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基于线粒体COI基因的河南境内四水系日本沼虾种群遗传多样性
引用本文:冯梦霞,汤永涛,刘如垚,闫雪朦,胡博,聂国兴,周传江.基于线粒体COI基因的河南境内四水系日本沼虾种群遗传多样性[J].中国水产科学,2021,28(12):1548-1558.
作者姓名:冯梦霞  汤永涛  刘如垚  闫雪朦  胡博  聂国兴  周传江
作者单位:河南师范大学水产学院, 河南省水产动物养殖工程技术研究中心, 水产动物疾病控制河南省工程实验室, 河南 新乡 453007
基金项目:国家自然科学基金项目(31872199, U1504304); 河南省科技攻关重点项目(182102110007, 182102110046, 182102110237, 172102310751); 河南省创新型科技团队支持计划项目(CXTD2016043); 2019 年度河南省高等学校青年骨干教师培养计划项目(2019GGJS063).
摘    要:日本沼虾(Macrobrachium nipponense)是一种经济价值较高的淡水虾类, 广泛分布于我国各淡水水体, 其在河南境内各水系均有分布。随着水产养殖业的发展、水域生态环境的变化及人为因素的影响, 日本沼虾的种质资源也逐渐受到影响。为评估河南境内水系日本沼虾的种质资源现状及其遗传多样性, 本研究利用线粒体 COI 基因对河南境内 18 个地理群体 135 尾日本沼虾开展种群遗传学研究, 样品覆盖河南境内的长江、黄河、淮河和海河 4 个水系。结果显示, 河南境内日本沼虾 18 个地理群体共包含 27 个单倍型, 群体平均单倍型多样性(Hd)为 0.78574, 平均核苷酸多样性(π)为 0.01059, 其中淮河水系日本沼虾群体平均遗传多样性最低, 长江水系日本沼虾群体平均遗传多样性最高, 且各水系群体均显示出高 Hd 低 π 的特点。AMOVA 分析显示, 日本沼虾遗传变异主要来源于日本沼虾群体内(66.03%), 群体间遗传变异为 40.22%。系统发育树和单倍型网络均未显示出明显的水系分化。中性检验、错配分布及贝叶斯天际线分析表明, 日本沼虾群体近期没有发生种群扩张, 群体相对稳定。本研究可为河南境内日本沼虾种质资源的保护和合理开发利用提供参考。

关 键 词:日本沼虾    COI    遗传多样性    种质资源    长江    黄河    淮河    海河    河南境内

Genetic diversity of Macrobrachium nipponense in Henan Province assessed using mitochondrial COI gene
FENG Mengxi,TANG Yongtao,LIU Ruyao,YAN Xuemeng,HU Bo,NIE Guoxing,ZHOU Chuanjiang.Genetic diversity of Macrobrachium nipponense in Henan Province assessed using mitochondrial COI gene[J].Journal of Fishery Sciences of China,2021,28(12):1548-1558.
Authors:FENG Mengxi  TANG Yongtao  LIU Ruyao  YAN Xuemeng  HU Bo  NIE Guoxing  ZHOU Chuanjiang
Abstract:
Keywords:
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