甘薯病毒2中国分离物全基因组序列克隆及遗传进化分析

正甘薯病毒2(Sweet potato virus 2,SPV2)是马铃薯Y病毒科(Potyviridae)马铃薯Y病毒属(Potyvirus)成员。SPV2也称为甘薯脉花叶病毒(ipomoea vein mosaic virus,IVMV)和甘薯Y病毒(sweet potato virus Y,SPVY)~[1],是甘薯上常见的病毒之一。SPV2病毒粒体为线条状,长度为850 nm,在细胞质中形成风轮状或卷轴状内含体~[2]。SPV2可由桃     

甜菜花叶病毒新疆分离物基因组3′末端序列分析

甜菜花叶病毒(Beet mosaic virus,BtMV)属马铃薯Y病毒科、马铃薯Y病毒属,可经多种蚜虫以非持久性方式传播,病毒粒子为弯曲线状,核酸为单分子正义ssRNA。目前只有美国华盛顿分离物的全序列以及斯洛伐克和英国少数几个分离物3′端的部分序列被报道[1,2]。美国分离物全长9591nt,3′端具有PolyA尾,编码一个由3086个氨基酸组成的多聚蛋白,与其它Potyvirus病毒一样可切割成10个蛋白,从N到C端依次为P1、HC-Pro、P3、6K1、CI、6K2、NIa-Vpg、NIa-Pro、NIb和CP[2]。对于我国发生的BtMV,1981年Liu等[3]报道了发生于北京地区菠菜上的Bt…     

山药潜隐病毒RT-LAMP快速检测方法的建立

<正>0引言山药(Dioscorea oppositifolia L．)是薯蓣科薯蓣属植物,可作为药用或食用材料^[1],广泛分布于全球热带及亚热带地区,在我国河南、山东、江苏、广西和江西等省份都有种植。山药生产中以块茎无性繁殖方式为主,导致病毒病发生严重^[2]。侵染山药的病毒主要包括马铃薯Y病毒属(Potyvirus)^[3]、杆状DNA病毒属(Badnavirus)^[4]、香石竹潜隐病毒属(Carlavirus)^[5]以及蚕豆病毒属(Fabavirus)^[6]的一些病毒。     

马铃薯Y病毒科分子进化研究进展

马铃薯Y病毒科Potyviridae包括许多重要的植物病毒。本文综述了近年来该科马铃薯Y病毒属Potyvirus、甘薯病毒属Ipomovirus和禾草病毒属Poacevirus内20余种病毒的分子进化研究现状,从突变、重组、漂移、选择和迁移5个方面探讨了影响该科一些病毒分子进化的因素,并展望了未来的研究方向,以期为该科病毒的有效防控提供理论依据。     

华南番木瓜环斑病毒的鉴定、提纯与性质的初步研究

 为害华南番木瓜的病毒以番木瓜科(Caricaceae)和葫芦科(Cucurlitaceae)中若干植物为寄主,范围狭窄。病毒的稀释终点为10^-2~10^-3;热灭活点为50~55℃;体外存活期为8~16小时。病毒颗粒长约600~800nm、宽约10~15nm的略为弯曲的细丝。在感病番木瓜组织的细胞内,电镜观察到典型的风轮状内含体(pinwheel inclusion body)。病毒具有马铃薯Y病毒组成员的典型特征,可认为是国外报道的番木瓜环斑病毒的中国株系,初步命名为华南番木瓜环斑病毒。     

分子检测韭葱黄条病毒的研究

韭葱黄条病毒(Leek yellow stripe virus,LY SV)为马铃薯Y病毒组(Potyviridae)的典型成员, 是危害葱属作物的主要病毒之一。该病毒最早由 Bos等在1978年鉴定并命名,目前在全世界范围内均有广泛分布。LYSV在电镜下呈11-12 nm ×820 nm长的线状颗粒,为正义单链RNA病毒, 基因组全长10 142 bp,5'端具有病毒基因组结合蛋白VPg,3'端具有Poly(A),基因组含一个开放阅读框(ORF),翻译先产生一个具有蛋白酶功能的多聚蛋白,再自身酶解成包括外壳蛋白在内的十个多肽。     

甜菜花叶病毒新疆分离物基因组3'末端序列分析

甜菜花叶病毒（Beet mosaic virus，BtMV）属马铃薯Y病毒科、马铃薯Y病毒属，可经多种蚜虫以非持久性方式传播，病毒粒子为弯曲线状，核酸为单分子正义ssRNA。目前只有美国华盛顿分离物的全序列以及斯洛伐克和英国少数几个分离物3’端的部分序列被报道。美国分离物全长9591 nt，3’端具有PolyA尾，编码一个由3086个氨基酸组成的多聚蛋白，与其它Potyvirus病毒一样可切割成10个蛋白，从N到C端依次为P1、HC—Pro、P3、6K1、CI、6K2、NIa—Vpg、NIa～Pro、NIb和CP。对于我国发生的BtMV，1981年Liu等报道了发生于北京地区菠菜上的BtMV，之后研究人员相继报道了黑龙江、内蒙古和新疆等甜菜主产区甜菜花叶病的发生及危害情况，并陆续开展了对BtMV的生物学特性、外壳蛋白分子量测定和氨基酸组分分析、细胞病理学等研究，目前对于我国发生的BtMV的分子结构特征还未见报道。本文报道了甜菜花叶病毒新疆分离物（BtMV—XJ）3’端的核酸序列，并与国外已报道序列进行了比较分析，为从分子水平上明确我国BtMV的分子结构特点、深入研究其编码蛋白的功能打下了基础。     

3种甘薯病毒多重RT-PCR检测方法的建立及应用

正病毒病是引起甘薯品质降低和减产的重要原因之一,现已报道30多种能侵染甘薯的病毒~([1,2])。山东省是甘薯种植大省,病毒种类近10种~([3,4])。甘薯羽状斑驳病毒(Sweet potato feathery mottle virus,SPFM V)、甘薯潜隐病毒(Sweet potato latent virus,SPLV)是为害甘薯的主要病毒,在全国甘薯种植区广泛分布~([5,6])。甘薯病毒2(Sweet potato virus 2,SPV2)为Potyvirus的一个暂定种,多与同属的其他病毒混合侵染~([7])。多重PCR技术由Chamberian等~([8])1988年首次提出,可实现多基因的同时扩增,具有节省时间、提高效率的优点,已初     

我国发现由甘薯褪绿矮化病毒和甘薯羽状斑驳病毒协生共侵染引起的甘薯病毒病害

甘薯病毒病害(Sweet potato virus disease,SPVD)是由毛形病毒属(Crinivirus)的甘薯褪绿矮化病毒(Sweet potato chlorotic stunt virus,SPCSV)和马铃薯Y病毒属(Potyvirus)的甘薯羽状斑驳病毒(Sweet potato feathery mottle virus,SPFMV)协生共侵染甘薯引起的病毒病害[1].     

引起掌叶半夏花叶病的芋花叶病毒

 在表现花叶症状的天南星科药用植物掌叶半夏(Pinellia cordata)上检测到一种线状病毒,病毒粒子的最大分布范围为725~776nm,平均长度为745nm。提纯病毒A₂₆₀/A₂₈₀为1.28,电镜下观察为均一的线状病毒粒子。经免疫电镜测定该线状病毒与芋花叶病毒(DMV)抗血清有强的阳性反应。在病叶横切面的细胞质里观察到具风轮状、卷筒状和片层状聚集结构,在纵切面上为束状的细胞质内含体以及分散的和紧密聚集的线状病毒粒子。寄主反应测定结果表明,该病毒侵染天南星科植物,不侵染其它11科35种非天南星科供试植物。据上述试验结果,该病毒分离物认为属芋花叶病毒。本文是有关该属植物上病毒的首次报道。     

一株PVYNTN-NW黑龙江马铃薯分离物的检测鉴定

 马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)是马铃薯、烟草等茄科作物上的重要病毒,在与寄主共同进化过程中产生了许多株系。本文从黑龙江马铃薯样品中得到PVY分离物A12。ELISA结果表明A12被PVY^O的单克隆抗体特异性识别。A12开放阅读框为9 186个核苷酸,编码3 061个氨基酸,与SYR-II-Be1分离物的核苷酸和氨基酸序列一致率均最高,分别为98.3%和99.2%。系统发育分析发现A12与PVY^NTN-NW株系SYR-II型的分离物聚类到一起;重组分析表明,A12是N-605和O_z的重组体,重组类型与SYR-II-Be1相同。综合以上结果表明,A12属于PVY^NTN-NW株系SYR-II型。但与常见PVY^NTN-NW株系分离物在珊西烟引起叶脉坏死不同,A12产生花叶症状。A12辅助成分-蛋白酶在182位和245位的氨基酸均为精氨酸,而其它PVY^NTN-NW株系分离物为赖氨酸。本研究结果可为黑龙江马铃薯PVY的早期检测和有效防控提供理论指导。     

一株PVYNTN-NW黑龙江马铃薯分离物的检测鉴定

 马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)是马铃薯、烟草等茄科作物上的重要病毒,在与寄主共同进化过程中产生了许多株系。本文从黑龙江马铃薯样品中得到PVY分离物A12。ELISA结果表明A12被PVY^O的单克隆抗体特异性识别。A12开放阅读框为9 186个核苷酸,编码3 061个氨基酸,与SYR-II-Be1分离物的核苷酸和氨基酸序列一致率均最高,分别为98.3%和99.2%。系统发育分析发现A12与PVY^NTN-NW株系SYR-II型的分离物聚类到一起;重组分析表明,A12是N-605和O_z的重组体,重组类型与SYR-II-Be1相同。综合以上结果表明,A12属于PVY^NTN-NW株系SYR-II型。但与常见PVY^NTN-NW株系分离物在珊西烟引起叶脉坏死不同,A12产生花叶症状。A12辅助成分-蛋白酶在182位和245位的氨基酸均为精氨酸,而其它PVY^NTN-NW株系分离物为赖氨酸。本研究结果可为黑龙江马铃薯PVY的早期检测和有效防控提供理论指导。     

进境加拿大豌豆中豌豆细菌性疫病菌的检测

 利用MT选择性培养基从进境加拿大豌豆样品上分离到一株细菌分离物(编号1314),对该分离物进行PCR检测、16S和23S rRNA序列扩增、多位点序列分析、Biolog测定、烟草过敏性反应和致病性测试。豌豆细菌性疫病菌(Pseudomonas syringae pv. pisi, Ppi)特异引物AN7F/AN7R扩增分离物1314和Ppi菌株ATCC 11043得到预期272 bp的条带,二者的PCR产物序列一致,与GenBank中Ppi (X97405)的序列相似性为99.57%。分离物1314的部分16S rRNA、23S rRNA序列以及16S-23S序列均与Ppi菌株ATCC 11043一致。选择gap1、gltA、gyrB和ropD 4个看家基因进行多位点序列分析,系统发育树显示分离物1314与Ppi菌株聚在同一组内。Biolog鉴定结果表明:分离物1314为Ppi,PROB值为0.898,SIM为0.72。该分离物人工接种豌豆茎秆能引起水渍状症斑,接种烟草叶片产生过敏性反应。基于上述试验结果,将分离物1314鉴定为豌豆细菌性疫病菌。     

油菜花叶病毒山西地黄分离物的全基因组序列测定与分析

 采用双链RNA(double-stranded RNA, dsRNA)技术和非序列依赖PCR扩增(sequence-independent amplification,SIA)方法对感病地黄进行分子鉴定,并测定油菜花叶病毒(Youcai mosaic virus,YoMV)山西地黄分离物(YoMV-SX)的基因组全序列。序列测定及分析发现侵染地黄的病毒为油菜花叶病毒(Youcai mosaic virus,YoMV)。获得YoMV-SX(GenBank登录号JX422022)全长为6 304 nt,5′UTR长度为68 nt,3′UTR长度为236 nt,含有4个开放阅读框(open reading frame,ORF)。全序列核苷酸一致性分析显示YoMV-SX与Tobamovirus亚组Ⅲ中分离物的一致性为90.7%～96.0%,与同属亚组Ⅰ和Ⅱ的一致性仅为50.2%～63.3%。全序列系统进化分析表明,YoMV-SX与YoMV-Wh形成一个独立分支,亲缘关系最近。这是YoMV侵染地黄的首次报道。     

马铃薯Y病毒HC-Pro第182位赖氨酸残基参与引起烟草叶脉坏死

 马铃薯Y病毒(potato virus Y,PVY)是侵染烟草的最重要病毒之一。不同PVY株系侵染烟草可引起不同症状,有些PVY株系可引起烟草叶脉坏死,严重影响烟草的产量和品质。PVY A12分离物属于NTN-NW株系,但侵染珊西烟(Nicotiana tabacum cv. Xanthi)不能引起叶脉坏死。分析发现,PVY分离物A12 HC-Pro第182和245位的氨基酸均为精氨酸(R),而能引起叶脉坏死的其他NTN-NW分离物HC-Pro的这2个位点均为赖氨酸(K)。PVY坏死株系N605的HC-Pro第182位和245位氨基酸也均为K。本研究通过定点突变,将N605侵染性克隆PVY^N605-GFP HC-Pro第245位残基K突变为R,突变体仍然能够引起叶脉坏死,而将其HC-Pro第182位残基K突变为R,突变体不能引起叶脉坏死。Western blot检测发现,2个突变体与野生型病毒CP蛋白在珊西烟中的表达水平没有明显差异。沉默抑制实验结果显示,2个突变体和野生型的HC-Pro抑制RNA沉默能力没有发生变化。初步确定PVY^N605-GFP HC-Pro第182残基K是引起叶脉坏死的关键氨基酸,推测PVY A12分离物不能引起烟草叶脉坏死的原因是其HC-Pro第182残基R引起的。     

重楼花叶坏死病毒侵染滇黄精的首次报道

<正>滇黄精(Polygonatum kingianum Coll. et Hemsl)为百合科(Liliaceae)黄精属(Polygonatum)多年生草本植物,属于药食两用资源^[1]。用于补气养阴、健脾、润肺、益肾,现代药理研究发现具有抗氧化、抗病毒、抗肿瘤等作用^[2-3]。近年滇黄精人工种植发展迅速,病虫害问题凸显。2019—2020年在云南曲靖、昆明滇黄精种植基地调查发现滇黄精表现花叶、褪绿、叶片皱缩、植株矮小等症状(图1-A),该病害田间发病较为普遍,不同地块发生率在5%～15%,一些地块出现集中发病现象。为明确病原种类,本研究利用透射电子显微镜观察、转录组测序、序列分析,对侵染滇黄精的病毒进行鉴定。     

凤仙花花叶病的病原鉴定

<正>0引言凤仙花(Impatiens balsamina)为凤仙花科(Balsaminaceae)凤仙花属(Impatiens)一年生草本植物,在我国大部分地区均有分布。栽培过程中凤仙花真菌病害主要有白粉病、褐斑病、炭疽病和立枯病等^[1-2]。有关凤仙花病毒病的报道,如番茄斑萎病毒(tomato spotted wilt virus,TSWV)^[3]、凤仙花坏死斑点病毒(impatiens necrotic spot virus,INSV)^[4]、黄瓜花叶病毒(cucumber mosaic virus,CMV)^[5-6]、烟草花叶病毒(tobacco mosaic virus,TMV)^[7]、番茄花叶病毒(tomato mosaic virus,ToMV)^[8]、长叶车前花叶病毒(ribgrass mosaic virus,RMV)^[9]等均可侵染凤仙花。     

海南红麻曲叶病的病原检测与鉴定

 红麻曲叶病是2012年在海南省海口市发现的一种新病害,病株表现为叶片向上卷曲、叶脉肿大、叶脉变深绿色等症状。PCR检测结果显示,该病样中均存在菜豆金色花叶病毒属病毒。基因克隆及序列分析结果表明,该病毒分离物(HN08)基因组仅含A组分(DNA-A),其全长为2 738 nt,与木尔坦棉花曲叶病毒(CLCuMuV)各分离物的相似性均大于89.0 %,其中与中国各分离物的相似性均大于99.0 %。该病毒分离物也伴随有β卫星分子,其全长为1 346 nt,与CLCuMuV各分离物伴随的β卫星分子(CLCuMuB)序列相似性大于83.0 %,其中与分离物Fz1的序列相似性最高,为99.7 %。构建了HN08 DNA-A及其β卫星分子侵染性克隆,通过农杆菌注射接种红麻,接种后30 d,HN08 DNA-A及其β卫星分子混合接种的红麻植株新出叶片开始产生曲叶症状;接种后60 d,二者混合接种的植株大部分叶片表现为严重的曲叶症状,且与田间自然病株症状相同,而二者各自单独接种的红麻植株没有产生明显的症状。PCR及Southern blot检测进一步证实这些症状是由HN08 DNA-A及其β卫星分子的共同侵染引起的。因此,海南红麻曲叶病是由CLCuMuV及其伴随的β卫星分子(CLCuMuB)共同侵染引起的。本文首次报道了红麻是CLCuMuV自然新寄主。     

中国大青金色花叶病毒浙江分离物全基因组序列测定与分析

<正>大青(Clerodendrum cyrtophyllum Turcz),别名路边青、淡婆婆、臭叶树,为马鞭草科(Verbena officinalis Linn)大青属(Clerodendrum)野生落叶灌木,常生长在山地林下、平原、丘陵和溪谷旁,我国江苏、安徽、河北、河南、浙江等地为主产区。大青用途广泛,叶片可萃取靛蓝作为染料,嫩叶可食用,     

潍坊萝卜红心病病原鉴定

 本文用生物学、血清学和分子生物学证据证明,引起潍坊萝卜红心病的病原为芜菁花叶病毒(Turnip mosaic virus,TuMV).该病毒可系统侵染曼陀罗、油菜、咸阳黄瓜、丝瓜、大白菜和普通烟,局部侵染苋色藜和假酸浆,不侵染豌豆.病毒粒体弯曲线状,长约700 nm,可由蚜虫传播,在红心病组织内形成风轮状和片层凝集状内含体,它在SDS-琼脂糖凝胶免疫双扩散试验中可与TuMV的抗血清形成明显的沉淀线.该病毒的CP基因共867个核苷酸,编码288个氨基酸,分子量为32.98 kD.该序列与国内外20个TuMV分离物的CP氨基酸序列比较结果表明,这些分离物可以分为5组,其中引起萝卜红心病的病毒与日本的H1J、KYD8lJ、意大利的ITA7同属一组.