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牙鲆(Paralichthys olivaceus) Activin 基因两种β亚基的启动子克隆及生物信息学分析
引用本文:刘蒙蒙,王晶,高金宁,马丽曼,张全启.牙鲆(Paralichthys olivaceus) Activin 基因两种β亚基的启动子克隆及生物信息学分析[J].海洋水产研究,2015(1).
作者姓名:刘蒙蒙  王晶  高金宁  马丽曼  张全启
作者单位:中国海洋大学海洋生命学院 海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室 青岛 266003
基金项目:国家863计划课题(2012AA10A402;2012AA10A408)资助。
摘    要:以牙鲆为研究对象,利用染色体步移(Genome walking)获得了 Activin 两个β亚基基因的上游部分启动子序列,并对其进行了转录调控元件的生物信息学预测分析。获得了 Activin βA 和βB两个亚基的启动子部分序列,长度分别约为2.7 kb 和2.4 kb;在预测的 Activin βB 转录起始位点(+1位)的上游31 bp 处有1个典型的 TATA box,而在 Activin βA 中未发现 TATA box 的存在。两个基因的启动子上发现了多个转录因子 Sp1、Oct-1、C/EBP、CREB、GATA-1、HNF-3、HNF-1、USF 等结合位点,还发现了与内分泌相关的 Pit-1、ER、PR、GR、RAR、RXR 等结合位点,但肌性转录因子 MyoD、myogenin 和雄性的性别决定基因 SRY 结合位点仅在 Activin βA 启动子中发现。生物信息学分析显示,牙鲆 Activin βA 和βB 表达受到多种潜在因子的调控,二者在调控上有所差异。

关 键 词:牙鲆  激活素  启动子  生物信息学分析

Bioinformatic Characterization of Promoters of Two Activin-βSubunit Genes in Paralichthys olivaceus
LIU Mengmeng,WANG Jing,GAO Jinning,MA Liman,ZHANG Quanqi.Bioinformatic Characterization of Promoters of Two Activin-βSubunit Genes in Paralichthys olivaceus[J].Marine Fisheries Research,2015(1).
Authors:LIU Mengmeng  WANG Jing  GAO Jinning  MA Liman  ZHANG Quanqi
Abstract:
Keywords:Paralichthys olivaceus  Activin  Gene promoter  Bioinformatics analysis
本文献已被 万方数据 等数据库收录!
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