用PBA标记和各种DNA标记构成二倍体马铃薯的综合遗传图

为了综合反映马铃薯（Solanum tuberosum）的遗传图信息，本试验中我们用已开发的PBA（P450 based analogue，即P450基因模型）标记以及不同的DNA标记来构成了遗传图。供试材料为二倍体马铃薯的F1群体，用各种DNA标记共计401个来检测了双亲间的多态性；这401个标记分别为111个SSR，33个RFLP，87个RFLP-SIS，45个CAPS，94个RAPD，15个PBA，9个AFLP，3个RGL以及4个ISSR。结果在这401个标记中有127个标记（172个基因位点）显示出了亲本间的多态性，     

ISSR和EST-SSR标记在检测中国、日本和肯尼亚茶树品种遗传多样性上的比较分析

本研究利用ISSR和EST-SSR标记对中国13个、日本4个与肯尼亚5个茶树品种的遗传多样性进行分析,重点比较了ISSR和EST-SSR在多态性位点数、引物解析能力、多态性信息含量和标记系数等方面的差异。结果表明在位点检测能力上ISSR明显高于EST-SSR,每条ISSR引物可检测的平均条带数（12.5）比每对EST-SSR引物（3.1）高三倍。ISSR标记的Rp值是EST-SSR标记的6.3倍,其多态性信息含量（PIC）和标记系数（MI）也明显高于EST-SSR,这表明ISSR具较高的多态性位点检测能力和较高的标记效率。EST-SSR揭示的Nei基因多样性（H=0.28）高于ISSR（0.21）,这种差异进而会影响到遗传距离和聚类分析的结果。在检测中国、日本和肯尼亚茶树品种的遗传差异上,两种标记表现出较一致的趋势,中国茶树品种在多态性位点数量、Nei基因多样性、遗传距离上均大于日本和肯尼亚的茶树品种。研究还表明,由于EST-SSR可检测到等位位点的变异,它比ISSR可以更准确地反映和揭示供试品种的遗传多样性水平。同时由于单个EST-SSR标记检测到的位点数量较ISSR标记少,且特异性较强,谱带较易分辨,因此比ISSR标记更适用于对大量样本的分析。     

基于EST-SSR的木薯分子标记遗传连锁图谱的构建

此实验以木薯推广品种‘KU50’为母本,‘SC124’为父本通过杂交得到包含240个单株的F1分离群体,利用300对EST-SSR引物,20对SSR和20对SRAP引物组合对亲本和部分群体株系进行多态性分子标记筛选,共获得具有多态性的引物110对。在此基础上,利用这110对多态性引物对该F1群体进行分子标记的多态性分析,共获得269个多态性标记。利用JoinMap 3.0软件对这269个多态性标记进行分组和遗传图谱构建,最后获得了一张包含140个标记的木薯分子遗传连锁图谱,其中EST-SSR标记111个,SSR标记22个,SRAP标记7个;共21个连锁群,其中连锁群1和3（LG1、LG3）上的标记位点最多（15个）,LG21标记位点最少（2个）。此遗传连锁图谱的总长度为1314.775 cM,单个连锁群最长为132.904 cM（LG3）,最短为0.431 cM（LG19）,标记间平均长度9.391 cM。     

SSR标记应用于烟草品种遗传多样性研究

SSR标记是进行植物遗传多样性研究的理想技术。本研究应用最近公布的烟草SSR标记分析了13个云南省烟草主栽品种的遗传多样性。对92对分布于烟草24个连锁群的SSR标记引物筛选发现20对在这些品种之间存在多态性。20个SSR位点上共检测到52个等位基因,平均每对引物等位基因数为2.6个。根据SSR标记多态性计算了不同品种之间的遗传距离（GD）,13个品种之间遗传距离介于0.0090-0.4286之间,平均距离为0.2237,说明品种间遗传差异较小。SSR标记技术将在烟草的基因标记定位及分子辅助育种中发挥重要的作用。     

FSHR基因的PCR-RFLP对牛双胎性状的标记分析

FSHR基因5’端（包括侧翼序列和第一外显子）的限制性内切酶TaqⅠ的PCR-RFLP标记研究发现，在秦川牛中双胎母牛的A基因频率（0.5500）和AA基因型频率（0.5000）分别高于单胎母牛的A基因频率（0.3500）和AA基因型频率（0.3000）；在黑白花奶牛中双胎母牛的B基因频率（0.5937）和BB基因型频率（0.6875）均高于单胎母牛的B基因频率（0.5416）和BB基因型频率（0.4167），也就是FSHR基因的5’端的PCR-RFLP标记在一个品种内单胎母牛和双胎母牛之间有一定趋势，但两个品种的趋势不同。     

我国棉花抗枯、黄萎病骨干品种（系）基于AFLP的遗传多样性

利用AFLP分子标记技术，对我国20世纪50年代开展抗枯、黄萎病育种以来培育的105份骨干品种（系）的遗传多样性进行了研究。结果表明，筛选的20个AFLP引物组合在该品种群体中扩增了1498个AFLP标记，其中多态性标记232个，占总标记数的15．5％。单一引物组合扩增的DNA标记数变幅在49-111之间，平均每个引物组合扩增的总标记和多态性标记分别为74．9和11．6。     

安徽野生香菇遗传多样性及杂种优势的RAPD分析

王子迎等采用随机扩增多态性DNA（RAPD）技术，利用17个引物对26个安徽野生香菇菌株和6个香菇栽培品种进行了遗传多样性分析，并构建了遗传相关聚类图。在128个RAPD标记中，多态性标记为104个，占81．3％。聚类分析显示，当以相异距离0．25为阈值时，32个菌株被划为5个RAPD遗传组，多数菌株之间遗传相似性较低。表明供试菌株在DNA水平上存在比较显著的遗传变异，具有较丰富的遗传多样性。杂种优势的检测表明亲本间遗传距离较大的组合其杂种优势也较强。     

绿豆SSR标记的开发及遗传多样性分析

SSR标记以其数量丰富、多态性好、共显性遗传等优点在基础研究和育种工作中发挥了重要作用,但目前绿豆基因组中的SSR标记依然较少。本研究将磁珠富集法和测序技术相结合高通量检测绿豆基因组SSR位点,鉴定出3,275,355个SSR位点,开发了2742个SSR标记。选取其中157个SSR进行PCR验证,发现有90个(57.33%)标记在10份材料中表现出多态性。挑选40个条带清晰、多态性高、染色体上均匀分布的标记对90份绿豆资源进行遗传多样性分析,单个位点检测到的等位变异数为2～8个,平均为3.0个,有效等位基因数为1.31～4.21个,平均为2.16。Nei’s基因多样性指数在0.23～0.76之间,平均为0.51。多态性信息含量为0.22～0.72,平均为0.43。聚类分析将90份材料分为2个类群,包含4个组。第I组主要由北方资源组成,第Ⅱ组种质来源较为分散,第Ⅲ组主要由山东的资源构成,第Ⅳ组包含多数河北的种质资源。本研究开发的多态性SSR标记不仅可以用于绿豆种质资源的遗传多样性分析,也将在高密度遗传图谱构建、基因定位和分子标记辅助育种中发挥重要作用。     

SSR和AFLP分析玉米遗传多样性的研究

利用SSR，AFLP两种分子标记方法研究了23个玉米种质材料的遗传多样性，并对这两种分子标记系统进行了比较。利用筛选出的40对SSR引物，检测到了202个等位基因。用12对AFLP引物组，检测到了444条有多态性的带。SSR和AFLP分子标记均有很高的多态性，SSR位点的平均多态性信息量（PIC）值达0．60，而AFLP多态性带比例是72％。两种分子标记结果将玉米种质划分为5组，与系谱分析基本一致，两种分子标记划分的结果也相近。研究认为SSR，AFLP两种分子标记系统均适合于玉米种质的遗传多样性研究。     

大豆品种间DNA限制性片段长度多态性（RFLP）的分析

用６２个大豆ＤＮＡ分子探针与５种限制性内切酶组合，对大豆基因组ＤＮＡ限制性片段长度多态性（ＲＦＬＰ）进行分析，结果表明，所选用的两对材料，其多态性ＲＦＬＰ标记的频率均高达６０％，可作为ＲＦＬＰ作图较理想的亲本，ＲＦＬＰ标记的多态性类型表现为共显性，少数为显性，其中一些标记揭示了２个或２个以上的独立分离的基因座位，不同限制性内切酶的揭示多态性的能力上差异不显著，在杂交片段长度上差异显著并都大于预期，     

基于SSR、InDel分子标记的红甜菜遗传多样性分析

本研究旨在了解21份国内外红甜菜品种的遗传多样性及其演化地位。利用Indel和SSR分子标记，对21份红甜菜遗传多样性研究。结果表明，InDel标记共得到25个基因位点，24个位点具有多态性，Shannon’s信息指数平均值为0.583，Nei’s基因多样性指数平均值为0.370，等位基因K为2~4个，平均2.4个，平均观测杂合度为0.235，期望杂合度0.398，多态信息含量PIC值为0.330；SSR标记共扩增出28个基因位点，全部具有多态性，平均每个标记扩增出3.5个多态性基因位点，Shannon’s 信息指数平均值为0.926，Nei’s基因多样性指数平均值为0.548，等位基因K为2~7个，平均4.625个，平均观测杂合度0.399，期望杂合度0.587，多态信息含量PIC值为0.523。本研究发现红甜菜品种大多因亲缘关系较近，因此在选育新品种时，建议尽量选择遗传距离较远的品种作为亲本。     

利用PCR标记对恢复水稻BT型胞质雄不育性的核基因Rf-1进行遗传制图

Rf-1基因能恢复盯型雄性不育细胞质引起的花粉不育，Rf-1基因所在的第10染色体上的9个限制性片段长度多态性(RFLP)标记被转换成PCR标记。利用9个标记和1042株组成的分离群体进行遗传分析。结果发现，Rf-1基因位于S12564 Tsp5091和C1361 MwoI之间。两个标记位点的遗传距离估计为0．3cM。     

小麦抗白粉病基因Pm5e的SSR标记研究

小麦白粉病是由小麦白粉菌（Erysiphe gramini f.sp．fritici）引起的真菌性病害。冬小麦品种复壮30中含有一个单隐性抗白粉病基因,即Pm5e。该基因对我国流行的白粉病小种表现为高抗或免疫。本研究以含抗白粉病基因的复壮30、感病品种Chancellor为材料构建F2分离群体,利用分离群体分组分析法（bulked segregant analysis,BSA）对该抗白粉病基因进行了SSR标记分析。在已定位在7B染色体上的56对SSR引物中,8对引物能在亲本间稳定的揭示多态性差异,3个引物Xwmc364、Xbarc065和Xwmc517在抗、感亲本,抗、感池间均表现多态性差异,F2分离群体的验证结果表明标记Xwmc364175、Xbarc06590和Xwmc517200与抗病基因连锁,遗传距离分别为4．9cM、5．1cM和18．5cM。其中标记Xwmc364175和Xbarc06590与抗病基因连锁紧密,在对Pm5e的标记辅助选择（marker-assisted selection,MAS）中具有重要利用价值。     

水稻小穗簇生性近等基因系的构建及其近等性评价

为了研究育种中间材料Z1820突变产生的小穗簇生基因对农艺性状的影响和对该基因进行定位克隆，我们用恢复系泸恢17(LH17)和N45作母本，Z1820作父本杂交，并用上述恢复系作轮回亲本，连续回交并自交，获得了簇生性近等基因系Cl-LH17和Cl-N45。用形态相似法和SSR标记对获得的两对近等基因系进行多态性分析，结果表明：（1）LH17和Cl-LH17在株高、穗长上有显著差异，在所考查的其他性状上差异不显著；N45和Cl-N45仅在穗长上有显著差异。（2）在所选用的120对SSR引物中，对LH17和Cl-LH17，只有第6染色体的两个引物（RM7434、RM5957）揭示了多态性，而对N45和Cl-N45则有位于3条染色体上的4个引物能揭示多态性。综合形态和SSR标记分析说明，LH17和Cl-LH17是一对近等性理想的簇生性近等基因系，有利于该簇生基因的进一步研究；Z1820的簇生基因能使穗长、株高负增长，对有效穗、每穗总粒数、结实率等重要性状无显著影响。（3）簇生性在N45的遗传背景中的表现强于在LH17的遗传背景中的表现。     

中国江、浙地区栽培大麦遗传资源的RAPD研究

采用随机扩增多态性（RAPD）标记，探讨了我国部分栽培大麦品种的遗传背景。结果表明：200个随机引物中，有30个引物扩增出的产物具有多态性，30个引物共扩增出223条谱带，其中130条谱带具有多态性，每个引物可扩增出2~9条多态性谱带，平均4.19条。67个大麦品种平均表型多样性值0.369，裸麦的表型多样性高于皮麦的表型多样性     

水稻中以遗传多样性分析为基础的分子标记

一系列分子标记系统的有效性允许我们比较其中两种标记系统在估计不同分类单位相互关系时的效率。本研究的目的是用简单序列重复(SSR)标记和随机扩增多态DNA(RAID)标记来评价40个水稻(Oryza sativa L)栽培品种和5个野生近缘种的遗传多样性。用36个十体引物和38个SSR引物对扩增后评价了这些试样的多态性。在40个栽培品种和5个野生近缘种中产生了总共499个RAPD标记，具有90．0％多态性。在所使用的38个SSR引物对中，仅有1个位点即RM115是多态的。     

大豆疫霉病及其遗传多样性的研究方法

本文对大豆疫霉菌（Phytophthora sojoe)发生危害概况、侵染特性、菌株分离方法、流行学调查、小种分化与鉴定方法、毒力基因的多态性、基因多态性的分子鉴定、SSR标记在基因多态性研究中的应用等进行了系统综述,讨论了研究P．sojae生理小种遗传多样性的方法,指出应用SSR分子标记进行P.sojae种下分类,确定生理小种间亲缘关系是可行的。     

大白菜根肿病的遗传规律及抗病基因定位研究

为探究根肿病抗病遗传规律,采用根肿病抗性差异的材料G57和G70,构建了包含500个单株的F2分离群体。通过对父母本、F1及F2分离群体的人工接种表型鉴定结果进行统计分析,结果发现,材料中的根肿病抗性由显性单基因控制。为进一步定位试验材料中的抗病基因,利用678个分子标记对双亲、F1及F2群体进行了筛选验证,初步将抗病基因定位在分子标记KBRH129J18和TCR02-F。并基于2个连锁标记,开发设计了更紧密连锁的分子标记,最终获得与抗病基因连锁的5对SSR分子标记,分别为Bra0345-1、Bra0235-2、Bra0235-1、Bra19317、Bra019392。其与抗病基因的遗传距离依次为2.4,2.4,2.4,2.5,3.3 c M。开发设计的多态性标记经验证在大白菜中具有较好的适用性。     

不结球白菜(Brassica campestris ssp. chinensis Makino)种质资源SRAP遗传分化分析

利用SRAP分子标记分析了国内外64份不结球白菜种质资源的DNA遗传多样性和遗传分化。21对引物组合共检测出215个位点，其中112个为多态性位点，多态性比率达52.09%，平均每对引物组合产生10.24个位点和5.33个多态性位点。不结球白菜各类型中普通白菜的Nei’s基因多样性指数（0.1410）和遗传丰富度[(190) 88.37%]最高；各生态区域中江淮流域不结球白菜的Nei’s基因多样性指数（0.1451）和遗传丰富度[(185) 86.05%]最高；国内的Nei’s基因多样性指数(0.1293)和遗传丰富度[(188) 87.44%]分别高于国外。遗传变异估算表明，不结球白菜遗传分化系数58.22%，大部分变异存在于种群间；基因流为0.4031，说明群体间基因流动较少，遗传分化程度较高。以遗传相似系数0.872为截值，可把不结球球白菜分为Ⅵ个类群。     

丹参种质资源遗传多样性的AFLP分析

对55份不同来源的丹参材料，采用扩增片段长度多态性（AFLP）标记，对丹参种质资源在DNA水平上进行遗传多样性研究，利用NTSYSpe2．1软件采用非加权配对算术平均法（uPGMA）方法进行聚类分析和计算遗传距离，构建遗传系统进化树。筛选得到的6对引物的扩增片段具有丰富的多态性，丹参种质资源存在很大的遗传变异，它们之间的相似系数为0．23～0．76，聚类分析将丹参种质资源分为4个主要类群。丹参种质资源存在丰富的遗传多态性，AFLP聚类分析结果与表型特征不完全一致，可能是基因型和环境共同作用于表型的结果。