广西地区犬细小病毒检测及VP2基因序列分析

为了调查广西地区犬细小病毒(CPV)的优势毒株及其遗传变异情况，试验利用PCR方法对采自广西地区的423份犬血清样本进行CPV检测并扩增其VP2基因，利用MegAlign软件进行同源性比对并分析VP2蛋白主要突变的氨基酸位点，同时利用MEGA 7.0软件采用邻接法构建遗传进化树。结果表明：共获得55份CPV阳性血清样本，阳性率约为13.0%。PCR扩增得到大小约为1 755 bp的VP2基因。55株分离毒株之间的相似性为98.6%～100%;分离毒株与国内外参考毒株的相似性为97.4%～100%,与疫苗株Pfizer/vaccine/06的相似性为98.3%～98.9%。扩增序列的推导氨基酸主要在第5,297,370,426,440位发生变异。在55株分离毒株中，有32株为New CPV-2a亚型毒株，20株为CPV-2c亚型毒株，3株为New CPV-2b亚型毒株。55株分离毒株形成3个主要的流行分支，与国内参考毒株的亲缘关系较近，而与国外参考毒株、猫细小病毒的亲缘关系较远。说明New CPV-2a、CPV-2c、New CPV-2b亚型毒株在广西地区流行广泛，正逐步取代CPV-2a...