纤细病毒属病毒的分子生物学研究进展

纤细病毒属（Ｔｅｎｕｉｖｉｒｕｓ）病毒粒体呈丝状,由核衣壳蛋白和基因组ＲＮＡ组成。到目前为止,水稻条纹病毒基因组所有４个片段、水稻草状矮化病毒所有６个片段以及水稻白叶病毒和玉米条纹病毒除ＲＮＡ１外的其余自然的核苷酸序列已经测定。各成员所有ＲＮＡ片段末端均具有共同的保守序列,并且两端互补配对形成锅柄结构。美丽基因组主要采取双义编码策略,但大部分可能编码蛋白的功能未知。ｍＲＮＡ的转录可能采用了抓帽机制     

纤细病毒属病毒的分子生物学研究进展

纤细病毒属（Ｔｅｎｕｉｖｉｒｕｓ）病毒粒体呈丝状,由核衣壳蛋白和基因组ＲＮＡ 组成．到目前为止,水稻条纹病毒基因组所有４个片段、水稻草状矮化病毒所有６个片段以及水稻白叶病毒和玉米条纹病毒除ＲＮＡ１外的其余片段的核苷酸序列已经测定．各成员所有ＲＮＡ 片段末端均具有共同的保守序列,并且两端互补配对形成锅柄结构．病毒基因组主要采取双义编码策略,但大部分可能编码蛋白的功能未知． ｍ ＲＮＡ 的转录可能采用了抓帽机制．纤细病毒属与白蛉热病毒属、番茄斑萎病毒属在基因组序列、结构和编码策略上的相似性表明,纤细病毒属可能归属于布尼安病毒科（Ｂｕｎｙａｖｉｒｉｄａｅ）．     

利用RT-PCR快速检测水稻条纹叶枯病病毒

根据水稻条纹叶枯病病毒基因组序列的信息,在其RNA聚合酶基因、外壳蛋白基因和RNA沉默抑制子基因以及特异蛋白基因的两侧设计4对引物,对感染病毒的水稻植株总RNA并进行RT—PCR扩增,可以在感病植株中分别扩增出水稻条纹叶枯病病毒基因组特有的4个条带,并通过测序和Genbank blast证实。利用该方法可以对水稻和其它寄主进行条纹叶枯病病毒早期检测。     

南方水稻黑条矮缩病毒的分子生物学研究进展

论述了南方水稻黑条矮缩病毒(Southern rice black-streaked dwarf virus,SRBSDV)的分类地位,其隶属于斐济病毒属的第2组成员,病毒基因组由10条双链dsRNA组成,编码13个蛋白。同时,详细介绍了3个非结构蛋白的功能,如SRBSDV-S6编码基因沉默抑制子,SRBSDV-P7-1蛋白形成管状结构,SRBSDV-P9-1与病毒基质的形成密切相关。最后阐述了SRBSDV与寄主之间的相互作用研究进展。     

大麦黄矮病毒运动蛋白情况的初级探索

黄矮病毒主要通过蚜虫为媒介传播,引发黄矮病毒病,会对很多作物,如小麦、大麦、水稻、玉米和燕麦等造成严重减产和绝收,有必要对此进行深入的研究。本文主要结合大麦黄矮病毒的形态结构以及分类等进行了分析,从大麦黄矮病毒运动蛋白的生物学功能等角度进行了阐述。     

水稻条纹叶枯病病毒RT-PCR快速检测研究

水稻条纹叶枯病是由灰飞虱传播的病毒性病害，近年来对长江下游地区的水稻生产带来严重危害。根据水稻条纹叶枯病病毒基因组序列的信息，在其外壳蛋白基因和毒蛋白基因的两侧设计2对引物，对感染病毒的植物和正常未感染植株进行扩增，可以在感病植株中分别扩增出水稻条纹叶枯病病毒基因组特有的2个条带，而在正常植株中未能扩增相关的条带。这就建立了水稻条纹叶枯病病毒检测体系，还对建立条纹叶枯病病毒检测体系在该病预测预报中的作用进行了讨论。     

水稻条纹病毒外壳蛋白自身互作的活性区段研究

水稻条纹病毒(Rice stripe virus,RSV)的外壳蛋白(coat protein,CP)参与病毒转录、复制等多个生物学过程。病毒蛋白之间的互作对病毒侵染活性非常重要,在明确RSV外壳蛋白CP能够自身互作的基础上,通过构建CP蛋白N端、M区段和C端(CP-N、CP-M和CP-C)的酵母表达载体,利用酵母双杂交系统确定外壳蛋白CP自身互作的活性区段。结果表明,N端和C端第1~81个氨基酸是参与水稻条纹病毒CP蛋白自身互作的活性区段。这一研究结果不仅有助于加深理解RSV CP蛋白在病毒基因组稳定、复制过程中的作用,也有助于加深了解RSV、寄主和传播介体之间关系。     

H5N1亚型禽流感病毒HA蛋白在水稻胚乳中的表达及其纯化

为制备H5N1亚型禽流感病毒HA蛋白并评估其免疫原性,利用水稻表达系统表达H5N1亚型禽流感病毒重组HA蛋白。首先构建了重组植物表达载体pCAMBIA1300-HA,该载体具有GT13特有启动子、信号肽SP和终止子,有利于外源基因在水稻中表达。之后将重组质粒pCAMBIA1300-HA通过电转化法导入根癌农杆菌EHA105中,筛选出阳性菌落并侵染水稻愈伤组织。经过暗培养、潮霉素筛选、分化、生根、成苗,采用CTAB法提取水稻叶片DNA,PCR鉴定结果显示,HA基因已插入到水稻基因组中,重组HA基因大小为4 660 bp。将阳性植株移植到大田中,4个月后收获水稻种子,提取水稻胚乳蛋白,Western blot鉴定结果表明,HA蛋白在水稻胚乳中成功表达。重组HA蛋白通过Q阴离子层析、疏水层析和凝胶过滤层析三步分离纯化,其纯度达到90%以上。最后将纯化后的重组HA蛋白与ISA 50V佐剂混合并乳化制成疫苗,免疫小鼠,小鼠血清具有较高的特异性抗体水平,表明重组HA蛋白免疫原性较好。综上,成功构建了H5N1亚型禽流感病毒HA重组蛋白的水稻表达系统,并分离纯化获得了高纯度和免疫原性良好的重组HA蛋白...     

南方水稻黑条矮缩病毒P8蛋白的定位和致病性分析

P8是南方水稻黑条矮缩病毒(Southern rice black-streaked dwarf virus,SRBSDV)编码的一种外壳蛋白,该蛋白的其他功能未知。利用马铃薯X病毒(Potato virus X,PVX)异源病毒载体和pEarleyGate101在本氏烟(Nicotiana benthamiana)中表达了P8,通过荧光共聚焦显微镜观察这些蛋白的亚细胞定位情况,分析该蛋白的表达对本氏烟的影响。结果显示:P8主要定位于细胞质,在细胞质中形成颗粒状聚集体;与PVX空载体侵染的本氏烟相比,P8蛋白的表达能够促使本氏烟表现出一定程度的花叶和新叶皱缩症状,推测可能参与病毒的致病性过程。     

水稻新型潜在冷调节蛋白的生物信息学预测与分析

冷调节蛋白是一类抗寒相关蛋白,其种类十分广泛。几种水稻冷调节蛋白也曾在水稻中被发现,但是目前深入了解的水稻冷调节蛋白种类较少。作者运用生物信息学方法,用已知的冷调节蛋白作为电子探针,预测出16种水稻新型潜在冷调节蛋白,并且使用NCBI-conserved domains、SWISS-MODEL和ExPASY ProtParam tool等在线软件预测它们的功能结构域和二、三级结构以及氨基酸组成,对其作为冷调节蛋白潜在家族成员的真实性、可靠性做出理论上的判断。分析表明,这16种水稻新型潜在冷调节蛋白,符合冷调节蛋白的一些基本的结构特征,具有其他冷调节蛋白相同的功能结构域,为这16种蛋白属于水稻冷调节蛋白家族提供了一些理论依据。     

桑冬芽休眠解除中蛋白质和核酸的动态变化研究

用生化分析法测定了桑冬芽休眠解除过程中ＤＮＡ，ＲＮＡ和蛋白质含量的变化。结果表明，桑休眠芽中ＤＮＡ，ＲＮＡ和蛋白质的含量最低。随着休眠的解除，其含量增加，ＲＮＡ和蛋白质的含量增加更显著     

Localization of amyloid beta protein messenger RNA in brains from patients with Alzheimer's disease

The distribution of cells containing messenger RNA that encodes amyloid beta protein was determined in hippocampi and in various cortical regions from cynomolgus monkeys, normal humans, and patients with Alzheimer's disease by in situ hybridization. Both 35S-labeled RNA antisense and sense probes to amyloid beta protein messenger RNA were used to ensure specific hybridization. Messenger RNA for amyloid beta protein was expressed in a subset of neurons in the prefrontal cortex from monkeys, normal humans, and patients with Alzheimer's disease. This messenger RNA was also present in the neurons of all the hippocampal fields from monkeys, normal humans and, although to a lesser extent in cornu ammonis 1, patients with Alzheimer's disease. The distribution of amyloid beta protein messenger RNA was similar to that of the neurofibrillary tangles of Alzheimer's disease in some regions, but the messenger RNA was also expressed in other neurons that are not usually involved in the pathology of Alzheimer's disease.     

半边旗抗肿瘤有效成分6F对HL-60细胞的 DNA、RNA及蛋白质生物合成的抑制作用

目的：从DNA、RNA及蛋白质生物合成的角度探讨半边旗有效成分6F抗肿瘤的作用机理。方法：用台盼蓝拒染法测定细胞成活率；[^3H]—TdR，[^3H]—UTP和[^3H]—Leu参入法分别测定细胞DNA、RNA及蛋白质生物合成的水平。结果：6F对HL—60细胞生长有强烈的抑制作用，且具明显的时间和剂量效应关系。6F明显抑制HL—60细胞DNA、RNA及蛋白质生物合成，呈剂量依赖关系。6F对蛋白质合成的抑制作用最强。结论：6F对HL—60细胞生长有强烈的抑制作用，抑制细胞DNA、RNA，特别是蛋白质的生物合成是6F抗肿瘤作用的可能机制之一。     

Active disruption of an RNA-protein interaction by a DExH/D RNA helicase

All aspects of cellular RNA metabolism and the replication of many viruses require DExH/D proteins that manipulate RNA in a manner that requires nucleoside triphosphates. Although DExH/D proteins have been shown to unwind purified RNA duplexes, most RNA molecules in the cellular environment are complexed with proteins. It has therefore been speculated that DExH/D proteins may also affect RNA-protein interactions. We demonstrate that the DExH protein NPH-II from vaccinia virus can displace the protein U1A from RNA in an active adenosine triphosphate-dependent fashion. NPH-II increases the rate of U1A dissociation by more than three orders of magnitude while retaining helicase processivity. This indicates that DExH/D proteins can effectively catalyze protein displacement from RNA and thereby participate in the structural reorganization of ribonucleoprotein assemblies.     

ApoB RNA编辑高效蛋白检测体系的构建

[目的]建立一个载脂蛋白B(apoB)RNA编辑蛋白检测体系。[方法]在慢病毒表达质粒载体pCSII-CMV-IRES-Neor中插入apoB RNA编辑保守序列,并在其2端嵌入红色荧光蛋白(DsRed)、绿色荧光蛋白(GFP)表达序列,以此慢病载体转染大鼠肝癌细胞系CBRH-7919获得稳定表达。采用共聚焦显微镜测序方法检测apoB RNA的编辑。[结果]目的指示基因能够在CBRH-7919细胞中稳定表达,表现出指征RNA编辑的多色特征。[结论]试验成功构建了在细胞水平上以颜色变化指示apoB RNA编辑的检测体系,该体系为快速检测以apoB RNA编辑为靶的降胆固醇药物筛选提供了基础。     

Distribution of protein and RNA in the 30S ribosomal subunit

In Escherichia coli, the small ribosomal subunit has a sedimentation coefficient of 30S, and consists of a 16S RNA molecule of 1541 nucleotides complexed with 21 proteins. Over the last few years, a controversy has emerged regarding the spatial distribution of RNA and protein in the 30S subunit. Contrast variation with neutron scattering was used to suggest that the RNA was located in a central core of the subunit and the proteins mainly in the periphery, with virtually no separation between the centers of mass of protein and RNA. However, these findings are incompatible with the results of efforts to locate individual ribosomal proteins by immune electron microscopy and triangulation with interprotein distance measurements. The conflict between these two views is resolved in this report of small-angle neutron scattering measurements on 30S subunits with and without protein S1, and on subunits reconstituted from deuterated 16S RNA and unlabeled proteins. The results show that (i) the proteins and RNA are intermingled, with neither component dominating at the core or the periphery, and (ii) the spatial distribution of protein and RNA is asymmetrical, with a separation between their centers of mass of about 25 angstroms.     

黄瓜花叶病毒M株系全序列测定

在定向克隆和序列分析试验中,白肋烟(Nicotiana tabacumcv.white Burley)为繁殖寄主,根据美国NCBI核酸数据库中CMV基因组RNA1,RNA2和RNA3基因序列,共设计3对特异性引物。对3对特异性引物进行PCR扩增,分别得到3.3 kb的RNA1、3.0 kb的RNA2和2.2 kb的RNA3 PCR扩增产物。M-CMV基因组cDNA经过序列测定,3条链的长度分别为:M-CMVRNA1全长3 361 bp,分子量为111 kDa的1a蛋白;RNA2全长3 037 bp,含有两个分子量为96.7 kDa的2a蛋白和分子量为13.1 kDa的2b蛋白;RNA3全长2 215 bp,分别编码分子量为30.5 kDa的3a蛋白和分子量为24 kDa的外壳蛋白(cp)。这是继国内CMV-CD、CMV-CA全序列报道之后的首次M-CMV全序列分析,为以后采用基因突变、置换方法观察寄主的症状变化做了前期工作。     

Structure of PTB bound to RNA: specific binding and implications for splicing regulation

The polypyrimidine tract binding protein (PTB) is a 58-kilodalton RNA binding protein involved in multiple aspects of messenger RNA metabolism, including the repression of alternative exons. We have determined the solution structures of the four RNA binding domains (RBDs) of PTB, each bound to a CUCUCU oligonucleotide. Each RBD binds RNA with a different binding specificity. RBD3 and RBD4 interact, resulting in an antiparallel orientation of their bound RNAs. Thus, PTB will induce RNA looping when bound to two separated pyrimidine tracts within the same RNA. This leads to structural models for how PTB functions as an alternative-splicing repressor.