绵羊经济性状主效基因与QTL的研究进展

绵羊的重要经济性状大多数由主效基因或QTL与微效多基因联合控制 ,因而主效基因或QTL在绵羊育种中就显得特别重要。文章综述了主效基因和QTL的遗传特征 ,检测定位方法以及对未来的展望。     

猪产仔数性状候选基因研究进展

产仔数性状是猪最重要的经济性状之一,与猪场的效益直接相关。影响猪产仔数的因素包括环境、品种、年龄、营养以及遗传等,而遗传是其中的关键因素。因此,对猪产仔数基因进行研究一直是猪高繁殖力育种领域的研究热点。鉴于科学家们已经找到了一些猪产仔数关键候选基因并定位了一些主效基因,且在这些基因分子标记研究方面取得了一些成果,该文对这些基因分子遗传机制研究进展进行综述,并提出分子育种领域存在的一些问题以及未来可能的发展方向,旨在为猪产仔数主效基因的筛选及猪高效育种提供参考。     

山羊多胎性状候选基因的研究进展

多胎性状是山羊的重要经济性状,直接关系到其产业的经济效益。目前在绵羊中已经找到了影响多胎性能的若干主效基因;在山羊上,国内外对遗传机制的研究主要集中在常规选育和分子标记方面,但是仍未找到控制山羊多胎性状的主效基因。论文就山羊多胎性状候选基因的研究现状进行综述,为其主效基因的筛选及应用提供有益参考。     

Booroola Merino羊FecB基因的研究及其在绵羊育种中的应用

Fec^B基因是控制绵羊多胎性状的主效基因．对绵羊育种具有重要意义。文章就Fec^B基因的遗传方式、分离定位以及生理效应等方面的研究现状作一阐述．并就Fec^B基因在绵羊育种中的应用效果及前景展望进行了探讨。     

国外部分高繁殖力绵羊主效基因简述

繁殖性状是绵羊的重要经济性状。作者就国外一些高繁殖力绵羊品种的繁殖特性以及相关主效基因的发现、遗传效应、定位等研究进展作一综述。      

影响绵羊羊毛性状的主效基因和QTL

在绵羊中已经发现了许多影响重要经济性状的主效基因，其中包括影响色素沉着、羊毛质量和角蛋白等的主效基因，而角蛋白对羊毛纤维的形态特征有着重要影响 。在羊毛质量和产量性状上，基因图谱研究已经发现了与其变异相联系的染色体区域。现在面临的主要挑战就是建立一种有价值的分子技术方法来提供绵羊的遗传进展。     

全基因组关联分析在水禽主要数量性状基因座定位的应用现状

水禽的经济性状多为数量性状,数量性状基因座(quantitative trait loci, QTL)是调控数量性状表达的遗传基础,因此QTL的定位是分子育种的基础。全基因组关联分析(genome wide association studies, GWAS)作为鉴定表型与基因型关系的一种分析策略,是挖掘畜禽QTL的重要手段,并已经成功应用于猪、牛、鸡等畜禽的遗传育种工作中。利用GWAS可以定位与水禽经济性状相关的QTL,确定影响水禽性状的功能基因或主效基因,从而实现对水禽重要性状的改良。文章综述了GWAS在水禽重要性状研究上的应用效果,并分析了不足之处,以期为完善水禽遗传育种与遗传改良方法提供参考。     

肉牛经济性状主效基因研究进展

牛是重要的家畜之一,在役用、肉用和乳用等方面对社会有着重要的贡献。通过鉴定牛经济性状相关基因及其变异有助于提高育种效率,增加经济效益。随着现代生物技术的发展,对牛经济性状主效基因的挖掘变得更加准确。已鉴定与牛生长发育相关的PLAG1基因,与繁殖相关的GDF9基因,与肉质相关的CAST基因,与胴体相关的MSTN基因,与毛色相关的MC1R基因,与泌乳相关的DGAT1基因等。针对牛不同性状进行合理的分子选育对牛业发展有着重要的经济价值和意义。本文对近年来黄牛生长发育性状、繁殖性状、肉质性状、胴体性状、毛色性状和泌乳性状主效基因研究进展进行综述,为今后黄牛遗传育种研究提供参考依据。     

绵羊多胎性的遗传机制及其育种改良研究进展

绵羊多胎性直接影响到绵羊业的经济效益,受多种因素影响。文章从绵羊繁殖性状的遗传特性及品种差异,以及一些已经发现并证明的影响绵羊繁殖力的主效基因,并从常规育种措施和标记辅助选择两方面对提高绵羊繁殖力的育种措施进行了探讨。     

绵羊重要经济性状可用遗传标记研究进展

绵羊作为重要的经济动物,是人类社会肉、奶和皮毛的来源之一。生长性状、胴体性状、繁殖性状、产毛性状、抗病及耐寒等都是绵羊生产和遗传育种研究领域的重要经济性状,了解这些性状的分子遗传基础,确定关键功能基因以及遗传标记位点有利于提高重要经济性状选择的准确性,进而加速绵羊经济性状的遗传改良。随着基因组重测序、转录组测序和甲基化测序等技术的发展以及全基因组关联分析技术的成熟,有关绵羊表型性状与基因型的关联分析报道较多,挖掘到一系列绵羊经济性状相关的候选基因和遗传标记。作者主要从生长发育、繁殖、尾脂沉积和羊毛生产4个角度对近几年筛选到的可用遗传标记基因进行总结,挑选出一些明星基因,如肌细胞增强因子(myocyte enhancer factor 2B,MEF2B)和生长抑素受体1(somatostatin receptor 1,SSTR1)影响绵羊体重;椎骨发育相关基因(vertebrae development associated, VRTN)是决定胸椎数量的主效基因;繁殖力基因(fecundity booroola, FecB)、骨形态发生蛋白15(bone morphogenetic pr...     

A review on prolificacy genes in sheep

Ovulation rate and litter size are important reproduction traits in sheep and are of high economic value. Reproduction traits typically have low to medium heritabilities and do not exhibit a noticeable response to phenotypic selection. Therefore, inclusion of genetic information of the genes associated with reproductive ability could efficiently enhance the selection response. The most important major genes affecting prolificacy and their genetic diversities in different sheep breeds were reviewed. Different causative mutations with major effects on reproductive traits including ovulation rate and litter size have been found in various sheep breeds around the world. A general overview of the studies on main prolificacy genes showed that some alleles may express different phenotypic effects in different breeds, and thus, further studies on epistatic effects are necessary for more understanding of genetic control of reproductivity in sheep. Regarding the polygenic control of fertility traits, application of new high‐throughput technologies to find new variants is essential for future studies. Moreover, genomewide association studies and genomic best linear unbiased predictions of breeding values are likely to be effective tools for genetic improvement of sheep reproductive performance traits.     

绵羊Tacr3基因多态性与产羔数的关联分析

本研究旨在探究绵羊速激肽受体3(tachykinin receptor 3,Tacr3)基因g.21484478A>C、g.21560640C>T和g.21560688T>C位点多态性与绵羊产羔数之间的关系,为绵羊高繁殖力分子育种提供新的遗传标记。利用全基因组重测序结合Sequenom MassARRAY?SNP技术对常年发情绵羊品种(小尾寒羊、湖羊和策勒黑羊)和季节性发情绵羊品种(滩羊、苏尼特羊和草原型藏羊)Tacr3基因3个多态位点进行检测,并与小尾寒羊产羔数进行关联分析。结果表明,3个位点均存在3种基因型,其中g.21484478A>C位点存在AA、CC和CA基因型,g.21560640C>T位点存在TT、CC和TC基因型,g.21560688T>C位点存在TT、CC和CT基因型,3个多态位点基因型频率和等位基因频率在两种发情模式绵羊品种间均达到差异极显著水平(P<0.01)。群体遗传学分析表明,g.21484478A>C位点在滩羊和策勒黑羊中均表现为中度多态(0.25T位点在6个绵羊品种中均表现为中度多态;g.21560688T>C位点在小尾寒羊、苏尼特羊、湖羊和草原型藏羊中均表现为低度多态。卡方适合性检验表明,g.21560640C>T位点在6个绵羊品种中均处于哈代-温伯格平衡状态(P>0.05);g.21484478A>C位点在草原型藏羊中处于哈代-温伯格不平衡状态(P<0.05);g.21560688T>C位点在滩羊、策勒黑羊中处于哈代-温伯格不平衡状态(P<0.05)。关联分析表明,3个多态位点与小尾寒羊第一、二、三胎产羔数均无显著关联(P>0.05)。推测Tacr3基因3个多态位点均不适用于小尾寒羊产羔数选育。     

绵羊多胎性状基因调控研究进展

绵羊的繁殖性状受多基因控制，本文综述了现已发现并证明的主基因和QTL住点，如FecB基因、FecX基因、FecX2基因、BMP15(形态发生蛋白15)突变、Q249R突变及Thoka基因等。通过分析这些基因或QTL位点的作用、遗传方式、遗传效应及基因定位，旨在为探讨绵羊多胎性状的基因调控规律提供理论依据。     

4个绵羊品种LHCGR基因单核苷酸多态性分析

为探究绵羊LHCGR基因在4个绵羊品种之间的多态性与基因功能，本研究以杜泊羊、滩羊、小尾寒羊、滩羊和小尾寒羊杂交羊4个绵羊品种为研究对象，利用Sequenom MassARRAYSNP技术对4个绵羊品种LHCGR基因g.75747421A>C、g.75748200T>A 2个位点进行检测，并利用相关生物信息学软件预测分析2个位点突变前后mRNA二级结构与其编码蛋白的理化性质、结构和蛋白互作等。结果表明，LHCGR基因g.75747421A>C位点在4个品种中存在3种基因型，分别是CC、CA和AA；g.75748200T>A位点在4个品种中存在AA、AT和TT 3种基因型；χ²适合性检验表明，g.75747421A>C、g.75748200T>A 2个位点在4个绵羊品种中均处于Hardy-Weinberg平衡状态（P>0.05）。生物信息学分析表明，该基因编码蛋白的相对分子质量为73 599.70，理论等电点为8.30，脂肪系数为98.90，总平均亲水性为0.191，推测该蛋白为疏水性蛋白；突变前后LHCGR基因的mRNA二级结构、编码蛋白二级结构及三级结构均发生了变化；蛋白互作的结果表明，与LHCGR蛋白相互作用的蛋白质主要包括骨形态发生蛋白15（BMP15）、嗜铬粒蛋白A （CGA）、甲羟戊酸激酶（MVK）、胆固醇侧链裂解酶（CYP11A1）、鸟嘌呤核苷酸结合蛋白α亚基（GNAS）等。本研究成功筛选出4个绵羊品种LHCGR基因多态位点，为绵羊繁殖力的标记辅助选择和育种提供一定的理论依据。     

绵羊DUSP6基因多态性及其与产羔数关联分析

文章旨在探究绵羊DUSP6基因g.125589716G>A、g.125587728C>T、g.125589714C>T、g.125589006G>A四个位点多态性及其与产羔数之间的关系,以期找到与绵羊高繁殖力相关的分子标记。利用全基因组重测序结合Sequenom MassARRAY誖SNP技术对多羔绵羊品种(小尾寒羊、湖羊、策勒黑羊)和单羔绵羊品种(滩羊、苏尼特羊、萨福克羊、草原型藏羊)DUSP6基因上述4个多态位点进行检测,并与小尾寒羊产羔数进行关联分析。结果表明:绵羊g.125589716G>A位点在多羔绵羊品种中存在AA、GA、GG三种基因型,在单羔绵羊品种中存在GA、GG两种基因型;g.125587728C>T、g.125589714C>T位点在单、多羔绵羊品种中均存在CC、CT、TT三种基因型;g.125589006G>A位点在单、多羔绵羊群体中均只存在GA、GG两种基因型。绵羊DUSP6基因g.125589716G>A位点基因型频率在单、多羔绵羊品种之间差异显著(P<0.05),等位基因频率在单、多羔绵羊品种间差异极显著(P<0.01);g.125587728C>T、g.125589714C>T位点基因型频率和等位基因频率在单、多羔绵羊品种间差异均达极显著水平(P<0.01);g.125589006G>A位点基因型频率和等位基因频率在单、多羔绵羊品种间差异不显著(P>0.05)。关联分析表明,DUSP6基因各SNPs多态性与小尾寒羊不同胎次产羔数之间无显著关联(P>0.05)。综上说明,绵羊DUSP6基因g.125589716G>A、g.125587728C>T、g.125589714C>T以及g.125589006G>A等4个位点的多态性与小尾寒羊各胎次产羔数之间均无显著关联(P>0.05),不适用于小尾寒羊多羔性状选育。     

猪腹股沟/阴囊疝易感位点定位及其候选基因研究进展

腹股沟/阴囊疝是猪最常见的遗传缺陷之一,每年给世界养猪业造成巨大的经济损失,其发病率一般在1.7%~6.7%,但在不同的品种和群体间有较大差异。已有研究表明,猪腹股沟/阴囊疝的发生主要受遗传因素影响,本文综述了猪腹股沟/阴囊疝疾病易感位点和相关侯选基因的研究进展,旨在为系统解析猪猪腹股沟/阴囊疝的分子遗传及病理机制提供参考,并对发展抗猪腹股沟/阴囊疝分子育种技术提出展望。     

绵羊繁殖性状候选基因调控的研究进展

绵羊的繁殖性状受多基因调控,作者简要综述了现已发现并证明的主效基因和QTL位点（如FecB、FecX^I、FecX^H和FecX^2W等）。通过分析这些基因或QTL位点的作用、基因定位、生理效应、遗传方式及遗传效应等,从而为探讨绵羊多胎性状的基因调控规律提供理论依据。     

绵羊生物钟基因Cry多态性与产羔数的关联分析

为探究绵羊Cry1基因g.175355119T>C、g.175357583C>T位点与Cry2基因g.74126865C>T位点多态性与绵羊产羔数之间的关系,本实验利用全基因组重测序结合Sequenom MassARRAY?SNP技术对常年发情绵羊品种(小尾寒羊、湖羊和策勒黑羊)和季节性发情绵羊品种(滩羊、苏尼特羊和草原型藏羊)Cry1基因与Cry2基因共3个多态位点多态性进行检测,并与小尾寒羊产羔数进行关联分析。结果表明:Cry1基因g.175355119T>C位点存在CC、CT和TT 3种基因型,g.175357583C>T位点存在TT、TC和CC 3种基因型;Cry2基因g.74126865C>T位点存在CC、CT和TT 3种基因型。群体遗传学分析表明,Cry1基因g.175355119T>C位点与Cry2基因g.74126865C>T位点的基因型频率和等位基因频率在2种发情模式绵羊品种间的差异均达到极显著水平。在6个绵羊品种中,Cry1基因g.175355119T>C位点与g.175357583C>T位点均表现为中度多态(0.25T位点均表现为低度多态(PIC<0.25)。卡方适合性检验表明,Cry1基因g.175355119T>C位点在6个绵羊品种中均处于哈代温伯格平衡状态(P>0.05),g.175357583C>T位点在苏尼特羊中处于哈代温伯格不平衡状态(P<0.05),Cry2基因g.74126865C>T位点在滩羊和草原型藏羊中处于哈代温伯格不平衡状态(P<0.05)。关联分析表明,3个多态位点与小尾寒羊第1、第2以及第3胎产羔数均无显著关联(P>0.05)。综上,Cry1基因g.175355119T>C、g.175357583C>T位点与Cry2基因g.74126865C>T位点均不适用于小尾寒羊产羔数选育。     

Diversity of the ovine DQA2 gene

Variation in the ovine DQA2 gene was investigated in approximately 2,000 sheep from six breeds. Fragments of DNA containing the ovine DQA2 exon 2 were amplified using PCR. Single-strand conformational polymorphism analysis and DNA sequence analysis were employed to detect genetic variation. Twenty-three nucleic acid sequences, encoding 22 DQA2 amino acid sequences, were identified. This increases the number of alleles identified from 10 to 23. In some cases, three or four unique sequences were isolated from individual sheep, suggesting that these DQA2 sequences may represent two loci. Phylogenetic tree analysis revealed that 5 of these 23 sequences were more closely related to cattle DQA3 or DQA4 sequences than to other sheep DQA2 sequences. These sequences clustered together and were called DQA2-like to differentiate them from other DQA2 sequences. There was no evidence of DQA5-like sequences in sheep. Information theory-based analysis indicated that some of the DQA2-like sequences had low information content at splice sites, suggesting that these alleles may have low functional activity. Allelic lineages were observed not only at the DQA2 locus, but also at the DQA2-like locus, supporting the trans-species mode of evolution of MHC genes. Comparison of the allelic sequences suggests that polymorphism seems to have arisen largely by point mutation and gene conversion, and a recent gene conversion event seems to have occurred between the DQA2 and DQA2-like loci. The high level of sequence polymorphism detected and varied number of loci demonstrate the extensive diversity of the ovine DQA2 gene.     

滩羊12个微卫星基因座遗传多态性研究

滩羊是我国优良的地方绵羊品种,开展滩羊微卫星标记和体重性状之间的相关性研究有利于建立基于分子标记的新育种体系。利用与绵羊体重主效基因高度连锁的12个微卫星标记(BL1080、BM6506、BM7145、BMS2263、BMS678、ILSTS004、ILSTS30、MCM58、BMS1591、BMS1636、CSSM004、MCM130),对51只滩羊进行了遗传检测。应用琼脂糖凝胶电泳检测微卫星的PCR扩增产物,计算12个微卫星基因座的等位基因频率、多态信息含量、基因纯合度和杂合度。结果表明,所选择的12个微卫星位点均为高度多态基因座,其中,BMS1636的遗传变异最大,BL1080的遗传变异最小。研究结果为滩羊种质特性研究提供了基础数据。