豌豆品种(系)的RAPD分析

以１８个豌豆栽培品种及野生种材料为ＤＮＡ样品来源,采用７个１０碱基随机引物进行ＰＣＲ扩增。基因组ＤＮＡ的多态性,利用ＲＡＰＤ标记鉴定其品种间及品种内的遗传变异性。７个引物共扩增出６６位点,其中多态性位点５６个,占８４．８％。每个ＰＣＲ扩增产物分别以０和１记录存在与否。扩增产物间成对比较产生非相似性矩阵（Ｊａｃｃａｒｄ相似系数表）,此矩阵用于构建遗传相似性的树状系图谱（遗传树）。通过遗传树的构建将１０个Ｐ．ｓａｔｉｖｕｍ与８个Ｐ．ｆｕｌｖｕｍ群居为截然不同的两大组。     

草鱼和鲤RAPD引物筛选及鱼种特异性分子标记

以草鱼和鲤为材料,提取基因组ＤＮＡ,制备ＲＡＰＤ－ＰＣＲ模板,对３个随机引物盒共６０个１０－ｍｅｒ引物进行了ＰＣＲ扩增,共筛选出７个较理想的可用于鱼种内或鱼种间群体遗传分析的随机引物．用这７个引物所获得的草鱼和鲤的ＲＡＰＤ指纹图谱平均带纹总数分别为４．２８±１．８９和６．７１±４．１９,多态性带纹总数分别为１．７１±１．６０和５．１４±４．７４．ＲＡＰＤ指纹图谱特征反映出草鱼比鲤具有更高的遗传纯度．７个引物共扩增出草鱼特异性带纹１８条,鲤特异性带纹３２条．大量特异性带纹的检出表明,两个鱼种间存在较大的遗传差异,同时也为鱼种间基因转移（特别是全基因组ＤＮＡ导入）提供了分子检测的候选遗传标记     

四川主栽小麦品种RAPD标记遗传差异研究

采用随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ） 标记,对四川近５０ 年来年推广面积６－６７ 万ｈｍ２（１００万亩）以上的４０ 个小麦主栽品种遗传差异进行了初步探讨。结果表明,５５ 个随机引物中,有３２个引物（ 占５８－２％ ） 扩增产物具有多态性。３２ 个引物共扩增出１８５ 条带,其中９３ 条带（ 占５０％ ）具有多态性,每个引物可扩增出１ ～１１ 条多态性带,平均２－９ 条。４０ 个品种ＲＡＰＤ 标记遗传距离（ＧＤ） 变异为０－０１９ ～０－４７５ ,平均ＧＤ 值为０－２２１。聚类分析表明,在ＧＤ 值０－２３ 水平上,４０ 个品种可聚为５ 类。一些随机引物对有些品种能进行特异性扩增。引物ＯＰＮ１４ 对小麦１ＢＳ 扩增能产生特异性ＤＮＡ 片段,能完全鉴定出４０ 个供试品种中的９ 个１ＢＬ／１ＲＳ小麦－ 黑麦易位系品种。据此认为,ＲＡＰＤ标记可以作为小麦品种鉴定的指纹图谱。     

栽培大豆品种间遗传关系的RAPD研究

选用８１种随机引物,利用ＲＡＰＤ技术对１３种栽培大豆品种的基因组ＤＮＡ多态性进行了分析,结果表明大多数的随机引物均得到了良好的ＰＣＲ扩增结果,显示出不同的栽培大豆品种之间基因组ＤＮＡ既有高度的同源性,又具有良好的多态性．通过Ｎｅｉ氏遗传共享度分析,使用ＵＰＧＭＡ（ｔｈｅｕｎｗｅｉｇｈｔｅｄｐａｉｒｇｒｏｕｐｍｅｔｈｏｄｆｏｒａｒｉｔｈｍｅｔｉｃａｖｅｒａｇｅｓ）进行聚类分析,得到了ＵＰＧ－ＭＡ系统树和实验材料之间的遗传关系．     

用RAPD和RFLP定位水稻香味基因（Ⅱ）

用ＲＡＰＤ引物Ｊａｓ１．５从亲本ＣＴ９９９３中扩增出的多态性产物１．５ｋｂ片段，经ＮｃｏＩ酶切后获得的一条０．５ｋｂ片段，将其制备成ＲＦＬＰ探针ｊａｓ５００，选用覆盖整个水稻ＲＦＬＰ图谱的１２５个随机克隆和ｊａｓ５００对ＣＴ９９９３／ＫＤＭＬ１０５的Ｆ２群体进行检测。     

栽培大豆品种间遗传关系的RAPD研究

选用８１种随机引物，利用ＲＡＰＤ技术对１３种栽培大豆品种的基因组ＤＮＡ多态性进行了分析，结果表明大多数的随机引物均得到了良好的ＰＣＲ扩增结果，显示出不同的栽培大豆品种之间基因组ＤＮＡ既有高度的同源性，又具有良好的多态性。通过Ｎｅｉ氏遗传共享度分析，使用ＵＰＧＭＡ（ｔｈｅ ｕｎｗｅｉｇｈｔｅｄ ｐａｉｒ ｇｒｏｕｐ ｍｅｔｈｏｄ ｆｏｒａｒｉｔｈｍｅｔｉｃ ａｖｅｒａｇｅｓ）进行聚类分析，得到了ＵＰ     

RAPD技术在金针菇菌株鉴别的应用

用２０个随机引起物对１６个不同来源的金针菇株进行了ＲＡＰＤ分析研究，结果表明：２０个随机引物中，有６个引物的扩增产物ＤＮＡ片段表现出明显的多态性，其中每个引物对不同菌株扩增出现的ＤＮＡ片段数目，少则没有，多达１１条，平均为５条，ＤＮＡ征段从０．４ｋｂ到３．３８ｋｇ；并且不同的引物扩增出的ＤＮＡ片段带谱不同，差异较大，这６个引物对１６个金针菇菌株共扩增出８４条ＤＮＡ片段带。采用系统聚类法中的类平均法     

利用RAPD标记鉴定豌豆栽培品种(P.sativum)和野生种(P.fulvum)

随机扩增多聚链ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）是基于聚合酶反应链（ＰＣＲ）的扩增反应。笔者应用ＲＡＰＤ技术区别Ｐ．ｓａｔｉｖｕｍ和Ｐ．ｆｕｌ－ｖｕｍ１２个品（种）系,并估测这些品（种）系之间的遗传多样性,用１２个１０－ｍｅｒ核苷酸引物扩增出１６８条染色带。估测遗传类型中遗传相似性是基于扩增产品中成对方法比较,遗传树的构建是利用无重量成组方法的平均数（ＵＰＭＧＡ）进行的。７个Ｐ．ｓａｔｉｖｕｍ栽培品种和５个Ｐ．ｆｕｌｖｕｍ材料群集为截然不同的两大组。ＲＡＰＤ的应用将为育种提供豌豆种间遗传关系资料。ＲＡＰＤ－ＰＣＲ鉴定出的物种特殊的强染色体带可以发展为稳定的物种特殊标记用于基因渗入研究。     

松材线虫和拟松线虫种间及种下群体的RAPD指纹分析

利用ＲＡＰＤ技术对松材线虫（Ｂｕｒｓａｐｈｅｌｅｎｃｈｕｓ ｘｙｌｌｐｈｉｌｕｓ）和拟松材线虫（Ｂ．ｍｕｃｒｏｎａｔｕｓ）的分离物基因组ＤＮＡ进行了ＤＮＡ片段的随机扩增,以确定种间及种内群体的亲缘关系和筛选具有种鉴定特征的分子标记。通过对４０个１０聚体随机引物的筛选,应用８个引物对两种线虫种间种内分离物扩增片段的遗传分析显示：两种间群体ＲＡＰＤ扩增片段的共享度为４０％￣５６％,百在松材线虫的不同分     

苦竹类植物RAPD分析及其系统学意义

利用随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）技术,分析了苦竹类植物中产于日本的大明竹Ｐｌｅｉｏｂｌａｓｔｕｓ ｇｒａｍｉｎｅｕｓ（Ｂｅａｎ）Ｎａｋａｉ、、长苦竹Ｐｌ．ｓｉｍｏｎｉｉ（Ｃａｒｒ．）Ｎａｋａｉ,中国产的苦竹Ｐｌ．ａｍａｒｕ（Ｋｅｎｇ）Ｋｅｎｇｆ．、宜兴苦竹Ｐｌ．ｙｉｘｉｎｇｅｎｉｓ Ｃｈｕ ＆Ｃｈａｏ、斑苦竹Ｐｌ．ｍａｃｕｌａｔｕ（ＭｃＣｌ．）Ｃｈｕ＆Ｃｈａｏ。采用２０个引物（１０ｂｐ）进行扩增出的ＤＮＡ片段,用于种间遗传相似性分析。结果表明：（１）苦竹与宜兴苦竹关系密切;（２）大明竹与其它４种关系较远;（３）形态为分上将中、日产苦竹分成两类没有得到ＲＡＰＤ分析的支持。     

新疆梨种质资源亲缘关系的ISSR和RAPD分析

[目的]探讨新疆梨种质资源亲缘关系以及遗传多样性,旨在为供试梨资源的分类提供科学依据.[方法]采用ISSR和RAPD分子标记对48份梨种质资源进行聚类分析和遗传关系研究.[结果]14条ISSR引物共扩增出113条清晰的谱带,其中101条显示多态性,平均每个引物扩增出7.2条多态性谱带.19条RAPD引物共扩增出163条清晰的谱带,其中多态性谱带138条,平均每个引物扩增出7.2条多态性谱带.基于ISSR和RAPD两种标记,利用UPGMA分别构建了48份梨资源的聚类树状图.ISSR和RAPD分别聚类以及两种标记混合聚类均将48份梨种质分为3类:第Ⅰ类群中包括1份种质;第Ⅱ类群中包括23份种质;第Ⅲ类群中包括24份种质.[结论]两种标记适合于梨种质资源亲缘关系和遗传多样性分析,可为梨资源的开发利用及新品种的选育提供科学依据.     

应用RAPD技术探讨红叶李、李和杏的亲缘关系

为了对红叶李Prunus cerasifera cv.Atropurpurea,李P.salicina和杏P.armeniaca的亲缘关系、品种识别及资源保存提供分子生物学依据,也为了验证传统的形态学分类方法,从132个随机引物中筛选出20个引物对红叶李、李和杏的8个材料进行了基因组DNA扩增,均具有多态性,共扩增出264条带,平均每个引物产生13.2个RAPD片段.RAPD带型及聚类分析表明:RAPD技术能将红叶李、李属植物和杏属植物完全分开,红叶李、李和杏之间表现出一定的亲缘关系,各属品种之间都有不同的遗传距离,证明RAPD技术可作为种和属水平的分类鉴定依据;利用红叶李、李和杏品种的特异谱带结合DNA指纹,可将参试的各品种鉴别出来,从而说明了RAPD技术能够用于种或品种之间的鉴定.图2表2参12     

应用RAPD 技术探讨红叶李、李和杏的亲缘关系

为了对红叶李Prunus cerasifera cv .Atropurpurea , 李P .salicina 和杏P .armeniaca 的亲缘关系、品种识别及资源保存提供分子生物学依据, 也为了验证传统的形态学分类方法,从132 个随机引物中筛选出20 个引物对红叶李、李和杏的8 个材料进行了基因组DNA 扩增,均具有多态性, 共扩增出264 条带, 平均每个引物产生13.2 个RAPD 片段。RAPD 带型及聚类分析表明:RAPD 技术能将红叶李、李属植物和杏属植物完全分开, 红叶李、李和杏之间表现出一定的亲缘关系, 各属品种之间都有不同的遗传距离, 证明RAPD 技术可作为种和属水平的分类鉴定依据;利用红叶李、李和杏品种的特异谱带结合DNA 指纹, 可将参试的各品种鉴别出来, 从而说明了RAPD 技术能够用于种或品种之间的鉴定。图2 表2 参12     

RAPD Anlysis of Different Leaf Colour in Euphorbia pulcherrima

Random amplified polymorphic DNA （RAPD） was used to study the diversity of seven E. pulcherrima with different color leaves. Aight 10 bp primers selected from 30 arbitrary primers were applied for amplifying the Euphorbia pulcherrima DNA. Total 62 bands were produced, among which 22 bands （35.48%） were polymorphic. The average numbers of polymorphic DNA bands amplified by each primer were 7.8. Cluster analysis results showed that the genetic background of seven E. pulcherrima was relatively narrow and they had the higher similarity coefficient, which indicated that these seven strains had a near relationship, and that RAPD marking technology may be the effective means for E. pulcherrima classification.     

应用RAPD标记技术研究大花蕙兰种质资源亲缘关系

利用RAPD标记技术对来自2个企业的18个大花蕙兰品种进行了检测。结果表明：从50个10碱基随机引物中筛选出15个多态性高、重复性好的引物,共扩增出92条DNA条带,其中90条为多态性带,占97.8%,平均每个引物扩增多态性带6条。18个种质之间的相似系数变化范围为0.1975～0.6704,平均相似系数为0.4761;遗传距离变化范围为0.3296～0.8025,平均遗传距离0.5239。基于RAPD的扩增结果建立了UPGMA亲缘关系聚类图,18份种质在遗传距离0.5239处被划分为4个类群。供试的18份种质间的遗传亲缘关系与其花色和花枝类型存在一定的相关性。     

红锥、白椎、大叶栎3个树种分子鉴定及亲缘关系的ISSR分析

[目的]进行红锥、白椎、大叶栎3个树种分子鉴定。[方法]利用ISSR-PCR方法构建红锥（Castanopsis hystrix）、白椎（Castanopsis carlesii Hayata）、大叶栎（Quercus griffithii Hook）3个树种的DNA指纹图谱,根据各个体的Nei氏遗传距离矩阵,利用UPGMA法进行聚类分析。[结果]从50个ISSR引物中筛选出6个多态性引物用于正式扩增,共扩增出86条DNA带,平均每个引物扩增的DNA带的数目为10.75条,多态性条带数目为53条,占总条带数的61.2%。其中,有5个引物扩增出差异条带和特异条带,并分别能准确地鉴定上述3个树种。应用DPS软件计算供试材料遗传距离界于0.16667～0.80952之间,平均为0.56357。[结论]ISSR-PCR方法可以解决红锥、白锥、大叶栎的鉴定问题。     

乌头种质资源遗传多样性的RAPD分析

为了探讨乌头(Aconitum carmichaeli Debx.)种质资源的遗传多样性和亲缘关系,我们收集了来自于云南和四川的23份种质资源,采用2%CTAB法提取乌头总基因组DNA,用15个RAPD随机引物进行分析。15个引物共扩增出242个DNA片段,多态性片段202个,占总扩增片段比率为83.5%,平均每个引物可扩增出13.47个多态性DNA片段。供试材料的遗传相似系数在0.155~0.940之间,表明乌头种质资源具有丰富的遗传多样性。在遗传相似系数0.582处将23份供试材料划分为9个类群,其中15份聚为一个大类,其余8份各自聚为一类。RAPD分析可作为构建乌头DNA指纹图谱的有效方法。     

茉莉花种质资源遗传多样性的ISSR分析

利用ISSR技术对茉莉花30份材料的遗传多态性进行了分析.从100个随机引物中筛选出10个多态性引物,共扩增出70条DNA条带,其中34条为多态性条带,占48.57%,平均每个引物扩增出3.4条DNA带.按照相同迁移位上有扩增带记为1、无带为0的方法构建ISSR表型数据的矩阵,用NTSYSpc 2.0软件对茉莉花30个材料进行UPGMA聚类分析.计算出30份材料的遗传相似系数为0.86～0.98,平均相似系数为0.91,并在此基础上建立了聚类分析树状图,在相似系数0.86处,将30份材料划分为A、B 2大聚类组.     

Analysis of the Germplasm Resources and Genetic Relationships Among Hybrid Cymbidium Cultivars and Native Species with RAPD Markers

The random amplified polymorphic DNA （RAPD） marker was assessed to detect the genetic relationships among 48 hybrid Cymbidium cultivars from Japan, Korea, China, and USA, and 2 species of native Cymbidium. Twenty primers were screened from 100 random decamer primers, and a total of 258 DNA bands were amplified, 253 of which （98.1%） were polymorphic. The average number of polymorphic DNA bands amplified by each primer was 12.6. All cultivars were distinguishable when a number of primers were considered. Genetic similarities among the cultivars and species were estimated based on the amount of band sharing ranging from 0.364-0.817 with an average of 0.581. According to the data, a dendrogram of genetic relationship, which was constructed using the UPGMA method, showed that all the tested cultivars and native species were classified into five cluster groups with the similarity coefficient of 0.592. It revealed that the genetic relationships among tested accessions were to some extent related with their origin, flower colour, branch type, and genealogy. It further indicated that the RAPD technique is a useful tool for studying the genetic relationships among hybrid Cymbidium cultivars.     

花椒种质资源的RAPD分析

利用30条RAPD引物对21份花椒种质资源的DNA进行了扩增,计算了样品间的遗传距离并进行了聚类分析。共扩增出257条谱带,其中多态性谱带186条(占72.37%),平均每条引物扩增多态位点6.2个。21份种质材料间均存在遗传差异,其中韩城红葡萄椒和韩城大红袍遗传距离最近,平均遗传距离为0.290 4;凤县野生构椒和韩城白葡萄椒的遗传距离最远,平均遗传距离为0.833 6;同一种质资源内个体间存在不同程度的差异,其中山东大红袍个体间差异最大,个体间平均遗传距离为0.087 2,但临夏一号和凤县大红袍2份种质内个体间均未检测到差异。当遗传距离取0.529 7~0.576 3时,21份花椒种质资源可以聚类为3组,当遗传距离取0.496 3~0.503 7时,可聚类为7组。RAPD多态性分析从分子水平上反映出了花椒种质资源复杂的遗传背景;为花椒品种的鉴定与分类研究提供了依据。