仔猪消化道菌群变化与仔猪腹泻的关系

通过对健康和腹泻仔猪消化道内(胃、十二指肠、空肠、回肠、盲肠、结肠和直肠)7个部位菌群取样后进行培养和分离鉴定，研究健康和腹泻仔猪间不同菌群关系的差异，揭示维持仔猪的正常消化代谢优势菌群的组成、比例和结构。结果发现：双歧杆菌和乳杆菌是健康仔猪消化道内数量最多的菌群，为优势菌群；韦荣氏球菌、肠杆菌、肠球菌在仔猪发生腹泻时明显增多，为有害菌群。有害菌群的增多抑制了有益优势菌群的生长，从而导致仔猪发生腹泻。     

仔猪消化道菌群变化与仔猪腹泻的关系

通过对健康和腹泻仔猪消化道内(胃、十二指肠、空肠、回肠、盲肠、结肠和直肠)7个部位菌群取样后进行培养和分离鉴定,研究健康和腹泻仔猪间不同菌群关系的差异,揭示维持仔猪的正常消化代谢优势菌群的组成、比例和结构.结果发现双歧杆菌和乳杆菌是健康仔猪消化道内数量最多的菌群,为优势菌群;韦荣氏球菌、肠杆菌、肠球菌在仔猪发生腹泻时明显增多,为有害菌群.有害菌群的增多抑制了有益优势菌群的生长,从而导致仔猪发生腹泻.     

健康与腹泻断奶仔猪肠道菌群的研究

为了解腹泻仔猪肠道菌群的变化,从而科学有效地防治断奶仔猪腹泻,选择吉林农业科技学院实习猪场的35日龄断奶仔猪20头,分成健康组(10头)和腹泻组(10头),采用无菌手术的方法,从活体仔猪肠道内采集肠内容物,进行细菌的分离培养及鉴定。结果表明:从十二指肠、回肠、结肠三种肠段中测得8种细菌,随着肠段的后移细菌数量逐渐增加。健康仔猪肠道内有益优势菌群为乳杆菌拟杆菌双歧杆菌;腹泻仔猪肠道内有害优势菌群为大肠杆菌沙门氏菌。腹泻组仔猪肠道内乳杆菌、拟杆菌、双歧杆菌的数量较健康组明显下降,大肠杆菌、沙门氏菌的数量较健康组明显上升,差异均显著(P0.05),肠球菌、梭菌、葡萄球菌的数量无显著变化(P0.05)。     

腹泻仔猪与健康仔猪粪便菌群多样性的比较

本试验旨在探究腹泻仔猪与健康仔猪粪便菌群多样性及结构的差异。采集同等饲养条件下的8份腹泻和8份健康哺乳仔猪的粪便样本,利用16S rRNA高通量测序技术对健康仔猪和腹泻仔猪粪便菌群进行比较。结果表明:健康仔猪粪便菌群的多样性高于腹泻仔猪(P<0.05);与健康仔猪粪便菌群组成相比,腹泻仔猪变形菌门(Proteobacteria)的相对丰度增加(P<0.05),而拟杆菌门(Bacteroidetes)降低(P<0.05);在属的分类水平上,腹泻仔猪粪便中埃希氏-志贺菌属(Escherichia-Shigella)和乳杆菌属(Lactobacillus)的相对丰度高于健康仔猪(P<0.05),而拟杆菌属(Bacteroides)、Lachnoclostridium和瘤胃球菌属(Ruminococcus)低于健康仔猪(P<0.05)。综上表明,腹泻仔猪与健康仔猪粪便菌群的多样性和结构存在显著差异,埃希氏-志贺菌属的相对丰度显著增加可能是仔猪腹泻的重要原因之一。     

双岐杆菌对仔猪生长性能的影响

在30～75日龄仔猪的基础日粮中添加不同剂量的有益优势菌双歧杆菌，添加剂量为每千克饲料18mI双歧杆菌发酵液[活菌数为（7-8）×10^10个／ml]的试验Ⅱ组对仔猪的生长性能表现出较好的效果，其平均末重23．100kg,平均净增重16．375kg，平均日增重364g，料重比1．37：1；与对照组相比平均末重高出42．8％，平均净增重高出54．8％，平均日增重高出54．9％，差异均显著（P〈0．05），每增加1kg活重比对照组少耗0．8kg饲料。说明此添加剂量对30—75日龄仔猪的生长有明显的促进作用。     

不同日龄兔肠道正常菌群的研究

用稀释滴种的方法对３个不同生长阶段（未哺乳、哺乳、断乳）的比利时家兔大、小肠部位正常菌群进行了研究。结果表明，肠道中以消化球菌、梭杆菌、双歧杆菌、乳杆菌等厌氧菌占绝对优势。断乳兔与哺乳免正常菌群比较，大、小肠部位的韦荣氏球菌、小肠部位的肠杆茵差别极显著（Ｐ＜０．０１）；大肠部位的优杆菌、双歧杆菌、类杆菌、肠杆菌差别显著（Ｐ＜０．０５）；其余菌差别不显著（Ｐ＞０．０５）。     

微生态制剂对肠道菌群紊乱的调节作用

1动物肠道的正常菌群 细菌、真菌广泛寄居于健康动物的体内和体表，动物出生时肠道内是无菌的，经2～4h后有大量细菌进入井繁殖，称为细菌的定植（colonizaition），细菌种类和数量随动物年龄、食物、宿主对细菌、细菌与细菌之间相互作用而发生变化，这种变化存在整个生命过程中，并维持动态平衡，形成正常菌群。消化道的不同部位，不仅细菌数量不同：胃内的菌落数低于10^3／g（内容物）；小肠约在10^4～10^7个／ml（内容物）；大肠约为10^11～10^12个／g；而且种类也不同；最主要的是类杆菌和双歧杆菌，分别占30％和25％，其次为芽抱杆菌和球菌。     

莱芜仔猪肠道菌群组成初步分析

猪的肠道菌群组成与种类及健康状态密切相关,研究健康、品种优良的猪的肠道菌群组成对于养猪业的发展具有积极意义。本研究采用16SrRNA高通量测序方法对10日龄莱芜哺乳仔猪腹泻仔猪的粪便进行测序分析。结果显示,健康仔猪共有优势菌门为厚壁菌门（Firmicutes）、变形菌门（Proteobacteria）和拟杆菌门（Bacteroidetes）,共有优势菌属为乳杆菌属（Lactobacillus）;腹泻仔猪共有优势菌门为厚壁菌门（Firmicutes）、拟杆菌门（Bacteroidetes）,共有优势菌属为乳杆菌属（Lactobacillus）。此外,两组比较,Lactobacillus、Escherichia-Shigella、Prevotella＿9、Fusobacterium、Prevotellaceae属在腹泻仔猪组丰度水平高,而Acinetobacter、Jeotgalibaca、Treponema＿2、Psychrobacter属在健康仔猪组丰度水平高。本研究结果为莱芜猪肠道菌群多样性研究提供基础数据,并为后期调节肠道菌群、促进猪的健康成长提供参考依据。     

鸭不同肠段内菌群结构分析与拟杆菌分布研究

旨在分析健康鸭十二指肠、空肠、回肠和盲肠内容物菌群组成、多样性特征以及拟杆菌分布。本研究选择健康高邮鸭20只,公母各半,70日龄时无菌采集十二指肠、空肠、回肠和盲肠内容物,提取肠道内容物细菌基因组,利用IonS5TMXL平台进行高通量测序,分析肠道内容物菌群结构与丰度特征以及拟杆菌的分布。结果表明,十二指肠、空肠内容物菌群丰度显著高于回肠和盲肠内容物（P<0.05）,回肠内容物菌群多样性最低;十二指肠和空肠内菌群群落结构较为相似,与回肠,特别是盲肠的相似度较小。健康鸭肠内优势菌门为拟杆菌门（Bacteroidetes）、厚壁菌门（Firmicutes）、变形菌门（Proteobacteria）和梭杆菌门（Fusobacteria）,上述菌门在各肠段内容物中相对丰度不同;不同肠段内容物中定植了不同差异微生物物种,十二指肠、空肠、回肠和盲肠内容物中差异菌门分别是变形菌门、放线菌门（Actinobacteria）、厚壁菌门和拟杆菌门。鸭肠道中共分析到28种拟杆菌种,其中B.acidifaciens、B.barnesiae、B.caccae、B.caecicola、B.coprocola、B.sp和B.luti在盲肠内容物中显著聚类,且B.caecigallinarum、B.plebeius和B.barnesiae在鸭盲肠中优势定植。结果显示,鸭肠段空间显著影响了其内容物中菌群丰度与多样性,不同肠段内定植了差异的优势微生物物种,这可能与肠段小环境以及功能一致,在盲肠内容物中优势定植拟杆菌,推测可能与鸭盲肠生理生化功能相关。     

猪肠道菌群对其生长发育的影响

１猪的肠道菌群 健康猪的肠道菌群保持着动态平衡，有益菌和致病菌在肠道内保持一定比例，并与机体的生长发育密切相关。 仔猪在出生２４小时内大空肠、回肠、盲肠和直肠就定植了分歧杆菌、大肠杆菌、乳酸杆菌、消化球菌、类杆菌、肠球菌、小梭菌、真杆菌和酵母菌等，以前５种占优势。仔猪在哺乳期，胃内存在的微生物以乳酸杆菌为主。以每克粪便湿重按Ｌｏｇ_１０计值猪肠道活菌数，分歧杆菌 ９．０±０．５、大肠杆菌 ８．１±０．１、乳酸杆菌９．９±０．４、消化球菌９．８±０．４、厌氧弯杆菌９．４±０．４、真杆菌９．２±１．０、…     

仔猪肠道微生物宏基因组的研究分析

试验采用高通量测序技术分析仔猪在不同生长阶段肠道微生物菌群的动态变化。从同窝仔猪中随机选择健康仔猪3头,于出生当天(0 d)、出生后5 d、7 d、15 d、23 d(21日龄断奶,即断奶后2 d)和60 d收集仔猪粪便样品进行16SDNA V3-V4段测序,对照数据库进行聚类分析和物种分类学分析,以纲分类进行仔猪粪便微生物宏基因分析。结果表明,仔猪出生当天(0 d)的优势菌主要为γ-变形菌、杆菌、β变形菌、梭状芽胞杆菌、黄杆菌、拟杆菌;出生后5 d的优势菌主要为梭状芽胞杆菌、拟杆菌、杆菌、γ-变形菌;出生后7 d的优势菌主要为梭状芽胞杆菌、杆菌、拟杆菌、γ-变形菌、黄杆菌、β变形菌、ε变形菌;出生后15 d的优势菌主要为梭状芽胞杆菌、杆菌、γ-变形菌、拟杆菌;出生后23 d的优势菌主要为梭状芽胞杆菌、拟杆菌、革兰氏阴性厚壁菌;出生后60 d的优势菌主要为梭状芽胞杆菌、拟杆菌、杆菌、革兰氏阴性厚壁菌。研究表明,仔猪在刚出生阶段肠道微生物菌群与其他阶段显著不同,且21日龄断奶对菌群分布影响较大。     

鼠李糖乳杆菌对早期断奶成华黑仔猪生长性能、免疫性能和肠道菌群的影响

本试验旨在研究饲粮添加鼠李糖乳杆菌对早期断奶成华黑仔猪生长性能、免疫性能和肠道菌群的影响。试验选用32头体重为(7.54±0.19) kg的28日龄断奶成华黑仔猪,随机分为2组,每组4个重复,每个重复4头仔猪。对照组饲喂基础饲粮;鼠李糖乳杆菌组在基础饲粮中添加5.56 mg/kg鼠李糖乳杆菌,使每千克饲粮活菌数达到2.78×10~9CFU。试验预试期7 d,正试期28 d。结果表明:1)与对照组相比,鼠李糖乳杆菌组断奶仔猪平均日增重和肉料比显著提高(P0.05)。2)与对照组相比,鼠李糖乳杆菌组断奶仔猪血清总蛋白、肿瘤坏死因子-α、白细胞介素-2、补体3和免疫球蛋白G含量、过氧化氢酶和超氧化物歧化酶活性以及总抗氧化能力显著提高(P 0.05)。3) 16S rDNA基因高通量测序显示,厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和变形菌门(Proteobacteria)为断奶仔猪盲肠内容物菌群中的优势菌门。在属水平上,鼠李糖乳杆菌组盲肠内容物乳杆菌属(Lactobacillus)和Alloprevotella的相对丰度较对照组分别提高了21.00倍和3.79倍,而盲肠内容物普雷沃氏菌属9(Prevotella_9)和埃希氏菌-志贺氏菌属(Escherichia-Shigella)的相对丰度较对照组分别降低了54.54%和70.62%。综上所述,饲粮添加鼠李糖乳杆菌能够提高早期断奶成华黑仔猪平均日增重和肉料比,提高血清抗氧化能力和机体免疫性能,提高盲肠内容物乳杆菌属和Alloprevotella相对丰度,降低盲肠内容物埃希氏菌-志贺氏菌属相对丰度,改善肠道菌群结构,促进肠道健康,从而提高其生长性能和免疫性能。     

蜡样芽孢杆菌FS株在动物体内部分生物效应的研究

本试验对植物源蜡样芽孢杆菌FS株在动物体内部分生物效应进行了研究。研究表明：饲喂FS菌液的断奶仔猪粪便中大肠杆菌、肠球菌明显减少，而乳酸菌、双歧杆菌增多；饲喂断奶仔猪30天，提高日增重达33.63%，腹泻发生率比对照组降低57．14％；血清中总球蛋白提高4．8％，SOD提高7．7％；以0．25亿个菌／mL给小白鼠饮水40天，脾指数提高118.98%；急性毒性试验观察15天，未出现死亡，饲喂断奶仔猪30天，未发现不良反应。     

重庆地区3个地方品种哺乳仔猪和断奶仔猪结肠菌群比较研究北大核心CSCD

本研究旨在通过监测重庆地区特色动物品种合川黑猪、盆周山地猪和荣昌猪断奶前后的结肠菌群结构,比较分析不同猪种断奶前后的结肠菌群组成特点,探讨断奶前后2个阶段以及不同品种对仔猪肠道菌群的影响。试验样品采集于2018年4月,每个猪种随机选取5头哺乳仔猪(21~25日龄,35日龄断奶)和5头断奶仔猪(30~40日龄),无菌采集每头猪的结肠内容物,提取总DNA,利用细菌通用引物对16S rRNA的V3~V4区进行扩增,通过Illumina Hiseq测序平台对扩增产物进行高通量测序,对优化后的测序序列进行统计分析。结果表明:3个地方猪种哺乳仔猪和断奶仔猪的结肠内容物菌群主要由厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)组成。beta多样性分析发现,哺乳仔猪和断奶仔猪的结肠菌群明显分成了2簇,而3个猪种间的结肠菌群未出现明显组内聚类。在门水平上,梭杆菌门(Fusobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)和疣微菌门(Verrucomicrobia)在哺乳仔猪结肠内容物中的相对丰度均显著高于断奶仔猪(P<0.05),而不同品种间各菌门相对丰度没有显著差异(P>0.05)。在属水平上,拟杆菌属(Bacteroides)、梭杆菌属(Fusobacterium)、脱硫弧菌属(Desulfovibrio)、红螺菌属(Rhodospirillum)和Bradymonadales 5个主要细菌属在哺乳仔猪结肠内容物中的相对丰度显著高于断奶仔猪(P<0.05),而普氏菌属(Prevotella)、Intestinibacter和溶杆菌属(Solobacterium)等8个主要细菌属在断奶仔猪结肠内容物中的相对丰度显著高于哺乳仔猪(P<0.05);不同品种间仔猪结肠内容物中的真细菌属(Eubacterium)、红螺菌属(Rhodospirillum)、瘤胃球菌属(Ruminococcus)和琥珀酸弧菌属(Succinivibrio)的相对丰度存在显著差异(P<0.05)。以上结果表明,断奶前后2个生长阶段对仔猪结肠菌群的影响较不同品种更为明显。     

枯草芽孢杆菌与乳酸杆菌联合应用对断奶仔猪肠道菌群的影响

旨在研究枯草芽孢杆菌与乳酸杆菌联合应用对断奶仔猪肠道菌群的影响。采用Illumina MiSeq测序平台的16S rRNA测序技术分析不同处理后仔猪肠道菌群的变化。结果表明:处理组多样性指数Shannon指数均高于对照组(P0.05),Simpson指数均低于对照组(P0.05);门水平分类上拟杆菌门和厚壁菌门为优势菌群,拟杆菌门在联合益生菌组中的比例最高(61.6%),对照组中最低(43.3%);属水平分类上联合益生菌组与对照组相比存在显著性差异的菌群是颤螺菌属和瘤胃球菌属(P0.05)。结果提示,枯草芽孢杆菌与乳酸杆菌联合应用可以改善断奶仔猪肠道菌群结构,促进肠道内有益菌群的生长。     

复合益生菌对断奶仔猪生长性能及肠道菌群的影响

本文旨在研究益生菌凝结芽孢杆菌和枯草芽孢杆菌组合运用对断奶仔猪生长性能及肠道菌群的影响。选取54头25 日龄健康的断奶仔猪分成2个处理组,每个处理组27头。对照组饲喂基础日粮,试验组饲喂基础日粮添加复合益生菌（凝结芽孢杆菌800 g/t垣枯草芽孢杆菌400 g/t）。通过体外牛津杯试验评估凝结芽孢杆菌和枯草芽孢杆菌组合对断奶仔猪肠道致病大肠杆菌K88的抑菌性能,确定凝结芽孢杆菌和枯草芽孢杆菌在饲粮中最佳的添加比例。试验第8d,仔猪盲肠食糜 取样,测定盲肠肠道菌群。试验结果显示,饲粮中添加凝结芽孢杆菌和枯草芽孢杆菌能够显著（P＜0.05）降低断奶仔猪料肉比和腹泻率;同时,显著增加（P＜0.05）断奶仔猪盲肠中乳酸杆菌的数量,显著降低（P＜0.05）断奶仔猪盲肠中大肠杆 菌的数量。以上结果表明,饲粮中添加凝结芽孢杆菌和枯草芽孢杆菌能够抑制肠道中有害菌大肠杆菌的数量,增加肠道菌群有益菌乳酸杆菌数量,改善断奶仔猪生长性能。     

断奶马驹小肠菌群多样性分析

本试验旨在研究断奶马驹十二指肠、空肠和回肠菌群的多样性，为全面评价断奶后马属动物小肠发育、健康、功能等提供参考依据。选取6匹平均体重为（147.08±4.86） kg的哈萨克断奶马驹为研究对象，在相同的饲养管理和饲粮营养水平条件下饲养60 d。采集断奶马驹十二指肠、空肠和回肠的内容物，采用16S rRNA高通量测序技术检测各肠段内容物中菌群的多样性。结果显示：1）断奶马驹十二指肠菌群的ACE指数和PD＿whole＿tree指数均显著高于空肠（P<0.05）。2）在门水平上，厚壁菌门是十二指肠、空肠和回肠中最主要的优势菌，其次是变形菌门和拟杆菌门，其中空肠中厚壁菌门的相对丰度比回肠提高了26.98%(P<0.05)，回肠菌群中变形菌门和梭杆菌门的相对丰度显著或极显著高于十二指肠和空肠（P<0.05或P<0.01）。在科水平上，回肠中肠杆菌科和巴斯德氏菌科的相对丰度均显著高于空肠（P<0.05），且巴斯德氏菌科的相对丰度还显著高于十二指肠（P<0.05）；十二指肠中瘤胃球菌科的相对丰度较空肠提高了156.04%(P<0.05)。在属水平上，回肠中肠...     

植物源蜡样芽胞杆菌在动物体内的生物效应

对植物源蜡样芽胞杆菌FS株在动物体内的生物效应进行了研究。结果，饲喂FS菌液的断奶仔猪粪便中大肠埃希氏菌、肠球菌明显减少，而乳酸菌、双歧杆菌增多；断奶仔猪饲喂FS菌液30d，日增重比对照组增加33.63%，腹泻发生率比对照组降低57．14％；血清总球蛋白提高4．80％，SOD提高7．70％；以FS0．25亿菌／mL给小白鼠饮水40d，脾指数提高118.98%；小白鼠安全试验观察15d，未出现死亡，饲喂断奶仔猪30d，未出现不良反应，显示FS菌株安全性好。     

腹泻仔猪与健康仔猪肠道微生物多样性比较

目的通过研究对比哺乳期腹泻仔猪与健康仔猪粪便菌群,探讨腹泻对哺乳期仔猪肠道微生物的影响。方法通过高通量16S rDNA测序技术对腹泻组仔猪（n=6）和健康组仔猪（n=3）粪便样本进行测序,比较两组仔猪肠道微生物群落的组成和结构。结果腹泻组仔猪和健康组仔猪粪便菌群差异显著（P<0.05）,腹泻组仔猪的肠道菌群多样性显著（P<0.05）低于健康组仔猪。与健康组仔猪相比,在门水平上,腹泻组仔猪的梭杆菌门和变形菌门的相对丰度显著（P<0.05）增加,而厚壁菌门的相对丰度显著（P<0.05）下降;在属水平上,腹泻组仔猪的梭杆菌属（Fusobacterium）、普雷沃菌属（Prevotella）、埃希菌属（Escherichia）、乳杆菌属（Lactobacillus）、厌氧弧菌属（Anaerovibrio）、拟普雷沃菌属（Alloprevotella）和Fusobacteriaceae_unclassified的相对丰度显著（P<0.05）增加,而大部分厚壁菌门菌属的相对丰度显著（P<0.05）降低。结论通过分析对比腹泻仔猪与健康仔猪肠道微生物多样性,为预防和治疗哺乳期仔猪腹泻提供了理论依据。     

运用454焦磷酸测序技术对断奶前后仔猪肠道菌群的分析

本研究旨在运用454焦磷酸测序技术分析断奶前后仔猪肠道菌群的变化。随机选取胎次和出生时间相近的、体重差异不显著的健康"杜×长×大"外三元新生仔猪12头用于试验。整个试验期间由母猪按常规哺乳直到断奶(25日龄),母猪饲粮不含有抗生素,仔猪于12日龄开始饲喂教槽料。于25日龄(断奶前)和32日龄(断奶后)分别随机挑选3头仔猪进行心脏放血屠宰,无菌采集盲肠内容物,运用454焦磷酸测序技术分析断奶前后仔猪盲肠内容物中菌群结构的变化。结果表明:与断奶前仔猪相比,断奶后仔猪腹泻率显著增加(P<0.05);肠道中菌群多样性增加;肠道中拟杆菌门(Bacteroidetes)含量变化不显著(P>0.05),厚壁菌门(Firmicutes)含量显著增加了63.95%(P<0.05),梭杆菌门(Fusobacteria)和变形菌门(Proteobacteria)含量分别显著减少了100.00%和70.54%(P<0.05)。对厚壁菌门含量进行深入分析发现,在纲的水平,与断奶前仔猪相比,断奶后仔猪肠道中梭菌纲(Clostridia)和芽孢杆菌纲(Bacilli)含量有减少的趋势(P>0.05),而Negativicutes纲、Erysipelotrichia纲和未知厚壁菌纲含量有增加的趋势(P>0.05)。从门到属的水平,断奶前后仔猪肠道菌群相对丰度不同,有些菌是断奶前仔猪肠道特有的,如嗜胆菌属(Bilophila)、具核梭杆菌属(Fusobacterium nucleatum)、黄杆菌属(Flavobacteriaceae)等,有些菌是断奶后仔猪肠道特有的,如费克蓝姆菌属(Facklamia)、八叠球菌属(Sarcina)等。由此可见,断奶后仔猪肠道菌群多样性和菌群结构发生了改变。