藏獒血液蛋白遗传多样性的研究

采用不连续垂直板聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,对河曲藏獒、青海藏獒、青海藏狮犬和青海土种犬共4个群体103只犬的9个血液蛋白基因座(Tf、Po、Es-1、Es-2、Sα_2:、Hb、Alb、Pr、Amy)的多态性进行了检测,分析了两个藏獒群体的群体内和群体间的遗传变异,并以Nei氏标准遗传距离(D)为基础用UPGMA法探讨了不同犬群之间的遗传关系.结果表明,在4个被测犬群中,Tf、Po、Es-1、Es-2和Sα_2 5个基因座上存在多态性,其中Tf、Es-1和Po分别由3个等住基因所控制,Es-2和Sα_2,分别由2个等位基因所控制,而Hb、Alb、Pr和Amy基因座均呈现单态;河曲藏獒群体内遗传变异较青海藏獒丰富,而两个藏獒群体间的遗传分化程度很低(G_(ST)=0.0187);以Nei氏标准遗传距离(D)为基础的UPGMA法聚类结果表明.青海藏獒与青海藏狮犬和青海土种犬的遗传关系近于河曲藏獒.     

不同生态类群藏獒亲缘关系的RAPD分析

采用RAPD技术对不同生态类群藏獒个体之间的亲缘关系进行了分析,从80个随机引物中筛选出27个引物,共扩增出369条带,其中339条带表现出多态性,多态性位点百分率为91.86%.根据20只藏獒个体之间的Nei氏标准遗传距离用UPGMA法构建了聚类分析图.结果表明:河曲藏獒和青海藏獒同类群个体之间亲缘关系较近,在聚类图上形成了河曲藏獒类群和青海藏獒类群各自独立的分支,这一结果有力地支持了按地域对藏獒进行生态类群划分的说法.     

安徽省草鱼养殖群体遗传多样性及遗传结构分析

通过微卫星分子标记对来自安徽省4个草鱼养殖群体进行遗传分析。结果表明,7个微卫星位点均具有高度多态性(PIC=0.863～0.926),4个草鱼群体均显示出较高的遗传多样性(He=0.886 1～0.911 4)。AMOVA分析显示,大多数遗传变异存在于草鱼群体内(97.6%),群体间的遗传变异仅为2.4%。遗传分化和遗传距离分析显示,4个群体整体分化水平较低(Fst0.05),怀远和滁州群体遗传分化最小(Fst=0.013 7),遗传距离最近(Dn=0.269 8),池州和无为群体遗传分化最大(Fst=0.042 5),遗传距离最远(Dn=0.591 6)。系统进化树显示,怀远和滁州群体亲缘关系最近,与池州最远。此外,4个养殖场内部草鱼均存在近亲繁殖现象。建议4个养殖场及时更新亲本,增加繁殖亲本的数量,避免近交衰退带来的风险。     

广东省水稻纹枯病菌群体遗传结构

运用RAPD分子标记技术分析了广东省水稻纹枯病菌的群体遗传结构，研究结果表明，水稻纹枯病菌存在遗传分化现象(G=0．1658)，分子方差分析表明群体遗传多样性在广东省地区间、地区内以及县市内3个水平分布，群体遗传分化在地区间的水平非常低(ФST=0．038)，地区内的遗传分化程度较高(ФST=0．240)，遗传分化主要来源县市内菌株的遗传变异(ФST=0．269)，占总群体遗传多样性的73．07％．Mantel分析表明地理距离和遗传距离间缺少相关性，群体分化不符合地理距离隔离模式。     

藏獒随机扩增多态DNA分析

采用随机扩增多态DNA技术,对不同品种的20只藏獒个体之间的亲缘关系进行了分析。从80条随机引物中筛选出了27条引物,共扩增出369条条带,其中339条表现出多态性,多态性位点百分率为91.87%。根据20只藏獒个体之间的遗传距离,用UPGMA法构建了聚类分析图。结果表明,河曲藏獒和青海藏獒同类群个体之间亲缘关系较近,在聚类图上形成了河曲藏獒类群和青海藏獒类群各自独立的分支,这一结果有力地支持了按地域对藏獒进行类群划分的说法。     

短枝木麻黄群体的遗传分化和遗传结构

利用RAPD技术对4个短枝木麻黄(Casuarina equisetifolia)种群的遗传分化和群体遗传结构进行了分析。结果表明,短枝木麻黄具有较高的遗传多样性,但各种群的遗传多样性大小不一,由大到小依次为天然分布于澳大利亚、太平洋群岛的原生种群(YSAP)>引种于亚洲的次生种群(CSAS)>引种于非洲的次生种群(CSAF)>天然分布于东南亚的原生种群(YSAS)。遗传变异分析表明,短枝木麻黄群体的遗传变异主要存在于群体内,种群间遗传多样性比例(Hsp-Hpop)/Hsp=0.246,遗传分化系数GST=0.263,种群间变异比率φST=0.278 9,即群体内变异占了72.11%,群体间变异占27.89%。UPGMA聚类分析将4个短枝木麻黄种群归为2类,YSAS与CSAS的亲缘关系较密切,而YSAP与CSAF有着更亲密的关系,这在一定程度上反映了次生种群的主要引种来源。     

峨眉蔷薇居群遗传多样性的SSR分析

以收集的11个峨眉蔷薇群体的88份样本为研究对象,利用SSR技术分析其群体水平遗传多样性.88份样本的多态位点百分率、Nei氏基因多样性指数(H)和Shannon信息指数(I)分别为90.48％、0.196 0和0.316 6.比较11个群体的遗传多样性指标,种质间遗传变异44.73％,种质内遗传变异55.27％.东环线的遗传多样性最高(H=0.137 7,I=0.206 8,多态位点百分率为38.78％).聚类分析结果显示,11个群体可聚为4支.群体间遗传分化系数(Gst)和基因流(Nm)分别为0.447 3和0.617 9,表明峨眉蔷薇基因分化明显,各群体间基因交流受阻.     

基于微卫星标记的不同种质资源罗氏沼虾遗传多样性研究

为探究江浙地区不同罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)群体的遗传多样性和遗传结构,利用16个微卫星标记对潮丰(CF)、蓝天(LT)、源泉A(YQA)、源泉B(YQB)、嘉丰(JF)、南太湖(NTH)等6个江浙地区养殖群体和1个泰国正大(ZD)引进群体进行遗传变异分析.结果显示,16个微卫星位点均为高度多态位点;7个群体均为较高的遗传多样性,期望杂合度(He)和多态信息含量(PIC)均大于0.7,遗传多样性大小排序为ZD>YQA>YQB>JF>LT>NTH>CF;遗传分化指数(Fst)分析结果显示,泰国正大与江浙地区各群体间存在中等程度的遗传分化,Fst介于0.10145～0.12348之间;江浙地区群体除NTH与CF群体间为中等程度遗传分化(Fst=0.05098)外,其余群体间的遗传分化程度较低,Fst介于0.01571～0.04099之间.AMOVA分析结果显示,遗传变异主要发生在个体内和群体内个体间,群体间遗传变异仅占2.10％.依据Nei's遗传距离构建的非加权组平均法(UPGMA)系统进化树显示,泰国正大群体独占一支,江浙地区6个群体聚为另一支.Structure分析结果显示,所有样本被划分为2个理论群,江浙地区6个群体为一个集群,泰国正大群体为一个集群.该研究不但揭示了江浙地区罗氏沼虾养殖群体的遗传多样性现状,而且也为罗氏沼虾种质资源的保护、利用以及优良品种的选育提供了参考信息.     

2个鲤鱼群体遗传多样性的RAPD分析

从50条随机引物中筛选出10条有效引物,采用RAPD技术对蒙自响水河和草坝的2个鲤鱼群体进行遗传多样性分析。结果表明:在2个群体中分别检测到47、53个位点,多态位点分别为44、51个,平均多态位点比例分别为93.61%和96.23%;利用Popgene version1.32软件分析获得2个鲤鱼群体Shannon信息指数(I)分别为0.479 9和0.455 7,Nei's基因多样性指数(H)分别为0.328 7和0.298 4,等位基因观察数(Na)分别为1.821 4和1.910 7,有效等位基因数(Ne)分别为1.584 3和1.487 9,群体间的遗传相似性系数为0.958 1,遗传距离为0.041 9。2个鲤鱼群体间的遗传分化系数Gst为0.082 4,表明群体间的遗传变异占总的遗传变异的8.24%,群体内的遗传变异占总变异的91.76%。     

巴什拜羊群体遗传多样性与遗传分化的研究

利用10个微卫星标记对新疆巴什拜羊4个品系(红毛、白毛、黑毛和瘦肉型新品系)189个个体进行检测,分析群体遗传多样性和群体间的遗传分化、系统发育关系。结果表明:在巴什拜羊10个微卫星座位中共检测到110个等位基因,平均每个座位等位基因数为11个;4个群体10个微卫星标记的平均多态信息含量为0.791 4,平均杂合度为0.814 9,说明巴什拜羊4个群体均具有丰富的遗传多样性;4个绵羊群体的总近交系数为-0.178 2,群体内近交系数为-0.211 2,群体间基因分化系数为0.023 7,说明4个绵羊群体间2.37%的遗传变异来自群体间,而97.63%的遗传变异是由各群体内个体间的差异引起的;基因流(Nm)平均值为8.916 7。聚类分析发现,红毛品系与黑毛品系亲缘关系较近,之后与白毛品系相聚,最后与瘦肉型新品系聚在一起,聚类结果与品系育成史基本一致。     

藏獒血液蛋白多态性研究

［目的］了解藏獒血液蛋白基因座的遗传变异状况,为藏獒品种资源保护及合理开发利用提供理论依据。［方法］采用不连续垂直板聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,对河曲藏獒、青海藏獒、青海藏狮犬和青海土种犬共4个群体103只犬的7个血液蛋白基因座（Tf、Po、Sα2、Hb、Alb、Pr、Amy）的多态性进行研究,并分析不同群体的群体内遗传变异。［结果］ 4个犬群中,Tf、Po和Sα2 3个基因座上存在多态性,其中Tf和Po分别由3个等位基因控制,Sα2 由2个等位基因控制,Hb、Alb、Pr和Amy基因座均呈现单态;藏獒群体的有效等位基因数（Ne）和Nei氏平均预期基因杂合度（H）分别为1.532 4和0.230 3,均高于其他犬群。［结论］ 藏獒群体内在血液蛋白位点上存在丰富的遗传变异。     

藏獒血液蛋白多态性研究

1材料与方法 1．1材料共采集血样103份,其中,44份河曲藏獒（HTM）,42份青海藏獒（QTM）,5份青海藏狮犬（QTS）以及12份青海土种犬（NAD）。均采集后肢静脉肝素钠抗凝血5—10ml,24h内带回实验室,处理后置低温冰箱（-40℃）冻存备用。     

河曲藏獒鉴定标准及品种选育的研究

从体形、外貌、体尺、气质、毛色等方面提出了河曲藏獒鉴定标准。在依据此标准选集优良个体组建的河曲藏獒育种核心群中,加强选种选配。3个世代后,河曲藏獒育种核心群群体有效含量达到96.43,犬群每世代近交系数的增量保持在0.005,公犬平均体高72.1 cm,管围16.3 cm;母犬平均体高70.2 cm,管围15.2 cm。为河曲藏獒保护与选育奠定了基础。     

河曲藏獒繁殖性能研究

对原产地组和兰州核心群组河曲藏荚母犬繁殖性能研究表明，该犬年发情一次，９～１１月发情母犬占全年总发情数的８３．３％。发情率、受胎率主要受母犬年龄及体况影响，正常条件下，３岁龄母犬发情率和受胎率均可达到１００％。幼犬初生重为０．３４～０．５７ｋｇ，断奶重 ２．９３～３．５３ ｋｇ。初生重与活产仔数之间呈负相关，ｒ＝－０．６１；而与断奶重之间呈正相关，ｒ＝０．７３。活产仔数为 ６～８只时，幼犬的初生重和断奶重较大。     

江苏地方山羊不同地域群体间的遗传分化

在采用多座位电泳法检测江苏地方山羊群体结构基因座遗传变异的基础上,分析群体间的遗传分化水平并探讨了影响群体遗传分化的主要因素。结果显示,4个山羊群体间的遗传分化系数在0.0067~0.0368之间,平均仅为0.0177,说明群体间的遗传分化水平很低,遗传变异绝大部分存在于群体内;不同地域山羊群体的分布符合地理隔离模式,而且群体间的基因流十分通畅;亲缘关系的模糊聚类结果与已知的品种史也是吻合的。据此可认为,大而通畅的基因流是江苏4个地方山羊群体间遗传分化水平很低的主要原因,而生境异质性则是引起群体发生轻微遗传分化的原因。     

东亚及南亚固有绵羊群体的遗传结构研究

 【目的】分析东亚及南亚固有绵羊群体的遗传结构。【方法】以多座位电泳法检测中国4个绵羊群体结构基因座上的变异，同时引用11个绵羊群体的同类资料作为参考。【结果】15个群体结构基因座平均杂合度和有效等位基因数分别为0.2746和1.559；平均杂合度和有效等位基因数都是蒙古国绵羊群体最大，蒙古国、中国、越南、孟加拉国和尼泊尔绵羊群体的遗传多样性依次减小。绵羊群体间遗传分化系数在0.0126～0.3083之间，平均为0.148，说明遗传变异主要存在于群体内，占总变异的85.2%。群体地理位置的远近与遗传距离间无相关性；大多数群体间基因流通畅，使得群体间地理位置的远近与遗传距离不完全一致。东亚及南亚15个固有绵羊群体大致可分为两大类群：一类包括了中国和蒙古国的部分群体，另一类则包括了中国云南绵羊、尼泊尔以及孟加拉国的部分群体，其余群体逐步汇入这两大类群。【结论】东亚及南亚15个固有绵羊群体间的遗传分化程度相对不高；地理隔离不是影响群体间遗传分化的主要原因；亲缘关系聚类分析可将15个绵羊群体大致分为两大类群。     

河曲藏獒保种措施的探讨

在河曲藏獒保种群中,实施各家系等数、公母比例不等的留种方法。使保种群犬群结构达到最佳配置,群体有效含量为239.8,世代间隔2.5年,世代近交系数的增量被控制在0.002以下,公母比例为1♂ : 3♀,同步开展了对河曲藏獒的保护与选育。     

根据EH277045衍生序列变异分析中国互花米草种群的遗传结构

[目的]在核DNA水平根据DNA序列变异分析我国沿海8个互花米草种群的遗传结构。[方法]根据互花米草EST序列EH277045的序列信息设计引物,在8个种群共75份样本中扩增该衍生序列,采取直接测序的方法,比较序列差异,计算多种遗传参数,分析中国互花米草种群的遗传多样性与变异。[结果]共得到28个多态位点将75份样本分为25种单倍型,核苷酸多样性为0.011,单倍型多样性为0.794;种群间基因分化系数GST为0.163、遗传分化指数FST为0.222;AMOVA分析揭示79%的遗传差异来源于种群内,21%的遗传差异来源于种群间。[结论]我国互花米草种群遗传多样性水平高,种群间遗传分化较低,遗传多样性主要存在于种群内。