名词解释

一、近交系数亦称近亲繁殖系数、近亲育种系数、亲交系数和近交量,是指某一个体形成时双亲配子间的相关程度,即有亲缘关系的两个个体近交后所生的某一个体,通过双亲自共同祖先得到相同等位基因的概率。它可通过谱系分析按公式计算。     

基于Excel的个体近交系数直观估算

通过计算畜群内的个体近交系数,可以把握现有畜群的遗传效应,对于畜群的选种选配有着重要的指导意义,能有效地防止近交造成的品种退化等现象。通过Excel函数计算畜群系谱信息中共同祖先出现的次数频率,可简单快速地估算个体间的近交系数,实现近交系数的直观估算,不需要使用者掌握计算机编程知识,可供基层畜牧行业的技术人员参考使用,能快速估算系谱个体的近交情况,使得对群体遗传效应的评估工作极易进行。     

近亲系数简式计算法

近亲系数简式计算法辽宁省黑山县畜牧局︵１２１４何新刘迎春张建国李忠山近亲交配双亲的亲缘程度通常用罗马数字和阿拉伯数字表示，即用共同祖先在父方、母方出现的代数比表示；也可以用近交分数表表示。近交系数分个体近交系数和群体近交系数。个体近交系数的大小取决于...     

近交对狼山鸡繁殖性状影响的研究

利用RAD-seq简化基因组测序鉴定狼山鸡保种群个体基因组SNP标记,计算个体(间)分子近交系数和分子亲缘系数,结合系谱信息组建高、低近交两个试验组。分析后代繁殖性状近交衰退系数,评价近交对繁殖性状的影响。结果显示:利用FROH、FGRM、FHOM和FUNI四种分子近交系数结合亲缘系数kin估算的后代分子近交系数较为一致。低近交组后代的平均分子近交系数小于0.04,高近交组(6个家系)后代的平均分子近交系数介于0.14~0.25。近交对各繁殖性状的效应表现并不一致。高近交组后代母鸡开产日龄、300日龄产蛋数发生显著衰退(P<0.05,P<0.01),且与分子近交系数呈显著相关(P<0.05,P<0.01);开产体重和开产蛋重未发生显著性衰退(P>0.05)。研究结果为进一步探讨狼山鸡繁殖性状近交衰退分子机制提供了基础。     

近交对中国荷斯坦牛泌乳性能的影响

为研究近交对中国荷斯坦牛泌乳性能影响，收集2008年5月至2022年2月河南37家奶牛场67 150头中国荷斯坦牛1～5胎次共128 282条泌乳性能记录数据，筛选后用于分析的数据共23 933头奶牛40 737条数据。个体近交系数F_ped是基于系谱信息采用R(v4.1.2)nadiv包计算，将奶牛按照近交系数分为无近交组(F_ped=0)、低近交组(F_ped≤6.25%)和高近交组(F_ped>6.25%)3个组。采用R(v4.1.2)方差分析(aov)函数，分析不同近交系数分组对泌乳性能指标的影响。采用DMU软件(v6)和动物模型按照总数据和分胎次对泌乳性能进行近交衰退评估，在评估模型中近交系数作为协变量，近交系数回归系数即为近交衰退效应值，并进行显著性检验。结果表明：近交对奶牛305 d产奶量、305 d乳脂量和305 d乳蛋白量有极显著影响；近交系数每增加1%,305 d产奶量、305 d乳脂量和305 d乳蛋白量分别减少8.55 kg(P<0.01)、0.22 kg(P<0....     

近交系猪群的现代化饲养管理

1近交系的命名 近交系是由全同胞兄妹或亲子连续20世代交配而育成的，其近交系数应达到或大于98．6％，且所有个体可以追溯到一对共同祖先。亲子配或全同胞配是近交的2种极端形式，也称“急骤近交”。     

罗马数字法计算近交系数点滴

<正> 罗马数字法,亦称亲缘结构式法,就是用罗马数字表示共同祖先在系谱中所处的代数和位置,中间用短横线(—)连结,横线左右两边的罗马数字分别相应地表示共同祖先在母系和父系方面所占的代数,父母为第1代祖先,祖父母和外祖父母为第2代祖先,余类推。用罗马数字法计算近交系数对于复杂系谱也不需制成结构式系谱,通路的条数不会被遗漏或重复,计算简便。现以计算Z个体的近交系数为例,说明使用这一方法时值得注意的几个问题。     

蜜蜂工程育种中的一个理论问题——近交与杂交的相互关系

一、近交的后果一般认为近交引起物种的适应性衰退。但作者认为并非如此,事实上,它与隐性度γ有关。当γ<0时,会引起近交优势。在有人工选择的情况下,当对隐纯个体的选择系数S满足下述条件时,近交总引起群体平均数的增加。 s>(2pqFh)/(d(q+pF)) (1) (1)式中p·q分别为群体显性基因及隐性基因频率。h·d分别为显性值与纯性值。F为近交系数。     

利用R语言程序计算德国弗莱维赫改良牛群的近交和亲缘系数

[目的]利用德国西门塔尔牛(弗莱维赫牛)与澳大利亚西门塔尔母牛品系间、及德国西门塔尔牛(弗莱维赫牛)与本地肉用母牛选种选配后,培育优秀种群。[方法]通过个体牛只信息和编号、父母代和祖父母代信息和编号,采用近交系数和亲缘系数的计算公式,利用R语言编制程序计算47头德国西门塔尔牛(弗莱维赫牛)的后代母牛个体间亲缘系数和近交系数。[结果]所有个体间均无近交,近交系数为0,群体亲缘系数值在0～0.500 0之间。本试验的牛群主要来自于自繁自育母牛场,做选配时,较好地控制了近交系数,但是,从亲缘系数来看,在群使用的种公牛较少,为防止近交,有必要提高使用种公牛家系的数量,每年都要计算近交系数和亲缘系数。     

不同近交程度南阳黑母猪的繁殖成绩

淅川畜牧场保存地方品种南阳黑猪已17 年。保种群母猪按每头所反映到的实际近交情况计算的平均近交系数,在1992,年底为0.0442。母猪的繁殖性能,因近交程度的增加有没有变化,直接关系到品种保存的质量。本文统计分析了场内1980年以后出生的部份不同近交程度南阳黑母猪的繁殖成绩。 按远交(即不存在近交,近交系数0.0000)、远亲 (近交系数0.0001～0.0155)、中亲(0.0156～0.0624)、近亲(0.0625～0.1249)、嫡亲(0.1250以上)     

培育近交公牛进行顶交繁育的效果初步分析

通过近交方法,把祖先的优良性状保存下来,培育近交公牛,然后采用顶交的方法,亦即与无亲缘关系的母牛群进行配种,是提高牛群质量的方法之一;但这一繁育方案在生产实践中是否可行,我们缺乏经验。自1974年以来我们进行培育近交公牛的研究,共培育出三头近交公牛,其中752352号公牛(近交系数12.5％)已有后裔测定成绩,证明是10头公牛中最好的一头,现将结果报告于下。     

中间偃麦草染色体核型及C-带带型的分析比较

为比较确定偃麦草属植物种质材料间的亲缘关系和进化程度,以3份不同来源的中间偃麦草(Elytrigia in-termedia(Host)Nevski)种质材料为研究对象,分别进行染色体核型及C-带带型的分析。结果表明:3份中间偃麦草种质材料均为四倍体,其中EI015的细胞染色体核型公式为2n=4x=28=2M+10m+16sm,但不显带;EI021的染色体核型公式为2n=4x=28=4M+22m(SAT)+2sm,而带型公式为2n=4x=28=5C+2CT₊+2CT⁺+4T⁺+2T₊+1CS₊+12;EI038的染色体核型公式为2n=4x=28=4M+12m+12sm(SAT),带型公式为2n=4x=28=2S₊+4T₊+1CT₊+1T⁺+20,3份种质材料染色体不对称性均属2A型。综合比较染色体核型及带型变化,EI021染色体核型特征与EI015、EI038相差明显,EI015与EI038染色体核型比较相近,但EI015与EI038在带型特征上存在明显差异,说明各种质材料间亲缘关系较远,并且染色体带型分析能够更加客观地反映染色体变化。     

野豌豆属4个品种（系）的染色体核型

对野豌豆属(Vicia)4个不同品种(系)的根尖细胞有丝分裂中期染色体进行数目统计及核型分析。结果显示,4个品种(系)的染色体数目相同,均为2n=2x=12;但核型公式和核型类型各不相同,春箭筈豌豆品种“兰箭3号” (Vicia sativa Lanjian No.3)和狭叶野豌豆品种333/A (V. angustifolia 333/A)的核型公式分别为2n=2x=8m+2sm+2st和2n=2x=2m+8sm(2SAT)+2st,春箭筈豌豆品系2556、2560的核型公式均为2n=2x=10m+2sm;兰箭3号和品系2556的核型类型均为“2B”,品系2560的核型类型为“1B”,而品种333/A的核型类型为“3B”。表明不同品种(系)春箭筈豌豆之间具有染色体遗传多样性。     

品系近交系数的控制方法

品系与高度亲缘是分不开的,同时,高度近交也是品系衰亡的主要因素。因此,在不失品系特性的基础上,有效控制近交系数是品系维持的根本内容。本文就这个问题从理论上做一初步论述。首先是控制种公畜数量问题。在一个闭锁的随机交配群体中,每代的近交率即近交系数增量(△F)的估计公式如下:     

小梅山猪最佳近交区域的研究

将江苏农林职业技术学院小梅山猪育种中心839窝纯种小梅山猪按其近交系数的大小(F=0～39.9%),分成9组,运用数量遗传原理,探讨小梅山猪以产活仔数为主目标性状的繁殖性能近交效应,发现小梅山猪最佳近交区域为近交系数0.1%～14.9%,较佳近交区域近交系数为15%～19.9%;衰退区域近交系数为20%～39.9%。结果表明:小梅山猪具有安全近交区域广、耐近交能力强等优良特性。     

不同来源大白猪总产仔数近交衰退评估

旨在评估两个不同来源大白猪群体经过近8个世代的选育后总产仔数（total number of piglets born，TNB）近交衰退的程度。本研究对1 937头大白猪使用GeneSeek GGP Porcine HD芯片进行分型，其中1 039头来自加系大白猪和898头来自法系大白猪，且两品系均有表型记录和系谱记录，系谱共由3 086头大白猪组成。分别使用系谱、SNP和ROH进行个体近交系数估计，并将近交系数作为协变量利用动物模型对总产仔数进行近交衰退评估。为了精准定位导致总产仔数衰退的基因组片段，又进一步对每条染色体以及显著染色体分段计算近交系数并估计其效应，检测是否能引起总产仔数发生近交衰退现象。对于加系群体，F_ROH、F_GRM和F_PED估计的近交系数均值分别为0.124、0.042和0.013，其中F_ROH和F_PED相关最高，相关系数为0.358；对于法系群体，F_ROH、F_GRM和F_PED均值分别为0.123、0.052和0.007，其中F_ROH和F_GRM相关最高，相关系数为0.371。利用3种不同计算方法所得近交系数用于估计近交衰退时，加系群体的总产仔数均检测到显著的近交衰退，而且当F_ROH、F_GRM和F_PED每增加10%时，总产仔数分别减少0.571、0.341和0.823头；但法系群体仅有F_ROH估计的总产仔数检测到显著近交衰退，F_ROH每增加10%时，总产仔数减少0.690头。为了锁定相关的染色体和基因组区段，首先利用ROH估计每条染色体近交系数并进行近交衰退分析发现，加系群体中检测到第6、7、8和13号染色体产生了显著近的总产仔数交衰退，而法系群体未检测到与近交衰退相关的染色体。然后，又将与加系总产仔数近交衰退显著相关的4条染色体平均分为2、4、6、8个片段进行近交衰退检测，其中平均分成8段后的染色片段的长度范围为15.1~25.8 Mb。在第6、7和8号染色体分别检测到1、2和3个与总产仔数相关的近交衰退染色体片段。这些区域注释到了CUL7、MAPK14和PPARD基因与胎盘发育相关，AREG和EREG基因与卵母细胞成熟有关。本研究利用3种近交系数计算方法对两个不同来源的大白猪总产仔数进行近交衰退评估，在加系大白猪中3种估计方法都能检测到近交衰退的现象，而法系群体中只有F_ROH才能检测到。而且通过ROH方法进一步确定了能引起加系大白猪总产仔数衰退的4条染色体和6个特定的染色体区段，还注释到了与繁殖相关的候选基因。这为揭示近交衰退的遗传机制提供了新的研究手段，也为基因组选种选配提供了参考依据。     

加拿大奶牛的近交趋势

奶牛有亲缘关系的个体交配产生近交后代,其后代的近交系数为双亲亲缘系数的一半。近交的后果之一是一些性状的平均表型值下降,即“近交退化”(Falconer 1989,Schmidt等1988)。研究表明,近交百分率每增加1个百分点都会导致产奶量下降22～23公斤(50磅)。近交不仅使致死因子的纯合性提高(VonKrosigk and Lush 1958,Young等.1969,Hodges等1979,Hodson and Vanvleck1984,Hermas等1987),而且近交降低了加性的遗传方差。奶牛的繁殖依靠先进的人工授精技术,只有少     

近交羔羊的生长和发育

1974—1976年间,奇姆肯特州“塔斯”卡拉库尔羊良种场对肋型黑色卡拉库尔羔的羔皮特性的近交稳定性进行了实验研究。供试羊为周岁,由四只公羊与其亲本母羊交配获得,其近交系数(F_x)分别为:25.0％;12.5％;6.25％;和3.125％。用上述种公羊的远亲后代作对照。分别在初生、断奶和周岁时测定羔羊活重。根据СБроди的公式确定相对增重。羔羊外形主要测量下列指标:体高、体斜长、胸围(肩胛骨后)、胸深和管围。     

羊的亲缘选配

<正>所用羊只具有共同祖先,或者说具有一定血缘关系的公、母羊交配时称为亲缘选配。一般在7个世代以内具有共同祖先的个体间的交配属于亲缘选配,而7个世代以外才有共同祖先的个体间的交配,属非亲缘选配。在亲缘选配中,按交配双方亲缘关系的远近又可分远交与近交。亲缘关系较近的个体间交配后代的亲缘系数大于0.78%者,可称为近交,反之为远交。1近交采用近交可使羊群中优良性状尽快地结合与稳     

枫泾猪群体繁殖性能遗传分析

利用枫泾猪现有母猪群体进行繁殖性能的遗传分析,以母猪个体间的亲缘程度和产仔主效基因为主的分析结果得到:1)现有母猪平均近交系数为0.089,近交程度的大小未能影晌枫泾猪的产仔数性能,并且随着近交系数的增加,产仔数反而呈上升趋势;2)繁殖性能主效基因在群体中的频率高达到0.72,基因型之间具有0.5头的产仔数差别,但在初产母猪间无该基因的效应存在;3)半同胞遗传力计算得到产仔数为0.08,产活数为0.044.