪中只有BB基因型,长白猪、大白猪、山西白猪和山西黑猪中BB基因型为优势基因型,马身猪中AA基因型频率最高。在引入品种长白猪、大白猪和杜洛克猪中B等位基因为优势等位基因,基因频率分别为0.96、0.96和1.00;在地方品种马身猪中A等位基因频率（0.52）略高于B等位基因（0.48）;在培育品种山西白猪和山西黑猪中B等位基因频率分别为0.76和0.78,介于引入猪种和地方品种之间。基因型频率分布在马身猪、山西白猪和山西黑猪之间无显著差异（P>0.05）,杜洛克猪与长白猪、大白猪间差异均不显著（P>0.05）,而长白猪和大白猪间差异显著（P<0.05）,任意一个引入品种与马身猪、山西白猪和山西黑猪之间的差异均达到极显著水平（P<0.01）。ADIPOQ基因外显子2多态性对断奶重有显著影响,其中BB基因型个体28日龄断奶重显著高于AA和AB基因型（P<0.05）,AA和AB基因型间无显著差异（P>0.05）,但对其他性状无显著影响,说明该位点只在个体发育早期阶段起作用。     

猪SLA-DRA基因外显子2多态性及其与仔猪腹泻的关联分析

为探索SLA-DRA基因作为猪抗病育种分子标记的可能性,本研究采用PCR-SSCP和克隆测序方法对大白、长白和杜洛克共216头猪的SLA-DRA基因外显子2进行了多态性研究,分析了该基因与仔猪腹泻的关联性。结果,在SLA-DRA外显子2上检出了3个等位基因和6种基因型;6种基因型(AA、AB、BB、AC、BC和CC)在大白猪和长白猪中都存在,而在杜洛克猪中只检出4种基因型(AA、BB、AB和BC)。杜洛克猪与大白猪和长白猪间基因型分布均差异极显著(P<0.01);3个品种的基因型分布均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。最小二乘法分析表明,品种和性别对仔猪腹泻影响不显著(P>0.05),基因型与仔猪腹泻显著相关(P<0.05);AA和BB基因型个体腹泻评分的最小二乘均值均显著高于AC和CC基因型个体(P<0.05)。本研究表明,SLA-DRA基因不同基因型对仔猪腹泻有着重要的影响,可作为猪抗病育种应用中的一个潜在遗传标记。     

北京油鸡AMPD1基因多态性及其与肌苷酸含量关系的研究

根据人和大鼠的腺苷-磷酸脱氨酶1（AMPD1）基因序列设计引物，采用PCR-RF-SSCP技术检测了130只北京油鸡AMPD1基因多态性，并分析了AMPD1的不同基因型与北京油鸡肌苷酸含量的关系。结果表明：在北京油鸡中检测到AMPD1基因的A、B、C3个等位基因，基因频率分别为0．1808、0．6615、0．1577；产生AA、AB、AC、BB、BC、CC6种基因型，基因型频率分别为0．0769、0．1769、0．0308、0．4615、0．2231、0．0308。最小二乘分析表明基因型AC、BB所对应的肌苷酸含量最小二乘均值显著高于基因型AA所对应的最小二乘均值（P〈0．05），肌苷酸含量在AMPD1其余基因型之间没有显著差异（P〉0．05）。     

Relationship Analysis Between the Polymorphism of T138A Locus in TYR Gene and Hair Color in Mink (Neovison vison)

In order to detect the polymorphism of T138A locus in tyrosinase (TYR) gene in mink and analyze the relationship between the genetic polymorphisms and phenotypes of mink hair color, the blood samples of 430 minks with five kinds of different hair color were taken and their genomic DNA were extracted. The T138A locus of TYR gene in mink was detected using PCR-RFLP method. Allele frequency and genotype frequency were calculated. Furthermore, the relationship between the polymorphism of T138A locus and hair color trait were analyzed by the statistical method of Chi-square independence test. The results showed that the T138A locus polymorphism was found with two alleles T and A,and three genotypes of TT, TA and AA. AA genotype was dominant genotype in Jilin White mink (0.9069), TT genotype was dominant genotype in Jinzhou Black mink,Pearl mink,Coffee mink and Silverblue mink, and existed mainly in Jizhou Black mink (1.0000). The association analysis of T138A locus polymorphism with hair color trait indicated that there was extremely significant correlation between TYR gene polymorphism and hair color of mink (P < 0.0001). This results indicated that the T138A locus might affect hair color phenotype, or molecular marker linked with the major gene regulating the white hair phenotype of mink.     

水貂TYR基因T138A位点多态性及其与毛色性状的关联分析

试验旨在检测水貂酪氨酸酶（tyrosinase,TYR）基因T138A位点的多态性,并分析其与水貂毛色表型的相关性。提取5种被毛色型430只水貂血液基因组DNA,采用PCR-RFLP技术,对TYR基因T138A位点进行多态性检测,统计等位基因频率与基因型频率,通过卡方（χ²）独立性检验分析该位点多态性与水貂毛色性状的相关性。结果表明,T138A位点存在2个等位基因T和A,形成TT、TA和AA 3种基因型,AA基因型在吉林白水貂群体中为优势基因型（0.9069）,而TT基因型为金州黑水貂、珍珠水貂、咖啡水貂和银蓝水貂群体的优势基因型,其中在金州黑水貂群体中基因型频率最高（1.0000）。关联分析表明,TYR基因T138A位点的多态性与毛色性状呈极显著相关（P<0.0001）。表明TYR基因T138A位点可能是影响水貂毛色的主控位点或与调控白色被毛表型主控位点连锁的分子标记。     

肌细胞生成素基因多态性对京海黄鸡繁殖性状的遗传效应研究

本研究旨在探讨肌细胞生成素(myogenin,MyoG)基因多态性与鸡繁殖性状间的相关性。以378只京海黄鸡为研究对象,采用PCR-SSCP技术研究MyoG基因外显子的多态性。运用最小二乘法分析这些突变位点形成的基因型与京海黄鸡繁殖性状间的相关性。结果表明,MyoG基因外显子1上存在1个G102A突变,外显子3上存在1个T36C突变,分别形成基因型AA、AB、BB和CC、CD、DD。关联分析结果显示,基因型AA、AB和BB在京海黄鸡繁殖性状上无显著差异（P＞0.05）;基因型CC和DD在京海黄鸡开产体重上存在显著差异（P＜0.05）,在其余性状上各基因型差异均不显著（P＞0.05）。因此,推测MyoG基因对京海黄鸡的繁殖性状无显著影响,为探索鸡育种过程中的标记辅助选择提供参考资料。     

草原红牛二酞甘油酞基转移酶2（DGAT2）基因的多态性及与泌乳性状关联性分析

为研究草原红牛二酞甘油酞基转移酶2（DGAT2）的多态性及与泌乳性状相关性,采用PCR-RFLP方法检测DGAT2基因的遗传多态性。结果检测到AA、AB和BB 3种基因型,统计分析表明该多态位点与草原红牛乳中脂肪和干物质含量呈显著相关,脂肪：AA型极显著高于AB型和BB型（P〈0.01）,AB型和BB型之间差异不显著（P〉0.05）;干物质：AA型显著高于AB型（P〈0.05）,极显著高于BB型（P〈0.01）,而AB型又显著高于BB型（P〈0.05）;其他泌乳性状的基因型间差异不显著（P〉0.05）。此结果提示,DGAT2基因对草原红牛乳中脂肪和干物质含量具有较大的遗传效应,可以初步推断DGAT2是控制这些性状的众多基因之一,可能是影响草原红牛乳中脂肪和干物质含量的一个主效基因或与主效基因相连锁,可作为选育草原红牛低脂及高干物质奶牛的分子标记,用于标记辅助选择意义重大。     

钙调素基因启动子序列多态性对京海黄鸡产蛋性状和蛋壳性状的遗传效应

本试验旨在分析钙调素(Calmodulin,CAM)基因启动子区域碱基多态性与京海黄鸡产蛋性状和鸡蛋蛋壳质量性状间的关系。采用PCR-SSCP法检测京海黄鸡CAM基因启动子区域碱基多态性。结果表明:京海黄鸡CAM基因启动子区域有3个SNPs(G326A、A327G、C366T),PCR扩增产物SSCP出现6种基因型:AA、AB、AC、BB、BC和CC。AA基因型个体的300日龄产蛋数和66周龄产蛋数显著高于BB型个体(P<0.05)。AA型个体的蛋壳强度和蛋壳重显著小于AB、BB、AC和BC型个体(P<0.05)。CAM基因座对京海黄鸡300日龄蛋重、蛋型指数、蛋壳强度和壳重百分率的主效应指数(MEI)均大于3%。初步推断CAM基因座可能是影响京海黄鸡产蛋数和蛋壳质量性状重要候选基因。     

Polymorphism of A-FABP Gene and Its Association Analysis with the Productive Performance in Male Baicheng Fatty Chicken

In order to search the molecular genetic markers for breeding of Baicheng fatty chicken, the relationship between the polymorphism of adipocyte fatty acid binding protein (A-FABP) gene and the productive performance of the male chickens at different ages was studied. Ninety two chickens with age of 6 weeks were randomly selected. The polymorphism of A-FABP gene was detected by PCR-RFLP method. In each genotype group, fifteen chickens with similar body weight were categorized, each group was randomly divided into three sub-groups with equal numbers. The productive performance of the chickens was measured at their age of 12, 18 and 24 weeks. The results showed that there were three genotypes of A-FABP gene:AA,AB and BB, BB genotype was the dominant genotype,allele B was the advantageous allele,and it was not in Hardy-Weinberg equilibrium (P<0.01). At the age of 12 weeks,no significant difference was found among the measured productive performance (P>0.05). At the age of 18 weeks, it was found that the intramuscular fat width of BB genotype was significantly higher than AA genotype (P<0.05), the abdominal fat weight of BB and AB genotypes were extremely significantly higher than AA genotype (P<0.01),and the abdominal fat weight percentage of BB and AB genotypes were significantly higher than AA genotype (P<0.05). At the age of 24 weeks, it was found that the body weight, intramuscular fat width and abdominal fat weight of BB genotype were significantly higher than that of AA genotype (P<0.05). Therefore, this results suggested that A-FABP gene could be used as a potential candidate marker for the association of fatty traits in male Baicheng fatty chicken.