利用微卫星标记对宁强矮马和蒙古马遗传多样性的研究

通过8个微卫星位点的多态性检测对宁强矮马和蒙古马共83个个体进行了遗传多样性分析。计算各微卫星位点的等位基因频率、有效等位基因数(Ne)、多态信息含量(PIC)、杂合度(H)和F统计量。结果表明:8个微卫星座位中HMS2变异最大,HTG6变异最小;蒙古马的Ne、PIC、H的平均值均高于宁强马;总群体的平均遗传分化系数Fst为0.017(P<0.01),群体内近交系数Fis为0.171(P<0.01)。说明蒙古马和宁强矮马虽外形和性能上有很大差异,但在品种形成和进化上有着较近的遗传关系。     

利用微卫星标记研究贵州矮马和伊犁马的遗传多样性

试验通过9个微卫星座位对贵州矮马和伊犁马2个品种共84匹马进行了遗传多样性检测,以8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离PCR扩增产物,并用银染法显色,计算各微卫星位点的等位基因频率、有效等位基因数(Ne)、杂合度(H)和多态信息含量(PIC)。结果表明,9个微卫星座位中COR059检出的变异最大,AHT040的变异最小;伊犁马的Ne、H和PIC的平均值高于贵州矮马;2个群体的平均遗传分化系数为0.041。说明2个品种都有丰富的遗传多样性,贵州矮马的基因较伊犁马更为纯合。     

利用微卫星标记分析兴义鸭的遗传多样性

文章旨在阐明兴义鸭的遗传多样性,为其保种与开发利0用提供参考依据。采用20对引物扩增兴义鸭的微卫星片段和判型,计算每个微卫星座位的有效等位基因数(Ne)、等位基因频率(P)、基因杂合度(H)及多态信息含量(PIC)。结果显示:20对微卫星引物在兴义鸭群体中均检测到多态,共检测到85个等位基因,平均每个微卫星基因座等位基因数4.2500个,群体平均杂合度H=0.6850,平均多态含量PIC=0.6284,平均有效等位基因数Ne=3.4449个,其中AJ272578、AJ515883、AJ515889、AJ515895、AJ515897、AJ515900表现为中度多态,剩下的14个位点均表现出高度多态性,试验结果表明,在兴义鸭具有丰富的遗传多样性,具有重要的保种价值和选育开发潜能。     

三个微卫星标记在松辽黑猪中的遗传多样性研究

利用3个微卫星标记ESTMS20、SW2570和S0002对松辽黑猪的等位基因频率、有效等位基因数(Ne)、遗传杂合度(H)和群体多态信息含量(PIC)进行了遗传检测.结果表明,这3个微卫星标记在松辽黑猪中均存在多态性,可以用于松辽黑猪遗传多样性的评估.     

豫西脂尾羊微卫星DNA多态性研究

为了分析5个微卫星位点BL1038、BM757、BM4621、OarFCB304、OarFCB48在豫西脂尾羊群体中的多态性,试验采用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳方法检测其多态性。结果表明:在豫西脂尾羊群体中共发现5个微卫星位点有60个等位基因,有效等位基因(Ne)在6.010 3～10.846 8之间,平均Ne为8.430 3,OarFCB48的Ne最高为10.846 8;5个微卫星位点的平均杂合度(H)为0.876 7,OarF-CB48的H最高为0.907 8。微卫星位点OarFCB48的多态信息含量(PIC)最高为0.902 1,BM757的PIC最低为0.817 5,平均PIC为0.866 5。说明豫西脂尾羊群体属于PIC较高的遗传群体。     

新疆南疆7个地方绵羊品种遗传多样性的微卫星分析

利用14对微卫星引物,以新疆南疆7个地方绵羊群体作为研究对象,分析了7个绵羊品种的遗传多样性。通过计算基因频率、平均杂合度(H)、多态信息含量(PIC)、有效等位基因数(Ne),并根据Nei氏标准遗传距离,进行聚类分析。结果表明:绵羊群体的PIC为0.692,H为0.725,所有位点平均8.4个等位基因,平均4.48个有效等位基因,各绵羊品种聚类结果与其来源、育成史和地理分布基本一致。     

新疆13个绵羊群体遗传多样性及遗传分化的研究

利用10个微卫星标记对新疆13个绵羊群体的遗传多样性和遗传分化进行了分析.通过计算多态信息含量(PIC)、平均杂合度(H)、群体内近交系数(Fis)、遗传分化系数(Fst)、总群体近交系数(Fit)和基因流(Nm)等参数,评估各品种遗传多样性和品种间遗传分化.结果表明:13个绵羊群体10个微卫星标记的平均多态信息含量为...     

蒙古马4个地方品种SSR遗传多样性的研究

利用个策卫星基因座对蒙古马勒个地方品种的188匹马进行了遗传检测。通过软件计算了各微卫星座位的有效等位基因数（E）、多态信息含量（PIC）、平均杂合度（H），并构建NJ聚类图和UPGMA聚类图。结果：9个微卫星基因座均为高度多态位点；4个群体在个位点上的平均有效等位基因数为5.0570-6.0744，平均PIC为0.7662，4个群体平均杂合度无显著差异，均很高；乌珠穆沁马群体与乌审马群体遗传分化最近，马尔虎马群体与锡尼河马群体遗传分化较远。     

运用微卫星标记对中国地方绵羊品种的遗传多样性分析

利用30对微卫星引物,以中国西部7个地方绵羊（Ovi saries）品种为研究对象,通过计算基因频率、平均杂合度（H）、多态信息含量（PIC）及有效等位基因数目（Ne）,并根据共祖遗传距离矩阵进行UPGMA聚类分析,评估其品种内和品种间的遗传变异。结果表明：在30个座位中,共检测到239个等位基因,平均每个座位等位基因数为8个;品种平均有效等位基因数为2.9～3.4个,座位平均有效等位基因数为1.9～5.3个;座位平均杂合度为0.320～0.818,品种平均杂合度在0.656～0.719之间,座位平均PIC为0.388～0.786,品种平均PIC在0.590～0.666之间。聚类分析表明各绵羊品种聚类结果与其来源、育成史和地理分布基本一致,其中有争议之处仍待进一步探讨。     

2个与HSP70基因连锁的微卫星座位与牛运输应激性状的关联分析

试验探讨了2个与HSP70基因连锁的微卫星座位与牛运输应激性状的关联分析。选择120头12月龄、体重250 kg左右的健康西门塔尔杂种肉牛进行运输应激试验，并根据牛基因组遗传图谱，选择23号染色体上与HSP70基因连锁的微卫星座位BMS468和BM1258检测其在西门塔尔杂种肉牛样本群体中的多态性，采用最小二乘拟合一般线性模型分析微卫星座位与运输应激性状部分指标之间的关联效应。结果显示：微卫星座位BMS468共检测到5个等位基因（128、134、140、146、154 bp），优势等位基因为128和134 bp，有效等位基因数（Ne）、多态信息含量（PIC）和遗传杂合度（He）分别为3.66、0.68和0.73，遗传多态性较高，关联分析显示与运输后7 d平均日增重和发病率显著相关，其中128/128 bp基因型个体的运输后7 d平均日增重最大（P < 0.05），134/128 bp基因型个体的发病率最低（P < 0.05）；微卫星座位BM1258座位共检测到6个等位基因（99、101、103、113、117、119 bp），优势基因为101 bp，Ne、PIC和He分别为4.30、0.73和0.77，遗传多态性较丰富，关联分析显示，其与发病率显著相关，其中99/99 bp基因型个体的发病率最低（P < 0.05）。综上所述，2个微卫星座位可作为牛运输应激性状的潜在遗传标记，为开展牛抗运输应激性状的标记辅助选择提供科学依据。     

利用微卫星分析康西草原马匹种群的遗传多样性和群体结构

旨在揭示康西草原马匹的品种来源以及群体遗传结构。本研究采集了当地60匹健康状况良好、体重适中、3～6岁之间不区分公母马的血液样品,试验分为6个种群并以纯血马等4个国外马品种、1个我国地方马品种作为对照， 通过设计引物并提取基因组DNA结合微卫星扩增法对染色体上12个微卫星位点的等位基因进行检测，并对各种群遗传多样性参数、群体分化指数、瓶颈效应以及群体结构进行分析。试验按照群体个数为依据分为6组，每组1个重复，每个重复以该组样本量为标准。分析6个种群马的遗传参数结果表明，其中共检测到221个等位基因,平均Shannon指数为1.691；有效等位基因数(Ne)为3.649～5.397；期望杂合度(He)为0.681～0.798；观测杂合度(Ho)为0.632～0.780；平均多态信息含量(PIC)为0.643～0.772。这些结果表明，6个群体都具有很高的遗传多样性。通过微卫星DNA位点的连锁不平衡及哈迪-温伯格平衡分析发现， 大多数位点的P值都大于校正值(P=0.006 5)，表示较多位点都处于哈迪-温伯格及连锁平衡状态。各群体间群体分化系数(Fst)表明，群体间分化程度较低(Fst<0.15)。基于Nei’s遗传距离与地理距离之间Mantel相关性检验显示二者之间呈现正相关性(R=0.502)，但未达到显著水平(P=0.310)；各马匹种群瓶颈效应分析表明，P值极显著(P_(IAM)<0.01)说明该地区的马群体受到过瓶颈效应的影响且该马群体历史上数量有大规模的减少。通过 FCA因子分析、基于Nei’s标准遗传距离UPGMA树状图以及Structure贝叶斯聚类分析发现，该地区马种群与纯血马和温血马聚为一类，说明该种群最有可能主要来源于温血马和纯血马。这些结果揭示，康西草原地区马匹具有较高的遗传多样性，该地马群体的血统与纯血马和温血马相近，这为当地马遗传资源评估以及开发利用打下了坚实的基础。     

8个微卫星位点在甘肃高山细毛羊肉毛兼用品系中的遗传多样性研究

利用8个微卫星位点对甘肃高山细毛羊肉毛兼用品系进行遗传检测,计算了等位基因频率、有效等位基因数、群体杂合度和多态信息含量。结果表明,位点BM3501的有效等位基因数、群体杂合度和多态信息含量都最高（Ne=7.30,H=0.866,PIC=0.848）;位点BM3413的有效等位基因数、群体杂合度和多态信息含量都最低（Ne=2.33,H=0.573,PIC=0.478）;8个微卫星位点在甘肃高山细毛羊肉毛兼用品系中多态性丰富,除位点BM3413表现为中度多态外,其余位点均表现为高度多态。因此,甘肃高山细毛羊肉毛兼用品系遗传杂合度较高,遗传多样性丰富,选择余地较大;8个微卫星位点可用于甘肃高山细毛羊肉毛兼用品系遗传多样性评估,并可用于对其羊毛性状和肉用性状的进一步研究。     

不同品种马ELA-DQA* exon2的多态性分析

通过PCR—SSCP技术检测了7个品种300匹马ELA—DQA＊^exon2的多态性。用12％非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳将已变性的PCR扩增产物分离，银染法显色。结果300匹马中共出现27种基因型：10种纯合子和17种杂合子；7个品种马的He和PIC值均表现为高度多态；等位基因序列分析得到10个等位基因间的Kimura双参数遗传距离为0．015～O．147，符合（dN：〉dS）的正选择检验。因此表明马的ELA—DQA＊^exon2多态性丰富。     

Genetic Analysis of Three Lithuanian Native Horse Breeds

This study was the first to analyze the polymorphic characteristics of a wide range of genetic markers in three Lithuanian horse breeds. Genetic variation at seven red blood cell alloantigen (blood group) loci, 10 biochemical genetic loci and 16 microsatellites was examinated in 31 Zemaitukai, 30 large-type Zemaitukai and 24 Lithuanian Heavy Draught horse and compared to that of other domestic horse breeds. Genetic variability of the Zemaitukai breeds based upon blood groups and biochemical loci was higher than average for domestic horse breeds. For microsatellite loci, the variability of the large-type Zemaitukai and the Heavy Draught breeds also was high compared to the mean variation for domestic breeds; however, for the Zemaitukai breed, variation levels were very near the average for horses.     

小尾寒羊微卫星DNA多态性研究

本研究利用5个微卫星标记BL1038、BM757、BM4621、OarFCB304、OarFCB48对小尾寒羊的遗传多样性进行了分析。结果表明,小尾寒羊群体在5个微卫星标记中共发现有57个等位基因,小尾寒羊群体的有效等位基因数(Ne)在5.7315~12.3025之间,5个微卫星标记的有效等位基因数平均达到7.4888个,其中OarFCB48的有效等位基因数最高为12.3025个。5个微卫星标记中平均杂合度为0.8559 ,其中OarFCB48的杂合度最高为0.9187。微卫星标记OarFCB48的多态信息含量(PIC)最高为0.9130,BM757的PIC最低为0.8091,平均PIC为0.8439。说明小尾寒羊群体属于多态信息含量较高的遗传群体。     

新疆13个绵羊品种及1个杂交群体遗传多样性的微卫星分析

利用7个微卫星标记对新疆13个绵羊品种和1个杂交群体的遗传多样性进行了检测。统计了各品种的等位基因组成、平均有效等位基因数(E),利用等位基因频率计算出各品种的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(PIC)和品种间的遗传距离。结果表明,7个微卫星位点均为高度多态,可作为有效的遗传标记用于绵羊品种之间遗传多样性和系统发生关系的分析。各品种的分子系统发生关系与其来源、育成史及地理分布基本一致。     

闽南黄牛的微卫星多态性研究

：用8个微卫星标记对闽南黄牛的等位基因频率、多态信息含量、杂合度和有效等位基因数等指标进行统计分析，并在此基础上对其进行聚类分析和分类研究。结果：8个微卫星标记在所检测的闽南黄牛群体中都表现出较丰富的多态性，在4个群体8个微卫星座位共有58个等位基因，每个微卫星标记平均检测到7．2个等位基因（3～11）；8个微卫星标记的平均多态信息含量（PIC）为0．6471，各群体的平均多态信息含量（PIC）差并不显著；全部群体平均杂合度为0．2930；各群体平均有效等位基因数为3．37。此表明闽南黄牛在微卫星位点上具有丰富的遗传多样性；根据奈氏标准遗传距离进行UPGMA聚类分析，结果表明4个群体间的遗传变异不大。     

Molecular characterization and differentiation of five horse breeds raised in Algeria using polymorphic microsatellite markers

In this study, genetic analyses of diversity and differentiation were performed on five horse breeds raised in Algeria (Barb, Arab‐Barb, Arabian, Thoroughbred and French Trotter). All microsatellite markers were highly polymorphic in all the breeds. A total of 123 alleles from 14 microsatellite loci were detected in 201 horses. The average number of alleles per locus was the highest in the Arab‐Barb horses (7.86) and lowest in the thoroughbred breed (5.71), whereas the observed and expected heterozygosities per breed ranged from 0.71 (Thoroughbred) to 0.752 (Barb) and 0.71 (Thoroughbred) to 0.77 (Arab‐Barb), respectively. The genetic differentiation between the breeds was significant (p < 0.01) based on the infinitesimal model (F_ST). Three different approaches for evaluating the genetic relationships were applied. Genetic distances, the factorial correspondence analysis and structure analysis showed that a significant amount of genetic variation is maintained in the native horse populations and the other breeds. The Barb and Arab‐Barb breeds seem to be the most genetically related and support the decision to consider the breeds as same population.