微卫星DNA分子标记及其在绵羊遗传育种中的应用

分子标记技术是近20年来继形态学标记、生化免疫标记和细胞遗传学标记后的一种新遗传标记技术,它是从DNA水平上来揭示遗传物质的遗传变异情况,是动物遗传育种领域内的一项新兴技术。目前常用的分子标记主要有:限制性核酸内切酶酶切片段长度多态标记(RFLP),随机引物扩增多态(RAPD)标记,扩增片段长度多态(AFLP)标记,小卫星DNA标记,微卫星(SSR)标记及单核苷酸多态性(SNPs)等。1微卫星(SSR)标记微卫星(Microsatellite)DNA也称为简单序列重复(si mple sequence repeat,SSR)、简单序列长度多态性(si mple sequence length polymorph…     

微卫星标记BMS2508在4个山羊品种中的遗传多样性研究

微卫星DNA又称简单序列重复、短串联重复序列和简单序列长度多态性,广泛存在于真核生物基因组中.微卫星多态性是由于减数分裂过程中不等交换造成变异而产生的,具有保守性,其核心序列为2～6 bp,重复约10～20次,属于等显性遗传.自1989年在人类基因组研究发现微卫星多态性后,目前在马、牛、猪、绵羊和鸡等动物基因组中也筛选出了大量的微卫星标记,但山羊等动物中则相对较少.     

微卫星DNA标记与乌骨鸡屠宰性能的相关分析

微卫星(mierosatellite)DNA标记是由重复单位为2～6 bp的核苷酸序列所构成的串联重复序列,由于重复单位的重复数目不同,形成了微卫星标记的丰富多态性.微卫星标记普遍存在于真核生物基因组中,由于具有数量多、分布广、多态性丰富、呈共显性遗传方式及检测快速和方便等优点而成为当今包括人类在内的各物种基因作图的首选标记,并在基因诊断、物种的演变追踪、QTL分析、系谱的确定、群体遗传结构分析、标记辅助选择等方面显示出巨大的应用价值.     

微卫星分子标记的研究进展

微卫星是指以少数几个核苷酸(一般1～6个)为单位多次串联重复的DNA序列，是1974年Skinner在研究寄居蟹的卫星DNA时发现的。微卫星广泛均匀地分布在基因组上，其重复数和重复单位序列都是可变的，故多态信息含量大。但由于微卫星无位点特异性，无法确切定位。因此以微卫星核心序列为中心，两侧各加上1个侧翼序列，形成所谓的序列示踪微卫星位点(STMS)。由于侧翼序列在基因组中是单拷贝的，具有位点特异性，而微卫星本身又使STMS具有多态性，只需根据微卫星侧翼序列设计一对PCR引物，通过PCR反应从模板DNA中将该位点扩增出来，然后用聚丙烯酰胺凝胶电泳分离，溴乙锭或银染法显色进行研究。     

丝羽乌骨鸡群体遗传结构的微卫星标记分析

用9对微卫星引物对170只丝羽乌骨鸡的基因组DNA进行扩增,结果表明,9个微卫星标记在该品系中都表现出了丰富的多态性,所有扩增结果都能重复.微卫星标记平均每个座位检测到4.56个等位基因(3-7个).9对微卫星引物平均多态信息含量为0.6072,标记平均杂合度为0.7423.本研究的结果可以为进一步利用微卫星进行丝羽乌骨鸡种质特性等研究提供一定的参考.     

猪EST序列的微卫星标记定位

通过对 Gen Bank中猪的表达序列标签数据库进行序列扫瞄 ,结果检测到大约 10 0个包含一个微卫星重复或简单重复 (SSR)的序列文件。这些重复单元多数是二核苷酸(CA/GT)重复 ;而且检测到 3～ 6个核苷酸的重复序列。通过 6个二核苷酸和 14个中度串联重复序列的初步分析 ,仅二核苷酸重复序列标记产生丰富的标记信息。 (二核苷酸为10 0 % ,中度串联重复序列为 14 % )。另外对 5 0个二核苷酸和 1个三核苷酸 SSRs设计了几对引物 ,结果在 MARC的参考家系中 ,发现 4 2个标记具有多态性 ,17个标记不具有多态信息 ,12对引物没有扩增产物。通过二核苷酸和 3～ 6个核苷酸重复单元的比较 ,二核苷酸标记 72 %能够反映标记信息 ,而其它重复单元仅有 7%。不同的是 ,在 3～ 6个碱基重复单元中 ,非多态标记占较高的比率 (6 4 % ) ,而 2个碱基重复单元仅 14 %。这或许是因为在猪基因组 DNA中 ,中度重复单元的多态性较少 ;或是由于我们选择 17个以上连续重复碱基长度的标准太低。本研究将定位的微卫星标记加入猪的遗传图谱上 ,并为人和猪的基因组之间提供了有用的联系     

丝羽乌骨鸡群体遗传结构的微卫星标记分析

用 9对微卫星引物对 170只丝羽乌骨鸡的基因组DNA进行扩增 ,结果表明 ,9个微卫星标记在该品系中都表现出了丰富的多态性 ,所有扩增结果都能重复。微卫星标记平均每个座位检测到 4 .5 6个等位基因 (3～ 7个 )。 9对微卫星引物平均多态信息含量为 0 .6 0 72 ,标记平均杂合度为 0 .74 2 3。本研究的结果可以为进一步利用微卫星进行丝羽乌骨鸡种质特性等研究提供一定的参考     

微卫星标记技术的研究进展及其在家兔研究中的应用

微卫星标记DNA是简单串联重复序列(simple sequence repeas,SSR),它的组成基元为1～6个核苷酸,例如(CA)n、(CGA)n、(GACG)n等.由于这些序列广泛存在于真核细胞的基因组中,且由于串联重复的数目是可变的而呈现高度的多态性,以及在单个微卫星点上可作共显性分析.近年来,微卫星序列作为比较理想的分子标记广泛应用于遗体图谱的构建、居群遗传学以及系统发育的研究.     

荧光标记通用引物在银狐微卫星基因分型中的应用

微卫星又称短串联重复序列(STR)或简单重复序列(SSR),由侧翼序列和串联重复核心序列组成,一般其串联重复核心序列长度为1～6 bp[1]。由于微卫星遗传标记具有多态信息含量高、基因组内分布广泛及呈共显性遗传等优点,因而已被广泛应用于遗传图谱的构建[2-3]、QTL定位[4]、亲缘关系鉴定[5]及遗传多样性评估等[6]。微卫星标记的基因分型主要     

微卫星标记在家禽育种中的应用

1974年，skinner在研究寄生蟹的卫星DNA时发现一种简单的串联重复序列，Ali等在1986年将合成的寡聚核苷酸用于人的指纹研究。1989年，Taetz利用PCK技术研究了微卫星的变异特性，提出微卫星有丰富的多态性。作为近十几年来发展起来的遗传标记，微卫星具有数量大，分布广泛均匀，多态信息含量高，检测快速方便等优点，受到广大研究者的青睐。本文旨在对微卫星标记的特性及其在家禽育种中的应用作一简要综述。     

利用微卫星血液DNA标记分析延边圈养黑熊遗传多态性

为了掌握圈养黑熊的相关遗传信息,试验采用微卫星血液DNA标记法研究圈养黑熊的遗传多态性,试验选择延边地区3个熊场175头圈养黑熊,对其进行遗传多态性检测,计算其等位基因频率、多态信息含量(PIC)等。结果表明:圈养黑熊的6个微卫星座位总共检测到39个等位基因,每个位点的等位基因数量为4.000~8.000个,每个微卫星的平均位点为6.500个,基因频率分布在0~1之间;6个微卫星基因座的平均PIC为0.571 7,且PIC值在0.453 4~0.742 2之间,延边3个黑熊养殖群体的平均PIC均高于0.5,表明6个微卫星标记均具有高度多态性,因此可以分析圈养黑熊的遗传多态性。     

随机扩增微卫星DNA多态标记(RAMPs)及其应用

随机扩增微卫星DNA多态标记是在微卫星DNA基础上衍生出的一种新型分子标记。它综合了微卫星DNA和随机扩增多态DNA（RAPD）两种标记的优点，可用来快速检测动植物群体的遗传变异及分离新的微卫星DNA。本文介绍了随机扩增微卫星DNA多态标记的种类及其应用。     

高原鼢鼠微卫星多态位点筛选及其通用性检测

跨种扩增是微卫星DNA标记获取的快捷有效途径之一。为了筛选出高原鼢鼠微卫星多态性位点,从已开发微卫星信息的鼹形鼠科和甘肃鼢鼠物种中进行了高原鼢鼠微卫星多态性位点及其通用性研究,结果表明:在87对微卫星位点中,只有54对进行了成功扩增,多态位点仅有9个,27个鼹形鼠科物种的微卫星在高原鼢鼠中并没有多态性,9个多态位点全来自于同属的甘肃鼢鼠。基于获得的9个多态位点,检测到高原鼢鼠的等位基因数在4~12,其平均观测杂合度(Ho)为0.544,期望杂合度(He)为0.671,多态信息含量为0.551,研究为高原鼢鼠的微卫星标记应用奠定了基础。     

用磁珠富集法从AFLP片段中分离鹅微卫星DNA标记

用磁珠富集法从AFLP片段中分离微卫星DNA标记，可以避免基因组文库的构建和筛选这一繁重的工作，既节省时间又节约费用。利用少量的内切酶组合建立一系列AFLP DNA，然后用生物素标记的简单重复序列（SSR）作探针与其杂交，杂交复合物固定到包被有链亲和素的磁珠上，经过一系列洗涤过程，含有SSR的AFLP片段被吸附到磁珠表面。这些片段经洗脱下来后，先用对应的AFLP引物扩增，再进行克隆和测序，根据SSR两端的保守序列设计引物，经过多态性分析后，便可得到微卫星DNA标记。用这种方法已成功地从6个中国地方品种鹅中分离到30个微卫星DNA标记。其中有11个引物表现为多态性好，特异性强且相互之间并不连锁。各品种平均多态信息含量（PIC）在0．513～0．546之间。说明这11个微卫星均为高度多态，可作为有效的遗传标记用于鹅品种间遗传多样性和系统发生关系的分析，并为建立鹅遗传图谱、重要经济性状的基因定位及标记辅助选择奠定基础。     

四个微卫星标记在苏钟猪中的多态性分析

微卫星标记是近年来发展起来的一种检测基因DNA多态性的新型DNA标记,因其数量多、分布广、多态性丰富及检测方便等优点而倍受推崇。本文利用四个微卫星标记分析其在苏钟猪中的遗传多样性。结果表明,四个微卫星座位在苏钟猪中均存在较高的遗传多样性,基因杂合度为0.5962～0.8823;多态信息含量为0.5146～0.8709;有效等位基因数为2.4768～8.4935。以上结果表明,本研究采用的四个微卫星标记可以作为苏钟猪的遗传多样性的标记辅助选择。     

兔微卫星标记研究进展

微卫星DNA,亦称简单序列重复,是指以2~6个核苷酸为基本序列串联重复的短片段〔1〕。微卫星标记与其它分子标记技术相比,具有分布广泛、多态信息含量高、呈共显性遗传等优点,因此在品种资源分类及畜禽遗传多样性的评估和保存中,微卫星被作为重要的遗传标记之一〔2〕。我国家兔分子生物学标记的研究起步较晚,最近几年才开始,利用微卫星标记来研究家兔的群体遗传特性是在2003年才开始的,相比较而言,国外则开展的较早,技术比较成熟,研究也相对较深入。1国内研究进展殷宝法、魏万红等,使用8对微卫星引物对高原鼠兔血样中的DNA微卫星位点(Sol33…     

四个微卫星标记在苏钟猪中的多态性分析

微卫星标记是近年来发展起来的一种检测基因DNA多态性的新型DNA标记，因其数量多、分布广、多态性丰富及检测方便等优点而倍受推崇。本文利用四个微卫星标记分析其在苏钟猪中的遗传多样性。结果表明，四个微卫星座位在苏钟猪中均存在较高的遗传多样性，基因杂合度为0.5962-0.8823；多态信息含量为0.5146-0.8709；有效等位基因数为2．4768-8．4935。以上结果表明，本研究采用的四个微卫星标记可以作为苏钟猪的遗传多样性的标记辅助选择。     

微卫星标记及其在动物遗传育种中的应用

微卫星技术是20世纪80年代末期发展起来的能有效区别不同物种、不同群体及不同基因型个体的分子标记,可作为第二代分子标记。微卫星标记广泛分布于各真核生物基因组中,且随机分布。微卫星DNA(Microsatellite)是一类以1~6 bp的核苷酸为基本单位,呈串联重复状散在分布于整个基因组的重复序列,具有数量多,分布广且均匀,多态性丰富和     

家禽微卫星标记研究进展

有关微卫星的报道始见于Skinner等(1974)在研究寄生蟹的卫星DNA时发现一种简单的串联重复序列。Ali等(1986)首次将合成的寡聚核苷酸用于人的指纹研究，才受到重视。Jeffreys等和Gao等(1988)进一步将其发展成为一种新的遗传标记系统。Tautz等(1989)报道微卫星具有丰富的多态性。早期将微卫星称为“简单序列”、“简单序列重复(SSR)”、“简单串联重复(STR)”等。     

四个微卫星标记在苏钟猪中的多态性分析

微卫星标记是近年来发展起来的一种检测基因DNA多态性的新型DNA标记,因其数量多、分布广、多态性丰富及检测方便等优点而倍受推崇。本文利用四个微卫星标记分析其在苏钟猪中的遗传多样性。结果表明,四个微卫星座位在苏钟猪中均存在较高的遗传多样性,基因杂合度为0．5962～0．8823;多态信息含量为0．5146～0．8709;有效等位基因数为2．4768～8．4935。以上结果表明,本研究采用的四个微卫星标记可以作为苏钟猪的遗传多样性的标记辅助选择。