30个香蕉品种遗传多样性的ISSR分析

利用ISSR技术对香蕉30个品种的遗传多态性进行了分析。从60个随机引物中筛选出8个多态性引物,共扩增出54条DNA带,其中44条为多态性带,占81.5%,平均每个引物扩增的DNA带数为6.75条。按照相同迁移位上有扩增带记为1、无带为0的方法构建ISSR表型数据矩阵,用MEGA2.0软件对香蕉30个品种进行UPGMA聚类分析,计算出30个品种间的平均距离系数为0.313,并在此基础上建立了聚类分析树状图,将香蕉30个品种划分为A、B、C、D4大聚类组。     

冬青属植物的ISSR标记分析及其应用

利用ISSR分子标记对36种冬青属植物的种间关系进行了研究,从100条引物中筛选出12条能扩增出清晰带型并具多态性的引物,共扩增出235条DNA片段,相对分子质量主要集中在400～1 500 bp之间,其中232条片段呈多态性,多态率为98.7%,平均每条引物扩增出19.6条DNA片段;依据扩增结果用UPMGA类平均聚类法进行遗传相似系数分析并构建了系统树.结果表明,36种冬青属植物在遗传相似系数0.64处明显聚为落叶类和常绿类,初步证明了利用ISSR分子标记时冬青属植物进行系统进化和亲缘关系分析的可行性.     

茄子种质资源的ISSR遗传多样性分析

利用ISSR分子标记分析茄子种质多样性,从100条引物中筛选出20条能够扩增出多态性条带稳定清晰的ISSR引物,对48份茄子材料的DNA进行扩增,共获得了186条谱带,其中多态性带153条(占所有谱带的82.2%).利用UPGMA法建立了48份茄子及其近缘野生种间的遗传关系聚类图.聚类结果表明,48份供试种质间的遗传相似系数分布在0.52～0.98之间,可将其分为5大类群.其中又将44份栽培品种分为5组,其品种间相似遗传系数在0.84～0.98之间,表明栽培品种的遗传背景比较窄.聚类结果与茄子的果形以及地理来源有一定的相关性,而与果色呈现不完全相关.     

越橘品种的ISSR鉴定及其亲缘关系分析

利用ISSR分子标记对由北美引种到南京的7个南高丛越橘品种(Vaccinium darrowi×V.corymbosum)、9个南高丛越橘实生选择系和12个兔眼越橘(V.ashei)品种共28份材料进行分子鉴别和亲缘关系分析.10个引物共扩增出98条谱带,其中37条为多态性条带,多态率为37.8%.利用其中8个引物扩增的17条多态带可以区分19个品种和9个实生选择系.利用POPGENE1.31软件进行了Nei's遗传距离计算,利用UPGMA法构建了聚类树状图.聚类结果将各类群单独聚成一大类,证实了它们的亲缘关系.同时显示实生选择系间的遗传差异相对较大,其中7个与南高丛越橘品种聚为一类,而其余2个与兔眼越橘品种聚为另一大类.但是在同一类群内各品种间的遗传关系与谱系数据不完全相吻合,表明本试验所用的ISSR引物不足以用来估算兔眼越橘品种间的遗传关系.     

利用ISSR分子标记分析香蕉品种的遗传多样性

利用ISSR分子标记技术对威廉斯B6及其选育亲本等国内外32个香蕉品种(系)的遗传多态性进行分析。从98对通用ISSR引物中筛选出7对多态性引物,共扩增出64条DNA带,其中51条为多态性带,多态性比例为79.69%,平均每个引物扩增的DNA带数为9.12条。供试香蕉品种间的遗传相异系数范围为0.0345～0.7500,平均相对遗传相异系数为0.03051。聚类分析结果表明,所有供试的32个香蕉品种(系)可分为四个类群,其中巴引103、野酸蕉和花蕉(观赏)分别为一类,其余29个品种(系)聚为一类。     

新疆引进扁桃品种与当地品种间种质资源的RAPD分析

利用7个多态性稳定的引物,对18个扁桃品种进行遗传多样性和亲缘关系RAPD分析.共扩增出54条DNA片段,其中多态性DNA带30条,占总扩增片段的55.6;.根据RAPD扩增结果,应用DPS(V3.01)软件进行Jaccard相似系数和遗传距离计算,并利用UPGMA法构建聚类树状图,结果表明,供试的18个扁桃品种可分为2个大类,聚类结果与种质分布结果基本一致.     

鸡品种随机引物扩增多态DNA的研究

用12个随机引物对6个鸡品种60个个体核DNA进行了RAPD扩增,共检出223条扩增片断,多态性片断188条,占843%。反映了品种内和品种间的遗传变异。12个引物对60个个体分别扩增出16,21,22,17,17,20,22,12,18,23,18,16条带。品种内和品种间遗传相似度变异范围为07981～08685和05993～07813。肉鸡AA品种内变异程度最大,且与伊莎褐遗传距离最大为04007。海兰白和海赛克斯褐首先聚类。肉鸡AA在UPGMA法中与海兰褐聚类后再与其它4种蛋鸡聚类。在NJ法中与海兰褐和其它4种蛋鸡的聚合同时聚类。说明了肉鸡AA与5种蛋鸡品种的距离较远。12个引物在6个鸡品种共检测到7条品种特异带和3条与性别相关带。     

8个云南主要栽培梨品种亲缘关系的ISSR分析

[目的]探索利用简单序列重复间区（ISSR）分子标记研究供试栽培梨品种的分类和系统发育。[方法]利用ISSR分子标记技术对8种云南主要栽培梨品种的亲缘关系进行分析。[结果]ISSR—PCR反应体系优化结果表明,20μl ISSR．PCR反应体系中各因素的最佳浓度分别为：1×PCR buffer、100μmol／L dNTP、0．3μmol／L引物、20ng的模板DNA和1．5U Taq DNA聚合酶,并在此基础上建立了梨ISSR—PCR反应体系。从24个引物中筛选出9个能扩增出清晰带并具多态性的引物,共扩增出了135条DNA片段,其中102个DNA片段呈现多态性,占总扩增片段的75．5％。利用NTSYS—pc2．10t软件计算8种梨品种间的Jaccard遗传相似系数。结果显示梨品种间的相似性系数为0．186～0．750,平均遗传相似性系数为0．476。UPGMA聚类分析表明,8种梨品种可以聚为2类：第一类群包括日本水晶梨、早95-2、四川火把和西子绿;第二类群由早酥、金花、旱黄酥和砀山梨4个品种组成,这与传统分类结果一致。[结论]该研究为梨资源的开发利用及新品种的选育提供科学依据。     

不同花色牡丹品种亲缘关系的RAPD-PCR分析

 用RAPD PCR技术对 7个花色 35个牡丹品种进行基因组DNA多态性分析 ,34个随机引物扩增出 4 18个DNA片段 ,其中 337条谱带表现多态性 ,多态性检测率为 80 .6 % ,表明受试牡丹栽培品种之间富含遗传多态性 ,其中18个受试牡丹品种产生特异性遗传标记 ,这些特异标记对各个牡丹品种具有一定的鉴别价值。将扩增图谱利用UP GMA方法构建遗传聚类树状图 ,分析品种间遗传关系。相似系数 1.5将 35个牡丹品种划分为 2个遗传聚类组 ,相似系数 1.0将其划分为 4个遗传聚类组 ,不同相似系数的遗传聚类划分与花色之间并非完全未有相关性。来源相同花色一致的牡丹品种之间亲缘关系相对较近 ,但产地来源对牡丹品种的亲缘关系的影响比花色更为突出。     

广东地区不同长春花品种的遗传多样性分析

利用ISSR分子标记技术对广东地区栽培的25个长春花品种进行遗传多样性分析.结果表明,供试的15条引物共扩增出110条清晰的条带,平均每条引物扩增出7.33条;多态性条带为69条,多态性比率(PPB)为62.7％,说明25个长春花品种间存在较丰富的遗传变异,ISSR标记可用于长春花的遗传多样性分析.品种间的遗传相似系数介于0.69～0.94之间.UPGMA聚类分析将25个长春花品种分成2组,该聚类结果表明同一系列不同颜色的品种具有较高的遗传相似性,各个商业品系的品种间存在广泛的杂交或具有相同的原始育种材料;花色遗传在分类学上的地位比花眼花色遗传重要;偏蓝色系、白色系均与其他色系相比遗传距离较远.     

13个砂梨品种的ISSR分子鉴别

用ISSR分子标记对13个砂梨品种进行了遗传多样性分析,从50条ISSR引物中筛选出多态性好、稳定性高的12条引物对13个梨品种的DNA序列进行了PCR扩增,共扩增出92个位点,多态性位点比率为63.04%;建立了13个砂梨品种的分子识别卡,用2条引物的9个多态性位点即可将13砂梨品种分开来;采用UPGMA聚类方法构建了各品种之间的聚类图,结果显示,新世纪梨作亲本的品种与非新世界梨做亲本的品种间可明显划分为2组,可进一步细分为6个亚组。本研究为砂梨品种之间的杂交实验和梨新品种培育以及新世纪梨为原料加工产品的真伪鉴别提供了可靠的理论依据。     

薹菜种质资源的RAPD和ISSR分析

【目的】对29份薹菜(Brassica campestris L.ssp.chinensis Makino var.tai-tsai Hort) 种质资源进行遗传多样性和亲缘关系分析,为薹菜的种质资源保护和利用奠定基础。【方法】利用优化的RAPD和ISSR标记体系,对采自山东、江苏和北京的29份薹菜品种进行DNA多态性分析,并采用类平均法对29份薹菜品种的RAPD和ISSR扩增结果进行聚类分析。【结果】从273条RAPD引物中筛选的33个RAPD引物,共扩增出了336条清晰的谱带,其中293条显示多态性,平均每个引物扩增出10.2条多态性谱带,多态性比率为87.2%。利用RAPD标记构建了29份薹菜资源的聚类树状图,距离系数为0.63～0.79。从100条ISSR引物中筛选的45个ISSR引物,共扩增出了522条清晰的谱带,其中414条显示多态性,平均每个引物扩增出9.2条多态性谱带,多态性比率为79.3%;利用ISSR标记构建了29份薹菜资源的聚类树状图,距离系数为0.70～0.86。【结论】基于RAPD和ISSR标记构建的29份薹菜品种的聚类树状图虽有一定差异,但总体趋势一致,1、20、21号薹菜与其他品种的遗传距离相对较远。     

荸荠种质资源品种遗传多样性ISSR分析

为揭示不同荸荠栽培品种的遗传多样性,利用ISSR分子标记技术对24个荸荠品种的亲缘关系进行分析。结果表明,从100条ISSR引物中筛选出适合荸荠种质分析的11条ISSR引物,共扩增出86条带,平均每条引物扩增出7.8条带,多态性为69条带,多态性比例为80.3%。供试的24份荸荠品种两两之间的遗传距离值在0.0909-0.6071之间,平均值为0.3493。UPGMA法聚类结果表明24个荸荠品种在遗传距离0.34处可分为五类。24个荸荠品种在ISSR分析中亲缘关系较近,其遗传基础相对较狭窄,但部分不同地区栽培品种之间仍存在一定的遗传差异。     

“福星01”人参与黄果人参及人参农家类型的ISSR、RAMP分析

利用RAMP和ISSR2种标记分别对人参品种及农家类型间的遗传差异进行检测和分析。结果表明:2种标记均能揭示各材料间的遗传多样性,其中RAMP标记的多态性高于ISSR标记。在ISSR标记中,每个引物可扩增出1～7条DNA片段,24个引物扩增出97条带,平均为4.04条。其中45条带具有多态性,多态性比率为46.4%,揭示供试材料间遗传相似系数(GS)为0.7526～0.9691,平均值为0.8304。在RAMP分析中,每条引物可扩增出1～8条DNA片段,23对引物共扩增出112条带,平均为4.87条。其中75条带具有多态性,多态性比率66.9%,揭示供试材料间遗传相似系数(GS)为0.5625～0.9286,平均值为0.7114。聚类分析结果表明,2种标记均能将供试材料完全分开,分类具有一定的相似性,即聚类与地域性有一定关系。     

应用ISSR对25个小菊品种进行遗传多样性分析及指纹图谱构建

【目的】揭示选育出的菊花新品种遗传多样性并建立ISSR指纹图谱,为品种知识产权保护提供依据。【方法】选用21个ISSR引物,对新选育的25个小菊品种的基因组DNA进行随机引物PCR扩增。【结果】共获得122条扩增带,其中多态性谱带114条,占扩增谱带数的93.4%;品种间相似系数变幅在0.282～0.757;平均有效等位基因数为1.6390,平均Nei’s基因多样性指数为0.3620,平均Shannon信息指数为0.5323;在21个引物中,引物ISSR35扩增的谱带可把25个品种完全区分开。【结论】ISSR标记技术能较好地从分子水平揭示出菊花品种的遗传多样性,并能有效应用于菊花品种指纹图谱的构建。     

36 个蝴蝶兰品种遗传关系的ISSR 分析

采用ISSR分子标记技术对36个蝴蝶兰栽培品种进行遗传多样性和亲缘关系的分析.结果表明,从100条ISSR引物筛选出11条引物共扩增出98条清晰的谱带,其中91条表现出多态性,多态比率为92.86％,品种间的相似系数在0.57～0.96之间,表明供试品种间具有丰富的遗传多态性.并检测到4条品种特异性条带,可用来鉴定供试蝴蝶兰种的3个品种.36个品种在遗传距离L=0.644处可分为7个组,3个最大的组分别代表了黄色系、白色系和红色系,而在同一色系的亲缘关系中又以唇瓣的颜色来聚类,可见聚类情况与花色特征比较一致.     

ISSR标记对34份樱桃种质资源的遗传分析

利用ISSR标记对34份樱桃种质资源进行遗传多样性检测。结果发现,ISSR标记能够揭示材料间较高的遗传多样性。每个引物可获得6～12条DNA片段,平均为8.76条;17个ISSR引物共扩增出149条DNA片段,其中143条具有多态性,多态性比率（PPB）为95.97%;平均多态信息量（PIC）为0.90;每个位点有效等位基因数（Ne）为1.914;材料间遗传相似系数GS变幅为0.44～0.91,平均达0.73。通过聚类,从分子水平对樱桃种质资源的遗传关系进行分析,并对34份资源进行分类,ISSR标记能将34份樱桃种质完全区分开,为樱桃种质资源的研究利用提供参考。     

盾叶薯蓣品种的ISSR指纹图谱研究

[目的]利用ISSR分子标记构建盾叶薯蓣品种鉴定的DNA指纹图谱,为盾叶薯蓣药材鉴定和良种选育提供技术支持。[方法]筛选ISSR引物,对10个盾叶薯蓣品种进行PCR扩增和电泳检测,统计条带并进行遗传多样性分析、聚类分析等;选择核心引物,建立DNA指纹图谱鉴定体系。[结果]从50条ISSR引物中筛选出9条,对10个品种扩增共得到86条谱带,多态性条带72条,多态性条带比率为83.72%;选出3条ISSR核心引物建立了10个薯蓣品种的ISSR指纹鉴定图谱。[结论]盾叶薯蓣品种遗传多样性丰富;3条核心引物所构建的植物图谱中,每个品种均有各自特异的共有谱带、特有谱带、缺失谱带,这些谱带的组合可用于盾叶薯蓣品种鉴定。     

利用RAPD标记分析柞蚕品种资源的亲缘关系

【目的】从分子水平揭示柞蚕品种资源之间的遗传关系，为柞蚕的育种及种质资源的利用提供依据。【方法】利用RAPD（random amplified polymorphic DNA）技术，对来自中国6个主要柞蚕产区的66个品种（系）和2个朝鲜的品种的基因组DNA多态性进行分析。根据扩增结果计算单匹配相似系数，用Neighbor-Joining法构建聚类图。【结果】筛选出的33个随机引物对68个柞蚕品种（系）共扩增出296条DNA带，其中多态性带269条（90.88%）。品种间的成对遗传距离在0.120～0.324之间,主要集中在0.200～0.300之间，有99.05%的品种对的遗传距离小于0.300。聚类分析表明，供试的68个柞蚕品种（系）聚为6个类群，并表现出按目前所在地域(产地)聚类的特性。【结论】柞蚕品种资源之间的遗传差异较小，并且遗传聚类与其目前的地理分布有密切相关性。     

福建主栽非洲菊品种遗传多样性ISSR分析

利用ISSR技术对35份福建主栽非洲菊资源进行遗传多样性分析。从100条ISSR引物中筛选出多态性好的15条随机引物,分别对35份非洲菊资源基因组DNA进行扩增,共扩增得到78条清晰可辨条带,其中多态性条带70条,多态位点百分比达89.7%。利用DPS软件统计分析,结果表明,各品种间的遗传相似系数介于0.296 8～0.750 0,当阈值为0.420 0时,可将35个非洲菊分成4类。当遗传相似系数为0.491 4时,第I类非洲菊又可分为4个亚类。聚类结果表明,花心颜色和重瓣类型可以作为非洲菊亲缘关系分类的一种依据,同一搜集来源的品种有聚类到一起的趋势,这与农艺性状的聚类结果有一定的对应关系。