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基于EST-SSR的木薯分子标记遗传连锁图谱的构建
引用本文:孙湘来,陈新,文明富,卢诚,周玉飞,王文泉.基于EST-SSR的木薯分子标记遗传连锁图谱的构建[J].中国农学通报,2011,27(9):231-236.
作者姓名:孙湘来  陈新  文明富  卢诚  周玉飞  王文泉
作者单位:1. 海南大学农学院,海口,571101;中国热带农业科学院生物技术研究所,海口,571101
2. 中国热带农业科学院生物技术研究所,海口,571101
基金项目:国家重点基础研究发展计划项目
摘    要:此实验以木薯推广品种‘KU50’为母本,‘SC124’为父本通过杂交得到包含240个单株的F1分离群体,利用300对EST-SSR引物,20对SSR和20对SRAP引物组合对亲本和部分群体株系进行多态性分子标记筛选,共获得具有多态性的引物110对。在此基础上,利用这110对多态性引物对该F1群体进行分子标记的多态性分析,共获得269个多态性标记。利用JoinMap 3.0软件对这269个多态性标记进行分组和遗传图谱构建,最后获得了一张包含140个标记的木薯分子遗传连锁图谱,其中EST-SSR标记111个,SSR标记22个,SRAP标记7个;共21个连锁群,其中连锁群1和3(LG1、LG3)上的标记位点最多(15个),LG21标记位点最少(2个)。此遗传连锁图谱的总长度为1314.775 cM,单个连锁群最长为132.904 cM(LG3),最短为0.431 cM(LG19),标记间平均长度9.391 cM。

关 键 词:模型  模型  
收稿时间:2010/11/8 0:00:00
修稿时间:2010/12/26 0:00:00

Based on EST-SSR Constract the Molecular Genetic Linkage Map of Cassava
Sun Xianglai,Chen Xin,Wen Mingfu,Lu Cheng,Zhou Yufei,Wang Wenquan.Based on EST-SSR Constract the Molecular Genetic Linkage Map of Cassava[J].Chinese Agricultural Science Bulletin,2011,27(9):231-236.
Authors:Sun Xianglai  Chen Xin  Wen Mingfu  Lu Cheng  Zhou Yufei  Wang Wenquan
Institution:Sun Xianglai 1,2,Chen Xin 2,Wen Mingfu 2,Lu Cheng 2,Zhou Yufei,Wang Wenquan 2(1 College of Agronomy,Hainan University,Haikou 571101,2 Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology,Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences,Haikou 571701)
Abstract:In this experiment,segregating from an F 1 contains 240 separate population of an intraspecific crossed between ' Ku50 ',as female parent,and ' SC124 ' as male parent.We obtained 269 polymorphic markers when used 110 polymorphic primer pairs with the F 1 populations,and basing on these 269 polymorphic markers,a genetic linkage map that consisting of 140 molecular markers,including 111 expressed sequence tag(EST)-SSRs,twenty-two simple sequence repeats(SSRs) and 7 sequence-related amplified polymorphisms(SRA...
Keywords:cassava  EST-SSR  molecular marker  genetic linkage map  
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