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二倍体和四倍体泥鳅线粒体ND 5/6基因多态性的PCR RFLP分析
引用本文:郑鹏飞,张桂蓉,魏开建,邹桂伟,王卫民,周玲玲,冉 伟.二倍体和四倍体泥鳅线粒体ND 5/6基因多态性的PCR RFLP分析[J].水生态学杂志,2011,32(1):51-56.
作者姓名:郑鹏飞  张桂蓉  魏开建  邹桂伟  王卫民  周玲玲  冉 伟
作者单位:1. 华中农业大学水产学院/农业部淡水生物多样性保护与利用重点开放实验室/农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,湖北,武汉,430070
2. 中国水产科学研究院长江水产研究所/农业部淡水生物多样性保护与利用重点开放实验室,湖北,荆州,434000
基金项目:国家科技基础条件平台专项(2006DKA30470-002);农业部淡水生物多样性保护与利用重点开放实验室开放课题(LFBCU0708)
摘    要:采用PCR-RFLP分析方法,对洞庭湖、武汉两地的二倍体和四倍体泥鳅线粒体DNAND-5/6基因多态性及4个群体遗传变异和遗传关系进行了研究。结果表明,120尾泥鳅mtDNAND-5/6扩增片段长度均为2.2kb;从13种限制性内切核酸酶中筛选出6种多态性内切酶(HaeⅢ、DraⅠ、RsaⅠ、TaqⅠ、HinfⅠ、MspⅠ),对扩增产物进行酶切,共检测到66种单倍型。泥鳅群体内单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.7679~0.9385和0.01041~0.03212;其中,洞庭湖二倍体核苷酸多样性最高(0.03212),武汉二倍体其次(0.02452),二倍体群体内核苷酸多样性高于四倍体。群体间的核苷酸多样性(π)大小为0.02588~0.04144,平均值为(0.031737±0.000005)。群体间的核苷酸歧化距离(δ)大小为0.00462~0.01617,平均值为(0.010659±0.000003);其中,武汉二倍体和四倍体之间的核苷酸歧化距离最大(0.01617),武汉四倍体和洞庭湖二倍体之间的核苷酸歧化距离最小(0.00462)。MonteCarlo模拟x2检验表明,4个群体间的单倍型频率存在极显著差异(P<0.0001)。UPGMA聚类分析表明,武汉四倍体、洞庭湖二倍体和四倍体聚为一支,亲缘关系较近;武汉二倍体为单独一支。

关 键 词:泥鳅  二倍体  四倍体  RFLP  mtDNA  ND-5/6
收稿时间:4/16/2010 4:26:56 PM
修稿时间:2010/12/8 0:00:00

PCR-RFLP Analysis on Mitochondrial ND-5/6 Gene Polymorphisms of Natural Diploid and Tetraploid Loach(Misgurnus anguillicaudatus)
zheng peng fei,zhang gui rong,Wwei kai jian,zou gui wei,wang wei min,zhou ling ling and ran wei.PCR-RFLP Analysis on Mitochondrial ND-5/6 Gene Polymorphisms of Natural Diploid and Tetraploid Loach(Misgurnus anguillicaudatus)[J].Journal of Hydroecology,2011,32(1):51-56.
Authors:zheng peng fei  zhang gui rong  Wwei kai jian  zou gui wei  wang wei min  zhou ling ling and ran wei
Institution:College of Fisheries, Huazhong Agricultural University,College of Fisheries, Huazhong Agricultural University,College of Fisheries, Huazhong Agricultural University
Abstract:
Keywords:Misgurnus anguillicaudatus  diploid  tetraploid  RFLP  mtDNA  ND-5/6
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